Structure and evolution of a mouse tRNA gene cluster encoding tRNAAsp, tRNAGly and tRNAGlu and an unlinked, solitary gene encoding tRNAAsp

We have sequenced mouse tRNA genes from two recombinant lambda phage. An 1800 bp sequence from one phage contains 3 tRNA genes, potentially encoding tRNAAsp, tRNAGly, and tRNAGlu, separated by spacer sequences of 587 bp and 436 bp, respectively. The mouse tRNA gene cluster is homologous to a rat sequence (Sekiya et al., 1981, Nucleic Acids Res. 9, 2239-2250). The mouse and rat tRNAAsp and tRNAGly coding regions are identical. The tRNAGlu coding regions differ at two positions. The flanking sequences contain 3 non-homologous areas: a c. 100 bp insertion in the first mouse spacer, short tandemly repeated sequences in the second spacers and unrelated sequences at the 3' ends of the clusters. In contrast, most of the flanking regions are homologous, consisting of strings of consecutive, identical residues (5-17 bp) separated by single base differences and short insertions/deletions. The latter are often associated with short repeats. The homology of the flanking regions is c. 75%, similar to other murine genes. The second lambda clone contains a solitary mouse tRNAAsp gene. The coding region is identical to that of the clustered tRNAAsp gene. The 5' flanking regions of the two genes contain homologous areas (10-25 bp) separated by unrelated sequences. Overall, the flanking regions of the two mouse tRNAAsp genes are less homologous than those of the mouse and rat clusters.     

10个线粒体基因在甘蓝型油菜NCa不育系统不同组织中的转录调控及其与育性的关系

用10个线粒体基因为探针,对NCα不育系、保持系和可育F1的苗期叶片、幼蕾及未成熟种子的线粒体RNA进行了Northern分析。结果表明,这10个线粒体基因除atp6外,其余9个基因在同一材料的不同组织中没有表达差异,都属于组成型表达的线粒体基因。其中,off139、orf222、atp1、cox1、cox2、cob、rm5S、rm26S等8个线粒体基因在不育系、保持系和可育F1的苗期叶片、幼蕾及未成熟种子中有着相同的表达,属于表达不受核基因型影响,没有组织特异性的类型：atp9基因分别在同一材料的不同组织中的转录也基本没有变化,但是在3个不同的材料间具有表达差异：可能属于表达受核基因型影响、没有组织特异性的线粒体基因。atp6基因也在3个材料的叶、蕾和种子中都产生相同大小的转录本,但是在各个材料的不同组织中存在着信号强度的差异,可能是属于表达既受核基因型影响、又有组织特异性的线粒体基因。Orf222和off139分别在不育系和可育F1幼蕾中产生相同大小和丰度的转录本,但是在保持系幼蕾中没有检测到转录本;orf222检测到的3条转录本分别为1．1kb、0．9kb、0．6kb,而off139检测到0．8kb和0．6kb两条带。atp9探针在不育系和保持系幼蕾中都检测到1条0．6kb的转录本,而在可育F1幼蕾中检测到0．6kb和1．2kb的转录本。讨论了orf222、off139、atp9基因的表达与NCα细胞质雄性不育的可能关系。     

苎麻atp6和atp9基因的克隆表达及与细胞质雄性不育的相关性

摘要: 根据GenBank报道的双子叶植物线粒体atp6和atp9基因编码区保守序列设计简并引物, 通过PCR技术从苎麻细胞质雄性不育系、保持系和恢复系(简称“三系”) mtDNA中扩增目的基因片段, 发现所得序列开放阅读框虽不完整, 但与GenBank报道的其他植物线粒体atp6和atp9基因同源性分别高于94%和85%。采用DNA Walking步移法分别从3′端和5′端扩增两个基因片段的未知侧翼序列, 分离出完整的苎麻线粒体atp6和atp9基因, 包含了完整的开放阅读框。其中“三系”的atp6基因在mtDNA水平、转录和翻译调控水平、蛋白质水平上均无差异。不育系atp9基因在编码区3′端与保持系和恢复系相比存在若干个碱基的差异和缺失; RT-PCR分析还表明, 不育系atp9基因在现蕾期和盛花期的表达量很高。推测不育系atp9基因的结构变异和/或异常表达与苎麻细胞质雄性不育(CMS)的关系密切。