急剧弯曲DNA柔韧性的研究进展

基因调控,核小体和病毒的包装行为都会涉及DNA的急剧弯曲成环。DNA分子的环化是研究其本身柔韧性的主要方法。目前已经发展出很多研究DNA环化的模型,其中WLC(worm-likechain)模型较为成熟。近年来,在DNA环化的重要参数、影响因素以及DNA急剧弯曲成环的理论研究等诸多方面都有了新进展。     

DNA结构的多态性

在生物体内ＤＮＡ不仅能形成多种右旋双螺构象,还能形成左旋双螺旋、三股螺旋和四联体螺构象。目前已证实或推测这睦不同形态的ＤＮＡ结构,都具有重要的生物学意义。对ＤＮＡ结构的进一步深入研究,将促进ＤＮＡ结构学说的发展。     

三锭DNA结构研究的新进展

本文详细总结了近年来三螺旋ＤＮＡ的结构和应用研究方面的进展,研究了各种因素对三螺肇稳定性的影响,并提出了一些在三螺肇ＤＮＡ中富有挑战性的需进一步研究的问题。     

DNA依赖蛋白激酶研究进展

DNA依赖蛋白激酶由Ku异二聚体和DNA-PKcs组成,结合Ku蛋白后,DNA-PK激酶活性激活,DNA依赖蛋白激酶具有多功能性,参与DNA修复、基因重组以及复制、转录等多种细胞学过程.     

DNA修复酶的结构和功能

DNA修复酶是一类能保护生物体免受各种DNA损伤的毒性效应和保证遗传信息完整性的重要酶蛋白。近年来对DNA修复酶晶体结构的研究揭示了一些结构基序参与了酶蛋白与特定DNA损伤的识别过程,这些研究结果促进了对修复特定DNA损伤的作用机理和结构基础的认识和了解。本文综述了这方面的研究进展。     

DNA连接酶的结构与功能

在ＤＮＡ合成中 ,合成方向为 5′→ 3′ ,即一条链上是连续复制的 ,而另一条链的复制是不连续的 ,必须先合成岗崎片段 (真核细胞的岗崎片段为 10 0ｂｐ ,原核细胞的为 10 0 0ｂｐ)。ＤＮＡ连接酶的作用就是催化岗崎片段的连接以完成ＤＮＡ的合成。另外 ,ＤＮＡ连接酶在ＤＮＡ修复过程中也起重要作用 ,如在切除修复中 ,切除损伤的ＤＮＡ片段 ,以未受损伤的链作为模板合成一条新的ＤＮＡ链后 ,ＤＮＡ连接酶将新合成的ＤＮＡ链与原来的ＤＮＡ链之间的缺口封闭完成ＤＮＡ的修复。ＤＮＡ链未封闭的缺口对细胞具有潜在的危险性 ,所以 ,ＤＮＡ连接…     

高频激光-DNA分子相互作用体系相空间的局域特征

利用激光与DNA分子相互作用的动力学模型,借助适当的数值方法,讨论了系统动力学演化及相空间特性。结果表明：高频激光可使DNA分子的运动状态发生变化;特别地,相空间分析表明,高频激光的作用会使DNA分子运动在一些特定状态之间转变。从而可说明高频激光作用下DNA分子呈现新的有序运动现象。     

DNA拓扑异构酶Ⅱ的结构和作用原理

1976年美国国立卫生研究所的Ｇｅｌｌｅｒｔ等从大肠杆菌中提取到解旋酶 (ｇｙｒａｓｅ ,也叫细菌ＤＮＡ拓扑异构酶Ⅱ ,以下简称ＴｏｐｏⅡ )以来 ,对ＴｏｐｏⅡ的作用机制一直存在争议。Ｔｓｅ (1 980 )报道 ,ＴｏｐｏⅡ能同时打断ＤＮＡ的两条链 ,ＴｏｐｏⅡ的两个亚基通过磷酸化酪氨酸残基酯键分别与断开的ＤＮＡ的两个 5′末端连接 ,并互相错开 4个碱基对 ,以便让另一股ＤＮＡ双链通过。这种作用机制向来只有间接的证据。直到最近 ,Ｊａｍｅｓ等用Ｘ射线衍射方法研究酵母ＤＮＡ拓扑异构酶Ⅱ的大片段的晶体结构 ,提供了一个该酶的分子模…     

