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为了进一步明确家蚕和野桑蚕的亲缘关系,收集了中国和日本的一些家蚕和野桑蚕品种资源,提取了家蚕和野桑蚕的总mRNA,通过RT-PCR克隆了家蚕和野桑蚕线粒体DNA (mtDNA)的细胞色素氧化酶亚基1基因(cytochrome oxidase subunit 1 gene, COⅠ)和NADH-6基因,并制备探针进行了DIG-RFLP检测。结果表明,中国和日本的家蚕与中国野桑蚕的COⅠ和NADH-6基因的DIG-RFLP的分子多态性相同,但与日本野桑蚕存在差异。此结果从线粒体水平证实了中国和日本的家蚕都起源于中国野桑蚕,而不是起源于日本的野桑蚕。 相似文献
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为探索中国野桑蚕Bombyx mandarina的遗传多样性及其与家蚕B. mori的系统发育关系, 采用PCR产物直接测序法(少数样本克隆测序)获得34个家蚕和野桑蚕样本淀粉酶基因amy序列片段(715 bp)。分析发现56个多态性位点, 鉴定出28种单倍型(haplotype); 核苷酸多样性π=0.01390±0.00103, 单倍型多样度Hd=0.988±0.011。核苷酸不配对分析(mismatch analysis)和Fu’s Fs 检测表明中国野桑蚕曾发生过种群扩张。分子方差分析(AMOVA)表明, 遗野桑蚕传差异主要在种群内, 种群间和地理组群间差异不显著。聚类树上34个样本聚为3枝/3蔟, 野蚕和家蚕都不按地理区域或系统(类型)聚类, A枝由来自不同地区的野蚕和不同类型的家蚕混合构成, 并且进一步分成3个亚枝, 每一亚枝也同时包含家蚕和野蚕, B枝由3个家蚕和1个野蚕混合构成, C枝全部由来自不同地区的野蚕构成。网络分析没有发现“祖先单倍型”和优势单倍型。结果提示, 淀粉酶基因是一个多态性丰富的分子标记, 中国野桑蚕遗传多样性十分丰富, 据此推测家蚕起源于多种生态类型混杂的野桑蚕。 相似文献
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野桑蚕、蓖麻蚕及家蚕基因组的RFLP分析 总被引:2,自引:0,他引:2
以家蚕Bombyx mori丝素重链基因、丝胶基因1和胰凝乳蛋白酶抑制因子13基因为探针,对野桑蚕B.mandarina、蓖麻蚕Philosamia cynthia ricini和家蚕B.mori基因组DNA进行限制性片段长度多态性分析。结果发现,在野桑蚕、蓖麻蚕基因组中存在着家蚕丝素重链基因、丝胶基因1的同源序列,而在中日野桑蚕以及蓖麻蚕品种间存在着限制性酶切位点差异;丝胶基因1在中国野桑蚕基因组的EcoRⅠ酶切图谱较日本野桑蚕与家蚕更为一致,表明家蚕与中国野桑蚕亲缘关系更近。此外,在野桑蚕基因组中发现了家蚕胰凝乳蛋白酶抑制因子13基因的同源序列,并且在家蚕品种间以及中日野桑蚕之间也存在着多态性。这些结果表明不同绢丝昆虫在适应生存环境的进化过程中,基因组发生了结构改变。 相似文献
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昆虫能够特异性识别同类异性。雄蚕蛾对雌蚕蛾感知定位过程中, 性信息素结合蛋白PBP1、气味受体OR1和OR3起重要作用。为研究家蚕Bombyx mori和野桑蚕Bombyx mandarina杂交困难的分子机制, 了解性识别相关基因的进化, 本研究克隆得到了野桑蚕的性信息素结合蛋白基因pbp1(GenBank注册号:GQ246497)和气味受体基因or1(Genank注册号:GQ246496)和or3(GenBank注册号:GQ246498)。序列分析发现, 家蚕与野桑蚕相比, pbp1基因存在4个SNP位点, 分别为C10A, A40T, T270C和A333G, 其中2个SNP位点引起氨基酸的改变, 分别为Q→K和N→Y; or1基因存在5个SNP位点, 分别为T910C, A1147C, A1192T, T1276C和G1282A, 其中1个SNP位点引起氨基酸F→L的改变; or3基因存在4个SNP位点, 分别为A507G, A513G, T605C和G672A, 其中1个SNP位点引起氨基酸I→T的改变。3个基因的遗传距离很近, 进化速率也很慢。氨基酸的分子量和等电点有细微差异或无差异。PHD预测的二级结构表明, 变异位点对附近区域的结构没有任何影响, 功能位点也没有变化。推测家蚕与野桑蚕之间, 这些基因功能可能没有差异, 即二者的雌雄性个体间可以相互感知、识别, 这与实验观察结果一致。 相似文献
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秆野螟属部分种的线粒体COⅡ基因序列分析及其分子系统学 总被引:4,自引:1,他引:3
本文利用mtDNA-COⅡ基因序列,研究了中国分布秆野螟属Ostrinia 8种螟虫的分子系统学和系统分化。结果表明:秆野螟属昆虫COⅡ基因序列全长682 bp,共编码227个氨基酸,8种昆虫12个样品中核苷酸多态性位点百分率为8.2%,氨基酸突变率为2.2%。同种内不同种群间的遗传距离小于种间距离,种内不同地理种群间的遗传距离在0~0.0044之间,种间遗传距离在0.0015~0.063之间。基因变异转换数(Ts)明显高于颠换数(Tv)。分别采用UPGMA法、NJ法和MP法构建的分子系统树显示,种间进化关系基本一致:秆野螟属8种昆虫明显分为2个大群,虎杖螟O. latipennis与其他7种亲缘关系最远,单独形成一个群;在另外1个大群中又分为3个亚群,亚洲玉米螟O. furnacalis不同地理种群首先聚在一起形成1个亚群,酒花螟O. kurentzovi与麻螟O. narynensis亲缘关系最近,聚在一起形成的分支又与欧洲玉米螟O. nubilalis、苍耳螟O. orientalis和豆秆野螟O. scapulalis聚在一起形成1个亚群,刺菜螟O. zealis在该大群内与其他种亲缘关系最远,单独形成1个亚群。 相似文献
