微生物代谢产物在心血管疾病中的应用

心血管疾病严重威胁着人类健康,研发防治心血管疾病的有效药物一直是广大研究者研究的焦点。微生物的多种代谢产物在预防和治疗心血管疾病方面得到广泛应用,从微生物代谢产物中寻找预防和治疗心血管疾病的药物是比较传统而且简单的方法,文章就微生物代谢产物在心血管疾病方面的应用进行了阐述。     

质谱分子网络在天然产物结构研究中的应用CSCD

质谱分子网络(molecular networking)常用于新颖天然产物发现及鉴定、药物代谢及药物研发等研究。目前,分子网络能够将具有相似二级质谱的化合物连接成簇,在天然产物分析中得到了广泛的应用。本综述将简单介绍分子网络的基本概念和构建分子网络的步骤,以及从化合物的鉴定及发现;鉴定天然产物的代谢产物;天然产物化学成分的定性及定量;天然产物活性成分筛选、分离与制备;天然产物的生物合成途径五个方面对分子网络的应用进行阐述。     

微生物代谢产物在溶栓药物制备中的应用研究进展

目的 :探讨从微生物代谢产物中寻找溶栓药物制备的研究方法和动态。方法 :从大量的近期文献中阐述了来源于微生物代谢产物溶栓药物的性质和优缺点。结果 :从微生物代谢产物中寻找溶栓药物是传统而又简单的方法 ,比较经济实惠。结论 :微生物代谢产物是溶栓药物或其他药物的重要来源。     

单菌多次级代谢产物方法及其在微生物代谢产物研究中的应用

微生物次级代谢产物的结构多样性赋予其广泛的生物活性,是药物先导化合物的重要来源。然而传统单一的培养方法,使微生物中大量的代谢途径不能被表达,以至于许多代谢产物不能产生。因此,运用各种技术和方法激活这些沉默途径,获得结构多样的代谢产物已成为目前关注的热点。单菌多次级代谢产物(Onestrainmany compounds,OSMAC)策略作为一种简便有效的研究手段,已成功应用于该领域的研究。本文综述了OSMAC策略中常用的研究手段(包括改变培养状态、混合培养及添加酶抑制剂等),以及OSMAC与基因组扫描技术相结合的研究进展,并介绍了本研究室利用此方法对高产细胞松弛素的海洋来源真菌曲丽穗霉(Spicaria elegans KLA03)进行研究的部分结果。     

微生物代谢产物库研究进展

微生物代谢物具有极大的化学结构多样性和复杂性,建立微生物代谢物库对发现新药有重要意义。对几种重要的微生物代谢物库及建库方法作一综述。     

微生物挥发性代谢产物的产生途径及其质谱检测技术

微生物挥发性代谢产物（MVOCs）是微生物代谢产物的重要组成部分,是人类了解微生物生命活动本质规律的重要窗口,也是提高微生物利用价值的重要物质基础。MVOCs种类较多,按其化学结构不同可分为醇类、醛类、酸类、酯类和酮类等化合物。由于这些化合物的理化性质差异较大,在样品中含量低且浓度差异大,经常与大量的复杂基体共存,一般需要对其进行分离、富集后才能够进行分析测定。本文归纳了常见MVOCs的产生途径,综述了常规质谱分析方法在MVOCs分析检测中的应用,同时结合本课题组的研究工作,介绍了新兴的复杂基体样品快速质谱分析技术的原理,评述了它们在MVOCs检测中的优势,并展望了质谱技术在MVOCs检测方面的发展趋势。     

微生物次生代谢产物的生物合成

来源于微生物的次生代谢产物是新药发现和发展的重要源泉,也是行之有效、研究生物学问题的探针工具.微生物产生次生代谢产物的目的并非为人类所用,而是以之为工具或媒介,调控其内在的生物化学过程并响应各种外部环境的变化.另一方面,微生物也通过其产物的结构改变、优化和最终选择,适应各种动态、可变的生物学过程.化学结构与生物功能的共...     

微生物代谢产物作用于植物的研究探讨

随着微生物学与植物生理学、植物病理学等学科的不断交叉,微生物所分泌的各种活性代谢产物对植物的作用逐渐被人们重视.这些分泌物对某些植物起到了促进或抑制的作用.简述了微生物所分泌的代谢产物的种类及其对植物的促进和抑制作用,指出这两种作用对农业生产以及植物病害防治工作的指导都具有重要意义.     

