南京附近下蜀黄土内腹足类化石的氨基酸外消旋年代测定

一、引言自Bada, Wehmiller和Hare等首先使用氨基酸外消旋反应测定贝壳化石年龄以来,随着实验仪器和实验技术的改进,这一方法得到了较快发展和应用,为第四纪地质古生物的研究提供了新的途径。甚至还有可能为较老地层的划分对比及生态环境的研究提供证据。因此,氨基酸外消旋年龄测试技术逐渐受到人们的关注。自1979年Bada在中国科学院南京地质古生物研究所讲授“贝壳化石的氨基酸外消旋年龄测定”以后,刘德明等(1987)较成功地进行了福建沿海全新世贝壳沉积物的氨基酸外消旋年代测定。本文报道的是南京附近三山矶下蜀黄土内腹足类化石的氨基酸外消旋年代测定,以及氨基酸组份含量与其生态环境的关系。承唐天福教授审阅文稿并提出宝贵建议,臧晓泉绘制图表,笔者在此表示衷心感谢。二。     

论化石氨基酸外消旋比率与纬度的梯度相关关系

成岩温度史不相同的剖面中,标本的氨基酸外消旋比率不可能直接进行对比。为了便于横向对比,根据氨基酸外消旋动力学原理,对长白山孤山屯、陕西洛川、南京三山矶和福建古雷头４个剖面中贝壳化石及沉积物的异亮氨酸Ｄ／Ｌ比率进行了外椎对比,发现同时代的跨纬度剖面中标本的氨基酸Ｄ／Ｌ比率与其纬度的梯度成负相关关系,当前研究有可能为氨基酸外消旋比率的横向对比,跨纬度的不同区域的古温度、古生态的研究提供理论依据。     

论化石氨基酸外消旋比率与纬度的梯度相关关系

成岩温度史不相同的剖面中,标本的氨基酸外消旋比率不可能直接进行对比.为了便于磺向对比,根据氨基酸外消旋动力学原理,对长白山孤山屯、陕西洛川、南京三山矶和福建占雷头4个剖面中贝壳化石及沉积物的异亮氨酸D/L比率进行了外推对比,发现同时代的跨纬度剖面中标本的氨基酸D/L.比率与其纬度的梯度成负相关关系.当前研究有可能为氨基酸外消旋比率的横向对比,跨纬度的不同区域的古温度、古生态的研究提供理论依据.     

福建沿海全新世贝壳沉积物的氨基酸外消旋年代测定

引言十多年来,氨基酸外消旋反应作为年代测定方法已取得了很大进展(Schroeder & Bada,1976),它为第四纪地质的研究开拓了新的前景。对化石贝壳中氨基酸D及L光学异构体的动力学研究表明,氨基酸外消旋反应已成功地应用于更新世以来有海相贝壳沉积的地层划分及对比中(Karrow & Bada,1980;Kvenvolden& Blunt,1979;Miller & Hare,1975;Miller &Andrews,1977;Mitterer,1974,1975;Weh-miller,1977)。氨基酸年代测定方法是基于下述原理:现生生物体中所有蛋白氨基酸,除甘氨酸外,几乎全部以L构型存在,生物死亡后,L-氨基酸自然地经受一种可逆转换而成D-及L-氨基酸混合物,随着时间延续,最后含这两种构型的混     

氨基酸的生产与应用

氨基酸工业是1909年以谷氨酸钠作为一种调味料首先在市场上出售开始的,其后得到不断的巩固和发展。目前,氨基酸的生产产值已达到约十亿美元的水平。氨基酸的生产就其方法而论有蛋白质水解抽(?)法、微生物发酵法、酶法和化学合成法。从化学合成去制取天然L-型氨基酸,通常还要经过光学拆分和D-型异构体的外消旋化两个步骤。氨基酸的最重要用途是用来补充植物性食物和饲料中所缺少的必需氨基酸。我们姑且不谈氨基酸在食品工业上的应用,就是在医药方面作为高营养制剂和治疗药物也变得越来越重要。     

氨基酸的生产与应用

氨基酸工业是1909年以谷氨酸钠作为一种调味料首先在市场上出售开始的,其后得到不断的巩固和发展。目前,氨基酸的生产产值已达到约十亿美元的水平。氨基酸的生产就其方法而论有蛋白质水解抽(?)法、微生物发酵法、酶法和化学合成法。从化学合成去制取天然L-型氨基酸,通常还要经过光学拆分和D-型异构体的外消旋化两个步骤。氨基酸的最重要用途是用来补充植物性食物和饲料中所缺少的必需氨基酸。我们姑且不谈氨基酸在食品工业上的应用,就是在医药方面作为高营养制剂和治疗药物也变得越来越重要。     

