中科院上海植物逆境生物学研究中心招聘蛋白质组学研究人员

正中科院上海植物逆境生物学研究中心蛋白质组学平台应用现代色谱-质谱技术对植物蛋白质翻译后修饰及其相互作用进行分析鉴定,以揭示蛋白质在生命过程中结构和功能的相互关系。在中科院的大力支持下,蛋白质组学实验室装备了高分辨的组合轨道阱质谱仪(Orbitrap Fusion)、四极杆轨道阱质谱仪(Q Exactive),三重四极杆飞行时间质谱仪(TripleTOF 5600)、基质辅助解吸电离串联飞行时间质谱仪(MALDI TOF/TOF)、四极杆气质联用仪(GCMS)和电感耦合等离子体质谱仪(ICP-MS)等先进仪器设备。平台隶属于中组部"千人计划"顶尖人才与创新团队,现承担支持多项国家重大科研项目,包括优秀青年     

后基因组时代的质谱技术

人类基因组测序已完成 ,生命科学研究进入了后基因组时代。今后的人类基因组研究发展趋势是解决基因的功能和不同种族间基因的差异等更为复杂的问题。随之而来的繁重任务迫切需要各种先进技术[1,2 ] 。质谱技术因其具有超高分辨率、灵敏度 ,以及高通量、良好的自动化前景等优点而备受关注。1 .质谱技术的现状质谱仪一般由离子源 ,质量分析器和离子检测器 3部分组成。质谱仪操作可简化为 :产生气相离子 ;按离子的质荷比 (ｍａｓｓｔｏｃｈａｒｇｅｒａｔｉｏ ,ｍ/ｚ)将离子在空间或时间上分离 ;测定不同质荷比下离子的数量。如今针对多肽、蛋…     

选择反应监测技术在蛋白质组学研究中的应用

基于三重四极杆质谱仪的选择反应监测(SRM)技术是一种根据已有信息或理论信息靶向进行质谱信号采集的技术,具有高选择性、高重复性、高灵敏度、宽动态范围等特点,已被广泛应用于蛋白质组学研究,用于生物样本中蛋白质的绝对定量分析.本文对SRM技术的特点、发展过程、在蛋白质组学中的应用现状以及发展前景进行了概述.     

生物质谱结合IMAC亲和提取和磷酸酶水解分析蛋白质磷酸化修饰

蛋白质磷酸化是生物体内非常重要的翻译后修饰方式 ,对磷酸化蛋白质的分析及磷酸化位点的确定有助于理解与其相关的生物功能。基质辅助激光解吸 /电离飞行时间质谱和电喷雾 四极杆 飞行时间质谱这两种生物质谱仪在蛋白质鉴定和翻译后修饰分析中发挥着重要作用。固相金属亲和色谱可选择性亲和提取肽混合物中的磷酸肽 ,结合磷酸酶水解实验和基质辅助激光解吸 /电离飞行时间质谱分析可确定肽混合物中的磷酸肽 ,最后用电喷雾 四极杆 飞行时间串联质谱分析磷酸肽的序列 ,结合数据库检索确定磷酸化位点。     

集胞藻Synechocystis sp.PCC 6803脂质组的分析

以集胞藻Synechocystis sp.PCC 6803为研究对象,研究建立了基于超高效液相色谱耦合串联质谱技术脂质组学分析方法.鸟枪法脂质组学通过电喷雾离子化有效分离油脂粗提物中所含单个脂质分子,在三重四极杆扫描碎片离子,能够利用特征片段离子鉴定光合甘油酯的种类和酰基组成,具有高效、灵敏度高和质量准确度高等优点.对...     

二次离子显微镜及其在生物医学中的应用

二次离子显微镜是由离子源激发样品表面原子产生二次离子,通过质谱仪将不同原子产生的离子分离并在显示系统上成像,以确定不同元素在样品中的分布图。较高的图像分辨率(0.5—1μm)和极高的灵敏度(浓度低于10^-19g/μm³)使得生物样品含有极低浓度甚至是痕迹量的元素分析成为可能。目前,二次离子显微镜已广泛应用于细胞生物学、核医学、植物生理学和人类病理学等领域。     