高等植物DNA重复序列的主要类型和特点

高等植物核基因组的一个显著特征是其内含有大量的ＤＮＡ重复序列,因此它们在核基因组结构和功能研究中居于举足轻重的地位。一些ＤＮＡ重复序列已日趋广泛地作为分子民用于构建遗传图谱、鉴别品种、研究进化和分离目标基因等。主要介绍高等植物几类重要ＤＮＡ重复序列,如卫星ＤＮＡ、微卫星ＤＮＡ、核糖体ＲＮＡ基因、端粒重复序列和转座子等的若干特点和用途。     

DNA的核骨架结合序列（MARs）研究进展

核骨架结合序列(Matrix-associated Reg-ions,MARs)是存在于真核细胞染色质中的一段与核骨架特异性结合的DNA序列。它常常位于基因的侧翼区内,与一些调控因子相邻;序列具有A-T丰富的特点,而且常常含有拓扑异构酶Ⅱ的酶切位点。近年来的研究表明MARs参与了细胞的许多重要的生命活动,包括染色质的组装,基因的复制和表达。因此,MARs被认为是一种决定染色质结构性和功能性区域的新的顺式调控因子。本文对MARs的特点,生物学功能以及研究方法等方面的最新进展进行了阐述。     

DNA序列分析新进展

自从生物学家发现DNA是生命的遗传物质之后,便迫切地想知道它是如何携带信息及控制遗传的.这取决于对DNA分子中的碱基序列的分析.序列分析对于发现旧的基因,促进基因工程的发展有着重大意义.本世纪七十年代,世界上许多生物实验室相继进行这方面的研究.1977年,英国的Sanger序列测定的末端终止法,随后,Maxam和Gilbert等人提出     

抗癌药物顺铂对DNA结构的影响

本文采用脉冲激光荧光技术及常规的荧光分光光度计详细地研究了顺铂对DNA变性温度的影响,DNA氢键受损的碱基对数随温度变化,DNA的G—C碱基含量对顺铂作用效果以及顺铂浓度的影响,初步探讨了抗癌药物顺铂对DNA的结构影响.     

质粒pUC18 DNA的螺线管型超螺旋结构

理论上,游离的超螺旋DNA可以采取两种结构形式：互缠式超螺旋和螺线管型超螺旋。前者早已被透射电子显微镜和原子力显微术的研究所证实,而后者却仍然缺乏足够的证据。使用温和的清亮裂解液法,从DNA拓扑酶野生型大肠杆菌HB101细胞抽提质粒pUC18 DNA。经CsCl-EB平衡密度梯度超离心分离获得超螺旋pUC18 DNA和松弛型pUC18 DNA(DNA Ⅱ）。纯化DNA分别用疏水必不容放亲水性溶剂系统的细胞色素单分子层展开技术制备电子显微镜标本。观察结果显示：在疏水性的甲酰胺－水展开系统中,DNA采取通常的互缠式结构;在含有1.5mmol/L醋酸铵的水介质中制备的超螺旋DNA标本,DNA采取线圈型结构,测得pUC18 DNA（单体）分子这种结构的外直径约为43.8nm,内直径约为2nm。在相同亲水介质中松弛型pUC18 DNA采取典型的螺线管型结构,其单体平均外直径约为53.1nm,内直径约为17.2nm。表明：在疏水介质中超螺旋DNA趋向于采取互缠式结构,而在亲水介质中DNA则要取螺线管型结构。DNA链之间可能存在非共价相互作用以维持这种结构。螺线管型结构可能是水溶液中的超螺旋DNA分子普遍的存在形式。     

遗传密码和DNA序列的高维空间数字编码

二进制数字化编码是信息科学最基本的编码方式。用０（００）、１（０１）、２（１０）和３（１１）４个数码对４种碱基（Ｃ、Ｔ、Ａ、Ｇ）进行二进制数字编码,共有２４种可能的编码组合,其中８种满足碱基到补法则,它们是拓扑等价的。按碱基分子量大小排列的编码格式：０１２３／ＣＴＡＧ是最理想的编码格式。用二进制数对ＤＮＡ的字符序列进行编码,有以下优点：１）压缩信息冗余度,提高编码效率;２）可以对碱基的结构、功能基