关于白色链霉菌的筛选与鉴定

白色链霉菌(Streptomyces albus)是链霉菌属的代表种,是白放线菌素、硫藤黄菌素及白真菌素等的产生菌,在放线菌的分类和抗菌素生产上具有一定的意义。已有的文献资料对白色链霉菌典型种的特征描述和鉴定依据,看法不一,概念不清,对白色链霉菌生态问题的意见也有很多分歧。目前,国际上公认的白色链霉菌     

放线菌分类主要参考书

链霉菌鉴定手册,中国科学院微生物研究所放线菌分类组编著,1975年,科学出版社。本书将七百多个链霉菌的种和变种,按形态和培养特征分为14个类群。拟定了简便的查索方法,并附有链霉菌产生     

链霉菌属菌株AS4.693和AS4.702的分类学研究

链霉菌属“Setae”种群原为北里孢菌属Kitasatosporia (Omura,1982)。1992年,Wellington根据16S rRNA序列分析结果将其并入链霉菌属,并建立“Setae”种群。通过对保藏的链霉菌AS 4.693、AS 4.702进行的形态学、细胞化学、分子遗传分类研究结果表明,它们与链霉菌属“Setae”种群中的典型种——西唐链霉菌Streptomyces setae(JCM3304’)具有相似性。它们的rDNA相似性高达100％,证明它们应归属于同一种群。AS.4.693定名为西唐链霉菌不规则新亚种Streptomyces setae subsp.irregularis nov.,AS 4.702定名为西唐链霉菌波曲弗氏新亚种Streptomyces setae subsp.flexuofradiae nov.。     

云南兰坪铅锌尾矿区可培养细菌的分离及其酶活筛选

目的 对云南兰坪铅锌尾矿区样品中的可培养细菌进行分离及初步鉴定,同时挖掘具有酶活性功能的菌株。方法 从兰坪铅锌尾矿区及周边农田采集了20份样品,运用10种培养基进行细菌分离,对分离菌株的16S rRNA基因测序以鉴定其分类地位,再以平板透明圈法检测分离菌株的淀粉酶、纤维素酶、蛋白酶和脂肪酶活性。结果 从20份样品中分离获得了320株细菌,隶属于6个纲、14个目、26个科、39个属,有5个潜在新分类单元。其中链霉菌属的菌株数最多,高达102株,占菌株总数的31.88%,为优势种群;其次为芽胞杆菌属菌株40株,肠杆菌属菌株17株。去重后对165株菌进行酶活检测,有41株菌具有淀粉酶活性,占筛选菌株总数的24.70%,主要为链霉菌属和芽胞杆菌属;有40株菌对纤维素酶具有活性,占筛选菌株总数的24.10%,主要为链霉菌属和芽胞杆菌属;有14株菌对蛋白酶具有活性,占筛选菌株总数的8.43%,主要为链霉菌属和芽胞杆菌属;有12株菌对脂肪酶具有活性,占筛选菌株总数的7.23%,主要为链假单胞菌属。结论 兰坪铅锌尾矿区可培养细菌的种类丰富,且蕴藏着大量具有酶活性的菌株。研究结果为了解兰坪铅锌尾矿细菌多...     

珠江口沉积物来源链霉菌SCSIO 40020中bafilomycins的鉴定及其生物合成基因簇的异源表达

[目的] 从珠江口沉积物来源的菌株SCSIO 40020中分离bafilomycins,并对其生物合成基因簇进行克隆和异源表达研究。[方法] 通过分析菌株SCSIO 40020的16S rRNA基因序列并构建系统发育树以鉴定菌种,以柱层析法和制备色谱法对次级代谢产物进行分离纯化,借助波谱学手段完成单体化合物的结构鉴定,采用生物信息学分析定位bafilomycins的生物合成基因簇,通过筛选菌株SCSIO 40020基因组的细菌人工染色体文库和接合转移将bafilomycins生物合成基因簇导入3种链霉菌进行异源表达,利用高效液相色谱检测异源表达菌株的发酵产物。[结果] 菌株SCSIO 40020被鉴定为链霉菌属菌株,从其发酵产物中分离鉴定了2个单体化合物bafilomycins A₁和D。克隆了链霉菌SCSIO 40020中bafilomycins的生物合成基因簇并推导了其生物合成途径,在3种链霉菌中表达产生了bafilomycins。[结论] 从珠江口环境中获得了一株产生bafilomycins的链霉菌SCSIO 40020,成功建立了该菌株次级代谢产物生物合成基因簇的异源表达体系,并首次在链霉菌Streptomyces lividans SBT18、Streptomyces coelicolor M1154和Streptomyces albus J1074中进行了表达,获得了bafilomycins,为后续bafilomycins结构类似物的生产和链霉菌SCSIO 40020中新结构活性化合物的挖掘奠定了基础。     