桂枝茯苓胶囊HPLC-ESI-QTOF/MS化学成分分析过程中提取溶剂的优化

采用高效液相色谱电喷雾四极杆飞行时间串联质谱(HPLC-ESI-QTOF/MS)对桂枝茯苓胶囊中的化学成分进行分离和鉴别。运用Agilent Eclipse XDB-C18(4.6 mm×250 mm,5μm)色谱柱,以0.1%甲酸水溶液-乙腈为流动相梯度洗脱;使用ESI离子源,正离子与负离子模式下采集数据。根据Q-TOF/MS正、负离子质谱信息、通过元素组成分析、化合物同位素分布验证和对质谱裂解碎片解析并与相关文献对照,鉴别了桂枝茯苓胶囊中18个化合物。本法为桂枝茯苓胶囊中的化学成分分析提供了一种快速、有效的方法。     

离子阱串联质谱仪质荷比测量误差统计分析

离子阱串联质谱仪是蛋白质组研究中一种高通量,高灵敏度的分析仪器。目前对影响离子阱质谱仪质荷比测量误差的因素和数据产出后系统误差的校正方法还没有系统的分析。利用两批蛋白质标准品的数据和统计方法分析了离子阱质谱仪质荷比测量误差的分布规律,对测量的质荷比和信号强度对测量误差的影响进行了分析。在此基础上,提出了一种对质谱数据进行系统误差再校正的方法和一种根据信号强度确定误差容限的模型。     

纳升电喷雾串联质谱技术对阻断泛素通路诱导凋亡相关蛋白质的鉴定

应用毛细管液相色谱 电喷雾 四极杆 飞行时间串联质谱和纳升电喷雾 四极杆 飞行时间串联质谱技术 ,对阻断白血病细胞泛素通路诱发的凋亡相关蛋白质进行了鉴定。通过双向电泳发现 ,蛋白质斑点H在阻断Mo7e白血病细胞泛素通路 2h之后 ,表达量明显增加 ,6h达到最高。该斑点经MALDI TOF MS肽质量指纹谱分析未获结果 ,但通过上述 2种串联质谱技术获得其胰蛋白酶水解肽段的串联质谱图和肽段的全长序列 ,经检索均确认为RhoGDIβ蛋白。进一步发现阻断泛素通路还诱发了另 2个斑点出现 ,位于H点附近 ,经鉴定为同一蛋白质 ,可能是不同翻译后修饰所造成     

UPLC-Triple TOF-MS方法鉴定野漆树苷在大鼠体内的代谢物

目的:分析野漆树苷在大鼠体内的代谢产物结构。方法:大鼠灌胃给予野漆树苷96 mg/kg后,收集0~24h尿液及粪便样品,应用超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱(UPLC-Triple TOF-MS)技术分析野漆树苷在大鼠体内的代谢产物。结果:共检测到了除原型药的4个代谢产物。经过对野漆树苷可能代谢产物的母离子和碎片离子的准确分子量及裂解规律的解析,并结合黄酮类化合物的可能代谢途径,推断出了这些代谢产物的结构。结论:上述实验结果将为血浆代谢产物的寻找提供靶标,为野漆树苷体内物质基础的确立以及体内代谢途径和代谢机制的研究提供重要的参考。     

沃特世宣布收购REIMS技术

<正>沃特世公司近日宣布收购MediMass公司的快速蒸发电离质谱(REIMS)技术。REIMS技术实质上代表了MediMass的所有资产,包括专利申请、软件、数据库和REIMS专业知识。此次收购将显著增强沃特世在健康科学领域的技术地位,并有望实现跨领域应用。REIMS是一项电离技术,可作为质谱仪直接进样分析的离子源。目前,REIMS技术已经能够帮助用户在实际应用(例如食品安全、微生物学和临床诊断应用)中实现常压敞开式电离取     

超高效液相色谱——质谱联用测定果酱中纳他霉素的残留

纳他霉素(Natamycin)是一种的新型生物防腐剂,它有高效、安全、广谱等优点,对食品中污染的霉菌、酵母等真菌有很强的抑菌效果。本文笔者系统的介绍了利用液相色谱一串联四极杆质谱技术对果酱中纳他霉素的测定方法。     

Life Technologies推出台式基因测序仪,实现1000美元解码人类基因组

近日,Life Technologies公司推出了新型台式基因测序仪Ion ProtonTM。该款测序仪采用新一代半导体测序技术,拥有快速、简单及可扩展等特征,能有效推进临床研究在癌症及遗传性疾病等诊断中的发展。借助该技术产品,只需1000美元即可在一天时间内完成个人全基因组测序。目前,使用传统的光学测序技术对人类基因组进行     

AB SCIEX发布Triple TOF 5600

AB SCIEX TripleTOFTM5600系统的问世,它是一项开创性的质谱分析技术,是史上最快速且最灵敏的高分辨定性、定量分析质谱仪。此系统代表着质谱领域一个重要的革命,即它是世界上第一台将三重四级杆定量分析能力以及高分辨定性能力整合在一个平台上的精准质谱系统。     

