基于共进化基因功能模块发现候选癌基因

癌基因组的体细胞突变扫查数据为研究人员发现新的癌基因提供了大量的信息。已有的通过基因突变频率寻找候选癌基因的方法倾向于发现突变频率较高的癌基因,但是部分低频率突变的基因也可能在癌症发生过程中发挥重要作用。具有相似系统发生谱并且具有蛋白互作关系的基因可能具有相似的功能,它们的损伤可能会导致相同或相似的疾病表型。基于这一假设,文章提出了一种发现候选癌基因的新方法。首先,寻找具有相似系统发生谱的蛋白质互作子网,定义为共进化基因模块;然后,在癌基因组中发生至少一次非同义体细胞突变的基因中,筛选出与已知癌基因在同一共进化模块并具有直接相互作用的基因,预测为候选癌基因。据此,文章共预测了15个候选癌基因,其中只有2个基因在以往的工作中通过基于高突变频率的方法被识别为癌基因。因此,该方法可以有效地发现突变频率低的候选癌基因。     

根据在癌突变谱中的共突变基因对识别癌基因

癌是一种涉及多基因变异的遗传异质性疾病,涉及多种生物学功能通路中不同基因的遗传变异。因此,识别癌基因是一项富有挑战性的工作。提出通过寻找在癌样本中突变显著共发生的基因筛选候选癌基因的方法。应用该方法,通过分析蛋白激酶基因在癌组织中的突变谱数据,发现了167个显著共发生突变的基因对,包含85个基因。分析这167个基因对发现:(1)发生共突变的基因富集已知的癌基因;(2)共突变基因对倾向于共扰动与癌症相关的通路对。以上结果提示,在癌样本中显著共发生突变的基因倾向于候选癌基因;在癌发生过程中起重要作用的基因倾向于协同扰动不同的癌相关细胞生物学过程。     

人类肿瘤基因组系统性突变分析带来的机遇

最近发表于《科学》杂志(Science)的“人类乳腺癌和结直肠癌共有编码序列”一文,是继人类基因组计划完成后,对人类疾病状态下基因组改变的首次无偏倚系统性分析.对如何利用该研究发现的候选癌基因获得肿瘤治疗药物的新靶标作初步分析,并介绍这些候选癌基因在识别肿瘤高危人群和依据分子机制更新肿瘤分型方面的潜在应用价值.     

P73表达在人类肿瘤中的意义

原癌基因（proto-oncogene）的激活和/或抑癌基因（tumor suppressor gene）的缺失和灭活是恶性肿瘤发生、发展的分子生物学基础.P53基因是迄今为止发现的与人类肿瘤相关性最高的抑癌基因,其第一个被发现的家族成员P73基因作为候选的抑癌基因受到学者们的广泛关注.本文对P73基因在人类肿瘤中的表达及意义作一综述.     

孤独症研究新进展:新发突变及CHD8功能

孤独症(即自闭症谱系障碍)是最常见的儿童中枢神经系统发育紊乱疾病。目前尚无特效治疗药物。最新的突破性进展是通过外显子组测序发现了一批与孤独症相关的单基因新发突变(de novo mutation)。在筛查到的众多孤独症相关新突变基因中,染色体结构域解旋酶DNA结合蛋白8(chromodomain helicase DNA-binding protein 8,CHD8)突变频率最高,是一个重要的孤独症候选致病基因。CHD8与p53、β-catenin等转录因子结合,具有复杂的转录调控作用。孤独症致病基因的发现为孤独症的诊断和治疗提供了分子靶标。     

RASSF1A 基因在乳腺癌发生、发展中的作用

RASSF1A基因是新近发现的新型候选抑癌基因,其正常表迭能够抑制肿瘤的发生。启动于区域CpG岛异常甲基化可以导致其失活,并在乳腺癌的发生、发展起着重要作用。RASSF1A的甲基化状态检测具有重要的临床意义,有望为乳腺癌的早期诊断、疗效监测、预后判断提供新的参考指标,而逆转RASSF1A的甲基化则可能为乳腺癌治疗提供新的方向。     

癌基因和抑癌基因研究进展

癌基因和抑癌基因的发现和研究是肿瘤研究史上的一个里程碑,标志着肿瘤研究进入了分子时代,从而在更深层次上为阐明基因的结构、表达、调控、功能的改变与肿瘤形成的关系提供了科学依据和可能性,具有重要的理论和实际意义。本文概述了癌基因和抑癌基因的最新研究进展。     

人脑原发性肿瘤癌基因扩增和重排的研究

作者对52例人脑原发性肿瘤和5例正常人脑DNA中c-myc、L-myc、Nmyc、erbB、c-fos、sis及Ha-ras等七种癌基因的扩增和重排进行了研究,发现多数胶质瘤中有c-myc、L-myc、erbB及c-fos等癌基因的扩增,少数胶质瘤和脑膜瘤中发现myc家族癌基因的限制性酶切区带位置有多态性变化;同时还观察到原发性脑瘤中存在两种或两种以上癌基因的扩增和重排现象。作者对癌基因与人脑原发性肿瘤的关系进行了讨论。     

日本的癌基因研究一瞥——日本癌学会第45届年会见闻

本文介绍了在日本癌学会第45届年会上发表的一部分关于癌基因的研究成果。在新癌基因的发现、“抗癌基因”的研究、癌基因表达的调控和癌基因的克隆与表达等方面,都有了不少新进展。     

