多巴胺D4受体基因启动子区功能多态性与海洛因依赖的相关性研究

目的:探讨多巴胺D4受体(DRD4)基因启动子区的3个功能多态性位点与海洛因依赖的相关性.方法:严格按照诊断标准,选取无亲缘关系的海洛因依赖患者212例及健康对照组200例提取基因组DNA,采用聚合酶链反应及等位基因特异性扩增技术检测DRD4基因启动子区-521C/T、-616C/G、及-1240L/S 3个功能多态性位点的基因型,采用HaploView及SPSS11.5软件分析各位点基因型、等位基因频率及组间差异.结果:DRD4基因-521C/T的基因型及等位基因频率分布在海洛因依赖组与正常对照组存在显著性差异(p＜0.05).结论:多巴胺D4受体(DRD4)基因-521C/T多态性与海洛因依赖相关联,T等位基因可能是海洛因依赖的风险因子.     

多巴胺D4受体基因启动子区多态性与精神分裂症的相关性

目的:探讨多巴胺D4受体(Dopaminc D4 receptor,DRD4)基因启动子区的3个功能多态性与精神分裂症是否存在相关性.方法:严格按照诊断标准,选取无亲缘关系的精神分裂症患者220例,健康对照组200例提取基因组DNA,采用聚合酶链反应及等位基因特异性扩增技术检测DRD4基因启动子区-521C/T、-616C/G和-1240L/S 3个功能位点的基因型,采用HaploView4.0及SPSS11.5软件分析各位点基因型、等位基因频率及组间差异.结果:DRD4基因-1240L/S的基因型及等位基因频率分布在精神分裂症与正常对照组存在显著性差异(p<0.05).DRIM基因启动子区-521C/T和-616C/G位点的基因型及等位基因频率分布在精神分裂症组与正常对照组无统计学差异(p>0.05).结论:DRD4基因-1240L/S多态性与精神分裂症相关联,携带有-1240L/S多态性住点L等住基因的个体可能更容易患精神分裂症.     

多巴胺D4受体基因启动子区多念性位点与注意缺陷多动障碍的关联研究

目的:探讨多巴胺D4受体基因启动子区-1240L/S,-616C/G和-521C/T三个多态性与注意缺陷多动障碍(Attention deficit hyperactivity disorder,ADHD)的关系.方法:取无亲缘关系的ADHD患者及对照组各166名,采用等位基因特异性扩增技术(allele specific amplification,ASA)及聚合酶链式反应琼脂糖凝胶电泳技术,检测ADHD患者和对照组基因型和等住基因的频率分布.结果:DRD4基因-521C/T的基因型及等位基因频率分布在ADHD组与正常对照组存在显著性差异(p＜0.05),ADHD组的T等位基因的频率显著高于正常对照组(x2=9.827,p=0.002,OR=1.639,95%CI=1.202-2.234).DRD4基因启动子区2个功能多态性位点-616C/G及-1240L/S的基因型及等位基因频率在正常组与ADHD组的分布无显著性差异(p＞0.05).结论:-521C/T位点与ADHD的易感性存在关联,且-521C/T等位基因是决定ADHD个体易感性的重要因素,含有T等位基因的个体罹患注意缺陷多动障碍的相对风险增高.     

多巴胺D4受体基因与注意缺损多动障碍

为探讨注意缺损多动障碍(ADHD)与多巴胺D4受体基因(dopamineD4receptorgene,DRD4)间的关系,采用Amp-FLP的方法检测了上海地区汉族人群中68例ADHD患者及其父母DRD4的多态性,数据采用基于单体型的单体型相对风险(HHRR)及传递不平衡检验(TDT)进行遗传关联分析.结果表明HHRR分析和复等位基因的TDT检验,均未显示出与ADHD的遗传关联性(P＞0.05).提示上海地区人群中DRD4基因与ADHD无显著性关联。 Abstract:The present study was designed to investigate the association between attention-deficit hyperactivity disorder (ADHD) and the dopamine D4 receptor gene (DRD4).Amp-FLP was used to test the polymorphisms of DRD4 in 68 ADHD children and their parents from Shanghai.The haplotype-based haplotype relative risk (HHRR) and transmission disequilibrium test (TDT) methods were used to analyze the association between DRD4 and ADHD.In our samples we found no significant association between DRD4 and ADHD (P>0.05).Our results do not support that ADHD is associated with DRD4 in population in Shanghai.     

