不同系统聚类算法对昆虫包涵体病毒模式的识别

随着分析微生物学技术的不断发展,毛细管裂解色谱法（PyrolysisGaschromatography,简称pyGC）业已用干鉴定微生物［‘－‘1和分析鉴别化学成分、结构极为复杂的生物大分子［’］,并证明了利用nyoc分析鉴定昆虫包涵体病毒的可行性K］。系统聚类分析是统计模式识别的重要方法之一,已广泛应用于化学模式的识别。我们使用欧氏距离系数的8种常规系统聚类算法,对48株典型昆虫包涵体病毒株,即26株核型多角体病毒（NPV）、13株颗粒体病毒（GV）和9株质型多角体病毒（CPV）,用PyGC制备的气象色谱（GC）图进行聚类分析,并对不同聚类算…     

用裂解气液色谱法鉴定昆虫包涵体病毒的初步研究

用Shimadzu GC-9A气相色谱仪和PyR-2A管式炉裂解器,对11株昆虫包涵体病毒进行了裂解气相色谱鉴定,通过对“指纹图”的分析,既可明显地区分GV、NPV和CPV包涵体病毒彼此间的差异,亦可较好的区别不同分离株间的异同,实验结果初步证明,用裂解气液色谱法分析、鉴定昆虫包涵体病毒是可行的。     

昆虫病毒

应用昆虫病毒防治农林害虫是微生物工作中心的研究领域,也是很有发展前途的微生物杀虫剂。据不完全统计,国内已发现的昆虫病毒有130种,分属 NPV、CPV、GV,全国有50个科研和教育单位在从事此项研究。目前单棉铃虫 NPV 在江苏、湖北、河北等省的使用面积已达20多万亩。莱青虫     

宁夏地区犬细小病毒的分离鉴定及其VP2基因进化分析

犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)具有高度传染性,是幼犬最危险的消化道传染病病原之一。为了解宁夏地区CPV的流行现状及其VP2基因的遗传变异情况,本研究采集了14份经胶体金试纸条检测为CPV阳性的腹泻犬粪样,进行病毒分离和鉴定,并将分离株VP2基因全序列进行克隆和测序分析。结果显示,14份样品中成功分离到5株CPV;病毒TCID50在104.9/0.1mL～105.4/0.1mL之间;HA效价均达1∶512以上;序列分析显示,5株分离株中3株为new CPV-2a型,2株为new CPV-2b型;分离株与参考株的核苷酸和氨基酸相似性分别为98.2%～99.9%和96.9%～99.8%;聚类分析显示,分离株序列全部聚类在同一分支。本研究的结果为我国西北地区CPV分离株的分子流行病学和遗传多样性提供了依据,有助于该地区预防和控制CPV感染。     

11株核型多角体病毒的裂解气相色谱分析

本文介绍了茶毛虫、蓖麻蚕,棉铃虫、斜纹夜蛾、黑点银纹夜蛾以及美国白蛾等6种昆虫的11株核型多角体病毒裂解色谱图的绘制方法。通过指纹图的分析,可明显地鉴别(区分)相同亚群的不同毒株。11株核型多角体病毒既有峰群的特异性,亦有峰高比值的特异性。指纹图分析结果表明,它们是各不相同的毒株,证明了裂解气相色谱法分析鉴定核型多角体病毒的可行性。     

系统聚类分析在细菌全细胞脂肪酸模式识别中的应用

用欧氏距离系数和指数相关系数,结合8种常用的系统聚类算法,对用毛细管柱气相色谱祛绘制的34株莫拉氏菌(Moraxella)及其类属菌和13株嗜肺军团杆菌(Legionella pneumo-phila)的全细胞脂肪酸气相色谱图,进行了聚类分析。比较了欧氏距离系数的8种系统聚类算法所得的聚类树状谱。结果表明,奠拉氏菌与嗜肺军团杆菌可以明确区分。在奠拉氏菌中,我国分离的两个新种与目前该属的主要标准株也能明确区分。两种相似系数中,欧氏距离系数的聚类结果较好;8种系统聚类算法中,最长距离法和类平均法的聚类结果较好。     

昆虫病毒在害虫防治上的应用及其对寄生蜂的影响

本文综述了昆虫病毒,包括核多角体病毒(NPV)、昆虫痘病毒(EPV)和颗粒体病毒(GV),在防治农林害虫中的应用及其对寄主寄生蜂影响的研究进展,同时也介绍了昆虫杆状病毒诱导细胞凋亡及基因工程研究的近况.     