受体相关蛋白80:一种新的乳腺癌发生相关因子

乳腺癌癌基因1（breast cancer gene 1,BRCA1）是最早发现的乳腺癌抑癌基因,它通过参与DNA损伤修复应答而保证了基因组完整性和正常的细胞分裂,它的突变可导致乳腺癌等相关肿瘤发生率显著升高。最新研究发现,受体相关蛋白80（receptor-associated protein 80,RAP80）作为BRCA1发挥作用时的一个伴侣蛋白,通过泛素化而与BRCA1相互作用,共同参与了DNA损伤修复过程。RAP80的发现及生理功能的深入研究使人们对乳腺癌发生机制有了新的理解,从而为乳腺癌诊断、预防和治疗提供了新的思路。     

紫外线对哺乳类细小病毒H-1的致突效应的分析

用哺乳类细小病毒H-1为探针研究紫外线的致死和致突效应,可发现随照射剂量的增加,病毒存活率按对数规律下降,病毒的突变频率线性增加,低剂量紫外线诱导回复突变体的几率较大。用小剂量紫外线诱导宿主细胞,病毒的存活率和突变频率相应提高,同时使紫外线诱导突变体的几率显著提高。     

c-myc癌基因在大肠组织中表达的免疫组织化学和原位杂交研究

本文应用 c-myc 癌基因蛋白免疫组织化学和 mRNA 原位杂交方法研究了 c-myc 癌基因在大肠组织中的表达,并以胎盘作为阳性对照。发现在胎盘合体滋养叶细胞和结肠粘膜表面上皮都有 c-myc 癌基因的表达。结肠肿瘤 c-myc 表达增加,腺癌表达高于腺瘤。腺瘤中以绒毛状腺瘤表达最高。研究表明 c-myc 癌基因表达并不绝对与细胞增殖状态相关。     

《科学》：研发解析癌症基因新工具

来自英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）。西班牙IMOMA的研究人员开发出了一种可以用于发现癌基因的研究工具。利用这一工具。研究人员发现了与白血病相关的癌基因等。这一研究成果公布在Science杂志上。     

《科学》：研发解析癌症基因新工具

来自英国桑格研究所（Wellcome TrustSanger Institute）。西班牙IMOMA的研究人员开发出了一种可以用于发现癌基因的研究工具。利用这一工具。研究人员发现了与自血病相关的癌基因等。这一研究成果公布在Science杂志上。     

p73基因的分子生物学

从分子了生物学水平对新发现的抑癌基因ｐ７３进行综述和报道。ｐ７３和ｐ５３在分子结构,基因功能和生物学活性等方面都具有同源性和相似性。ｐ７３的发现为癌症治疗提供了一条新途径。     

细胞凋亡（Apoptosis）与癌基因

细胞凋亡是细胞衰老、死亡过程的主要形式.最近研究发现有多种癌基因与抑癌基因参与细胞凋亡过程.因此目前认为癌基因与抑癌基因不仅控制细胞增殖、分化,而且调节细胞凋亡.细胞凋亡受阻或缺陷可能是肿瘤发生的基础之一.     

人膀胱癌中某些癌基因的研究

本实验应用Northern和斑点印渍杂交技术探测了人膀胱癌细胞株中c-myc、c-fos、erbB等癌基因的表达,以及TPA对这些癌基因表达的调控,发现BIU-87细胞有这些癌基因的表达,并能被TPA所增强,同时也发现人膀胱癌组织有c-myc、c-fos、erbB、N-ras基因的高表达。提示蛋白激酶C的激活可以诱导某些癌基因的表达。多种癌基因的表达异常可能在膀胱癌中起重要作用。     

性病艾滋病感染者HIV-1相关基因CCR5Δ32、CCR2b-64I、SDF1-3＇A多态性分布的研究

研究HIV-1相关等位基因CCR5Δ32、CCR26—64I、SDFl-3'A在性病艾滋病感染人群中的突变频率和多态性分布的特点,为我国艾滋病的预防和未来的基因治疗提供初步依据。收集198例汉族性病艾滋病感染的血液标本,提取基因组DNA,经PCR检测,并用统计学方法分析。198例性病艾滋病人群CCR5Δ32、CCR2b-64I、SDFl-3’A的突变频率分别为0．25％、16．16％、25．00％,与中国普通汉族人的结果一致。CCR5Δ32的突变频率较低,而CCR2b-64I、SDFl-3'4的突变频率较高,提示本地性病艾滋病汉族人群对性传播的HIV—1(R-5)毒株有较大的易感性。     

c-myc原癌基因产物存在于哺乳类精细胞中并影响其功能

至今已经发现有40多种病毒和细胞来源的癌基因。因为被激活的癌基因具有诱发细胞异常生长的特性,提示癌基因的前体——原癌基因可能是正常细胞信息传递途径的组成成份,调节正常细胞生长和分化。     

基因转移与癌

本书为癌基因研究论文集。书中综述了癌基因研究的一些新的发现及其进展。分属几个方面介绍和论述了细胞致癌基因、癌基因在哺乳动物中的转移和表达。 一、细菌的转化作用:从基本理论和机理方面论述并阐明了嗜血杆菌转化中对DNA识别的顺序特异性和非序列特异性成分。