纯种犬在15个STR基因座上的遗传多态性

目的:指导纯种犬的繁育及建立一套简便的犬个体识别和亲权鉴定方法。方法:通过设计引物进行PCR扩增及PAGE检测的方法,分析了88头纯种犬在15个STR基因座上的遗传学多态性。结果:15个STR基因座的累积非父排除率(CPE)和累积个体识别率(TDP)分别为0.999678和0.999999999997,而平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.607和0.640。12个STR基因座(PEZ1、PEZ2、PEZ3、PEZ5、PEZ6、PEZ8、PEZ12、FHC2010、FHC2054、FHC2087UbF、HC2132、FHC2611)的多态信息含量(PIC)和杂合度(H)大于0.5,它们的TDP和CPE值分别为0.999999999963和0.999334,能有效用于犬的个体识别和亲权鉴定。结论:这15个STR基因座可以用于指导犬的繁育,其中12个STR基因座能有效用于犬的个体识别和亲权鉴定。     

磁珠法在微量检材DNA提取中的应用

目的:研究磁珠法提取微量生物检材DNA物质的可行性。方法:对汗斑、微量唾液斑、指甲这3类微量生物检材采用磁珠法提取DNA,经过STR荧光复合扩增,ABI310测序仪检测,进行STR分型,以检测提取方法的灵敏度。结果:这3类微量生物检材获得了完整的STR分型。结论:磁珠法提取微量检材中DNA物质的效果较好。     

河南汉族群体6个STR基因座遗传多态性研究

对河南省河南籍汉族群体的6个短串联重复序列（Short tandem repeats,STR)基因座等位基因频率进行研究,得到河南汉族群体F13A1,F13B,D8S1179,CSF1PO,D5S818,TPOX基因座的群体遗传学依据。EDTA抗凝血样采自河南122名无血缘关系的汉族个体,采用Chelex法抽提DNA,PCR扩增,非变性聚丙烯酰胺垂直凝胶电泳,银染显色分析,得到6个基因座的等位基因频率,各基因座的杂合度分别为：0.62,0.46,0.83,0.59,0.78,0.65;人体识别率分别为0.78,0.66,0.95,0.79,0.92,0.82。6个STR基因座具有较高的杂合度,等位基因分布符合Hardy-Weinberg平衡,是较理想的遗传标记,可用于法医学个本识别和亲权鉴定。     

STR 分型应用于病理标本污染的个体识别

目的:通过STR分型,对两例卵巢囊腺癌病理标本的组织细胞进行个体识别,以鉴别其中一例病理标本癌细胞是否源于污染。方法:对甲醛固定石蜡包埋组织,分别切片后在倒置显微镜下,用显微操作系统分离出不同形态的细胞团,对提取的DNA样本进行常规STR扩增检验。结果:经过STR分型比对,证实病理标本存在污染,其中一例的癌细胞来源于另一个体。结论:STR分型是用于病理石蜡包埋组织标本污染个体识别的有效手段。     

近交系剑尾鱼的STR遗传检测技术

目的建立近交系实验用鱼DNA检测方法,用于遗传质量控制。方法以RR-B、RW-H、BY-F三个近交系剑尾鱼的基因组DNA为主要研究对象,并以非选育剑尾鱼作对照,采用STR（short tandem repeat）引物扩增方法检测不同品系在DNA上的异同。设计10对STR引物,优化PCR电泳条件,使用相同的实验条件进行重复,以得到可靠的扩增条带,筛选出特异性引物。结果有4对引物可扩增出稳定条带,1对引物（AY204223）的PCR扩增条带在非选育群中表现多态性,在RR-B与BY-F系表型一致,与RW-H表型不同。这些STR位点能够区分剑尾鱼三个近交系品系。结论STR检测技术可望用于近交系剑尾鱼的遗传质量监测。     

广西融水苗族3个STR基因座的群体遗传学研究

为了解广西融水苗族人群无关个体的3个短串联重复序列(short tandem repeat,STR):HUMCSF1PO,HUMTPOX,HUMTH01遗传多态性分布情况,本文用枸橼酸钠抗凝法采集血样,酚—氯仿抽提法提取DNA,应用复合扩增技术对血样DNA的3个STR基因座进行扩增和检测。结果显示:在三个STR位点共检测出19种等位基因,48种基因型,频率分布分别在0.0024—0.4663和0.0048—0.3173之间;基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。计算种族、民族之间的遗传距离,并对之进行比较得出:广西融水苗族与美国高加索人及美国非洲人存在显著差异,且与美国非洲人之间的差异大于与美国高加索人之间的差异;广西融水苗族与广西侗族的关系近于与其他少数民族的关系。     

