家蚕不同地理品种分子系统学研

利用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)标志,在DNA分子水平上对不同系统、化性和眠性共六类59个家蚕Bombyx mori品种及野蚕且mandarina之间的遗传差异进行了研究。在34个随机引物中有12个(35.29%)引物出现稳定的扩增带,扩增总带数为103条,其中86条具多态性,占83.5%,平均每个引物7.2条。利用单匹配相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现其RAPD不但具有品种特异性,而且具有系统特异性,证明中国一化性四眠种为最早从野蚕中分化出来的系统,中国一化性三眠种与中国一化性四眠种在进化上属有显著差异的两个类群。     

大麦1H特异性CAPs标记和ASA标记的创制

选取大麦1H染色体的STS标记MWG913特异性扩增小麦,把得到的片段进行克隆.用Taq酶切分类并测序,把得到的序列同大麦的序列进行比较.依据比较结果,选取对大麦特异的内切酶,用该酶来酶切大麦、小麦、黑麦、长穗偃麦草、中间偃麦草、簇毛麦的MWG913扩增产物,获得对大麦1H染色体特异的CAPs标记.同时,依据酶切位点碱基的差异设计引物对扩增的产物进行第二次扩增,得到该位点的一对染色体特异性ASA标记.     

RAPD标记构建家蚕分子链锁图

以大造、Ｃ１０８及其Ｆ２群体构建了１个家蚕的ＲＡＰＤ连锁框架图,该图含ＲＡＰＤ标记位点１８２个,来自大造的１０３个标记分属前２３个连锁群,来自Ｃ１０８的７９个标记分属后１６个连锁群,覆盖基因组的总长度为１１４８．３ｃＭ（ｃｅｎｔｉｍｏｒｇａｎ）,它能与本室用同一群体构建的ＳＡＤＦ图谱相整合,亦可与相应的ＲＦＬＰ图谱相互补充。     

家蚕耐氟基因RAPD分子标记的筛选及其克隆

以家蚕耐氟品种T6和高敏感品种733新为材料,并构建其近等基因系,采用300个随机引物进行RAPD扩增,获得了与家蚕耐氟性有关的一个分子标记S207,并在F2代分离个体中得到验证,证明了此分子标记的可靠性,进而将此标记克隆进T载体pUCm-T中,完成了测序,分析发现此序列是新的未有报道的序列。计划下一步将此RAPD标记转化成SCAR标记,建立分子标记辅助育种技术体系。     

家蚕耐氟基因RAPD分子标记的筛选及其克隆

为获得家蚕耐氟基因的分子标记,以家蚕耐氟品种T6和高敏感品种733新为材料,并构建了其近等基因,采用300个随机引物进行RAPD扩增,获得了与家蚕耐氟性有关的一个分子标记,此标记由引物S250扩增得到,并在F2代分离个体中得到验证,证明了此分子标记的可靠性,进而将此标记克隆进T载体pmd-18中,完成测序,分析发现此序列是未有报道的新序列。     

AFLP标记在研究家蚕遗传多态性方面的应用

AFLP是一种多态检出效率很高的分子标记技术,在构建遗传图谱,遗传多态性研究,重建分子系统演化树,品种鉴定,基因克隆等众多研究领域有着其它分子标记技术不可比拟的优势。本文在前人用AFLP技术对植物多态性研究的基础上,将AFLP用于家蚕的遗传多态性研究,结果发现在家蚕中同样具有丰富的AFLP标记的多态性。由此暗示AFLP技术亦适合研究家蚕等昆虫类动物的遗传多态性,构建遗传图谱,或用于其分子生态学,分子进化和分类等方面的研究。此外本文还探讨了适合于家蚕等昆虫的AFLP分析的实验条件。     

