DNA重复序列的宏观分布趋势

以ＧＣＧ软件和数学模型为工具,用观察到的某ＤＮＡ序列的频数（Ｏ）与理论计算出的此序列频数（Ｔ）的比值（Ｏ／Ｔ）为参数（即相对频数）,将基因资料库（包括ＧｅｎＢａｎｋ和ＥＭＢＬＤａｔａＢａｓｅ）的ＤＮＡ序列进行了分析．结果显示ＤＮＡ重复序列的分布存在着如下趋势：（１）越简单的ＤＮＡ重复序列,其相对频数越高,离平衡分布越远;（２）顺向重复序列的分布的相对频数高于反向重复序列的分布;（３）较长的保守序列的相对频数较高;（４）含ＡＴ碱基对的重复序列的相对频数高于含ＧＣ碱基对的重复序列,在较长的ＤＮＡ重复序列中尤其明显：（５）上述ＤＮＡ重复序列分布的趋势存在种属特异性．     

从DNA序列到物种树

从ＤＮＡ序列到物种树张亚平（中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室６５０２２３）关键词ＤＮＡ序列,基因树,物种树Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ＤＮＡＳｅｑｕｅｎｃｅ,Ｇｅｎｅｔｒｅｅ,ＳｐｅｃｉｅｓｔｒｅｅＤＮＡ不仅是主要的遗传物质,同时也是生物进...     

正义-反义多肽的相互作用

遗传学中心法则指出,ＤＮＡ有义链（即正义链,ｓｅｎｓｅＲＮＡｓｔｒａｎｄ）可转录为单链ｍＲＮＡ,其核苷酸序列决定蛋白质的氨基酸序列。虽然ＤＮＡ无义链（即反义ＤＮＡ链,ａｎｔｉｓｅｎｓｅＤＮＡｓｔｒａｎｄ）能以框转录方式转录成反义ｍＲＮＡ,甚至能以框翻...     

玉米苹果酸脱氢酶基因的分离与结构分析

以一个玉米（ＺｅａｍａｙｓＬ．）杂种一代超亲表达的ｃＤＮＡ片段为探针,从玉米幼苗期ｃＤＮＡ文库中筛选到一个全长１２８７ｂｐ的ｃＤＮＡ克隆。序列分析表明,该ｃＤＮＡ编码细胞质苹果酸脱氢酶,推导的氨基酸序列与龙须海棠（Ｍｅｓｅｍｂｒｙａｎｔｈｅｍｕｍ　ｃｒｙｓｔａｌｌｉｕｍ　Ｌ．）及拟南芥（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ　ｔｈａｌｉａｎａ（Ｌ．）Ｈｅｙｎｈ．）同一编码基因的氨基酸序列同源性分别为９０％和８４％。这是禾谷类作物中首次克隆的编码细胞质苹果酸脱氢酶的完整基因。     

DNA序列信息的一种新的测度

根据信息理论给出了测度ＤＮＡ序列信息的一种新的方法,获得ＤＮＡ序列４个层次的信息量测度：Ｉｂ,Ｉｆ（１）,Ｉｆ（２）ａｎｄＩｆ（３）,这４种信息测度可分别用来测度ＤＮＡ的碱基序列、密码子序列、编码蛋白质序列和功能蛋白质序列的信息量。从Ｍ．ｅｄｕｌｉｓ的线粒体基因组中两个较短的编码蛋白质的ＤＮＡ序列和使用具有不同倍性的间并密码子组组成的模拟ＤＮＡ序列中所获得计算结果表明,这些信息测度确实能用来揭示所     