多巴胺D1受体基因多态性与注意缺陷多动障碍的相关性研究

目的:探讨多巴胺D1受体(Dopamine D1 receptor, DRD1)基因启动子区G-48A、外显子区T1403C两个SNP位点与注意缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder,ADHD)的关联性.方法:选取87名ADHD患者和103名正常对照,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测G-48A和T1403C两个多态性位点的基因型,SPSS13.0软件分析各位点的等位基因及基因型频率.结果:DRD1的G-48A基因型及等位基因频率分布在ADHD和对照组之间有统计学差异(p<0.05),ADHD组中等位基因A频率显著高于正常组(p<0.05).T1403C位点基因型及等位基因频率在ADHD组与健康对照组无统计学差异.结论:DRD1基因G-48A多态性可能与ADHD的发病有关,携带有等位基因A的个体可能更容易患ADHD.T1403C多态性与ADHD的发病无明显相关性.     

多巴胺D2受体基因多态性位点与海洛因依赖的关系

目的:探讨多巴胺D2受体(Dopamine D2 receptors,DRD2)基因3'非翻译区Taq ⅠA、启动子区-141 Ins/Del 2个多态性位点和海洛因依赖的相关性.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)技术检测320例海洛因依赖患者及300例健康对照组的TaqⅠA和-141 Ins/Del2个多态性位点的基因型.采用HaploView4.0及SPSS11.5软件分析这2个多态性位点的基因型、等位基因频率及组间差异.结果:DRD2基因Taq ⅠA位点的基因型及等位基因频率分布在海洛因依赖组与正常对照组存在显著性差异(p<0.01),海洛因依赖组TaqⅠA位点的等位基因A1频率显著高于正常对照组(x2=11.156,p=0.001,OR=1.463,95%CI=1.170～1.830);DRD2基因-141 Ins/Del位点的基因型及等位基因频率分布在海洛因依赖组与正常对照组之间无统计学差异(p<0.05).结论:DRD2基因TaqⅠA位点多态性可能与海洛因依赖有关,携带有TaqⅠA多态性位点A1等位基因的个体可能更容易对海洛因产生依赖.     

多巴胺D4受体基因与注意缺损多动障碍

为探讨注意缺损多动障碍（ADHD）与多巴胺D4受体基因（dopamine D4 receptor gene,DRD4)间的关系,采用Amp-FLP的方法检测了上海地区汉族人群中68例ADHD患及其父母DRD4的多态性,数据采用基于单体型的单体型相对风险（HHRR）及传递不平衡检验（TDT）进行遗传关联分析。结果表明HHRR分析和复等位基因的TDT检验,均未显示出与ADHD的遗传关联性（P＞0．05）。提示上海地区人群中DRD4基因与ADHD无显性关联。     

双生子多巴胺D3受体基因多态性对儿童体成分的影响

均衡的体成分构成对维持机体的健康状态具有重要作用,体成分受遗传与环境因素的共同影响。多巴胺参与摄食、运动及认知等活动的调节,多巴胺D3受体（DRD3）对多巴胺神经通路起关键调节作用,进而对摄食功能发挥作用,从而可能对体成分产生影响。为了解遗传与环境因素对双生子儿童体成分的影响,并探讨DRD3基因单核苷酸多态性（SNP）与体成分的相关性,对160对4-12岁双生子肱三头肌皮褶厚度（d₁）、肩胛下皮褶厚度（d₂）、髂前上棘位皮褶厚度（d₃）和体质量（m）进行了测量,计算d₄(d₁+d₂)、d₅(d₂/d₁),体脂率（P_f）、瘦体质量（m_l）;从口腔拭子中提取全基因组DNA;通过Amp FISTR Sino filerPlus试剂盒分析确定卵型;采用SNaPshot技术对DRD3基因4个SNP位点进行检测;使用Mx软件估算各指标遗传度;运用广义估计方程模型分析各指标与DRD3基因SNP的相关性。校正年龄效应后,除个别指标（d₃, m_l）外,男女生指标遗传度（h）学龄前期总体偏低,且某些指标（d₂, d₄, P_f, m_l）的遗传度存在一定的性别差异。d₂分别与rs324029、rs226082存在相关（P<0.05）; d₃分别与rs2134655、rs226082存在相关（P<0.05）;d₅分别与rs2134655、rs167771存在相关（P<0.05）;P_f分别与rs226082、rs167771存在相关（P<0.05）;m_l分别与rs2134655、rs226082、rs167771存在相关（P<0.05）。本研究结果表明,遗传和环境因素对儿童体成分发育均有影响,但遗传效应可能存在一定的发育阶段和性别差异;DRD3基因SNPs与儿童的体成分可能存在一定的相关性。     