间隔子修饰引物对扩增产物电泳行为的作用初探

目的:初步研究利用C3Spacer间隔子修饰引物对扩增产物电泳行为的影响及作用。方法:选取1个常用短串联重复序列(STR)位点,利用间隔子修饰该位点荧光标记引物,以DNA标准物质为模板进行PCR扩增,记录相应扩增产物DNA片段长度,进行修饰与长度变化的相关性分析。结果:选取STR位点D13S317,分别利用TTTTC3SpacerC3Spacer、TTTTC3Spacer、TTTT修饰R0X标记引物,相应扩增产物长度为182.67±0.05、182.19±0.11和181.6±0.19bp,未进行修饰的对照组引物扩增产物长度为177.09±0.15 bp,产物DNA片段长度随不同修饰基团的修饰发生规律性变化。结论:发现了一种修饰基团,用该基团修饰引物后,可在体外通过PCR反应改变扩增产物等位基因片段的大小,从而在不改变特异性引物信息的前提下使产物发生规律性位移,修饰基团与DNA片段大小呈内在相关性。     

北京汉族群体30个常染色体InDel位点群体遗传学及法医学研究

为了调查30个 InDel 位点在中国北京汉族人群中的群体遗传学数据, 并评估其法医学应用价值, 文章采集210名北京汉族无关健康个体外周血样, 提取样本DNA, 采用Investigator ® DIPplex 体系对HLD77等30个InDel 位点进行复合扩增, ABI3130 XL 遗传分析仪进行基因分型, 计算常用法医学参数, 分析群体遗传差异。经 Bonferroni 校正, 30个InDel 位点不存在连锁不平衡现象, 基因型分布符合Hardy-Weinberg 平衡; 各位点DP值为0.2690~0.6330, 累积个体识别力(TDP)为0.999999999985; 三联体累积非父排除率(CPEtrio)为0.98771049, 二联体累积非父排除率(CPEduo)为0.94579456。32例 STR 基因座发生突变的家系样本调查证实上述 InDel 位点未发现突变。结果表明, Investigator® DIPplex 试剂盒中包含的30个InDel 位点在北京汉族群体中具有较好的遗传多态性, 在 STR 存在突变及微量DNA检材等特殊检案中可作为有效的补充检测体系。     

快速STR分型在法医DNA分析中的应用研究进展

STR分型是目前世界通用的DNA指纹分析方法.传统的分型方法包括DNA提取、DNA定量、PCR扩增和对扩增后的STR片段进行检测和分析,耗时较长(8¹0 h).一些情况下很难满足案件的实际需求.法医学家们在加快STR分型的方法研究一直不懈努力.现从快速提取DNA、无提取直接PCR、快速PCR、微流控芯片技术在STR快速分型方面的应用四方面,对近年来出现的可进行快速STR分型的新技术、新方法进行综述.     

封闭群斑马鱼的STR遗传检测技术

目的以AB、LF、ST（本地短尾,short tail）三个封闭群斑马鱼的基因组DNA为主要研究对象,采用STR（short tandem repeat）引物扩增方法分析不同种群在核酸水平的异同。方法利用5对斑马鱼STR引物和3对剑尾鱼STR引物,优化PCR条件,对不同种群斑马鱼DNA进行扩增。结果Z24、Z9384、Z10508、Z20046这4对引物可扩增出稳定条带。除Z24的3对STR引物在群内和群间均表现出多态性。对扩增不同带型进行统计分析,Z20046群间差异显著（P〈0.01）,Z9384有群间差异（P〈0.05）,Z10508扩增结果无统计学差异（P〉0.05）。结论鉴于该方法操作简便,通过进一步研究,可为封闭群斑马鱼的遗传质量评价打下基础。     

胶带纸粘面上汗潜指纹的STR分型检测

目的:建立胶带纸粘面上汗潜指纹的STR分型检测方法.方法:采用EZ1 Tissue试剂盒与EZ1 BioRobot全自动DNA纯化装置提取纯化汗潜指纹中的DNA,低拷贝模板(LCN)STR复合扩增,荧光电泳检测.结果:胶带纸粘面上的汗游指纹可得到完整的powerplex16基因座的STR分型,经磺酸双三嗪类荧光显色液喷雾显现的胶带纸粘面的汗潜指纹可成功进行PowerPlex16位点的分型.结论:成功建立了胶带纸粘面上汗潜指纹的微量DNA检验方法.     