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为探讨柳蚕Actias selene Hübner与鳞翅目昆虫的系统发育关系,本研究利用PCR扩增获得了柳蚕核糖体18S rRNA和线粒体16S rRNA基因的部分序列,长度分别为391bp和428bp。并采用邻近距离法(NJ)、最大简约法(MP)、类平均聚类法(UPGMA)构建系统进化树。结果表明,柳蚕线粒体16SrRNA基因序列与大蚕蛾科昆虫的16SrRNA基因序列均表现出偏好于碱基AT的倾向。柳蚕与所研究的其它蚕类的遗传距离介于0.016至0.140之间,其中与温带柞蚕Antheraea roylii的遗传距离最小,与野桑蚕Bombyx mandarina的遗传距离最大。而基于鳞翅目昆虫18S rRNA基因部分序列的进化分析显示,柳蚕与柞蚕Antheraea pernyi之间的遗传距离最小(0.010),与蓖麻蚕Samia ricini的遗传距离最大(0.017)。 相似文献
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为查明拟环纹豹蛛Pardosa pseudoannulata不同地理种群的遗传多样性机制,应用AFLP技术对6个拟环纹豹蛛地理种群的遗传多样性进行了研究分析。8对引物组合扩增出1 038个AFLP条带,其中多态性条带占86.622%,全部个体显示了各自独特的AFLP图谱。AFLP标记的遗传多样性分析结果表明: 拟环纹豹蛛无论在物种水平(P=86.62%,H=0.2622,I=0.3101),还是在种群水平(P=73.0%,H=0.2155,I=0.2554)都表现出较高的遗传多样性。其中湖南长沙雷锋镇种群内遗传变异最大,云南高黎贡山福贡种群内遗传变异最小,华南北部(湖南、湖北、江西)地区拟环纹豹蛛遗传多样性明显高于华南南部(云南、海南)种群。据种群变异来源分析,有35.77%的遗传变异来自种群间,64.23%的变异来源于种群内(Nm=0.898),不同地理种群显示出一定的遗传分化。分析认为海拔是影响拟环纹豹蛛遗传分化的重要因素,这为进一步明确我国稻田狼蛛优势种群在农药胁迫下的遗传适应性机制提供了实验依据。 相似文献
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目的分析家蚕近交系IS-c108A的遗传纯度,为家蚕实验动物化的培育工作提供指导。方法应用经过筛选的20条随机引物对家蚕近交系IS-c108A(F10)的3个蛾区各30个个体和该近交系的亲本系统c108、对照实用化品种871各30个个体的基因组DNA进行RAPD扩增,计算个体间和蛾区间的相似系数及遗传距离。结果家蚕近交系IS-c108A(F10)的3个蛾区内的多态性带频率分别为1.807%、1.841%、1.841%,平均为1.830%;起点亲本c108个体间多态性带频率为7.207%,对照品种871个体间的多态性带频率为7.08%;而近交系IS-c108A与c108之间的多态性带频率为49.20%,c108和871品种之间的多态性带频率为58.33%。家蚕近交系IS-c108A10的3个蛾区内个体之间遗传相似系数的平均值分别为0.99581、0.99555、0.99551,总平均为0.99562。结论家蚕近交系IS-c108A(F10)已具有较高的遗传纯合度,家蚕具有易于获得高纯的有利条件。 相似文献
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五种绢丝昆虫随机扩增多态性DNA分析 总被引:9,自引:2,他引:7
本文对家蚕、野桑蚕、蓖麻蚕、柞蚕和天蚕等5种绢丝昆虫进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析。40个引物中有27个引物能扩增出536个清晰且重复性强的条带,其中可变条带数为520个,单个引物扩增的条带数在11~28之间,平均为19.9,各片段分子量大小在0.29~2.67kb之间。每个样本都能找出其独特的分子标记。家蚕与野桑蚕的遗传距离(D)最小,为0.3760;家蚕与蓖麻蚕的遗传距离(D)最大,为0.7488。根据遗传距离,用UPGMA聚类分析方法构建了它们的分子树。
Abstract:Five species of silk insects including Bombyx mori, B. manolarina, Philosamia cynthia, Autheraea pernyi and A. yamamai were analyzed by RAPD method using 40 arbitrary primers. In these primers, 27 of them could amplify clear and repeating bands. 536 fragments were obtained and the variable bands were 520. Each primer gave 11~28 bands and the average was 19.9. The length of the fragments is 0.29~2.67 kb. Some distinctive bands were found in every species. The genetic distance(D) between bombyx mori and B. manolarina is 0.3760, which is the lowest. The highest D value is 0.7488, which between Bombyx mori and Philosamia cynhia. The D value was then used to construct a dendrogram by unweighted pair-group method with arithmetical averages(UPGMA). 相似文献
