小鼠大脑皮质脊髓投射神经元核糖体蛋白质相关基因表达的研究

该研究采用激光显微切割技术从小鼠大脑第五皮层捕获少量皮质脊髓投射神经元,并分析其分子生物学特征。首先,提取神经元微量RNA,再借助WT-ovation试剂盒扩增RNA,随后利用合成的cDNA进行荧光定量PCR实验,分析投射神经元核糖体蛋白相关基因的表达情况。结果发现,与大脑皮层其它皮层组织相比,第五皮层投射神经元内部分核糖体蛋白相关基因的表达相对较高。这表明第五皮层投射神经元可能具有活跃的蛋白质合成功能,是核糖体蛋白质的能量场所,借此维持第五皮层脊髓投射神经元长轴突和大胞体的能量需要。     

核糖体蛋白质的新功能及其与相关疾病的关系

核糖体蛋白质与核糖体RNA共同组成了核糖体,是合成蛋白质的细胞器。除参与蛋白质合成,核糖体蛋白质还具有广泛的核糖体外功能,如独立于核糖体外发挥调控基因转录、mRNA翻译、细胞的增殖、分化和凋亡等等。基于诸多的核糖体外功能,核糖体蛋白质与人类疾病密切相关,例如在先天性贫血、生长发育不全和肿瘤的发生发展过程中均发挥重要作用。本文对近年来核糖体蛋白质的核糖体外新功能及其相关疾病的研究进展作一综述。     

核仁蛋白质的定位、移位和核仁功能

核仁一直被认为只是核糖体合成和加工的场所,但是近年研究发现它具有其他功能.核仁是一个高度动态的亚细胞结构,通常情况下核仁蛋白质在核仁内外不断穿梭完成对于核糖体的运输.但在细胞应激反应时核仁成为细胞应激的感受器(cell stress sensor),核仁蛋白质在核仁内外的定位分布发生改变,同时伴随功能改变,介导细胞的应激反应.     

烟草愈伤组织继代培养和分化期间蛋白质代谢的比较研究

柳叶烟草(Nicotiana tabacum L.)愈伤组织在分化和芽原基形成期间,与继代增殖培养物比较,蛋白质含量与蛋白水解酶活性均缓慢上升;组分Ⅱ(水溶性蛋白与酶蛋白)蛋白质和核糖体组蛋白的合成速率都明显高于继代培养物;分化组织中总核糖体水平,特别是执行蛋白质合成功能的多聚核糖体的构建也都高于继代培养物。显然,分化培养愈伤组织较继代培养物有更高的蛋白质合成作用;而且组织分化和芽原基形成所需合成的新蛋白组分是与继代增殖生长的不同。继代培养后期,蛋白水解酶活性迅速升高,多聚核糖体相对量与蛋白质合成速率均明显下降,蛋白质含量急剧降低,表现出继代培养物开始衰老的代谢特征。此时期的分化培养组织,随着芽原基的继续生长,虽然蛋白质合成速率、多聚核糖体水平与蛋白质含量较前期有所降低,但都明显高于同时期的继代培养愈伤组织。     

核糖体相关质量控制与核糖体自噬研究进展

细胞中蛋白质处于不断合成和降解的动态更新过程中,其稳态与细胞功能密切相关。细胞中存在多种蛋白质质量控制（protein quality control,PQC）机制来监测蛋白质合成和降解过程的异常,以确保蛋白质组的完整性和细胞适应性。核糖体是细胞内数量最多的细胞器,系细胞内蛋白质合成的主要场所。现已明确,核糖体相关质量控制（ribosome-associated quality control,RQC）与核糖体自噬能通过溶酶体依赖和非依赖途径调节细胞内核糖体数量及功能以维持蛋白质稳态,从而增强细胞在应激状态下的适应能力。RQC失调、核糖体自噬障碍则参与多种疾病的发生及发展过程,靶向RQC和核糖体自噬可能成为防治多种疾病的有效手段。本综述聚焦核糖体相关的PQC途径,并进一步讨论了它们在蛋白质稳态维持中的重要地位及其在人类疾病发生发展中的潜在作用。     

