转基因抗虫棉SSR和AFLP遗传变异研究

利用SSR和AFLP两种分子标记技术,分析了52份转基因抗虫棉品种（系）的遗传多样性。结果表明：在61对SSR引物中,有4对引物在供试材料中表现出多态性,共扩增出102个标记,其中多态性标记25个,多态性百分率为24．51％,每对引物的扩增带数变化在17～30之间;在100对AFLP引物中,有9对引物在供试材料中产生多态性,共扩增出618个标记,多态性标记33个,占总数的5．34％,每对引物组合扩增的标记数分布于47～81之间。成对品种的欧式距离变化在2．00～5．57之间,平均值为4．21,单一品种欧氏距离的平均值分布在3．73～4．75之间,表明不同品种之间遗传差异不大。基于SSRs和AFLPs多态性数据的聚类分析,可以将供试材料划分为3个类群（SAGs）,但类群划分与品种地理来源不十分吻合。     

AFLP标记及在植物中的应用

ＡＦＬＰ是 1 992年由荷兰Ｋｅｙｇｅｎｅ公司Ｚａｂｅａｕ、Ｖｏｓ在ＰＣＲ和ＲＦＬＰ的基础上发展起来的一种检测ＤＮＡ多态性的新方法[1] ,并于1 993年获得欧洲专利局专利。与ＲＦＬＰ类似 ,ＡＦＬＰ也是通过限制性内切酶片段的不同长度检测ＤＮＡ多态性的一种ＤＮＡ分子标记技术。由于ＲＦＬＰ是以传统的Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交为基础的 ,操作繁琐 ,对ＤＮＡ多态性的检出的灵敏度不高 ,在连锁图上有很多大的空间区。随着ＰＣＲ技术广泛应用 ,对分子标记技术的发展产生了巨大的推动作用。除了ＲＦＬＰ(限制性内切酶酶切片段长度多态性标记 …     

西南地区野生狗牙根种质资源的SSR与AFLP联合分析

为了制定科学的资源保护策略、促进其开发利用以及新品种的选育,对西南地区55份野生狗牙根材料,联合采用 SSR 和 AFLP 方法分析其遗传多样性.通过进行引物筛选,筛选出有效引物组合18对和11对;SSR 和 AFLP 扩增总条带353和626条,多态性条带267和592条,平均每对引物扩增出多态性条带19．61和53．83条,多态性位点百分率为75．10％和94．57％.聚类分析表明 GS＝0．806时,可将所有供试材料分成6个组群,当 GS＝0．82时,可将第 VI 个组群分成4个小组,当 GS＝0．836时,第 VI 组群中第3小组的14个材料分为3个组群基于 Shannon 多样性指数,类群内的遗传变异占总变异的67．41％,类群间的遗传变异占总变异的32．59％.基于 Nei 氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明,各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性.通过两种标记的相关性分析,表明 SSR 和 AFLP 标记之间具有显著的相关性,而且相关性较高,证明供试材料的聚类和其生态地理环境间有一定的相关性;采用 SSR 和 AFLP 两种联合分析,结果会更加合理和有效.     

AFLP分子标记及其在植物育种上的应用

扩增酶切片段多态性（ＡｍｐｌｉｆｉｅｄＲｓｔｒｉｃｉｔｏｎｆｒａｇｍｅｎｔｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ,简称ＡＦＬＰ）是由Ｚａｂｅａｕ等１９９２年发明的一项新的ＤＮＡ指纹技术,它结合了ＲＦＬＰ和ＰＣＲ技术的特点,具有ＲＦＬＰ技术的可靠性和ＰＣＲ技术高效性,其基本原理是对基因组ＤＮＡ酶切片段的选择性扩增,ＡＦＬＰ扩增片段的谱带数取决于采用的内切酶及引物３′端选择碱基的种类数目和所研究基因组的复杂性,实验     

线粒体SSR分子标记在植物中的应用进展

线粒体简单重复序列(mitochondrion simple sequence repeat,mtSSR)是近年发展起来的一种新型的分子标记技术,兼具SSR标记多态性高、分布广泛、共显性和植物线粒体基因组母系遗传、结构进化速率快等优点,在群体遗传结构、基因流动进化、物种演化、胞质遗传特性、种群分类等方面具有重要应用。根据国内外已有的研究成果,综述了mtSSR植物群落分析、胞质类型鉴定等方面的研究进展,并对植物mtSSR数据库进行了总结,以期为利用mtSSR技术进行植物研究提供参考。     

应用植物形态学和AFLP分子标记鉴别陕西漆树品种

应用植物形态学和AFLP分子标记,对陕西8个漆树栽培品种和6个野生居群进行了鉴别.结果表明:从26个形态性状中筛选出3个主成分,其中:第1主成分指标7个(第5小叶长/宽、花瓣长、花瓣宽、花丝长、花丝直径、花药长和宽)贡献率为30.383%;第2主成分指标5个(小叶数、复叶长、复叶柄长、第5小叶叶柄长、顶端小叶叶柄长)贡献率为19.321%;第3主成分指标2个(第5小叶顶角角度、顶端小叶顶角角度)贡献率为13.777%.筛选的8对AFLP引物组合,均可将漆树14个样品完全区分开.植物形态学和AFLP分子标记相结合,不仅可用于漆树不同品种及野生居群间的鉴别,而且可反映其相互间的亲缘关系.     

