实时荧光定量PCR技术及其应用

实时荧光定量PCR技术是一种多色荧光检测核酸定量技术,该简要介绍实时荧光定量PCR技术的原理及其应用。     

实时荧光定量PCR技术及其在植物转基因产品检测中的应用

实时荧光定量PCR技术因其实时、快速、高效和准确定量的优点,已经广泛用于转基因产品定量检测。本文介绍荧光定量探针技术的原理、特点及其在植物转基因产品检测中的应用情况。     

荧光定量PCR

荧光定量PCR又可以分为TaqMan探针和SYBR Green I荧光染料两种方法。比较而言,探针杂交技术在原理上更为严格,所得数据更为精确,荧光染料技术则成本更为低廉,实验设计更为简便。也许作为确认微阵列数据的金标准,TaqMan有些名不副实。TaqMan与SYBR Green孰优孰劣？在选择实验方案时要根据实验目的,以及对数据精度的要求来决定。     

实时荧光定量PCR技术及其在昆虫学研究中的应用

实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction, FQ-PCR)是一种利用荧光信号实时监测体外DNA分子PCR复制过程中每个循环的扩增产物,从而实现对DNA模板进行定量分析的技术,具有准确、快速、灵敏、特异等优点,在动植物基因工程、动植物检疫、微生物鉴定与分类、食品安全检测和医学等领域中得到广泛应用。本文对实时荧光定量PCR技术的原理、优缺点及近年来新的荧光探针的原理、类型进行了评述,并对实时荧光定量PCR技术在昆虫学研究中的应用进行了综述。     

实时荧光定量PCR 技术的原理及其应用研究进展

自从1983年Mullis发明聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)以来,PCR技术很快成为科研、临床诊断的热点技术。但是传统PCR技术在应用中一是不能准确定量,二是容易交叉污染,产生假阳性。直到近年来荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技术     

实时荧光定量PCR技术在检测复发性口腔溃疡患者口腔微生物菌群改变中的应用

目的 研究实时荧光定量PCR法在检测复发性口腔溃疡患者口腔微生物菌群改变中的应用。方法 取一般口腔溃疡患者和复发性口腔溃疡患者的唾液样本,分别使用涂片、革兰染色鉴定和实时荧光定量PCR法进行检测,比较检测方法是否存在差异。结果 复发性口腔溃疡患者口腔中革兰阴性球菌的数量要低于一般口腔溃疡患者（t=0.9841,P=0.0251）,其他类型的细菌则没有明显改变。细菌计数发现复发性口腔溃疡患者口腔链球菌、韦荣球菌、奈瑟菌明显低于一般口腔溃疡患者（t=0.997 4,P=0.004 0;t=0.976 7,P=0.036 6;t=0.998 4,P=0.002 6）。实时荧光定量PCR则进一步证实这个结果。结论 实时荧光定量PCR可应用于检测复发性口腔溃疡患者口腔中的菌群变化,为临床治疗和合理用药提供依据。     

鸭冠状病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

为建立一种鸭冠状病毒（Duck coronaviruses,DuCoV）的临床快速诊断方法,根据鸭冠状病毒1b基因保守区域设计特异性引物,成功建立了用于检测鸭冠状病毒的特异性SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。该方法特异性强、敏感性高、重复性好,对鸭冠状病毒有特异性扩增,最低检测限为8.04×100拷贝/μL,比普通PCR方法敏感10倍,批内变异系数与批间变异系数分别为0.28%～0.34%、0.25%～0.36%,均小于1%。对临床可疑鸭泄殖腔拭子进行检测,本方法与常规PCR方法的检测结果阳性符合率为100%,阴性符合率为96.43%,样本总符合率为97.62%。本研究建立的鸭冠状病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,可用于鸭冠状病毒的临床快速诊断及流行病学监测。     

实时荧光定量PCR及其在传染性疾病检测中的应用

实时荧光定量PCR技术被广泛应用于实验研究、临床检测中。与普通的PCR相比,实时荧光定量PCR技术具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、速度快、全封闭反应等优点。我们综述了实时荧光定量PCR技术的原理、定量方法,及其在传染性疾病检测研究中的应用。     

实时荧光定量PCR技术在曲霉病诊断中的应用

实时荧光定量PCR技术自问世以来,因其具有高度的特异性和灵敏性、可定量、污染少等特点而得到了广泛的应用,此技术用于曲霉的研究也有近十年的历史。本文对近年来实时荧光定量PCR技术在曲霉病诊断中的应用情况进行综述。     

荧光定量PCR技术在临床微生物检测中的应用

荧光定量PCR技术是近些年来发展起来的一种核酸检测技术,它以灵敏度高、特异性强、重复性好、快速准确定量等特点被广泛应用于各个领域。现主要介绍荧光定量PCR技术在病毒、细菌、真菌和寄生虫4个临床微生物检测方面的应用进展。     