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大气氟污染源附近食桑昆虫中氟的积累和分布 总被引:1,自引:0,他引:1
对大气F污染源附近野桑蚕,桑赤蠖和桑蚕体内的氟化物含量和器官分布进行了研究,结果表明,污染源附近食桑昆虫体有较高的氟化物含量,且食桑昆虫体的氟化物含量随着离污染源的距离增大而降低,野桑蚕,桑赤蠖和桑蚕的氟化物含量与桑叶的氟化物含量有极显著的线性正相关性,食桑昆虫不同器官间的氟化物积累量也存在较大差异,其消化管是食桑昆虫的主要氟化物积累器官。 相似文献
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两广地区家蚕白僵菌的SSRs遗传多样性 总被引:1,自引:0,他引:1
为查明广东和广西地区家蚕Bombyx mori病原白僵菌的来源及其菌株间的相互关系, 本研究利用了微卫星标记(simple sequence repeats, SSRs)技术, 分别对采自广东、 广西蚕区的白僵菌菌株居群之间和居群之内的遗传多态性进行了研究。结果发现, 两广白僵菌居群之间的基因分化系数(Gst)是0.0590, 多态位点百分率(PPL)为97.73%, Nei氏基因多样性指数(H)为0.1896, Shannon氏信息多样性指数(I)为0.3165, 表明两广家蚕来源的白僵菌居群间的遗传分化较小; 两个居群内部的遗传多态性研究结果分别是广东白僵菌居群的PPL=68.18%, H=0.1910, I=0.3044, 而广西白僵菌居群的PPL=65.91%, H=0.1713, I=0.1791, 表明广东白僵菌居群的遗传多样性水平较高, 广西白僵菌居群遗传多样性水平相对较低。最后, 利用Nei氏遗传距离进行了两广地区白僵菌菌株间地理来源关系的聚类分析, 结果表明实验室保存菌株单独聚为类群Ⅰ, 而不同采集地的菌株聚为类群Ⅱ。结果反映了生产来源的白僵菌菌株存在遗传多态性和基因分化现象, 暗示了家蚕白僵病病原来源的复杂性, 还说明应用SSRs技术进行家蚕白僵病病原的溯源是一条可行的途径。 相似文献
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India is one of the countries where sericulture is being practiced traditionally. Due to the higher economic return and the greater employment potential, attempts are being made to increase the productivity by developing high yielding mulberry varieties. At the present, Mysore local, Bomaypiasbari, Kanva-2, Bilidevalaya, Kajli, S1, BC(2)59, C776, RFS-175, S-36 and Victory-1 are being cultivated extensively in different parts of India for rearing the silkworm Bombyx mori L. Using 17 random amplified polymorphic DNA (RAPD) and 11 inter-simple sequence repeat (ISSR) primers the genetic relationships among these varieties were analyzed. The RAPD and ISSR primers revealed more than 75% polymorphism among the varieties. The genetic similarity estimated from RAPD markers varied from 0.645, between Kajli and Victory-1 to 0.887, between Kanva-2 and Bilidevalaya. Similarly, the genetic similarity estimated from the ISSR markers ranged from 0.600, between Kajli and Victory-1, to 0.873 between Kanva-2 and BC(2)59. The dendrogram constructed from these markers grouped the varieties into three major groups comprising the low yielding, medium yielding and high yielding. The low genetic similarity between the group of varieties originating from the eastern regions with that of the southern region encourages formation of extensive breeding programs between these groups as to transfer the high yield potential of the southern varieties to the low yielding but highly adaptive eastern varieties. 相似文献