大肠杆菌核糖体蛋白质L24和L27突变对λN和λQ基因表达的影响

核糖体是生物体翻译遗传密码的唯一场所。核糖体各组份的确切功能目前仍不清楚。本实验室的研究已证实：有些核糖体蛋白质突变能在翻译水平上影响核糖体翻译的特异性。本文使用转座子Tn10将核糖蛋白质L24（rpmA）突变从A19的衍生株转到T83菌株上,并研究这2个突变对λN和λQ基因及对N-lacZ和Q-lacZ融合基因表达的不同影响,为核糖体蛋白质能影响核糖体翻译的特异性提供了又一个实例。     

核糖体在蛋白质生物合成中的功能

核糖体是细胞中蛋白质合成的机器。许多科学研究的工作小组都试图阐明这种合成机器的机理。     

利用基因组学和MALDI-TOF MS技术鉴定放线菌纲细菌的核糖体蛋白质标志物

【目的】基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法基于微生物的特征蛋白指纹图谱鉴定菌种,本研究利用基因组学和MALDI-TOFMS技术鉴定放线菌纲细菌的核糖体蛋白质标志物。【方法】从MALDI-TOF MS图谱数据库选取放线菌纲代表菌种,在基因组数据库检索目标菌种,获取目标菌株或其参比菌株的核糖体蛋白质序列,计算获得分子质量理论值,用于注释目标菌株MALDI-TOFMS指纹图谱中的核糖体蛋白质信号。【结果】从8目,24科,53属,114种,142株放线菌的MALDI-TOFMS图谱中总共注释出31种核糖体蛋白质。各菌株的指纹图谱中核糖体蛋白质信号数量差异显著。各种核糖体蛋白质信号的注释次数差异显著。总共15种核糖体蛋白质在超过半数图谱中得到注释,注释次数最高的是核糖体大亚基蛋白质L36。【结论】本研究找到了放线菌纲细菌MALDI-TOF MS图谱中常见的15种核糖体蛋白质信号,可为通过识别核糖体蛋白质的质谱特征峰鉴定放线菌的方法建立提供依据。     

建议开展核糖体RNA拓扑学与核糖体失活蛋白的研究

(一)核糖体RNA拓扑学研究的重要性核糖体是细胞合成蛋白质的唯一场所。核糖体包括两个亚基,由RNA和蛋白质组成,蛋白质占1/3,而RNA占2/3,即RNA是主要组分。蛋白质生物合成的大多数步骤,包括肽链合成的起始、延伸和终止都是在核糖体上进行的。整个合成过程涉及二百多种生物大分子的协同作用。在蛋白质生物合成中,重要的是肽键的形成。这一化学反应就是在核糖体上进行的。核糖体的任何个别组分或局部组分都不能催化肽键的形成,而必须是完整的核糖体,因此人们认为核糖体本身就是一个包括多种蛋白质和rRNA的复杂酶系(有人把核糖体看作     

核糖体谱技术及其应用

当前,基因组范围内分析细胞内蛋白质翻译事件的研究仍然落后于转录事件的研究.无论原核生物还是真核生物,细胞内的核糖体均是蛋白质翻译的工厂,因此对于核糖体的研究至关重要.早在1963年,Warner等[1]发现了细胞内的多聚核糖体结构.Wolin和Walter[2]用RNase消化正在翻译中     