非蛋白氨基酸的生物合成及其生物学作用

解释了蛋白氨基酸和非蛋白氨基酸,并着重论述了非蛋白氨基酸的生物合成及其生物学作用。非蛋白氨基酸的生物合成主要通过基本氨基酸合成后的修饰、代谢及消旋作用产生,其生物学作用主要表现在能合成其他含氮物质、储藏氮和运输氮、储能、组成细菌细胞壁、毒性作用及药物作用等方面。     

模拟酶构型聚合物17用于氨基酸外消旋拆分的研究

<正> 引言近些年来,采用液体色谱法拆分氨基酸外消旋体发展很快,在配位交换色谱和固定手性冠醚分离等方法取得了显著的成果。近来,采用含有手性基团的硅石进行复杂氨基酸的逆相色谱和分离工作展现了远大的前景。     

3-(2-萘基)-D-丙氨酸的制备

<正> 在生物界已发现40多种D-氨基酸,其生理作用正为人们逐渐认识。例如D-A.1-a—D-A.1a二肽是各种致病菌细胞壁肽聚糖的组成部分,D-丙氨酸是由丙氨酸消旋酶对L-丙氨酸消旋而来。如果丙氨酸消旋酶的活性被仰制,断绝了D-丙氨酸的来源,细菌     

恶臭假单胞菌丙氨酸消旋酶基因的克隆、序列分析及表达

从恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)200的基因组出发,用PCR方法克隆到两个独立作用的丙氨酸消旋酶基因,称之为dadX和alr。DadX编码357个氨基酸长的多肽,计算分子量为38.82kDa,alr编码409个氨基酸长的多肽,计算分子量为44.182kDa。序列分析显示,DadX的氨基酸序列与Pseudomonas putidaKT2440,铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)和大肠杆菌(Escherichia coli)的DadX比较,相似性分别为96.64%、71.99%、44.88%和47.37%。Alr的氨基酸序列与Pseudomonas putidaKT2440比较,同源性为94.38%,而与铜绿假单胞菌(P.aeruginosa)、鼠伤寒沙门氏菌(S.typhimurium)和大肠杆菌(E.coli)的Alr比较,同源性均较低,分别为22.89%、25.72%和26.44%。在P.putida200的DadX和Alr氨基酸序列中部发现有对于酶活性至关重要的保守区域,如磷酸吡哆醛(PLP)结合位点。DadX和alr在大肠杆菌中得到表达,DadX丙氨酸消旋酶只对丙氨酸有消旋作用,而Alr丙氨酸消旋酶可以作用于丙氨酸和丝氨酸两种底物,且对丝氨酸特异性更高。Alr的表达不依赖于外源启动子,说明在其结构基因上游存在启动子结构。     

荧光假单胞菌TM5-2中D-型氨基酸脱氢酶的鉴定和表达

从荧光假单胞菌TM5-2中得到一个含丙氨酸消旋酶基因的DNA片段(8.8kb),相邻的一个开读框(ORF)与甘氨酸/D-型氨基酸氧化酶基因相似。该ORF经过克隆、表达,并没有检测到甘氨酸/D-型氨基酸氧化酶的活性,推导而得的氨基酸序列与D-型氨基酸脱氢酶序列比较发现,ORF含有D-型氨基酸脱氢酶的所有重要的保守序列。经TTC培养基鉴定,其具有D-型氨基酸脱氢酶的活性,并对一系列D-型氨基酸有作用,最佳作用底物是D-组氨酸。     

氨基酸化学与人的年龄

氨基酸的光学异构体在没有酶的作用下缓慢地、自发地发生消旋化反应。因此,经过较长的一段时间后,不论是纯D型还是纯L型异构体都要转化为L型异构体和D型异构体的等摩尔混合物。每一种L型氨基酸在一定温度下都以已知速率发生消旋化反应。这个事实可用来判断人和动物以及骨骼化石的年龄。例如在牙齿的珐琅质里有一种名为牙质的蛋白质,在体温条件下,其L型门冬氨酸以每年百分之零点一的速     

