交变脉冲电场凝胶电泳分离染色体DNA分子

交变脉冲电场凝胶电泳是一种可用来分离染色体大分子DNA的新的凝胶电泳方法。通过交替采用两个不同方向的不均匀电场,使DNA分子在挤过凝胶筛孔时不断改变方向,从而获得大分子DNA的高分辨率电泳。本文报道用自行设计的交变电场电泳仪进行脉冲电场凝胶电泳分离酵母染色体DNA,可分成11个条带。用自身连接的lDNA作为分子量标准物,可分出14个条带。     

用垂直凝胶脉冲电泳分离染色体DNA

脉冲电场凝胶电泳(PFGE)是近几年发展起来的一种分离高分子DNA片段(50—10000kb)的有效方法。包括正交场,六边形场,反向场和垂直胶脉冲电泳。本文改进了垂直胶脉冲电场(TAFE)的条件,使酵母DCo4染色体电泳核型从11条带提高到14条。利用TAFE鉴定了蛋白酶消化法和TLS法制备的人基因A,其分子长度主要分布在200—450kb。     

中美有机磷杀虫药剂抗性库蚊复合种群酯酶基因扩增的研究(英文)

用脉冲电场凝胶电泳技术,从北京和美国加州的有机磷杀虫药剂抗性库蚊复合品系中分离出一条49kb的酯酶基因扩增片段。该片段可能是一个完整的扩增单元,也是迄今分离出的最大的一条昆虫酯酶基因扩增片段,扩增基因结构的研究正在进行之中。本文还重点讨论了DNA大片段的制备方法和脉冲电场电泳分离技术。     

酵母(Sacchar omyces cerevisiae)的PFG电泳核型比较分析

我们用脉冲式梯度电场凝胶电泳技术,对一些啤酒酵母菌进行了电泳核型分析,比较了不同菌的染色体DNA电泳核型的异同。通过用染色体专一探针做Southern杂交,找出第Ⅰ—ⅩⅥ染色体DNA在PFG电泳图谱中的分布规律,并对一些特殊的电泳和分子杂交现象进行了讨论。     

交变脉冲电场凝胶电泳与植物大分子DNA的制备

介绍了交变脉冲电场凝胶电泳的原理、方法及其在植物大分子DNA制备方面的应用。     

交变脉冲电场凝胶电泳与植物大分子DNA的制备

介绍了交变脉冲电场凝胶电泳的原理、方法及其在植物大分子ＤＮＡ制备方面的应用     

用脉冲电场凝胶电泳分析棉病囊霉及其突变体的染色体DNA

采用交变脉冲电场凝胶电泳和碱变性交变脉冲电场凝胶电泳方法,分析了棉病囊霉酵母菌及其2个不同的突变菌株的核型,得知此菌株含有5条染色体 DNA,而2株突变体的染色体 DNA 都没有大片段的缺失或双链断裂,但其稳定性不如野生型菌株的 DNA,而且存在单链断裂等碱不稳定性位点.     

H_2O_2－Fe~（3＋）所致人淋巴细胞DNA双链断裂损伤

采用脉冲电场凝胶电泳法检测Ｈ２Ｏ２－Ｆｅ（３＋）体系产生的ＯＨ对人淋巴细胞ＤＮＡ的双链断裂损伤．Ｈ２Ｏ２－Ｆｅ（３＋）浓度与ＤＮＡ双链断裂呈明显量效关系;随ＯＨ作用时间延长,细胞ＤＮＡ双链断裂加重;过氧化氢酶对ＯＨ损伤有明显抑制作用．脉冲电场凝胶电泳法可检测到的Ｈ２Ｏ２和ＦｅＣｌ３引起细胞ＤＮＡ双链断裂的最低浓度为０．３ｍｍｏｌ／Ｌ和６μｍｏｌ／Ｌ．     

脉冲凝胶电泳系统及其应用

脉冲凝胶电泳系统是近年来发展起来的一种分离大分子染色体DNA的新型电泳技术。本文介绍了该技术的基本原理以及各种脉冲凝胶电泳系统,并比较了各个系统的优缺点。简要介绍了该技术在酵母、寄生虫以及高等动物染色体DNA的核型分析与基因定位中的应用。     