电子圆二色谱技术在微生物次级代谢产物结构研究中的应用研究进展

微生物次级代谢产物的化学结构十分复杂,对其绝对构型的确定十分困难。近年来,电子圆二色谱(electronic circular dichroism,ECD)由于其用量少、精度高等优点,在测定绝对构型方面的应用越来越多,已经成为研究微生物次级代谢产物结构的重要方法。本文就电子圆二色谱在微生物次级代谢产物结构研究中的应用进行综述,以期为今后的研究奠定基础。     

基因组重排技术在开发新代谢产物中的应用

基因组重排是一种基于原生质体融合,并对原生质进行递推式融合的新型技术。随着基因组重排技术的不断发展和成熟,通过基因组重排获得新代谢产物的例子不断出现,表明该项技术作为新代谢产物开发的途径具有一定的应用前景。在此列举了基因组重排在开发新代谢产物方面的成果,包括基因组重排激活沉默基因产生新代谢产物;基因组重排引入单酶基因产生新抗生素;基因组重排互换基因模块产生杂合抗生素和基因组重排替换前体基因产生新抗生素的例子,并展望了其发展的趋势。     

Pattern Recognition Analysis of Metabolites in Escherichia coli Based on ESI-Orbitrap Mass Spectrometry

To achieve rapid detection of carbapenem-resistant Escherichia coli strains, a pattern recognition method based on electrospray ionization Orbitrap mass spectrometry (ESI-Orbitrap MS) was used for the analysis of drug-resistant, and sensitive strains of metabolites were analyzed. Results of five clustering methods applied to analytical data of metabolites were evaluated using iso-phenotypic coefficients. The effectiveness of three methods, principal component analysis (PCA), partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) and orthogonal partial least squares discriminant analysis (OPLS-DA), was compared. Univariate statistics such as t-test and fold change were also used to examine the screened differential information. Both PLS-DA and OPLS-DA could achieve rapid identification of strain classes, and OPLS-DA was more powerful in screening 96 significantly different ions. This work is expected to be useful for rapid and accurate identification of strains.     

基于质谱技术的蛋白质互作研究进展

蛋白质作为生命活动的执行者,其功能往往体现在与其他蛋白质的相互作用中,研究蛋白-蛋白相互作用对于人们深入了解和预防传染病、靶向治疗多基因疾病、阐明蛋白质的分子作用机制及各种复杂的生命现象具有重要意义。目前,有多种技术被用来研究蛋白间的相互作用,研究难点在于实时捕获瞬时或弱蛋白质间的相互作用,质谱技术（mass spectrometry, MS）可在某种程度上解决该难点。由于质谱技术可研究简单的蛋白质复合物再到大规模的蛋白质组实验,基于质谱技术研究蛋白质间相互作用被越来越多地应用于科学研究中。综述了蛋白质间相互作用检测方法的研究进展,重点介绍了氢氘交换质谱法和化学交联质谱法研究蛋白质间相互作用的优缺点及其应用,最后对基于质谱技术研究蛋白质间相互作用进行了总结与展望,以期为深入开展相关研究提供借鉴。     

生物质谱及其在蛋白质组学研究中的应用

生物质谱是蛋白质组学研究必不可少的关键技术。近年来,生物质谱在鉴定通量、分辨率和灵敏度等方面均有质的飞跃,从而促进了蛋白质组研究各个领域的飞速发展。本文就生物质谱技术的原理、技术和仪器发展现状,及其在蛋白质组学研究中的应用进展作一简要的综述。     

Determination of Acidic Metabolites of Biogenic Amines in Human Aqueous Humour by Gas Chromatography-Negative Ion Chemical Ionisation Mass Spectrometry

The concentrations of acidic metabolites derived from the biogenic amines o-, m-, and p-tyramines (o-, m-, and p-hydroxyphenylacetic acids), p-octopamine/p-synephrine (p-hydroxymandelic acid), and dopamine (homovanillic acid and 3,4-dihydroxyphenylacetic acid) were measured in human aqueous humour obtained from patients undergoing elective surgery for cataract removal or for trabeculectomy as a treatment for chronic open-angle glaucoma. There were no clear differences in the pattern of metabolism of neurotransmitters between the two groups. An unexpected finding was that the o-tyramine metabolite, o-hydroxyphenylacetic acid, was present in aqueous humour.     