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Arvind K Awasthi GM Nagaraja GV Naik Sriramana Kanginakudru K Thangavelu Javaregowda Nagaraju 《BMC genetics》2004,5(1):1
Background
The genus Morus, known as mulberry, is a dioecious and cross-pollinating plant that is the sole food for the domesticated silkworm, Bombyx mori. Traditional methods using morphological traits for classification are largely unsuccessful in establishing the diversity and relationships among different mulberry species because of environmental influence on traits of interest. As a more robust alternative, PCR based marker assays including RAPD and ISSR were employed to study the genetic diversity and interrelationships among twelve domesticated and three wild mulberry species. 相似文献16.
S. N. Chatterjee C. G. P. Rao G. K. Chatterjee S. K. Ashwath A. K. Patnaik 《TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik》1993,87(3):385-391
A detailed study was carried out on six biochemical parameters and four yield attributes using multiple regression analysis to investigate their relationship in the mulberry silkworm,Bombyx mori. The study generated new information on the importance of digestive amylase activity for the survival of the silkworm and revealed the inability of other enzymes to affect this relationship. Data also substantiate the observations made earlier on the genetic variability of amylase in the mulberry silkworm. Analyses extend the positive role of alkaline phosphatase and invertase in the expression of the other yield traits studied and indicate the definite possibility of using biochemical markers for silkworm breeding. 相似文献
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The domesticated silkworm, Bombyx mori, has strict food preferences and grows by feeding on mulberry leaves. However, "Sawa-J", an abnormal feeding habit strain selected from the genetic stock, feeds on an artificial diet without mulberry leaf powder. In this study, the food preference gene in Sawa-J was genetically identified using restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) of a cDNA clone on each linkage group. Taking advantage of a lack of genetic recombination in females, reciprocal backcrossed F1 (BC1) progenies were independently prepared using a non-feeding strain, C108, as a mating partner of Sawa-J. Our results of linkage analysis and mapping proved that the feeding behavior is primarily controlled by a major recessive gene mapped at 20.2 cM on RFLP linkage group 9 (RFLG9), and clone e73 at a distance of 4.2 cM was found as the first linked molecular marker. 相似文献