介绍一种制备管状梯度凝胶的装置

梯度凝胶电泳分离生物大分子具有分辨力高、区带清晰的特点,特别适于分离γ-谷氨酰转肽酶一类膜结合蛋白。此外还可利用浓度梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳测定分子量。目前这种方法多是用垂直平板凝胶。本文介绍一套自制管状梯度凝胶的装置和制备凝胶的方法。用这种方法,既节省试剂     

PCR-DGGE技术在农田土壤微生物多样性研究中的应用

变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)在微生物生态学领域有着广泛的应用。研究采用化学裂解法直接提取出不同农田土壤微生物基因组DNA,并以此基因组DNA为模板,选择特异性引物F357GC和R515对16S rRNA基因的V3区进行扩增,长约230bp的PCR产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)进行分离后,得到不同数目且分离效果较好的电泳条带。结果说明,DGGE能够对土壤样品中的不同微生物的16S rRNA基因的V3区的DNA扩增片断进行分离,为这些DNA片断的定性和鉴定提供了条件。与传统的平板培养方法相比,变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术能够更精确的反映出土壤微生物多样性,它是一种有效的微生物多样性研究技术。     

用脉冲电场凝胶电泳检测电离辐射所致哺乳动物细胞DNA双链断裂

 本文将反向交变电场和六角形电极电场这两种脉冲电场凝胶电泳技术应用于X线照射小鼠乳癌细胞SR-1所致DNA双链断裂的检测,在本实验条件下,用这种电泳都能检测到低至1.5Gy照射所产生的DNA双链断裂,并且用六角形电极电场电泳获得了DNA双链断裂程度与照射剂量之间的良好线性关系,此外,还用此方法观察了不同浓度自由基清除剂DMSO对X线照射SR-1细胞所致DNA双链断裂的保护作用,结果进一步证实本方法的可靠性。     

高压脉冲电场辅助酶法提取鹿托盘胶原蛋白北大核心CSCD

为了提高鹿托盘中胶原蛋白的提取率,采用高压脉冲电场技术辅助胃蛋白酶的方法提取胶原蛋白。以胶原蛋白提取率为指标,通过对胃蛋白酶添加量、脉冲数和电场强度进行单因素考察,采用正交实验对胶原蛋白提取条件进行优化。优选出鹿托盘胶原蛋白的最佳提取条件为:胃蛋白酶添加量2%、脉冲数8、电场强度20k V.cm-1,在该条件下鹿托盘胶原蛋白的提取率可达到(73.27±0.73)%。与普通酶法相比,高压脉冲电场辅助提取胶原蛋白的得率比普通酶法提高了10.34%,且处理时间较短。聚丙烯酰氨凝胶电泳结果表明所提取的胶原蛋白由α1、α2和β-亚基组成,结构特征表明胶原蛋白具有完整的螺旋结构和Ⅰ型胶原蛋白的特性。该研究可为高压脉冲电场用于胶原蛋白的提取提供理论参考。     

高压脉冲电场辅助酶法提取鹿托盘胶原蛋白

为了提高鹿托盘中胶原蛋白的提取率,采用高压脉冲电场技术辅助胃蛋白酶的方法提取胶原蛋白。以胶原蛋白提取率为指标,通过对胃蛋白酶添加量、脉冲数和电场强度进行单因素考察,采用正交实验对胶原蛋白提取条件进行优化。优选出鹿托盘胶原蛋白的最佳提取条件为:胃蛋白酶添加量2%、脉冲数8、电场强度20k V.cm-1,在该条件下鹿托盘胶原蛋白的提取率可达到(73.27±0.73)%。与普通酶法相比,高压脉冲电场辅助提取胶原蛋白的得率比普通酶法提高了10.34%,且处理时间较短。聚丙烯酰氨凝胶电泳结果表明所提取的胶原蛋白由α1、α2和β-亚基组成,结构特征表明胶原蛋白具有完整的螺旋结构和Ⅰ型胶原蛋白的特性。该研究可为高压脉冲电场用于胶原蛋白的提取提供理论参考。     