GoldenEye 16BT体系在ABO基因及亲子鉴定中的应用评估

目的:调查湖南地区汉族ABO血型及其基因型,评估GoldenEye 16BT体系在血型与亲子鉴定中的检验能力.方法:以533例亲子鉴定案例为基础,用抗A(B)血清检测1248个个体的血清学血型,观察和分析GoldenEye 16BT体系在ABO基因型检测和15个STR基因座的遗传学数据资料.结果:(1)1248个个体中,1245(97.76%)个个体的血清学血型与基因型检测结果相符,有3例O型血经基因检测发现1例含A基因、2例含B基因 .688名无关个体血清学血型A＞O＞B＞AB,等位基因频率O＞A＞B.(2)GoldenEye 16BT体系累计个体识别能力为0.9999999999999999971,累积非父排除率为0.999999999999971.533例亲子鉴定中有380例肯定亲权关系,153例排除亲权关系;11例中有1个STR基因座发生突变.结论:GoldenEye 16BT体系用于ABO基因型检测与亲权鉴定是高效、可靠的.     

基于有限突变模型和大规模数据的19个常染色体STR的实际突变率研究

短串联重复序列(short tandem repeat, STR)已广泛用于法医学亲子鉴定和个体识别中,但STR的突变可能会影响其结果的解释。在大多数类似研究中,由于忽略"隐性"突变现象,STR的突变率被低估。鉴于此,为获得更加准确的STR实际突变率,本研究使用Slooten与Ricciardi提出的有限突变模型和大规模数据,对28,313例(78,739个体)中国北京汉族已确认亲生关系的亲子鉴定案的20个常染色体STR基因座(D3S1358、D1S1656、D13S317、Penta E、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、Penta D、TH01、vWA、D21S11、D6S1043、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433和FGA;由于有限突变模型中未包含D6S1043的矫正参数,因此本文实际计算其余19个STR基因座的突变率)进行了调查。结果发现,所有基因座均存在突变现象,总计发生1665个突变事件,包括1614个一步突变,34个两步突变,8个三步突变和9个非整步突变。基因座特异性的平均实际突变率在三联体中为0.00007700 (TPOX)～0.00459050 (FGA),在二联体中为0.00000000(TPOX)～0.00344850(FGA)。此外,本研究还分析了表面和实际突变率、三联体和二联体突变率、父源和母源的突变率之间的关系。研究表明,实际突变率多大于表面突变率,而且μ1*/μ2*(表面突变率)的比值通常也大于μ1/μ2 (实际突变率)(μ1*,μ1;μ2*,μ2分别是一步和两步的突变率),即更多的"隐性"突变被释放出来。而且父源和母源的三联体和二联体的突变率也有存在差异。随后,将这些突变率数据与已发表的中国其他汉族人口的相关研究进行比较,展现出了STR突变率的时间与区域差异。由于样本量大,本研究中还报告了一些少见的突变事件,例如同卵双胞胎突变和"假四步突变"等。综上所述,本研究通过大量数据获得了接近真实的STR突变率的估计值,不仅可为中国法医DNA数据库和群体遗传学数据库提供重要的基础数据,也对开展法医学个体识别、亲权鉴定和遗传学研究具有重要的意义。     

广西环江县毛南族九个短串联重复序列基因座的遗传学分析

为了了解广西环江毛南族人群无关个体的九个短串联重复序列:vWA,D18S51,D5S818,FGA,D8S1179,D21S11,D7S820,D3S1358,D13S317基因座的遗传多态性分布情况;本文用枸橼酸钠抗凝法采集广西环江县毛南族200份无亲缘关系的健康个体的血样,Chelex-100方法提取DNA,应用AmpFlSTRIdentifilerTM荧光标记复合扩增技术对血样DNA的九个STR基因座进行扩增,用ABI 3100型遗传分析仪对扩增产物进行检测。结果显示九个STR位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律,累积非父排除率达0.999996,累积个体识别能力达0.99999999996,多态信息总量为0.9999985。结论:广西环江县毛南族人群有自身的STR等位基因分布特征,所获数据可为法医学个体识别、亲子鉴定及群体的遗传学研究提供依据。     

4种快速PCR检测试剂法医学应用的初步研究

采用快速PCR扩增,探索其法医学应用价值.将AmpFLSTRIdentifiler试剂盒分别与4种不同的快速PCR检测试剂联合构建快速PCR体系,以9947A为模板,采用各自优化的循环参数进行扩增,并将各分型结果与常规方法进行比较,结果表明:联合构建的4种快速PCR体系均可获得与常规方法一致的DNA分型结果,扩增用时最短可减少至22 min.可见应用快速PCR方法进行扩增,可获得与常规方法一致的STR分型,并且显著缩短扩增时间,提高DNA分型速率.     