本溪山樱根际微生物区系

利用选择性培养基,对本溪山樱(Cerasus sachalinensis)根际微生物进行了分离、鉴定和分类,分析了不同物候期根际微生物区系的变化.结果表明:从本溪山樱根际分离纯化获得的细菌分别属于15个属,以芽孢杆菌属(Bacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、黄杆菌属(Flavobacterium)为主;放线菌的7个类群中,以黄色链霉菌属(Flavus)和白色链霉菌属(Al-bosporus)为主;真菌以毛霉属(Mucor)、曲霉属(Aspergillus)和青霉属(Penicillium)为主.本溪山樱不同物候期根际微生物区系不同,落叶期根际微生物区系最丰富,萌芽期较少.     

假橐吾内生菌分离及其拮抗菌的筛选与鉴定

从菊科植物假橐吾(Ligulariopsis shichuana Y.L.Chen)中分离得到110株内生真菌和26株内生放线菌,依照形态培养特征对菌株进行初步分类鉴定,采用琼脂块法进行拮抗菌株筛选,并对拮抗性最好的2株内生放线菌进行分子鉴定.结果表明:(1)经初步鉴定,将分离到的假橐吾内生真菌合并为86种,分为10个属,其中交链孢霉属和丝核菌属占优势(分别为41.9%和16.3%);内生放线菌分为3个属,其中链霉菌属占优势(92.3%).(2)抗菌活性试验表明,有31株内生真菌分别对细菌、植物病原真菌具有显著抑制作用,全部内生放线菌对靶标菌有抗性,其中菌株wz57和wz01拮抗性最强.(3)根据16S rDNA序列比对结果,菌株wz57和wz01与链霉菌属(Streptomyces griseoplanus)相似性最高,分别达到99.3%和99.5%,初步归为Streptomyces griseoplanus.     

山西运城盐湖放线菌区系研究

从山西运城盐湖分离到中、高温嗜碱或耐碱放线菌120株,对其进行了分类鉴定。根据形态和分类特征（细胞壁化学成分）,分别归入拟诺卡氏菌属（Nocardiopsis）、诺卡氏菌科（Nocediaceae）、小多孢菌属（Micromonospora）、马杜拉放线菌属（Actinomadura）及链霉菌属（Streptomyces）,并将链霉菌归入了11个类群。     

52株链霉菌全细胞蛋白组分的数值分类

全细胞可溶性蛋白的凝胶电泳分析作为细菌分类的一种简便而客观的方法得到了广泛应用,在许多报道中已证明蛋白凝胶电泳分析和DNA-DNA杂交的结果有紧密的相关性.目前在许多属中进行了全细胞蛋白组分的数值分类研究,我们对52株链霉菌进行了SDS-PAGE分析,并以全细胞蛋白组分进行聚类分析,以期在全细胞蛋白组分上探讨链霉菌属内种间及种内不同菌株的亲缘关系.     

亚嗜盐链霉菌新种的鉴定

在分离极端嗜盐细菌的过程中,在含25％NaGI的Gibbons[1]培养基上发现一个放线菌菌落A75,经两代转种之后便不再生长。此菌仅能在含5—8％NaCI的Gibbons培养基上较好地生长,当NaGl浓度高于18％时则完全不生长。经鉴定,此菌株属于链霉菌属中的白孢(Albosporus)类群[2],但它与本类群中的已知种差异明显。在不另外添加NaCl的其它供试培养基上,一般不产生气生菌丝体,对供试碳源均不利用。在5—8％NaGl的Gibbons培养基上孢子丝呈白色,常成圈,幼龄菌落形成同心圆,液体培养菌体呈团状。在普戈二氏基础培养基[3]中添加8％ NaCl,除D-木糖和L-阿拉伯糖外,对多种碳源均可利用,但生长弱。经鉴定认为A75菌株是链霉菌属中的一个新种,命名为亚嗜盐链霉菌(Streptomyces subhalophilus n.sp．)。