植物系统学研究中常用基因分子标记特点分析

阐述了目前用于植物系统学和进化研究的一些常用的ＤＮＡ分子标记技术,分析了各自的使用范围和应用特点,提出在使用这些分子标记来研究分子系统学时必须注意的问题。     

家蚕地方品种遗传多样性及其分子系统学研究

为检测家蚕(Bombyx mori)地方品种间的遗传差异,分析其遗传多样性和系统分化模式,为家蚕的品种鉴定和杂交育种亲本选择提供分子依据,本文对72个家蚕地方品种的淀粉酶基因(Bmamy2)片段进行测序,采用DNA序列分析技术探究了家蚕地方品种在核苷酸序列水平上的遗传差异及其系统分化特征.结果显示,家蚕地方品种在Bmamy2基因变异丰富,碱基突变率为5.6-8.2％,单倍型多样度为0.8294,核苷酸多样度为0.0236±0.00122,表明Bmamy2是一个具有丰富序列多样性的标记基因,能够较好地区分家蚕地方品种间的遗传多样性.系统发育分析、分子方差分析和Network分析等多种分析方法均检测到家蚕地方品种不按地理系统或生态类型聚类,各聚类种群均由来自不同地理系统或生态类型的品种构成,而来自同一地理系统或生态类型的品种则分别归属于不同的聚类种群.推测在家蚕的进化过程中并没有形成按地理系统或生态类型归类的分化格局,家蚕可能具有多种化性混合驯化起源的遗传背景和系统分化特征.     

家蚕抗核型多角体病分子标记筛选

对家蚕抗核型多角病毒病以不同的杂交方式,构建3种近等基因系,用RAPD技术筛选出抗病主基因连锁分子标记OPA-18700和感病连锁分子标记OPY-11400。同时在F2群体中验证了抗性分子标记的有效性。     

家蚕AFLP分子连锁图谱的构建及绿茧基因定位

利用改进的AFLP技术,对家蚕品系C100和大造的回交一代BC,群体进行连锁图谱的构建。经28对引物组合的选择性扩增,共获得了3956条带,平均每对引物产生141．3条带,获得多态性带只有1018条,多态性带的比率为25．7％。其中693(68．1％)个多态性位点符合1：1孟德尔分离比例。利用Mapmaker／Exp3．0软件进行连锁分析,构建了一张含有408个标记位点、33个连锁群、总图距为3676．7cM的连锁图谱,并将绿茧基因定位在该图谱的22连锁群上,表明该连锁群与家蚕经典遗传学的第15染色体相对应。     

家蚕胚胎期对高温干燥催青耐受性的遗传分析

本文运用完全双列杂交的方法,估测了家蚕在胚胎期对高温干燥催青条件耐受性的有关遗传参数。家蚕种对高温干燥催青的耐受性,在原种间和杂交组合间有明显差异。耐受性是一种遗传性性状,由遗传基因控制。经估算的广义遗传力大于狭义遗传力。有超显性现象。控制家蚕对高温干燥催青的耐受性的基因数目不少于两个。显性效应大于加性效应。显性效应为非单向性的。显性位点上的基因分布为不对称性。 Abstract:Some genetic parameters about endurance of silkworm to high temperature and low humidity condition during embryo stage were calculated in complete diallel crossing(6×6).There was clear variation in the endurance of both parents and F1 to the incubating condition of high temperature and low humidity.Endurance is a supper-dominant character controlled by genes not less than two.The generalized heritability is greater than narrow heritability .The effects of dominant genes were non-unidirection,with the dominant effect greater than additive effect.The distribution of genes on the location of the dominance is not symmetric.     

利用CLSM检测GFP基因在家蚕的瞬时表达

将绿色荧光蛋白(GFP)基因导入农蚕蛹(G0)的睾丸,利用激光共聚焦扫描显微镜(CLSM)系统检测,得到GFP基因在家蚕刚孵出未进食的幼虫(蚁蚕)(G1)瞬时表达的荧光图像。 Abstract:Plasmid DNA containing the GFP(Green Fluorescent Protein)reporter gene was injected into the testis of silkworm(Bombyx mori L.)pupa(G0),we observe the fluorescence imaging of expression of GFP gene in silkworm newly-hatched larvae(G1)examined by Confocal Laser Scanning Microscope.     

Genome-wide Investigation of Intron Length Polymorphisms and Their Potential as Molecular Markers in Rice (Oryza sativa L.)

