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利用最大似然法进行水稻产量性状基因的分子作图 总被引:10,自引:0,他引:10
本研究根据对估计标记-数量性状基因座位(QTL)之间重组率的两种分析方法(矩量法和最大似然法)、两种方差模型(QTL基因型之间的方差同质和异质模型)的分析,揭示了LOD值在标记-QTL连锁检测上所得结果的相关性高于重组率估计值的相关性。采用最大似然法和异质方差模型,估计了水稻产量构成有关的QTL与分布于11对染色体上的51个限制性片段长度多态性(RFLP)标记之间的重组率,并对似然比(以LOD值表示)进行X ̄2检验,发现7个存在显著连锁关系的标记-性状组合,其平均重组率为10.0%。这些标记分布于第1、5、6、8和11等5对染色体上,涉及7个RFLP标记和3个产量构成性状,即每穗颖花数(RG573、RZ617、RG103)、单株穗数(RG64B)和每穗实粒数(RG101、RG244、RG653)。 相似文献
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2015年5月至7月在贵州省梵净山国家级自然保护区采集到6号臭蛙标本,经鉴定为宜章臭蛙(Odorrana yizhangensis)(两栖纲,无尾目,蛙科),属贵州省两栖动物新纪录。本文给出了这6号标本的22项外形特征量度,并描述了其生境特征。基于12S r RNA和16S r RNA基因片段构建的最大似然系统发育树表明,这些标本与宜章臭蛙模式产地标本聚在一起,且他们之间的遗传距离远远小于臭蛙属物种之间的距离。宜章臭蛙在贵州的新记录将促进该物种的分类与谱系地理学研究。 相似文献
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应用经PMA诱导衍生的THP-1巨噬细胞为模型,以单克隆抗体C7B封闭oxLDL上的LDL受体结合位点,结果发现,正常细胞在摄取oxLDL时LDL受体与清道夫受体起协同作用;但C7B作用于蓄积了脂质的THP-1巨噬细胞时,对细胞脂质蓄积程度无明显影响,清道夫受体活性不但不降低反而有所升高,说明由于脂质蓄积LDL受体的作用减弱. 相似文献
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LDL受体对清道夫受体活性的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
应用经PMA诱导衍生的THP-1巨噬细胞为模型,以单克隆抗体C7B封闭oxLDL上的LDL受体结合位点,结果发现,正常细胞在摄取oxLDL时LDL受体与清道夫受体起协同作用;但C7B作用于蓄积了脂质的THP-1巨噬细胞时,对细胞脂质蓄积程度无明显影响,清道夫受体活性不但不降低反而有所升高,说明由于脂质蓄积LDL受体的作用减弱。 相似文献
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为了探究进化模型对DNA条形码分类的影响, 本研究以雾灵山夜蛾科44个种的标本为材料, 获得COI基因序列。使用邻接法(neighbor-joining)、 最大简约法(maximum parsimony)、 最大似然法(maximum likelihood)以及贝叶斯法(Bayesian inference)构建系统发育树, 并且对邻接法的12种模型、 最大似然法的7种模型、 贝叶斯法的2种模型进行模型成功率的评估。结果表明, 邻接法的12种模型成功率相差不大, 较稳定; 最大似然法及贝叶斯法的不同模型成功率存在明显差异, 不稳定; 最大简约法不基于模型, 成功率比较稳定。邻接法及最大似然法共有6种相同的模型, 这6种模型在不同的方法中成功率存在差异。此外, 分子数据中存在单个物种仅有一条序列的情况, 显著降低了模型成功率, 表明在DNA条形码研究中, 每个物种需要有多个样本。 相似文献
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水稻亚铁胁迫诱导ADH的基因定位及其遗传分析 总被引:2,自引:0,他引:2
籼稻品种IR64与粳稻品种Azucena及其DH群体135个系用于进行Fe^2+胁迫(250mg/L,pH4.5)及对照实验,对处理及对照条件下的ADH进行基因定位及遗传分析,结果表明,在Fe^2+胁迫条件下,ADH酶的活性大大提高,群体在Fe^2+胁迫条件下,表现低值的超亲现象,分布偏向IR64,单标记分析和最大似然区间作图结果表明,Fe^2+胁迫条件下,11号染色体上紧密连锁的3个标记位点RG 相似文献
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多维协变量具有测量误差的结构回归模型 总被引:1,自引:1,他引:0
提出具有测量误差的结构回归模型,研究可交换条件下多维协变量的测量误差对平均处理效应估计的影响,在没有其它的附加条件下,尽管大多数模型参数不可识别,平均处理效应仍可识别,由于平均处理效应的极大似然估计求解困难,建议在实际中使用拟极大似然估计作为替代。 相似文献
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高胆固醇饲料喂养造成的动脉粥样硬化(As) 模型家兔通过静脉注射人血浆HDL 制剂, 观察HDL 对As家兔肝细胞膜LDL受体活性的影响. 结果发现, 摄取高胆固醇饲料的As 家兔, 其肝细胞膜LDL 受体 Kd 值虽无明显变化但Bmax 值显著减小( P< 0-01 , 与正常对照组比较) ; 注射HDL 制剂后, As 家兔肝细胞膜LDL受体Kd 值仍无明显改变, 但Bmax 值却显著回升( P< 0-01 , 与高脂组比较) . 表明人血浆HDL 具有增加As 家兔肝细胞膜LDL 受体活性的作用. 相似文献