TSR1突变导致先天性白内障及其在晶状体中的表达

先天性白内障(congenital cataract,CC)是一种罕见的晶状体发育异常疾病,主要表现为晶状体部分或完全浑浊。先天性白内障遗传异质性高,已鉴定的致病基因多达266个。本研究在一个中国先天性白内障家系中通过全基因组测序及Sanger测序验证,筛查到一个新的先天性白内障候选致病基因TSR1,与家系疾病表型共分离。通过minigene实验证实该变异影响TSR1基因mRNA剪接。Western blotting、免疫荧光和RT-PCR实验证实TSR1在人晶状体上皮细胞SRA01/04、年龄相关性白内障患者晶状体前囊膜组织、24周人胎眼晶状体和小鼠晶状体中表达。通过对iSyTE数据库的分析发现,Tsr1在小鼠的胚胎期和不同发育时期的晶状体中都有表达,且在晶状体特异性CBP:p300双敲除小鼠中Tsr1表达下调。提取在CBP:p300双敲除小鼠晶状体中与Tsr1具有相同表达模式的一组基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析,结果表明筛选出6个基因与Tsr1存在直接相互作用。GO功能分析表明Tsr1参与核糖体的组装,还可能在MAPK-Erk信号通路中发挥作用,为进一步明确Tsr1在晶状体中的功能提供了有价值的研究线索。     

细胞中蛋白质的合成和转运（一）

细胞的一切功能活动,都离不开蛋白质的参与,细胞中蛋白质的合成场所有两处：基质中和ＲＥＲ 上的多聚核糖体上。特定蛋白有特定的合成场所和转运方式,本文简要介绍了分泌蛋白、膜嵌入蛋白、溶酶体蛋白、亲核蛋白、过氧物酶体蛋白、叶绿体蛋白、线粒体蛋白的转运方式     

MPTP慢性帕金森病小鼠纹状体差异蛋白质的研究

目的分离、鉴定MPTP诱导慢性帕金森病模型小鼠纹状体差异表达的蛋白质,对MPTP慢性PD动物模型的特异性蛋白质组进行初步探讨,为PD的发病机制提供一定的蛋白质组学依据。方法成功建立MPTP诱导慢性帕金森病小鼠模型,提取模型组和对照组小鼠脑纹状体蛋白质,分别以固相pH梯度等电聚焦为第一向,SDS-PAGE垂直电泳为第二向进行2-DE。图像分析软件PDQUEST8.0分析电泳图谱找出差异表达蛋白,运用MALDI-TOF MS质谱鉴定;其肽质量指纹图（PMF）经MS Fit检索。结果比较MPTP诱导慢性PD模型小鼠和正常对照小鼠纹状体二向电泳图,发现12个蛋白表达异常,最终鉴定出其中4个蛋白质：线粒体裂殖调节因子1（mitochondrial fission regulator 1）、类泛素样蛋白3前体（ubiquitin-like protein 3 precursor）表达下调;S100蛋白A10（proteinS100-A10）、Lin-7 homolog B为新出现点。结论初步鉴定出MPTP慢性PD模型小鼠纹状体部分差异表达蛋白,所发现4个表达异常的蛋白质与帕金森病线粒体的损伤和兴奋性神经毒性密切相关,与PD的发病机制相符,为深入研究帕金森病病理机制奠定了基础。     

线粒体核糖体蛋白质与人类恶性肿瘤

线粒体拥有自身独特的核糖体--线粒体核糖体,用于翻译线粒体DNA（mitochondrial DNA, mtDNA）编码的基因。线粒体核糖体由核基因编码的线粒体核糖体蛋白质(mitochondrial ribosomal protein, MRPs)和线粒体自身编码的rRNA组装而成。MRPs表达失调会引发代谢紊乱、呼吸链受损,导致细胞发生功能障碍和异常增殖,甚至发生癌变等恶性转化。大量研究证明,MRPs在不同的肿瘤细胞中表达异常,提示着MRPs在肿瘤发生发展过程中发挥着重要作用。本文就线粒体核糖体蛋白质与人类恶性肿瘤发生的关系作一综述,为进一步阐明其在恶性肿瘤发生过程中的作用机制奠定基础。     

烟草愈伤组织生长和衰老过程中多聚核糖体类群的变化(英文)