多巴胺D2受体基因TaqIB多态性与酒依赖的关系

目的:探讨汉族人群中多巴胺D2受体(DRD2)基因TaqIB多态性与酒依赖的相关性.方法:采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测酒依赖组(80例)和对照组(95例)的DRD2基因TaqIB多态性的基因型和等位基因频率.结果:酒依赖组和时照组的DRD2基因TaqIB多态性的基因型和等位基因频率有显著性差异,等位基因B2的携带者显著降低其嗜酒的发生率(OR:1.636,P＜0.05).结论:本研究提示,在汉族人群中DRD2基因TaqIB多态性与酒依赖存在相关性,TaqIB2等位基因可能是降低酒依赖发病的影响因子.     

高通量测序筛查多巴反应性肌张力障碍家系突变基因

快速发展的高通量测序技术使遗传病家系突变基因的筛查鉴定成为可能,本研究通过全外显子测序、生物信息分析和PCR-测序技术筛选一个多巴反应性肌张力障碍(DRD)家系中可能的致病突变位点,从1 005个低频位点中选出在3个疾病个体至少有一个杂合突变的9个候选SNP,再通过DRD家系12个个体PCR扩增测序验证,新发现突变基因SLC18A1可能是该DRD家系的致病基因。此外,PCR和Sanger测序发现高通量外显子测序和信息分析的SNP分型准确性可高达96.3%,是一种遗传病家系突变基因筛查鉴定高效、准确的方法。     

三穗鸭DRD4基因多态性及生物信息学分析

本实验以三穗鸭为材料,采用PCR扩增并采用直接测序技术对三穗鸭DRD4基因进行SNP多态位点检测,共筛查出4个SNP位点:exon2-C12406T、exon3-A13144G、intron2-C12777T、intron2-T12789C。其中exon2-C12406T、exon3-A13144G位点突变为同义突变。对DRD4进行生物信息学分析表明,突变前后的等位基因频率估算有差异,但其m RNA二级结构预测,蛋白质二级、三级结构预测分析均无差异。     

CDH13基因两个单核苷酸多肽性位点与非小细胞肺癌发生发展的关系

探讨CDH13基因两个单核苷酸多肽性(SNP)位点(rs11646213和rs7195409)与非小细胞肺癌(NSCLC)发生发展的关系。选取2015年6月~2016年6月我院收治的NSCLC患者100例作为观察组,选取同期健康体检人群100例作为对照组。采用实时荧光定量PCR法检测两组患者的CDH13基因启动子区域两个SNP位点(rs11646213,rs7195409);分析两个SNP位点在两组中的分布特征。观察组SNP位点rs11646213等位基因频率和基因型频率与对照组比较差异具有统计学意义(p0.05),观察组A等位基因频率明显低于对照组(76.2%vs 90.4%),差异具有统计学意义(p0.05);SNP位点rs7195409等位基因频率和基因型频率在临床Ⅰ+Ⅱ期和Ⅲ+Ⅳ期患者间比较差异具有统计学意义(p0.05),Ⅰ+Ⅱ期患者G等位基因频率明显高于Ⅲ+Ⅳ期患者(25.8%vs 12.4%),差异具有统计学意义(p0.05)。CDH13基因SNP位点rs11646213的A等位基因缺失可能与NSCLC发生启动有关,SNP位点rs7195409的G等位基因缺失可能与NSCLC的病情发展有关。     

SOX6 基因3'UTR 区野生型和突变型重组质粒的构建与鉴定

目的:构建含单核苷酸多态性(SNP)位点rs1065024的SOX6基因3'UTR双荧光素酶报告基因载体,并用生物信息学软件预测与rs1065024位点区域相结合的mi RNA,为进一步研究此SNP位点的功能及mi RNA与SOX6基因3'UTR区之间的关系奠定基础。方法:提取人全血基因组DNA,以基因组DNA为模板,通过PCR扩增含SNP位点在内的SOX6基因3'UTR片段,经过胶回收纯化后,将回收的目的片段插入双荧光素酶报告基因载体p MIR-REPORT中,再经DH5a转化扩增,挑单克隆进行菌落PCR并进行质粒提取,对质粒进行双酶切鉴定,最后进行DNA测序鉴定。针对SNP进行定点突变,构建出野生型和突变型重组质粒,并用生物信息学软件预测出与SNP位点相结合的mi RNA。结果:经单菌落质粒测序验证显示带有T碱基的SOX6基因3'UTR重组质粒p MIR-REPORT-3'UTR-T构建成功;经定点突变,成功将p MIR-REPORT-3'UTR-T质粒转变为p MIR-REPORT-3'UTR-C,经比对未引入任何其他突变;生物信息学预测显示,rs1065024位点位于mi R-190b、mi R-190a-5p、mi R-451b、mi R-4791与SOX6基因3'UTR的结合区域,其多态的改变可以影响mi RNA与m RNA的结合效率。结论:本研究成功构建了含SNP位点rs1065024的p MIR-REPORT-SOX6-3'UTR野生型和突变型重组质粒,为今后SOX6基因3'UTR的SNP位点的功能及mi RNA与SOX6基因3'UTR区之间的关系研究奠定基础。     