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本文研究H广义线性模型中未知参数的两种估计方法,一种是边际似然函数法,另一种是Lee和Nelder提出来的L-N法.对于一类具有两个随机效应的典型的Poisson-Gamma类模型,在一些正则性条件之下,我们已经证明了其中固定效应卢的L-N估计的强相合性及渐近正态性,并得到了其收敛于真值的速度.针对这类模型,本文进一步给出了其边际似然函数的解析表达式,并且通过Monte Carlo模拟,对模型中固定效应β的边际似然估计和L—N估计进行了比较,模拟表明L—N估计比边际似然估计在拟Poisson-Gamma模型中有着更加优良的表现,具有更高的精度。 相似文献
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DNA似近距离及进化时间的估算 总被引:1,自引:0,他引:1
在似近分析和Nei氏遗传距离的基础上,给出了DNA似近距离计算公式,并以DNA似近距离估算类群间的分歧时间(进化时间),应用10种限制内切酶对猕猴属(genus Macaca)内5个种mtDNA的切点数据计算了这5个种的DNA似近距离和进化时间,比较由DNA似近距,遗传距离构建的歧化树和Fooden及Delson的形态歧化树表明,除遗传距离的歧化树外,其它三种歧化树都有一个共同点,就是熊猴(M.a 相似文献
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遗传标记作图的通用最大似然模型 总被引:2,自引:0,他引:2
作者在构建连锁图谱时,发现Newton-Raphson迭代求解似然方程组,即便纳入合子和配子选择因子,各基因型的估计值仍不能很好的接近实测值,本文提出了一种偏分离遗传标记作图的通用最大似然模型。 相似文献
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氧化修饰低密度脂蛋白与动脉粥样硬化 总被引:8,自引:0,他引:8
动脉粥样硬化的发生发展与低密度脂蛋白受到氧化修饰有关。本文从以下四个方面对本室的工作进行了综述:(1)动脉粥样硬化机体受到脂质过氧化损伤;(2)Ox-LDL对内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞的毒性效应;(3)Ox-LDL和MDA-LDL的比较及与Ox-LDL和MDA-LDL结合的清道夫受体的特征;(4)不同方法对LDL氧化修饰的比较和以LDL氧化修饰为模型对某些物质的抗氧化修饰研究。研究结果为动脉粥 相似文献
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选择理由:最大似然法是一种重要的进化树构建方法。但由于运算量大,使它的应用受到限制。近似的算法可以减少最大似然法的运算量,从而加快运算速度。文章对这种近似方法的可靠性进行了评估。对于最大似然法的运用有重大影响。 相似文献
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天然及氧化修饰脂蛋白对人动脉平滑肌细胞原癌基因表达的影响 总被引:10,自引:0,他引:10
动脉平滑肌细胞(SMC)的增殖在动脉粥样硬化(AS)的形成过程中极其重要。我们在建立人主动脉SMC体外培养方法的基础上,观察了LDL,VLDL及HDL和相应的氧化修饰型脂蛋白对培养人SMCsis,jun,H-ras原癌基因及Rb抗癌基因转录表达的影响。结果表明:(1)HDL对SMCsis,jun,ras基因表达无影响;(2)LDL和VLDL有使这些基因表达增加的趋势;(3)ox-LDL,ox-VLDL和ox-HDL具有使SMCsis,jun,和ras基因表达显著增强的作用(P<0.01),且其作用较相应的天然脂蛋白大(P<0.01);(4)天然和氧化修饰型脂蛋白对Rb基因表达均无影响。据上述结果推测:LDL,VLDL,ox-LDL,ox-VLDL和ox-HDL的致AS作用可能与刺激SMCsis,jun和ras原癌基因表达增加有关。 相似文献
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研究表明:氧化LDL(Ox-LDL)可抑制LPS诱导的巨噬细胞NO释放,而正常LDL和乙酰化LDL则无抑制作用。用谷胱甘肽地的酶模拟物ebselen清除Ox-LDL上的脂氢过氧化物对其抑制作用没有影响。Ox-LDL的蛋白组分对NO释放也没有影响,而脂质组分则有抑制作用。LDL脂质的主要成分亚油酸和卵磷脂无论单独还是共同氧化后对NO释放都没有影响,而亚油酸和胆固醇一起氧化后则对NO的释放有很强的抑制 相似文献
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天然及氧化修饰脂蛋白对人动脉平滑肌细胞原癌基因… 总被引:9,自引:1,他引:8
动脉平滑肌细胞(SMC)的增殖在动脉粥样硬化(AS)的形成过程中极其重要。我们在建立人主动脉SMC体外培养方法的基础上,观察了LDL,VLDL及HDL和相应的氧化修饰型脂蛋白对培养人SMC sis,jun,H-ras原癌基因及Rb抗癌基因转录表达的影响。结果表明:(1)HDL对SMCsis,jun,ras基因表达无影响;(2)LDL和VLDL有使这些基因表达增加的趋势;(3)ox-LDL,ox-V 相似文献
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本文用聚丙烯酰胺凝胶电泳方法,对瑞氏七鳃鳗五种不同组织(骨骼肌、心、肾、肠、鳃)中LDH同工酶进行了分析研究,结果表明,LDH同工酶具有组织特异性,其中骨骼肌中含有五种LDH同。酶,即LDH1、LDH2、LDH3、LDH4、LDH5,鳃含有LDH1和LDH4而肾和心只含有LDH1,肠只含有LDH4。 相似文献
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毒性试验中的剂量与致死百分率平方根反正弦变换仍呈S形,且方差趋于同质, 半数致死量LD_(50)可表示为 Logistic模型参数的函数·因而,通过参数估计值的偏差和渐 过协方差矩阵,可推导出半数致死量LD_(50)的百分偏差,渐近方差和LD_(50)的置信区间.通 过 27个实例分析后建议,若 LD_(50)的百分偏差超过 5%,则 LD_(50)估计值的误差较大 相似文献