本研究中测定了黄花烟草(Nicotiana rusticaL cv.Gansu yellow flower)愈伤组织生长和由碳水化合物亏缺引起的衰老过程中多聚核糖体类群和蛋白质含量的变化,以期查明衰老的烟草愈伤组织中蛋白质合成速率与蛋白质含量变化的相关性。 继代培养的烟草愈伤组织经过约5d的生长迟滞期,进入指数生长期,第20天后生长停止,干重缓慢下降;第25天出现类似果实成熟时的呼吸跃变现象,呼吸商(RQ)开始下降,呼吸底物由糖转向游离氨基酸,表明在本实验条件下,烟草愈伤组织在培养20～25d后由生长转向衰老,这时蛋白质含量(占细胞总蛋白的90％～95％)立即降低,第35天降低了26％。代表蛋白质合成能力的多聚核糖体相对含量和总核糖体的相对含量在培养20d后开始减少;两者的比值也降低,这与植物衰老过程中蛋白质含量的降低基本一致,表明烟草愈伤组织衰老过程中蛋白质含量的降低.与蛋白质合成能力的下降可能有一定的关系。由于多聚核糖体的解聚并不伴随有单核糖体的增加,也暗示衰老过程中单核糖体被迅速破坏。     

拟南芥RPP1A参与幼苗生长的蛋白质组学分析

核糖体蛋白不仅参与蛋白质合成,而且参与植物生长发育的调控.利用拟南芥核糖体磷酸蛋白P1(ribosomal phosphoprotein P1,RPP1)家族基因RPP1A缺失突变体rpp1a研究RPP1A缺失对幼苗蛋白质表达水平的影响,揭示其参与调控幼苗生长的作用机制.表型分析发现,与野生型WT相比,RPP1A缺失导...     

蛋白质翻译中的反转运

在蛋白质的翻译过程中,氨酰-tRNA进入核糖体,解密mRNA上的一个密码子,并带着mRNA向其5'的方向运动,直到空载的tRNA离开核糖体,整个过程tRNA在核糖体内始终沿着一个方向运动.但随着LepA(EF4)蛋白的发现和其功能的明确,tRNA在核糖体内的新运动形式--"反转运"被揭示,即tRNA带着mRNA倒退一步,向其3'的方向运动.通过对tRNA反向运动生理意义的研究,引发了对蛋白质翻译调控的深入思考.     

萌发绿豆子叶衰老期间蛋白质代谢的变化

萌发绿豆子叶自然衰老过程中可溶性蛋白质含量一直下降;从衰老开始到衰老前期,总游离氨基酸含量明显上升;但游离氨基酸各组分在子叶衰老期间的变化趋势并不相同。~3H-亮氨酸掺入蛋白质试验和多聚核糖体的相对量及其与总核糖体的比值(P/T)测定都证明在子叶衰老前期有蛋白质的新合成。子叶衰老期间。氨肽酶活性明显降低;而以酪蛋白为底物的蛋白水解酶活性却急剧上升,承担着催化蛋白质降解的主要功能。     

《自然-结构和分子生物学》：首次获得膜蛋白形成瞬间图像

据美国物理学家组织网近日报道，在两项最新的研究中，研究人员首次详细地描述了生产蛋白质的核糖体如何将刚形成的蛋白质嵌入到细胞膜内。并首次获得蛋白质进入膜的图片。     

铁过载促进小鼠肝组织发生蛋白质酪氨酸硝化

蛋白质酪氨酸硝化是一种蛋白质翻译后的修饰,其存在会影响酶的催化活性,细胞信号转导和细胞骨架结构．在铁过载情况下,存在引起蛋白质酪氨酸硝化的有利环境,但目前尚无实验证实．本文运用腹腔注射右旋糖苷铁造成小鼠铁过载模型,通过免疫印迹法发现,在铁过载情况下,肝中诱导型一氧化氮合酶表达显著高于正常对照小鼠;铁过载小鼠肝中总体蛋白质硝化程度高于正常小鼠;铁过载引起的蛋白质酪氨酸硝化有一定的选择性,在铁过载小鼠肝中发现一些新的被硝化蛋白质条带（约 57 kD、 35 kD）．上述结果证实,铁过载会促进肝蛋白质酪氨酸硝化．