Intron length polymorphisms (ILPs) have been used as geneticmarkers in some studies. However, a systematic investigationand large-scale exploitation of ILP markers has not been reported.In this study, we performed a genome-wide search of ILPs betweentwo subspecies (indica and japonica) in rice using the draftgenomic sequences of cultivars 93-11 (indica) and Nipponbare(japonica) and 32 127 full-length cDNA sequences of Nipponbareobtained from public databases. We identified 13 308 putativeILPs. Based on these putative ILPs, we developed 5811 candidateILP markers via electronic-PCR with primers designed in flankingexons. We further conducted experiment to verify the candidateILP markers. Out of 215 candidate ILP markers tested on 93-11,Nipponbare and their hybrid, we successfully exploited 173 codominantILP markers. Further analyses on 10 rice accessions showed thatthese ILP markers were widely applicable and most (71.1%) exhibitedsubspecies specificity. This feature suggests that ILPs wouldbe useful for the studies of genome evolution and inter-subspeciesheterosis and for cross-subspecies marker-assisted selectionin rice. In addition, by testing 51 pairs of the ILP primerson five Gramineae plants and three dicot plants, we found anotherdesirable characteristic of rice ILP markers that they havehigh transferability to other plants.     

花莲种质资源的遗传多样性及品种间亲缘关系的探讨

利用17个随机引物对来自中国和美国的29份花莲种质资源材料进行了RAPD分析。扩增形成207条谱带,多态带122条,多态率为58．94％。说明中国花莲具有较丰富的遗传多样性。结果还显示：（1）花莲种质资源可被分为2个品种群：品种群Ⅰ以大花型为主,少量小花型。品种群Ⅰ以中小型花为主。又在欧氏遗传距离11．01处分为7个亚品种群。（2）美洲黄莲与中国莲的花莲之间在DNA水平上没有显著差异,与中小型花关系更近。     

分子标记在家畜遗传多样性研究中的应用

家畜遗传多样性是生物多样性的重要组成部分,与人类未来的生存与发展密切相关。中国拥有丰富的地方家畜品种资源,但由于保种不当和盲目引进外来品种进行杂交、资金缺乏等原因,许多品种已濒临灭绝。如何保存利用好我国优良的家畜遗传资源已成为越来越严峻的问题。随着生物学技术的不断发展与完善,许多分子标记技术已经应用于畜禽遗传资源的研究。简要介绍了在家畜遗传多样性研究中应用最广的几种分子标记及其特性,讨论了在家畜遗传多样性的研究中如何选用适当的分子标记。     

贵州野生大麦麦芽品质性状的SSR标记分析

采用6对啤酒大麦的麦芽浸提和糖化力紧密连锁引物对103份采自贵州的野生大麦材料进行SSR标记。结果表明,贵州野生大麦麦芽品质性状存在丰富的变异,6对SSR引物共检测出38个等位变异,每个位点平均6.33个等位变异,其中GMS001位点对贵州野生大麦基因组DNA变异检测最有效。UPGMA聚类图显示,该6对与麦芽品质紧密连锁的SSR引物对区分野生大麦在贵州不同的资源产地和棱性是有效的,表现为遵义地区野生大麦遗传多样性丰富,而来自贵州凯里地区的野生大麦资源遗传多样性狭窄。麦芽品质性状标记结果表明贵州野生六棱大麦较四棱大麦的遗传差异更显著,表明进行贵州啤酒大麦人工育种的亲本应在亲缘关系较远的六棱大麦之间选择。     

271份豌豆种质资源农艺性状遗传多样性分析

以来自五大洲57个国家和地区的271份豌豆资源为材料,利用主成分分析和聚类分析的方法,评价其2个质量性状和7个数量性状的遗传变异水平。结果表明,参试资源的农艺性状具有丰富的遗传多样性。其中遗传多样性指数最高的是始荚节位(2.0590),其次是主茎节数(2.0421);性状变异系数最大的是小区产量(64.874%),其次是百粒重(61.870%)。采用SPSS 22.0软件对参试资源7个数量性状的主成分分析结果表明,前3个主成分因子累计贡献率达66.021%,Ward法聚类将参试的271份豌豆资源划分为4大类群,其中第Ⅱ类群属于高秆、大粒、高产种质,具有很高的丰产潜力,为我国杂交育种亲本选择提供了原材料。对取材数大于等于5的来自于四大洲17个国家的参试资源进一步分析发现,不同地理区域资源间遗传变异显著,其中印度的遗传多样性指数最高(1.7533),巴基斯坦的最低(0.9685),波兰的变异系数和遗传多样性都较高。综合分析国外种质资源的农艺性状,有助于我国豌豆育种项目亲本选配。