酒精依赖综合征患者DRD2、DRD4和DAT基因多态性的研究

目的:探讨云南地区人群中DRD2(TaqIA、-141C)、DRD4和DAT基因多态性与酒精依赖的相关性.方法:采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)分析技术以及聚合酶链式反应-可变数目串联重复序列多态性(PCR-VNTR)分析技术检测酒依赖组(80例)和对照组(70例)在3个候选基因中的基因型和等位基因频率.结果:上述三个基因多态性的基因型和等位基因频率在酒依赖组和对照组中差异均无统计学意义(P>0.05),对DRD2基因中的TaqIA和-141C进行单倍型分析时发现,Del/Al是一种保护单倍型,能抑制酒依赖综合征的发生.结论:在云南地区人群中,携带有Del/Al单倍型基因的人不易形成酒依赖.     

鸡IGFBP2基因3′UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析

鸡IGFBP2基因3′非编码区(3′UTR)1196CA单核苷酸多态性(SNP)与鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP恰好位于gga-mi R-456-3p的一个潜在靶基因结合位点处,提示IGFBP2基因可能是gga-mi R-456-3p的一个靶基因,且该SNP位点可能影响gga-mi R-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用.为鉴定SNP 1196CA是否为功能性SNP,本研究分别构建了包含该SNP位点C或A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析这两个等位基因在鸡胚成纤维细胞系(DF1)和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;利用mi RNA mimics和inhibitor分析gga-mi R-456-3p对不同等位基因报告基因活性以及内源性IGFBP2表达的影响.结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性和表达均显著高于C等位基因(P0.05);gga-mi R-456-3p仅影响C等位基因的报告基因活性和表达,而对A等位基因的报告基因活性没有明显影响;gga-mi R-456-3p调控细胞内源性IGFBP2基因的m RNA和蛋白质表达.本研究证实IGFBP2基因是gga-mi R-456-3p的靶基因,其3′UTR区SNP 1196CA是一个功能性SNP,它影响gga-mi R-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用.本研究结果对于鸡的分子辅助选择育种及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义.     

香猪5个单核苷酸位点的多态性与产仔数的关联分析

为了寻找影响猪产仔数的功能基因,本研究选取5个候选SNP位点CASI0003452、DIAS0001380、ALGA0071919、MARC0052565和ALGA0045832,采用等位基因特异PCR方法对候选位点的多态性变化进行群体研究。结果表明:香猪群体中C~(452)位点以BB基因型为主,低产群的B等位基因频率明显高于高产群(p0.05),两个香猪群体的B等位基因频率明显高于大白猪(p0.05)。D~(380)位点,两个香猪群的A等位基因频率低于于大白猪,且与乳头数呈弱的正相关;香猪和大白猪群体中A~(919)和M~(565)位点在香猪和大白猪群体中的基因型均为CC型,没有多态性;A~(832)位点两个香猪群A等位基因频率明显低于大白猪(p0.05)。经测序证实D~(380)位点处于C1GALT1基因外显子1中,属于同义密码子突变(GCC→GCU),存在密码子偏好性,可能影响香猪C1GALT1基因的表达,可能与香猪的性早熟有关。C~(452)位于PDIA4基因内含子4中,已知PDIA4基因直接影响繁殖的主效基因ER的结构和功能,推测C~(452)位点的多态性有可能影响PDIA4蛋白的表达,进而干扰卵母细胞成熟、受精及胚胎的早期发育等生理过程。     

