自动对焦算法评估线虫脂滴图像的研究

自动对焦是实现线虫自动化筛选的一个重要步骤．在光学显微镜系统中,通过采集同一个视野下不同焦面的图像,再通过清晰度评价函数对这些图像进行运算,得到的最大值被认为是最佳对焦位置．在本研究中,对16种常用的自动对焦算法以及最近提出的一些算法进行了评估,通过评估找出最适合线虫脂滴图像的自动对焦算法,从而搭建一套线虫脂滴自动化筛选系统．同时就对焦精度、运算时间、抗噪声能力、对焦曲线等特征进行了分析评价,结果表明,大多数算法对线虫脂滴图像都有较好的表现,特别是绝对Tenengrad算法在对焦精度上有最好的表现,我们将优选该算法应用到线虫脂滴自动化筛选系统中．     

通过光学相干断层扫描图像进行自动视网膜分割评估黄斑水肿的投影面积（英文）

本文提出一种自动视网膜分割方法,以评估光学相干断层扫描(OCT)图像中黄斑水肿(ME)在视网膜特定层上的投影面积.首先使用基于权重矩阵的优化最短路径最快算法对10个视网膜层边界进行分割,这有效降低了算法对血管阴影的敏感性.然而,ME的存在将导致水肿区域的分割不准确.因此,使用强度阈值方法提取每个OCT图像中的水肿区域,并将该区域中的值设置为零,并确保获得的分割边界可以自动穿过而不是绕过水肿区域.同时使用最小值投影来计算ME在不同层的投影面积.为了测试该方法,使用了从Topcon OCT机器收集的数据.在轴向和B扫描方向上测得的黄斑区域分辨率分别为11.7μm和46.8μm.与手动分割相比,视网膜层边界分割的平均绝对误差和标准偏差为(4.5±3.2)μm.因此,所提出的方法为评估水肿提供了一种自动、无创和定量的工具.     

秀丽隐杆线虫体内脂滴的尼罗红染色观察

秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)为常见的生物实验模式之一,也是最近作为研究脂肪沉积的一种较理想的模型,其肠道是脂肪沉积的主要场所。本文使用尼罗红染液对秀丽隐杆线虫体内的脂肪进行染色,在荧光显微镜下可见其肠道周围呈现强烈桔黄色,较好的显示了线虫体内的脂肪沉积部位,为后续研究线虫脂肪沉积的调控机制奠定了基础。     

玄参化学成分研究（英文）

采用硅胶柱色谱、反相柱色谱、凝胶LH-20柱色谱、制备液相色谱等方法从中药玄参中分离得到15个化合物,并结合波谱数据及理化性质对其进行结构鉴定,分别鉴定为:哈巴俄苷(1)、哈巴苷(2)、益母草苷A(3)、6-O-甲基梓醇(4)、京尼平苷(5)、6-O-α-L-鼠李糖基桃叶珊瑚苷(6)、ningpogenin(7),甘草素(8),邻苯二甲酸二(2-乙基己)酯(9),麦芽糖(10),熊果酸(11),丙三醇(12),5-羟甲基糠醛(13),胡萝卜苷(14)及β-谷甾醇(15)。其中化合物3、6、8、9、10、12均为首次从该植物中分离得到。     

后记（英文）

正Half a century ago,the first discovery of the Paleocene vertebrates at Dinghuawu,Xiaoshi,Huaining County opened a door for understanding the Paleocene vertebrate fauna in the Qianshan Basin,Anhui Province,China.Since 1970,colleagues from the Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology(IVPP),Chinese Academy of Sciences have carried out a long term and continuous investigations to the Qianshan Paleocene,with     

贺信（英文）

<正>~~     

柠檬草和肿柄菊叶精油的抗线虫活性（英文）

柠檬草(Cymbopogon citratus)和肿柄菊(Tithonia diversifolia)为引种到我国的热带和亚热带植物。采用水蒸气蒸馏法提取柠檬草和肿柄菊叶精油,得率分别为1.02%和1.05%(w/w)。通过GC和GC-MS分析精油的组成。从柠檬草叶精油中鉴定出20个化合物,单萜和倍半萜占81.25%,精油中含量较高的化合物有:柠檬醛(49.76%)、月桂烯(8.54%)、橙花醇(5.92%)。从肿柄菊叶精油中鉴定出20个化合物,单萜和倍半萜占95.85%,精油中含量较高的化合物有:α-松油醇(20.31%)、1,8-桉树脑(14.67%)、1,7,7-三甲基二环[2.2.1]庚-2-醇(14.32%)、2,6,6-三甲基二环[3.3.1]庚-2-烯(13.51%)和1,1,4,7-四甲基十氢-1H-环丙并[e]薁-4-醇(7.39%)。两种精油对松材线虫、南方根结线虫、全齿复合线虫和秀丽隐杆线虫均表现较强的抑制活性。两种精油对南方根结线虫的抑制活性均最强,用柠檬草精油处理南方根结线虫24 h和48 h,半抑制浓度(IC50)分别为1.068μg/m L和0.747μg/m L;用肿柄菊精油处理南方根结线虫24 h和48 h,IC50值分别为1.118μg/m L和1.039μg/m L。研究结果为揭示柠檬草和肿柄菊精油中的抗线虫成分,以及这两种植物精油作为抗线虫剂的开发提供了依据。     