α-氨基酸的立体有择合成

简述了α－氨基酸立体有择合成中几个代表性方法：消旋氨基酸不对称转化、α,β－脱氢氨基酸不对称氢化、甘氨酸等量体不对称烷化和手性自身再生。引用文献１８篇。     

微生物乙内酰脲酶及其研究进展

乙内酰脲酶是广泛分布在微生物中的一类可降解乙内酰脲酶类化合物的酶系 ,包括乙内酰脲水解酶、N-氨甲酰氨基酸水解酶及乙内酰脲消旋酶。微生物的乙内酰脲酶在结构与组成、立体选择性、底物专一性、反应条件和作用机制等方面有所不同 ,在各种 L-及 D-型氨基酸的酶法生产中具有良好的应用前景。本文对乙内酰脲酶研究及应用的一般情况作了概述 ,并讨论了有关乙内酰脲酶研究的主要研究进展     

氨基酸的消旋研究

在纯乙酸溶剂中,以乙酸酐酰化消旋酪氨酸,消旋温度为90℃,L-酪氨酸和乙酸酐的摩尔比为12,每消旋1gL-酪氨酸时,溶剂乙酸的用量为5mL,效果较好。同样的方法应用于L-脯氨酸,L-苏氨酸,L-缬氨酸,L-赖氨酸,L-半胱氨酸等氨基酸,消旋率均可达到100%。     

氨基酸在临床上的应用

<正> 构成蛋白质的氨基酸,是人体生长发育的重要营养物质,具有特殊的生理作用。氨基酸在营养和保健等方面的用途已被人们所熟悉。由不同氨基酸复合组成的有各种用途的氨基酸输液也在临床上广泛使用。但氨基酸除作为人体的营养要素外,大多数氨基酸各自都有一些特殊的治疗作用。这方面国内尚未见系统的报道。作者根据近几年国内外有关文献,在这里对一些氨基酸在临床上的应用作一综述。     

西黑冠长臂猿粪便微生物宏基因组来源的丙氨酸消旋酶的异源表达及性质研究

丙氨酸消旋酶是异构酶家族中一类重要的酶,既能作为新型抗菌药物筛选的靶标,又是酶法合成D-氨基酸的关键酶之一,有巨大的研究价值.[目的]为挖掘动物胃肠道中未培养微生物的丙氨酸消旋酶基因资源,探究不同微生物来源丙氨酸消旋酶基因及其酶的功能和性质.[方法]本研究从西黑冠长臂猿粪便微生物宏基因组出发,基于序列分析和基因功能注释...     

广西一些第四纪洞穴堆积中化石的氨基酸地质年龄

利用化石中氨基酸的外消旋程度随化石年龄增加而增大的原理,本文分别用“校正法”和“高温法”测定了广西柳州早更新世巨猿洞、中更新世笔架山洞、晚更新世一全新世白莲洞、大龙潭及桂林Chen皮岩的一此处第四纪洞穴堆积物中牙化石、骨化石或贝壳化石的氨基酸年龄,测年结果与其它地质证据或^14C年龄基本一致。     

丙氨酸消旋酶C-端结构域重组体的构建及其功能初探

[目的]将嗜碱芽孢杆菌丙氨酸消旋酶OF4DadX的N-端结构域分别与多个不同种属的丙氨酸消旋酶C-端结构域重组,探究丙氨酸消旋酶C-端结构域功能.[方法]利用基因拼接构建丙氨酸消旋酶重组基因,通过镍亲和层析纯化酶蛋白,采用D-氨基酸氧化酶偶联法检测重组酶蛋白的酶学特性,借助分子筛和HPLC液相色谱分析其聚合状态及动力学...     

Val22对恶臭假单胞菌扁桃酸消旋酶催化活性的影响

恶臭假单胞菌扁桃酸消旋酶的Val22位于20 s环状结构上, 是与底物结合相关的氨基酸之一。其中Val被替换为Arg后酶活性下降了75.9%。除了酶与底物疏水作用减弱以外, 静电排斥作用增强也可能引起活性的下降。利用分子动力学模拟对酶与底物的米氏复合物进行分析, 结果表明: 突变后第22位氨基酸侧链与底物的静电势从0.036 kJ/mol升高至0.124 kJ/mol。这说明氨基酸侧链极性的改变增加了侧链与底物分子之间的静电排斥作用, 因而静电排斥作用也是导致突变体活性下降的原因之一。同时, 突变后系统势能增加了283 kJ/mol, 进一步证实了第22位氨基酸侧链极性和带电性质的改变导致酶与底物结合状态的势能增大, 从而引起活性大幅下降。因此, 将来对酶的结合口袋区域进行理性设计时, 除了考虑空间位阻效应外, 还需考虑疏水作用和静电作用。