来自海南等地的17个Bt分离株质粒多样性分析

本研究采用琼脂糖凝胶电泳对分离白海南岛的12个Bt菌株与分离自广西、黑龙江的5株Bt菌株及2株Bt模式菌株进行质粒数量、大小等特征分析.19个供试菌株可区分为16种独特的质粒电泳图谱,充分显示出不同来源bt菌株的质粒多样性.进一步选择了其中的10个菌株,利用包埋法制备琼脂块进行脉冲场凝胶电泳(PFGE),结果表明苏云金芽孢杆菌大质粒组成特征也具有丰富多样性.但是供试菌株的质粒电泳图谱并未体现与地理和生态特征相关联的特征差异.研究结果初步证实海南分离株S3078-1是一株无内生质粒的Bt菌株,而S3031-1和S3073-1两个分离株仅有一个大质粒存在,这三个分离株将为进一步研究质粒功能提供初始菌株.本研究进一步暗示将琼脂糖凝胶电泳和脉冲场凝胶电泳结合起来研究质粒特征提高了结果的可靠性.     

酵母完整染色体DNA分子的制备和脉冲电泳分离

分离完整的酵母染色体DNA分子难度较大。本文采用防止断裂措施制备样品获得满意的效果。样品在垂直交替脉冲电场中电泳,可以分离出清晰集中的12条带,达到能将各条带分別从凝胶回收的水平。同时,对各条带的泳动距离进行了测量。用传统的方法则定的酵母染色体长度作参考绘制的曲线表明,在900kb以下的DNA大分子在交替脉冲电场中泳动距离和分子置成直线反比。这种分离技术在遗传工程和分子生物学的研究方面是很有用的。     

PAHs污染土壤的物理强化修复过程中土壤细菌的响应

采用变性梯度凝胶电泳和荧光定量real-time PCR方法,研究了切换电场对多环芳烃(PAHs)污染土壤进行物理强化修复时土壤中细菌群落的响应。结果表明:施加切换电场有利于土壤PAHs的降解,电极周围的土壤中PAHs的降解率均在50%以上,且电场中心的效果更好。修复过程中土壤中细菌16S rRNA基因拷贝数和多样性指数在电极附近和电极中心土壤之间差异不明显,与对照亦没有显著差异;但细菌种群结构在电极附近和电极中心土壤之间却有明显差异,与对照之间差异尤为显著。施加电场后土壤细菌种群结构的改变可能是这一过程的微生物学机制之一。     

聚丙烯酰胺凝胶电泳的浓缩效应和面包酵母转移核糖核酸的分离

对聚丙烯酰胺凝胶电泳的浓缩效应作了研究。建立了电流密度梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳(CDGGE)。CDGGE不仅在电泳开始时,而且在电泳过程中对被分离的样品有压缩作用,从而提高了分辨率。作者用CDGGE法将面包酵母混合转移核糖核酸分成20条带,并对其中的一些带作了鉴定。     

聚丙烯酰胺凝胶电泳的浓缩效应和面包酵母转移核糖核酸的分离

对聚丙烯酰胺凝胶电泳的浓缩效应作了研究。建立了电流密度梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳(CDGGE)。CDGGE 不仅在电泳开始时,而且在电泳过程中对被分离的样品有压缩作用,从而提高了分辨率。作者用CDGGE 法将面包酵母混合转移核糖核酸分成20条带,并对其中的一些带作了鉴定。     

基因工程

960001 用次级脉冲场凝胶电泳分离大分子DNA[英]/Lai,E.…∥Anal. Biochem. -1995,224(1).-68～74[译自DBA,1995,14(7),95-03698] 报道了用次级脉冲场凝胶(SPFG)电泳在不降低分辨率的情况下提高大分子DNA的分离速度。然而,重复SPFG条件的试验却没有成功。于是人们试图精确限定次级脉冲对分离大分子DNA的作用,以确定该技术用于分离分子量最大为1100kb