杀松材线虫海洋放线菌HT-8的鉴定及培养条件的研究（英文）

松树萎蔫病(Pine wilt disease,PWD)是由松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)引起的一种毁灭性疾病,该病对世界上许多国家和地区的针叶林资源造成严重破坏。为了寻找具有高杀松材线虫活性的海洋放线菌,对分离自海洋环境中的放线菌菌株进行杀线虫活性测定。选用稀释涂布平板法对采自青岛近海海域的样品进行放线菌分离,采用浸渍法测定菌株的杀松材线虫活性,并对所筛选出的高杀线虫活性菌株的形态学、培养特征和16S rD NA序列进行测定,运用单因素试验测定菌株产生杀线虫活性物质的最适培养条件。结果显示,从采集的样品中共分离到28株放线菌,经杀线虫活性筛选得到1株具有高杀线虫活性的放线菌HT-8。该菌株分离自海沙,其培养上清液处理松材线虫30 h时,线虫的校正死亡率高达88.30%。根据形态学、培养特征和16S rD NA序列测定及其系统发育分析结果,将菌株HT-8鉴定为Streptomyces termitum。单因素试验结果表明,该菌株产生杀线虫活性物质的最适培养条件为接种体菌龄48 h,接种量6%,培养基海水浓度100%,初始pH 7.5,培养温度25℃,培养时间7 d。该研究为海洋微生物资源的开发及其杀松材线虫天然活性物质的利用提供理论依据。     

脂滴与心力衰竭的研究进展

脂滴(LDs)是脂肪组织的基本单位,广泛存在于真核生物胞浆中,其表面覆盖以Perilipin 1(Plin1)为主的脂滴包被蛋白,在脂滴表面发挥屏障作用,保护脂滴内部甘油三酯及胆固醇酯免受胞浆中脂肪酶分解。近年来研究表明脂滴与心力衰竭关联密切,脂滴包被蛋白缺失可引起机体脂质代谢异常,进而引起心肌细胞结构改变,最终导致心力衰竭发生。这些研究为认识脂滴与心力衰竭间关系提供了依据,本文将脂滴与心力衰竭的研究进展进行归纳。     

脂滴与动脉粥样硬化的研究进展

脂肪组织是哺乳动物最重要的能量储存库,脂滴(LDs)是脂肪细胞的基本单位,是生物体胞浆中重要的亚细胞器,广泛存在于真核生物胞浆中,参与机体能量储存、甾体激素合成、应激等生理过程。LDs不仅存在于脂肪组织,在心肌、肝脏、骨骼肌、睾丸、肾脏等器官和组织中均有表达,其功能不尽相同。近年来研究表明心肌细胞脂滴代谢与动脉粥样硬化斑块发生与发展密切关联,本文将对脂滴与动脉粥样硬化的功能联系及其临床意义的研究进展进行总结。     

家蚕ENF肽致麻痹活性的定量评估（英文）

【目的】麻痹肽(paralytic peptide,PP)是一种在鳞翅目昆虫血淋巴中鉴定到的Glu-Asn-Phe(ENF)肽,将其注入幼虫体内会引发快速僵化的紧张性收缩。本研究旨在确定PP引起家蚕Bombyx mori幼虫活体收缩的最适剂量和最大收缩幅度,并检测诸如背血管搏动速率和离子浓度等可能伴随收缩现象的其他生理指标的变化。【方法】向家蚕5龄幼虫注射不同剂量的PP后,监测其体长收缩幅度和背血管博动速率,并用原子吸收光谱测定血淋巴、脂肪体和肠道的离子浓度。【结果】浓度为50 ng/g动物时,PP引发最有力收缩且不会导致家蚕死亡。最大收缩出现在注射后4~5 min内,同时肠道出现不正常扭曲以及背血管脉动速率下降。此外,细胞外Ca~(2+)是收缩所必需的,PP刺激还导致血淋巴中Cl~-浓度急剧下降而后缓慢恢复。【结论】PP的致麻痹活动不仅引起身体收缩,还会影响家蚕幼虫的肠道和背血管的脉动,而且破坏Cl~-的体内平衡。研究结果为在动物模型中研究PP的生理功能提供参考。     