质谱技术解析磷酸化蛋白质组

蛋白质磷酸化是生物体内存在的一种普遍的调节方式,在细胞信号传递中占有极重要的地位.质谱已逐渐被人们认为是挑战这一领域的有利工具.综述了目前利用质谱技术分析磷酸化蛋白质的方法,包括利用固定化的金属亲和层析柱、抗体和化学标签技术富集目的分子,肽片段质量图和前体离子扫描（precusor ion scans）等技术检测磷酸化肽段,串联质谱对磷酸化肽段测序鉴定磷酸化位点,以及引入质量标签对蛋白质的磷酸化水平进行定量等.虽然现在已经有很多可行的方法用于分析磷酸化蛋白质,但要达到从少量生物样品中解析其全部磷酸化蛋白质仍需要有很多技术上的突破.     

生物质谱技术与蛋白质组学

生物质谱技术是蛋白质组学的支撑技术.详细论述了质谱技术的分类与基本分析原理,重点论述了质谱技术的发展变化,包括基质辅助激光解吸飞行时间质谱技术,电喷雾质谱技术,MALDI-Q-TOF和MAL-DI-TOF-TOF等质谱技术,以及质谱技术在蛋白质组学研究中的应用与未来的发展和挑战.     

质谱在寡核苷酸药物质量控制中的应用

介绍了质谱在寡核苷酸质量控制方面的应用.合成寡核苷酸及类似物作为反义治疗剂在病毒感染和一些癌症治疗方面有良好的前景.寡核苷酸作为药物,其结构特性必须进行确证.寡核苷酸浓度和纯度的分析可使用色谱或电泳技术,对寡核苷酸的碱基组成、序列、同一性,修饰基团,色谱或电泳分析方法无能为力.质谱的高鉴别能力使其能有效、灵敏、快速和精确地确定寡核苷酸的这些特性.     

Atmospheric-pressure Molecular Imaging of Biological Tissues and Biofilms by LAESI Mass Spectrometry

Ambient ionization methods in mass spectrometry allow analytical investigations to be performed directly on a tissue or biofilm under native-like experimental conditions. Laser ablation electrospray ionization (LAESI) is one such development and is particularly well-suited for the investigation of water-containing specimens. LAESI utilizes a mid-infrared laser beam (2.94 μm wavelength) to excite the water molecules of the sample. When the ablation fluence threshold is exceeded, the sample material is expelled in the form of particulate matter and these projectiles travel to tens of millimeters above the sample surface. In LAESI, this ablation plume is intercepted by highly charged droplets to capture a fraction of the ejected sample material and convert its chemical constituents into gas-phase ions. A mass spectrometer equipped with an atmospheric-pressure ion source interface is employed to analyze and record the composition of the released ions originating from the probed area (pixel) of the sample. A systematic interrogation over an array of pixels opens a way for molecular imaging in the microprobe analysis mode. A unique aspect of LAESI mass spectrometric imaging is depth profiling that, in combination with lateral imaging, enables three-dimensional (3D) molecular imaging. With current lateral and depth resolutions of ~100 μm and ~40 μm, respectively, LAESI mass spectrometric imaging helps to explore the molecular structure of biological tissues. Herein, we review the major elements of a LAESI system and provide guidelines for a successful imaging experiment.     

生物质谱分析法在脂质组学的应用

脂质与许多慢性病(如糖尿病、高血压)和精神系统疾病(如阿尔茨海默病)等有关。脂质组学是以现代生物技术为手段,对生物体中的全脂质进行定性和定量的一门新兴学科。目前,生物质谱分析法是对脂质谱进行分析和定量的最有效方法,国内对脂质组学的系统研究还比较匮乏。综述脂质组学的概念与分类,探究不同的生物样品前处理方法,系统介绍近几年国际上生物质谱分析法在脂质组学的应用,并对脂质组学的发展趋势进行展望。