松毛虫CPV不同分离株的基因组电泳图谱

综述了松毛虫CPV不同分离株基因组电泳图谱的研究状况。松毛虫CPV是松毛虫Dedrolimusspp .的重要病原微生物 ,在松毛虫灾害治理中起着重要作用。病毒基因组电泳图谱是CPV重要的分类依据和研究基础。到目前为止 ,全世界范围共分离报道了 1 0株不同的松毛虫CPV ,基因组电泳图谱研究表明CPV -1型是松毛虫CPV的主要类型。PAGE分析显示 ,松毛虫CPV不同分离株中至少存在有 3种不同CPV -1的型内变异 ,它们有时以纯一型或混合型的形式出现。特别需要指出的是中国马尾松毛虫CPV分离株 ,其存在有 2种不同形态的病毒多角体 ,通过蔗糖密度梯度离心可以分为上下 2条带 ,上带多角体为锥形 ,基因组dsRNA电泳图谱显示 1 3条带 ,不属于目前已确定的 1 4种电泳型中的任何一种 ;下带多角体为六边形 ,基因组为纯合的CPV -1型 ;另外在不同时期不同地方感染马尾松毛虫也分离得到了纯合型的马尾松毛虫CPV -型     

松毛虫质型多角体病毒的宿主域与交叉感染

自1956年从赤松毛虫Dendrolimus spectabilis上首次发现赤松毛虫质型多角体病毒1型（D. spectabilis cytovirus 1,DsCPV-1）以来,先后从马尾松毛虫D. punctatus、油松毛虫D. tabulaeformis、赤松毛虫、德昌松毛虫D. p. tehchangensis、文山松毛虫D. p. Wenshangensis和落叶松毛虫D. superans上发现了质型多角体病毒(cytoplasmic polyhedrosis virus,CPV)。病毒基因组dsRNA电泳图谱分析表明,这些松毛虫CPV的不同分离株均属于质型多角体病毒1型（cytovirus 1）。这些松毛虫CPV病毒可以感染鳞翅目10科35种昆虫,其中对多种昆虫具有很高的感染力和良好的杀虫效果,可以从中筛选替代宿主生产松毛虫CPV杀虫剂,用于害虫生物防治。松毛虫CPV接种某些昆虫后病毒的基因组dsRNA电泳图谱发生了改变,可能是异源病毒诱发了宿主自身潜伏型病毒的感染复制。     

不同PRRSV毒株间ORF1a基因密码子偏爱性差异分析

运用CodonW、ClustalX、TreeView软件及EMBOSS（,rIleEuropean MolecularBiologyOpenSoftwareSuite）、CIMMiner在线分析软件对选取的29株PRRSVORFla基因进行密码子偏爱性聚类分析．CAI、CBI、Fop、Nc、GC3s和GC含量、基因长度等相关性分析显示PRRSV各毒株编码的ORFla基因密码子偏爱性各有差异,其中Lelystadvirus、LV4-2．1、VR-2332、RespPRRSMIV与国内分离的高致病性PRRSV变异株之间差异较大．密码子使用概率聚类分析表明CC．1、NVSL．97．7895、CH—1a、RespPRRSMLV、LV4．2．1、Lelystadvirus与高致病性PRRSV变异株距离较远．而国内分离株相互间的聚类距离则较接近。此结果与基于氨基酸序列比对构建的系统进化树图谱基本一致．由此可见．PRRSV病毒ORF1a基因密码子使用偏爱性的差别与病毒的遗传多样性密切相关．     

毛细管气相色谱分析昆虫病毒包涵体中的脂肪酸

病毒脂肪酸的定性和定量,可作为病毒分类鉴定的辅助证据。有关细胞脂肪酸的研究已有报道［１～２］,但对病毒多角体（ｐｏｌｙｈｅｄｒｏｎｓ）和颗粒体（ｇｒａｎｕｌｅｓ）中脂肪酸成份的研究尚未见报道。本研究在病毒单糖分析的基础上［３］,用毛细管气相色谱法,对...     

Identification of two nuclear polyhedrosis viruses from the cabbage moth, Mamestra brassicae (Lepidoptera: Noctuidae)

Two nuclear polyhedrosis viruses from the cabbage moth Mamestra brassicae found in two geographical areas in Europe have been characterized and compared. These two virus isolates have similar biological activities and have the same host range. The two M. brassicae nuclear polyhedrosis viruses can be distinguished by restriction endonuclease analysis of their DNA. They appear to be distinct but related virus strains.     