不同浓度亳菊水提物对秀丽隐杆线虫脂滴凝聚影响观察

目的探讨毫菊对秀丽隐杆线虫脂肪沉积的影响。方法用不同浓度毫菊水提取液配制NGM培养基,培养同步化秀丽隐杆线虫,成虫经油红0染色,异丙醇萃取,测定OD值,并与普通NGM培养基培养的同步化线虫相比较。结果随着浓度的提高,线虫体内的脂肪沉积量呈现出一定的曲线变化,其具体机制有待于进一步研究。     

多原发癌（英文）

目的：探讨多原发癌的病因、临床特点及其诊治。方法：回顾性总结分析了一组普通外科多原发癌病人的资料,并结合文献进行了分析。结果：本组77例多原发癌,占同期普通外科住院病人的1.33%（77/5768）,半数以上发生于65岁及以上的老年人。胃肠道多原发癌占81.8%。其发生主要与下列因素有关：基因缺陷因素（遗传易感性）、环境因素、治疗所致（如放、化疗）、免疫缺陷、老龄。结论：多原发癌近年呈增加趋势,对于肿瘤病人的诊治,不要忽略了同时性癌的可能;手术仍是多原发癌实体瘤主要而有效的治疗手段。     

动态规划算法对GenoCAD设计结果的优化（英文）

Geno CAD(www.genocad.com)是一种基于Web的免费合成生物学设计软件,用它可以进行表达载体及人工基因网络设计。持续点击代表各种合成生物学标准零件的图标,以一种语法进行设计,最后就可以得到由数十个功能片段组成的复杂质粒载体。但是在GenoCAD中,每一类的合成生物学标准零件数量众多。随着这些标准零件的不断开发,其数量也在进一步增加,目前选择合适的零件组装成功能性的质粒载体费时费力并且容易发生错误。在进行载体设计的最后阶段,从众多的零件中选择合适的往往比较困难。为解决这一问题,本文采用了自然语言处理的统计语言模型,它最初用于自然语言识别,用来估算一组词串成为一个正确语句的概率的大小。本文最后以该模型为基础应用动态规划算法优化质粒载体设计,从众多的选项中找出最优者。利用这一方法可以减少进行生物学实验的冗余操作,从而减少载体构建过程中的花费。     

褐马鸡的寄生线虫—等长同刺线虫（Ganguleterakis isolonche）

1984年11月1日作者对山西省芦芽山自然保护区死亡的一只褐马鸡进行剖检,发现体内有30余条线虫寄生,在盲肠的表面见有大量的结节存在,病变部位肿胀充血是造成褐马鸡死亡的原因。经透明鉴定系异刺科等刺属的等长同刺线虫。根据文献记载,Самбон(1908)曾提出褐马鸡及蒙古的雉类(Phasianus chrysomelas)均为本虫的宿主。     

中国兰科植物研究杂记（英文）

中国西藏墨脱县位于东喜马拉雅和印缅交界地区,是雅鲁藏布江大峡谷国家级自然保护区的核心区域,是喜马拉雅生物多样性热点地区之一。该文通过对中国西藏墨脱的科学考察,报道了中国兰科植物2个新记录种,即西藏牛角兰(Ceratostylis radiata)和格当石豆兰(Bulbophyllum psychoon),并提供了描述和图片。西藏牛角兰花为纯白色,花辐射对称,唇瓣3裂,茎长2～2.5 cm,明显区别于该属内其他种。格当石豆兰与齿瓣石豆兰(Bulbophyllum levinei)相似,但不同之处在于格当石豆兰的花瓣卵形,先端锐尖。凭证标本分别保存于西藏自治区高原生物研究所(XZ)和中国科学院植物研究所(PE)标本馆中。2个新记录种原分布均在印度、缅甸和越南等地区,在中国西藏的发现说明了中国西藏墨脱的植物区系和原分布地有一定的关系,同时也印证了中国西藏墨脱属于亚热带地区,且2个新记录种的分布海拔超出了原分布地范围,开花的时间也相对推迟。此新记录种的发现对摸清该区植物种类和丰富中国西藏植物区系提供了更加详实的资料。