云南怒族STR基因座遗传多态性研究

本文选择9个STR基因座和Amelogenin基因座,利用基因测序,采用基因扫描技术,对云南怒族聚集地区84名无关个体血样进行研究,建立了云南怒族9个STR基因座的基因频率数据库。用χ2检验,9个STR基因座基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。与其他民族资料一样,本课题所获得的云南怒族9个STR基因座数据是一组有价值的DNA多态性遗传标记资料。为建立我国不同民族STR基因数据库提供了资料。 Abstract:In this study,blood samples were randomly drawn from 84 unrelated Nu individuals.The polymorphism of nine STR loci and Amelogenin locus were determined by DNA GeneScan.The genetic database on the distribution of gene frequency on the nine STR loci was established,statistical results showed that the genotype distributions were in agreement with Hardy-Weinberg equation.Compared with other population,the results in our study were of great value in human DNA genetic data instant method with the characteristics of precision and sensitivity.     

骨皮质核DNA分析在法医学中的应用研究

目的:为探讨在白骨化案件的骨皮质中提取到一定质和量的可供核DNA分析的DNA模板,本文从受环境因素和生物因素影响较小的骨皮质中有效地提取到了核DNA,并成功地进行DNA分析,进行个人识别和亲子鉴定.方法:采集10根无关个体胫骨骨皮质,分别用有机法、Chelex-100法、有机法结合Chelex-100法、有机法结合磁珠纯化柱法4种方法提取骨皮质核DNA,用常规荧光标记复合STR基因分型法成功分析骨皮质核DNA,获得满意STR基因座分型.结果:有机法能提取到骨皮质核DNA,进行STR分型时部分样本图谱峰值不均衡;仅用Chelex-100法提取的核DNA得不到STR分型结果或出现较多的等位基因缺失;有机法结合Chelex-100法、有机法结合磁珠纯化柱法提取的核DNA均能成功进行STR分型,没有等位基因的缺失,其中有机法结合磁珠纯化柱法提取的核DNA检测成功率最高.结论:骨皮质中能提取到核DNA,可以成功地进行DNA分析.     

不同亲子鉴定试剂盒对D7S820基因座稀有等位基因检测结果比较

目的：观察分析用不同亲子鉴定试剂盒对D7S820基因座稀有等位基因检测结果的差异。方法：280名不同个体的血样DNA提取和基因型检测,按中华人民共和国公共安全行业标准GA／T382—2002和GA／T383—2002进行;分别用Identifiler试剂盒（美国AB公司）、PowerPlex 18Dsystem试剂盒（美国普洛麦格公司）、GoldeneyeTM20A试剂盒（北京基点认知技术有限公司）,经PCR复合扩增STR基因座,用AB公司DNA序列分析仪电泳分离扩增产物和激光扫描分析。结果：检测到280名不同个体的常用常染色体STR基因座的等位基因。,其中六份样本在D7S820基因座上,Identifiler试剂盒检测的基因型与PowerPlex 18D—system和GoldeneyeTM20A试剂盒检测的基因型结果有差异。结论：不同厂家生产的试剂盒检测常用常染色体D7S820基因座的稀有等位基因存在有一定误差。     

BALB/c小鼠遗传质量检测的新方法

目的比较随即扩增多态性方法（RAPD）、微卫星方法（STR）与生化标记方法对近交系小鼠遗传质量检测的差异,为近交系动物遗传质量控制提供一种分子生物学方法。方法提取近交系小鼠BALB/c基因组DNA,用6条RAPD引物和20对STR引物对其进行PCR扩增,用生化标记法检测13个位点。结果在6条RAPD引物中,引物2（p2）、引物3（p3）、引物5（p5）和引物6（p6）这四条引物扩增的条带出现差异,表现为不同的RAPD图谱;在20对STR引物中,引物2、4、10和11,这四对引物扩增的条带出现差异,表现为不同的STR图谱;13个生化标记位点中,过氧化氢酶-2（Ce-2）等6个生化位点发现杂合基因。结论RAPD和STR可用于验证生化标记方法的实验结果,并用于保证近交系动物的遗传质量。     

5个X-STR基因座荧光复合扩增体系的建立及法医学应用

为了发掘更多多态性高的X染色体短串联重复(X-STR)基因座, 以解决法医学实践中的特殊案例, 建立了一组荧光复合扩增体系, 同时检测DXS6803、DXS981、DXS6809、DXS6789和DXS7132 5个X-STR基因座, 并用ABI PRISM 3100作毛细管电泳和GeneMapper ID 3.1软件进行基因分型, 结果清晰, 灵敏度高, 重复性好。最低检出限为0.25 ng, 10~20 ng模板DNA能得到最佳结果, 在实际检案中能得到满意结果。实验表明, 本体系能为用X-STR基因座解决特殊的亲权鉴定案提供快速鉴定技术, 是常染色体STR、Y-STR等鉴定方法的良好补充, 在法医学实践中有较好的实用价值。