用SSR和AFLP技术分析花生抗青枯病种质遗传多样性的比较

由Ralstonia solanacearum E.F.Smith引起的青枯病是若干亚洲和非洲国家花生生产的重要限制因子,利用抗病品种是防治这一病害最好的措施。虽然一大批抗青枯病花生种质资源材料已被鉴定出来,但对其遗传多样性没有足够的研究,限制了在育种中的有效利用。本研究以31份对青枯病具有不同抗性的栽培种花生种质为材料,通过简单序列重复(SSR)和扩增片段长度多态性(AFLP)技术分析了它们的遗传多样性。通过78对SSR引物和126对AFLP引物的鉴定,筛选出能显示抗青枯病种质多态性的SSR引物29对和AFLP引物32对。所选用的29对多态性SSR引物共扩增91条多态性带,平均每对引物扩增3.14条多态性带;32对多态性AFLP引物共扩增72条多态性带,平均扩增2.25条多态性带。在所筛选引物中,4对SSR引物(14H06,7G02,3A8,16C6)和1对AFLP引物(P1M62)检测花生多态性的效果优于其他引物。SSR分析获得的31个花生种质的遗传距离为0.12-0.94,平均为0.53,而AFLP分析获得的遗传距离为0.06～0.57,平均为0.25,基于SSR分析的遗传距离大于基于AFLP分析的遗传距离,疏枝亚种组的遗传分化相对大于密枝亚种组。基于两种分析方法所获得的聚类结果基本一致,但SSR数据聚类结果与栽培种花生的形态分类系统更为吻合。根据分析结果,对构建青枯病抗性遗传图谱群体的核心亲本和抗性育种策略提出了建议。     

AFLP标记及在微生物和动物中的应用

AFLP是在PCR和RFLP基础上发展起来的新一代分子标记技术,具有稳定好、分辨率高和效率高等特点。AFLP技术现已广泛应用于微生物和动物方面的研究,在构造遗传图谱、遗传多态性研究、育种辅助选择等多领域中有着其它分子标记技术不可比拟的优势,广泛应用于微生物和动物的研究。     

罗非鱼选育群体遗传结构的SSR与AFLP对比分析

对基于SSR和AFLP的罗非鱼选育群体遗传变异开展对比研究,得到5个选育世代群体内多态位点指数SSR/AFLP比率平均为1.683 17,群体内Fst比率平均为1.249 87,群体内基因多样性比率平均为1.676 60。5个选育群体间遗传距离比率平均为3.972 02,遗传相似性比率平均为0.937 92。本研究结果可以为其它类似研究提供参考。     

RFLP,RAPD,AFLP分子标记及其在植物生物技术中的应用

分子标记的创新、发展与应用对植物分子生物学和植物生长技术起了积极的推动作用。本文就ＲＦＬＰ、ＲＡＰＤ、ＡＦＬＰ分子标记及其在植物生物技术中应用作一介绍。     

植物他感作用及其在农业中应用的研究进展

全面而深刻地研究植物生化他感作用,不但有助于正确认识群落的结构,功能,演替和分类,而且对于营林造林,灌丛利用,杂草防除,园林植物,选配和生态环境的保护都具有十分重要的意义,本文概述了植物生化作用在国内外的研究进展,及其今后的研究发展方向。     

AFLP在芒果品种鉴定中的应用

利用 AFLP分子标记技术对 1 6个芒果 (Mangif era indica L.)品种以及 7个芒果砧木材料进行了初步研究 ,6对 AFLP选择性引物共产生 2 0 4条清晰谱带。同时利用品种间共有谱带率 (Band-sharing)对某些品种间的遗传关系进行了分析。 1 6个栽培品种间的平均共有谱带率为 83 % ,变异幅度为 70 %～ 94% ,7个砧木间的平均共有谱带率则为 80 % ,变异幅度为 5 3 %～ 96%。     

玉米SSR引物在芒属植物遗传多样性分析的应用研究

目的:本文为了探索芒属植物的遗传多样性,方法:运用SSR分子标记的方法,用30对玉米SSR引物对15份中国湖南省的野生芒属材料进行扩增.结果:结果表明:30对引物共扩增出159条带,其中多态性条带121个,占76.10%.平均Nei's基因多样度为0.1992,平均Shannon信息指数为0.3139.UPGMA聚类分析显示,15份材料在遗传相似系数(GS)为0.75水平上,聚成三大类.第一大类由芒组成,第二大类由五节芒组成,第三大类由南获组成.这与形态学上的分类吻合.结论:玉米的SSR引物对于芒属植物遗传多样性分析仍具有很好的可行性.     