UPLC-Q-TOF-MS快速鉴定黄山野生绞股蓝中皂苷类物质

为鉴定黄山野生绞股蓝中皂苷类成分,为黄山野生绞股蓝的开发利用提供理论基础。实验选取超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱联用技术(UPLC-Q-TOF-MS),采用waters Acquity HSS T3色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.8μm),以0.1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)为流动相,梯度洗脱。质谱采用电喷雾(ESI)离子源,在正离子模式下采集数据,首先选取4种具有达玛烷型结构的皂苷标准品进行分析,总结达玛烷型皂苷类物质质谱裂解规律及特征离子碎片信息,再依据这些规律快速鉴定黄山野生绞股蓝中的皂苷类物质。从黄山野生绞股蓝中共鉴别出25种皂苷类物质,其中有6个化合物在该植物中属首次发现。     

粘虫蛾复眼背、腹区视杆结构的差异

根据光学和电子显微镜的观察,粘虫蛾复眼背、腹区域的视杆结构具有以下主要差异:1)背方小眼视杆的长度短于腹方小眼视杆的长度。2)在横切面上,背方小眼视杆的中段近似方形。该段间细胞的视小杆为三角形,每个具有平行排列的微绒毛。整个视杆包含两个互相垂直的微绒毛轴。腹方小眼视杆的中段为风扇形。间细胞的视小杆为“V”字形,微绒毛排列不平行。3)背方小眼基细胞的视小杆几乎位于气管反光层远侧,而腹方小眼甚至延伸到气管反光层内。 在背方和腹方小眼视杆的内段,每个间细胞的微绒毛均平行,且排列在基细胞的大形视小杆周围。更深层,在其它细胞的轴突均已相继出现的水平上,基细胞的大形视小杆仍然可见。 最后,对形态上的特点,在功能上可能具有的一些意义也进行了初步讨论。     

废水中类固醇物质的LCMSMS检测方法优化及其在养殖废水检测中的应用

以固相萃取为预处理手段,用高效液相色谱 串联四极杆质谱联用技术,针对澳大利亚南威尔士州畜牧业废水中的丙酸睾酮等13种类固醇化合物含量建立了分析方法.采用大气压化学电离源,在正离子模式下,对色谱条件和质谱条件进行优化,其中,丙酸睾酮等7种化合物以质子化的准分子离子峰［M+H］⁺、另6种化合物以产生了脱去水的离子峰［M+H-H₂O］⁺为母离子进行二级质谱扫描,以最大丰度确定定量离子对.结果表明：该方法所建立的13种化合物的9点标准曲线的线性相关范围为1～1000 ng·ml^-1,在该范围内,相关系数均>0.9990;各化合物的平均回收率在83.75%～111.50%,相对标准差2.02%～14.21%;除美雌醇和雌三醇的灵敏度相对较低,检测限高于15 ng·ml^-1外,其余物质的检测限均低于5 ng·ml^-1;实际样品测定时,不同处理流程中各化合物的浓度均能得到较好体现,该方法能满足检测要求.     

斑马鱼体内离子检测方法的研究进展

斑马鱼作为新型模式生物被广泛利用在生命科学研究领域,本文综述了近年来活体斑马鱼体内离子的新近标记方法和观测技术。近年来,人们利用斑马鱼生物特性上的诸多优点,采取多种方式对各种离子在斑马鱼体内的转运和代谢进行动态观察,以期更好了解生理或病理状态下特定离子的转运特征,从而分析相关生理现象或疾病产生的机制。与此同时,伴随着成像观测技术及相关设备的快速发展,对斑马鱼体内的离子检测方式也有了全新的变化。     

广陈皮外源真菌的组成及产毒真菌分析

[背景]广陈皮为药食同源中药材,在高温、高湿且贮存不当的条件下容易发霉,从而产生毒素,严重威胁陈皮的质量安全.[目的]分析广陈皮表面外源真菌的组成及其产生毒素的真菌.[方法]采用平板稀释法分离广陈皮表面外源真菌,利用分生孢子形态特征及DNA序列分析进行真菌鉴定,采用高效液相色谱-三重串联四极杆质谱联用技术对青霉属和曲霉...     

人体组织反射光谱的检测研究

反射光谱是一种非侵入式的光学技术,可提高癌症实时反馈和诊断效率。本文综述了基于反射光谱技术在人体皮肤、口腔、肺、鼻咽等组织疾病的研究概况,包括离体组织和活体组织反射光谱的检测,展望了发展前景。