探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值

测定了果蝇ｎａｓｕｔａ亚群７个分类元和外群Ｄ．ｉｍｍｉｇｒａｎｓ的核糖体基因转录间隔区（ＩＴＳ,ｉｎｔｅｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｓｐａｃｅｒ）,包括５．８ＳｒＤＮＡ和２ＳｒＤＮＡ长约１．１ｋｂ的ＤＮＡ片段序列。结果表明：Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓ、Ｔａｘｏｎ Ｉ、Ｔａｘｏｎ Ｊ享有共同的序列;Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ则与Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ共享１个序列。序列之间存在少量的插入缺失和碱基替代。     

菜豆重金属胁迫响应基因：cDNA克隆及其表达分析

通过判别筛选ＨｇＣｌ２胁迫下的菜豆叶片ｃＤＮＡ库,分离出７组不同的ｃＤＮＡ克隆（Ｐｈａｓｅｏｌｕｓ ｖｕｌｇａｒｉｓ ｓｔｒｅｓｓ－ｒｅｌａｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎ,ＰｖＳＲ１－７）。ｃＤＮＡ序列和同源性分析结果表明：ＰｖＳＲ１编码富含脯氨酸细胞壁蛋白,     

导入小麦加倍单倍体植株的玉米DNA在后代中的遗传及序列同源性分析

作者曾报道了一个玉米（Ｚｅａ ｍａｙｓ Ｌ．）基因组特异的重复序列ＤＮＡ（克隆ＭＲ６４）通过小麦（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ｐｅｒｓｉｃｕｍ Ｖａｖ．ｅｘ Ｚｈｕｋ．）与玉米杂交导入一个小麦加倍单倍体（ＤＨ）植株中。利用分析主宰该重复ＤＮＡ序列可以稳定地传递到小麦ＤＨ３代植株。通过Ｉｎｔｅｒｍｅｔ在ＤＮＡ数据库中进行序列相似性搜寻和同源性比较,结果显示,ＭＲ６４的ＤＮＡ序列和玉米的最近报道的两个逆转座子Ｐ     

人组织性纤溶酶原激活物衍生物在大肠杆菌硫氧化还原蛋白融合表达系统中的

目的：克隆含ｔＰＡ中３５５个氨基酸密码子（１－３和１７６－５２７氨基酸）的ｃＤＮＡ序列（ｔＰＡ３５５）,将其在大肠杆菌融合蛋白表达系统中表达,并在体外复性使其具有激活纤溶酶原的生物活性。方法：采用ＲＴ－ＰＣＲ技术从人黑色素瘤细胞Ｂｏｗｅｓ中克隆出ｔＰＡ３５５ ｃＤＮＡ,然后在ｐＥＴ３２ａ（＋）ＢＬ２１（ＤＥ３）大肠杆菌表达系统中表达,将表达出的融合蛋白Ｔｒｘ－ｔＰＡ３５５（Ｔｈｉｏｒｅｄｏｘｉｎ,Ｔｒｘ）包涵体在体外进行变性、复性和纯化以使其具有激活纤溶酶原的生物活性。结果：测序结果表明本研究克隆的编码ｔＰＡ中３５５个氨基酸密码子的ｃＤＮＡ序列与美国专利（公开号：５,５８７,１５９）中对应的序列完全一致,将其在ｐＥＴ３２ａ（＋）／ＢＬ２１（ＤＥ３）大肠杆菌表达系统中表达可获得稳定表达的融合蛋白Ｔｒｘ－ｔＰＡ３５     

普通小麦三个基因组之间的遗传关系及原位杂交分析

以普通小麦（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍＬ．）的３个可能的二倍体供体种（乌拉尔图小麦（Ｔ．ｕｒａｒｔｕＴｈｕｍ．）拟斯卑尔脱山羊草（ＡｅｇｉｌｏｐｓｓｐｅｌｔｏｉｄｅｓＴａｕｓｃｈ）和粗山羊草（Ａｅ．ｔａｕｓｃｈｉｉＣｏｓｓ．）的基因组ＤＮＡ为研究对象,通过它们之间的相互杂交,比较杂交强度以及泳道中带纹的不同,并结合部分ＤＮＡ重复序列在基因组间含量差异的数据,得出结论：Ａ＾ｕ和Ｄ基因组的关系     