PKP2基因突变与致心律失常性右心室心肌病相关

为了探讨血小板亲和蛋白2(PKP2)基因突变与致心律失常性右心室心肌病(ARVC)的关系。选取2011年2月至2017年5月在我院治疗的ARVC患者41例(ARVC组),同时选取50例健康志愿者作为对照组,采用PCR扩增PKP2基因DNA片段,检测PKP2基因突变以及单核苷酸多态性(SNP)位点基因型及等位基因频率。结果显示,ARVC组PKP2基因突变率为29.27%,明显高于对照组的0.00%(p0.05);12例PKP2基因突变共发现了7个突变位点,包括3个错义突变、2个无义突变、1个缺失突变和1个剪接位点突变;ARVC组PKP2基因突变患者室速、LBBB型电轴向上形态室速比例均为83.33%,明显高于非突变患者的37.93%和41.38%,差异具有统计学意义(p0.05);PKP2基因共有2个SNP位点,包括P273和L366P位点,ARVC组和对照组2个SNP位点基因型频率及等位基因频率差异无统计学意义(p0.05)。ARVC患者PKP2基因突变较高,与患者迅速发作有关,而PKP2基因的两个SNP位点(P273P和L366P)与ARVC发病无关。     

北京和东京人群MYO9B单核苷酸多态性差异比较分析

为探讨中国北京汉族人群(CHB)和日本东京人群(JPT)肌球蛋9B(MYO9B)单核苷酸基因多态性(SNP)、单体域和单体型的差异,我们利用人类基因组单体型图(Hap Map)公布的Ⅲ期MYO9B SNP数据,通过Haploview4.2软件选择合格SNP、标签SNP(tagSNP)、估计最小等位基因频率(minimum allele frequency,MAF)及构建单体域,并比较其差异。然后通过Phase2.1软件构建特殊tagSNP位点单体型并行置换检验以比较两个人群所构建单体型的差异。研究结果表明,从CHB及JPT MYO9B中分别筛选出52个及50个合格SNP,其中49个是一致的。两人群合格SNP MAF频数最高组段及最低组段相同,且整体比较无差别(p=0.07)。于两人群MYO9B各构建7个和5个单体域,其中两个基本相同,一个单体域为CHB独有,其余在两人群分布不同但互有重叠。从两人群MYO9B分别筛选出23个及17个tagSNP,其中17个tagSNP相同,另6个SNP在CHB单独成为tagSNP而不与其他SNP相关联。利用两人群MYO9B特殊tagSNP位点共构建10个频率2%的相同的单体型,累计频率分别为51.37%和51.99%,且两者均以TCTCG和TTTCG单体型为主。两人群MYO9B特殊位点单体型构成基本相同(p=0.765)。综上所述,CHB和JPT的MYO9B SNP及单体域特征以共性为主,与人群的地域和种族属性一致;北京汉族与东京人群特殊SNP位点构建的MYO9B单体型构成及频率无差别。     

NLGN3基因多态性与秦巴山区儿童精神发育迟滞的相关性

用来自中国秦巴山区的187例非特异性精神发育迟滞(NSMR)儿童及213例正常对照儿童组成病例对照样本,采用PCR-SSCP结合测序方法,对NLGN3基因上的6个SNP标记位点进行分型,采用关联分析法分析位点多态性与NSMR的关系,进而探讨NLGN3基因多态性与当地NSMR的相关性。单位点分析结果显示rs11795613位点的等位基因频率与基因型频率在NSMR与对照组间均存在显著性差异(p值分别为0.000 9,0.006),其它5个标记均未有显著性差异(p0.05)。单倍型分析表明,rs5981077-rs11795613组成的单倍型和秦巴山区NSMR显著相关(p=0.000 4),与单位点分析结果一致。由此推断,NLGN3基因多态性与秦巴山区儿童NSMR有关,在该基因的rs11795613位点以及rs5981077-rs11795613单倍型块所标记的染色体区段中,可能存在着致病突变位点。     

ERCC5基因miRNA结合部位多态性rs4150390与乳腺癌的易感性分析

本研究旨在探讨切除修复交叉互补基因5(complementation group 5,ERCC5)基因miRNAs结合位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与甘肃地区女性乳腺癌易感性间的关系。以甘肃省散发乳腺癌病例101人和乳腺纤维腺瘤病例101人做研究对象;通过在线软件预测的方法,筛选出ERCC5基因rs4150390 SNP(GA)为研究位点,利用PCR-RFLP方法进行基因组DNA rs4150390位点SNP分型分析。研究结果显示rs4150390 A/G基因SNP与甘肃地区女性乳腺癌易感性无相关性,并且和肿瘤组织ER、PR、Her-2、P53的表达也无相关性。但当乳腺癌患者携带rs4150390突变型基因A/A时与肿瘤组织Ki67阴性表达相关(odds ratio,4.947;95%confidence interval,3.311~7.393;p=0.046)。综上所述rs4150390 A/G基因多态性与甘肃地区女性乳腺癌易感性无相关性。