SUSCEPTIBILITY OF LARVAE OF THE LARGE WHITE BUTTERFLY (PIERIS BRASSICAE L.) TO TWO VIRUS DISEASES

A cytoplasmic polyhedral virus ex Phalera bucephala (L.) induces a polyhedrosis in some stocks of Pieris brassicae (L.). Larvae from different localities vary in their susceptibility to their own viruses and the stock of Pieris brassicae larvae most susceptible to its granulosis is also more susceptible to the polyhedrosis.
Polyhedra obtained from Pieris brassicae , infected from Phalera bucephala , did not cause a cytoplasmic polyhedrosis in larvae of Plutella maculipennis (Curtis) and Pseudaletria unipuncta (Haw.), but did do so in the larvae of Lymantria monacha (L.).     

杨尺蠖核型多角体病毒蛋白质的特性

本文研究了杨尺蠖核型多角体病毒(AciNPV)蛋白质特性,用反复调等电点法,从AciNPV的多角体蛋白中分离到A,B两种蛋白,Sepharose 6B柱层析和超离心沉降分析表明,两者均为一个峰纯,沉降系数(S20w)分别为4.9和8.9,对A蛋白进行了16种氨基酸组成分析,Glu、Asp和Leu含量高于其它氨基酸,不含Cys,用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳和免疫双扩散法分析表明,用两倍体积饱和硫酸铵沉淀法制备的多角体蛋白,与提纯的多角体A、B蛋白之间无差异,多角体蛋白结构多肽由6种组成,分子量在12500—54000道尔顿范围内,其中32000是多角体蛋白的主要多肽,病毒粒子结构多肽和核衣壳蛋白分别由19和7个多肽组成,分子量范围分别在89000～13000和34000～13000之间,间接试验结果表明,在AciNPV中有碱性蛋白酶活性存在。     

流感病毒的裂解气相色谱分析

裂解气相色谱法(Pyrolysis Gas Chromatography,PGC)在微生物学的应用中曾多侧重于细菌的鉴定,Mayer最早用PGC做植物病毒的快速鉴定,80年代国内开始开展了病毒的PGC研究。本文报道用PGC分析流感病毒和新城疫病毒的初步结果。     

Quantification of two viruses in technical preparations of Orgyia pseudotsugata baculovirus by means of buoyant density centrifugation of viral deoxyribonucleic acid.

A reliable method was developed for the quantitative determination of two nuclear polyhcdrosis viruses present in commercially prepared viral insecticides used against Orgyia pseudotsugata. Deoxyribonucleic acids, from nuclear polyhedrosis bundle virus and nuclear polyhedrosis single-rod virus, were separated on CsCl gradients according to their respective buoyant densities, 1.715 and 1.704 g/ml. The proportions of the two viruses were quantified by measuring the relative absorbance at 254 nm of their deoxyribonucleic acid peaks.     

Quantification of two viruses in technical preparations of Orgyia pseudotsugata baculovirus by means of buoyant density centrifugation of viral deoxyribonucleic acid.

A reliable method was developed for the quantitative determination of two nuclear polyhcdrosis viruses present in commercially prepared viral insecticides used against Orgyia pseudotsugata. Deoxyribonucleic acids, from nuclear polyhedrosis bundle virus and nuclear polyhedrosis single-rod virus, were separated on CsCl gradients according to their respective buoyant densities, 1.715 and 1.704 g/ml. The proportions of the two viruses were quantified by measuring the relative absorbance at 254 nm of their deoxyribonucleic acid peaks.     

中国和日本分离的几株流行性出血热病毒的抗原性比较

采用间接免疫荧光法(IFA)和ELISA法比较了几株中国和日本流行性出血热病毒(EHFV)的抗原性,IFA法不能区分大鼠属和姬鼠属来源的病毒,ELISA竞争试验表明,大鼠型病毒(R22、SR-11和TR-352株)与姬鼠型病毒(A 9株)存在弱单向交叉反应,交叉ELISA证实,A 9株与R22株、SR-11株和TR-352株均有较显著的抗原性差异,但R22,SR-11和TR-352株彼此间抗原性相近,本文讨论了有关EHFV抗原性比较中的一些问题。