实时定量PCR技术及应用

实时定量PCR(Real-tim e Quantitative Polym erase Chain Reaction,RQ-PCR),是20世纪90年代中期发展起来的基于PCR技术的利用不同的荧光检测来给核酸定量的技术。克服了传统PCR的许多不足,能准确敏感地检测模板浓度,DNA拷贝数和检测基因变异。综述了RQ-PCR技术的原理,RQ-PCR实时定量检测系统及应用。     

代谢异速生长理论及其在微生物生态学领域的应用

新陈代谢是生物的基本生理过程,影响生物在不同环境中参与物质循环和能量转化的过程.代谢速率作为生物体重要的生命过程指标,几乎影响所有的生物活性速率,且在很多研究中均表现出异速生长现象.所谓代谢异速是指生物体代谢速率与其个体大小(或质量)之间存在的幂函数关系.代谢异速生长理论的提出,从机制模型角度解释了代谢异速关系这一普遍存在的生命现象.该理论利用分形几何学及流体动力学等原理,从生物能量学角度阐释了异速生长规律的机理,证实了3/4权度指数的存在;但同时有研究表明,权度指数因环境因素等影响处于2/3-1范围之间而非定值.随着研究工作的深入,代谢异速生长理论研究从起初的宏观动植物领域拓展到了微生物领域,在研究微生物的代谢异速生长理论时,可将微生物的可操作分类单元(Operational taxonomic unit,OTU)或具有特定功能的功能群视为一个微生物个体,基于其遗传多样性和功能多样性特征进行表征,以便于将微生物群落多样性与其生态功能性联系起来,使该理论在微生物生态学领域得到有效的补充和完善.尽管细菌具有独特的生物学特性,但与宏观生物系统中观测到的现象表现出明显的一致性.有研究表明,3个农田土壤细菌基于遗传多样性的OTU数的平均周转率分别为0.71、0.80和0.84,介于2/3与1之间,可能与生物代谢异速指数有一定关联,为微生物代谢异速指数的研究提出了一个参考解决方案.鉴于微生物个体特征和生物学特性,在分析代谢速率与个体大小关系中,从微生物单位个体的定义、个体大小表征到计量单位的统一,仍需更多的理论支持.分析了代谢异速生长理论在微生物与生态系统功能关系研究中的可能应用,延伸了该理论的应用范围,并对尚待加强的研究问题进行了评述和展望.     

Real-time quantitative PCR in parasitology

Standard techniques for counting parasites are often time-consuming, difficult and inaccurate, and occasionally unpleasant. Real-time quantitative polymerase chain reaction has recently been applied to parasitology, specifically Plasmodium, Toxoplasma, Leishmania and Neospora. These techniques are truly quantitative, give results over a range of 6-7 orders of magnitude, are quick to perform and require no manipulations post-amplification. They can be used to count genome numbers and to study levels of gene expression. The advantages and limitations of existing thermocyclers and applicable detection systems are discussed here, and promising new developments are highlighted.     

实时定量PCR及其在轮状病毒检测中的应用

实时定量PCR(Real-time polymerase chain reaction/quantitative Real-time polymerase chain reaction,Real-time PCR/qPCR)就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号对PCR进程进行实时监测。它具有特异性强、灵敏度高、定量准确和快速等优点,在生物医学领域中得到广泛的应用。对实时定量PCR技术的原理和类型,实时定量PCR技术在生物医学领域的应用,尤其在轮状病毒诊断、检测及疫苗研究中的应用及其未来前景进行了综述。     

Nucleic acid-based fluorescent probes in microbial ecology: application of flow cytometry

Microorganisms in natural environments have often been treated as 'black box' systems. Researchers have measured the inputs and outputs of the box, and have made bulk measurements on cell behaviour. However, unravelling the details of the diversity and interactions that exist within these microbial populations has proven exceptionally difficult. The information gained from the black box approach has been invaluable, and has allowed models of global foodwebs to be generated and tested. However, there is still little information about the interactions of individual microbial cells within natural populations. Such studies are essential to fully understand the integrated functioning of ecosystems. To achieve this goal, researchers need to be able to identify individual cells within a population, enumerate them, estimate both viability and activity, and monitor changes in response to relevant parameters. Due to the diversity, heterogeneity and numbers of cells that make up these populations, these measurements require automation and speed. At present, the use of flow cytometry in conjunction with nucleic acid probes provides an excellent method with which to pursue such studies.     

昆虫总RNA提取及实时荧光定量PCR方法探讨

本文以褐飞虱Nilaparvata lugens(Stl)为实例介绍了利用Trizol略法作改进用于提取昆虫总RNA的方法,抽提的总RNA利用甲醛变性凝胶电泳、NanoDrop核酸蛋白仪和Agilent 2100 Bioanalyzer分析表明其质量高和完整性好。同时讨论了应用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)进行昆虫时空表达研究中选择参考基因应注意的问题,为相关研究提供参考。