中国苋属nrDNA的ITS序列分析及其系统学意义

运用ＰＣＲ直接测序法,对苋属（Ａｍａｒａｎｒｈｕｓ Ｌ．）１５个种及外类群鸡冠花（Ｃｅｌｏｓｉａ ｃｒｉｓｔａｔａ Ｌ．）ｎｒＤＮＡ的ＩＴＳ区（包括ＩＴＳ－１,５．８５ｒＤＮＡ和ＩＴＳ－２）进行序列测定。结果表明苋属植物的ＩＴＳ序列总长度为６２９－６３２ｂｐ,长度变异仅发生在ＩＴＳ－１区（２５０－２５３ｂｐ）。采用ＰＡＵＰ软件进行系统发育分析表明：分布于中国的苋属植物可分为３组,即刺苋组（ｓｅｃｇ     

普通小麦细胞质雄性不育系及其保持系线粒体DNA的RAPD分析

应用随机扩增多态ＤＮＡ（ＲａｎｄｏｍａｍｐｌｉｆｉｅｄｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃＤＮＡｓ,ＲＡＰＤ）技术,对普通小麦细胞质雄性不育系（Ａ）及其保持系（Ｂ）线粒体基因组（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌｇｅｎｏｍｅ）的指纹图谱进行了分析。共使用引物４１个,其中２０个引物得到了扩增产物,部分引物扩增结果表现多态性。说明线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ,ｍｔＤＮＡ）序列在不育系和保持系之间存在差异,进一步明确了小麦细胞质雄性不育（ｃｙｔｏｐｌａｓｍｉｃｍａｌｅｓｔｅｒｉｌｅ,ＣＭＳ）与ｍｔＤＮＡ的关系。     

DNA损伤与修复

《ＤＮＡ损伤与修复,（第２卷）：高级真核生物的ＤＮＡ修复》（ＤＮＡＤａｍａｇｅａｎｄＲｅｐａｉｒ,ＶｏｌｕｍｅＩＩ：ＤＮＡＲｅｐａｉｒｉｎＨｉｇｈｅｒＥｕｋａｒｙｏｔｅｓ）由ＪａｃＡ．Ｎｉｃｋｏｌｏｆｆ和ＭｅｒｌＦ．Ｈｏｅｋｓｔｒａ编著,１９９８年ＨｕｍａｎａＰｒｅｓｓ出版,６３９页。ＤＮＡ损伤与修复提供了在广泛多样化生物体范围内ＤＮＡ修复主要方面的重要和简洁评论。第２卷：高级真核生物的ＤＮＡ修复集中于哺乳动物系统、人体遗传学疾病和癌症,强调最近５年发展的重要过程。主要题目：紫外线和Ｘ线的修复,…     

水稻D1snoRNA及其基因的鉴定和功能分析

测定和比较了籼稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．ｓｐ．ｉｎｄｉｃａ）、粳稻（Ｏ．ｓａｔｉｖａＬ．ｓｐ．ｊａｐｏｎｉｃａ）和多年生野生稻（Ｏ．ｒｕｆｉｐｏｇｏｎＷ．Ｇｒｉｆｉｔｈ）ｈｓｐ７０基因第一个内含子中Ｄ１ＤＮＡ以及部分上游序列,并通过Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交及ｃＤＮＡ序列分析对Ｄ１ＤＮＡ编码的Ｄ１ｓｎｏＲＮＡ进行了实验鉴定。Ｄ１ｓｎｏＲＮＡ属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,它与水稻２５ＳｒＲＮＡ互补序列为１４个核苷酸长。根据理论计算,Ｄ１ｓｎｏＲＮＡ具有指导水稻２５ＳｒＲＮＡ中第８０７位的核糖甲基化功能。Ｄ１ＤＮＡ与Ｃ１ＤＮＡ相隔仅１０５个核苷酸,在内含子中如此短的距离内连续编码两种ｓｎｏＲＮＡ是罕见的,这一结构为研究串联结构的ｓｎｏＲＮＡ转录后加工机制提供了一个良好的研究体系。     