AFLP在分子生物学研究中的应用

扩增片段长度多态性（AFLP）可靠性强,多态检出率高,因而被认为是最有效的DNA指纹分析技术。AFLP已广泛应用于分类学、病理学、种群遗传学、DNA指纹分析的研究和建立数量性状基因图谱,成为最主要的遗传标记。介绍了AFLP的原理、影响因素及其在分子生物学研究中的应用。     

SSR分子标记在荔枝上的研究进展

SSR作为第二代基于PCR的一种新型DNA分子遗传标记,数量丰富、多态性高、重复性好、分布于整个基因组、特异位点扩增、发生频率高、共显性遗传等,在果树育种中具有极大的应用价值和开发潜力.本文主要简述了SSR标记的原理和特点,并从分子指纹图谱构建、种质资源的遗传多样性分析、核心种质的发掘、品种鉴定、分子标记辅助育种、遗传图谱构建与基因定位等多方面介绍了近年来SSR技术在荔枝上的应用现状及前景.     

植物中phasiRNA研究进展

植物phasiRNA(phased,secondary,small interfering RNA)是一类内源性的、起调控作用的非编码小RNA(sRNA),它在植物的生长、发育、生殖以及抗病中发挥着重要作用。PhasiRNA初级转录本由Pol Ⅱ(RNA polymerase II)转录,随后miRNA(microRNA)引导AGO蛋白对phasi RNA初级转录本上的靶位点进行剪切,剪切后的phasiRNA前体片段(剪切位点的上游或下游片段)继而被RDR6(RNA-dependent RNA polymerases 6)复制成双链RNA,双链RNA被DCL4切割成一系列首尾相接,具有一定相位的21-nt或24-nt的小RNA,即phasiRNA。成熟的phasiRNA与AGO蛋白组装成沉默复合体,作用于靶基因,发挥转录后调控的功能。该文对植物phasiRNA的生物合成通路、生物学功能及其进化进行综述。     

植物中褪黑素的研究进展

植物褪黑素自20世纪90年代被发现以来,初期的研究多为测定方法,而后褪黑素生理功能的研究成为热点。植物中褪黑素含量的测定方法有放射免疫测定(RIA)、高效液相色谱(HPLC)、气相色谱(GC)、高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)和气相色谱-质谱(GC-MS)等,而高效液相色谱与荧光检测器(HPLC-FD)和电化学检测器(HPLC-EC)联用是植物中褪黑素定量研究的较常用方法。褪黑素含量因植物种类、器官不同而异,并以繁殖器官种子和花中较高。褪黑素在植物中具有调节光周期、促进植物种子萌发及生根、提高植物抵御外界环境压力如重金属、紫外辐射、温度变化等功能,而这些生理功能的作用机制、合成位点等尚待进一步研究。该文对国内外近年来有关褪黑素在植物中的检测方法、生物合成途径及生理功能等几个方面的研究进展进行综述,并提出今后的研究方向。     

植物中lncRNAs的研究进展

随着高通量测序技术的飞速发展,越来越多的lncRNAs在植物中被发现,并具有生物学功能。lncRNAs是长度大于200个核苷酸且不具备编码蛋白质功能的一类RNA分子。目前lncRNAs在动物中的功能、作用机制等方面的研究较深入,lncRNAs不仅在表观遗传水平、转录水平、转录后水平上调控基因的表达,也参与诸多生命过程调控如基因组印迹、染色体重塑、转录激活等。在植物中虽有关于lncRNAs的研究,但由于缺乏有效的技术方法而相对滞后。该文就近几年来国内外关于植物lncRNAs的来源、结构特征、分类、功能等方面的研究进展进行综述,为进一步理解和研究植物中lncRNAs的功能和分子机制提供参考。     

植物多糖在化妆品中的应用研究进展

植物多糖是从植物组织中提取得到的一类高分子聚合物,其生物活性高、功能全面、使用安全。我国植物多糖资源丰富、开发潜力巨大,根据近年来的研究成果,整合概述了植物多糖的提取、分离、纯化工艺,及其在化妆品中保湿补水、抗衰老、美白祛斑、抗敏抑菌、愈创修复等方面的应用,以期为后续研究提供参考。     

SSR分子标记在牡丹亲缘关系研究中的应用与研究进展

SSR标记具有操作简便、共显性和重复性好等特点。该文总结了通过生物信息学技术、磁珠富集法及二代测序技术开发牡丹(Paeonia suffruticosa) SSR标记引物的方法, 并根据现有研究结果解析了牡丹基因组中SSR位点频率及分布, 详细阐述了SSR标记在牡丹种质资源的遗传多样性、亲缘关系和遗传关系等方面的应用概况, 旨在为今后牡丹SSR标记的研究与应用提供参考。