中国对虾16 S rRNA基因序列多态性的研究

利用ＰＣＲ技术扩增获得中国对虾（Ｐｅｎａｅｕｓ ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ）线粒体ＤＮＡ的１６Ｓ ｒＲＮＡ基因片段,通过测定该基因片段的序列,分析了取自我国烟台、长岛近海和宁波养殖的１７只中国对虾遗传多态性。结果发现,不同地理种群存在丰富的ＤＮＡ序列多态性,１７只个体具有１７种基因型,在扩增的长为５２３ｂｐ的基因片段中,共检测到３７个多态性核苷酸位点（７．０７％）。ＵＰＧＭＡ法构建的分子系统树表明不同地理     

黑子南瓜甘油-3-磷酸酰基转移酶基因的克隆及序列分析

依据国外报道的南瓜甘油－３－磷酸转酰酶（ＧＰＡＴ）基因的ｃＤＮＡ序列合成相应引物,用ＲＴ－ＰＣＲ技术,成功地分离了黑子南瓜（Ｃｕｃｕｒｂｉｔａｆｉｃｉｆｏｌｉａ）ＧＰＡＴ基因的ｃＤＮＡ片段,并亚克隆到了ｐＧＥＭ－Ｔ载体系统的多克隆位点上,序列分析表明黑子南瓜ＧＰＡＴ基因的ｃＤＮＡ序列及递推的氨基酸序列与南瓜（Ｃｕｃｕｒｂｉｔａｍｏｓｃｈａｔａ）相比分别具有９８％和９６５％的同源性。在１１８８ｂｐ中有２２个核苷酸发生变化,导致１３个氨基酸的改变     

抗真菌药——瞄准着DNA拓扑异构酶

抗真菌药──瞄准着ＤＮＡ拓扑异构酶徐钤（第一军医大学生化教研室，广州５１０５１５）关键词抗真菌药，ＤＮＡ拓扑异构酶１、ＤＮＡ拓扑异构酶的功能ＤＮＡ拓扑异构酶（ＤＮＡｔｏｐｏｉｓｏｍｅｒａｓｅ，ＴＯＰＯ）能改变（或调整）ＤＮＡ的拓扑学结构。ＴＯＰＯｓ可...     

DNA操作技术领域里的两种新工具酶

ＤＮＡ操作技术领域里的两种新工具酶张显亮（中国科学院国家基因研究中心，上海２００２３３）关键词Ⅰ－内切酶超多位点内切酶（ｈｙｐｅｒｆｒｅｑｕｅｎｔｅｎｄｏｎｕｃｌｅａｓｅ）序列专一的ＤＮＡ双链内切酶是ＤＮＡ重组领域必不可少的工具之一。应用最普遍的是来...     

DNA也具有酶活性

ＤＮＡ也具有酶活性党喜同，贾弘，张廼蘅（北京医科大学生物化学与分子生物学系，北京１０００８３）［编者按：发现ＲＮＡ具有酶活性已有１５个年头了。１９９５年下半年，又相继出现了ＤＮＡ也具有酶活性的报道：（１）磷酸酯酶活性（ＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄｓＲｅｓ，...     

《DNA复制：调节机制》

《ＤＮＡ复制：调节机制》《ＤＮＡ复制：调节机制》（ＤＮＡｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ：ｔｈｅｒｅｓｕｌａｔｏｒｙｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ）由Ｐ．Ｈｕｇｈｅｓ等人编著,１９９２年斯普林格出版社出版,４２２页。该书有下列章节：１．细胞ＤＮＡ复制。ＤＮＡ复制的细胞周...