镜湖萼花臂尾轮虫（Brachionus calyciflorus）种群遗传多样性的季节变化

运用随机扩增多态DNA（RAPD）技术研究了于2005年春季和夏季采自芜湖市镜湖的萼花臂尾轮虫（Brachionus calyciflorus）种群基因组DNA多态性。从44个随机引物中筛选出10个谱带清晰、重复性好的引物。10个引物共检测到76个位点,其中65个位点显多态性,多态位点比例（P）为85.5%。对RAPD扩增结果进行聚类分析,基于遗传距离指数构建了萼花臂尾轮虫的UPGMA和ME系统树。经计算,各克隆平均遗传距离指数为0.5219,春季种群内遗传距离指数（0.4416）大于夏季种群内遗传距离指数（0.4304）;两季节种群间遗传距离指数为0.6010,明显大于季节种群内遗传距离指数。16个克隆分别聚在2个主要簇群中,在UPGMA系统树中,春季种群和夏季种群明显分聚在两个主要支系中;而在ME树中,除了夏季Su2克隆和春季种群聚到一个支系外,其它夏季种群则聚在一个独立支系中。上述结果表明,春季种群和夏季种群在遗传上具有较大的差异;镜湖萼花臂尾轮虫种群存在着明显的季节更替,而Su2克隆可能是春季和夏季种群间的过渡。     

南方红豆杉不同居群遗传多样性的RAPD研究

用随机扩增多态性方法对广东、湖南、江西等3省的12个南方红豆杉自然居群进行了基因组DNA多态性分析,从100条引物中共筛选出10个引物,获得RAPD谱带86条,多态性谱带占51％。聚类分析结果表明：南方红豆杉居群间的遗传距离与这些居群的地理分布相关,即相同或相邻产地的居群间的遗传距离较小,不同产地个体间的遗传距离较大。粤北南方红豆杉的9个居群的遗传多样性较低,可能与近年来资源遭到严重破坏,及其生长缓慢、种子萌发率低、成活率不高等原因有关。     

长筒石蒜居群遗传多样性RAPD分析

利用RAPD标记对长筒石蒜3个居群的遗传多样性及分化程度进行了研究。12条随机引物扩增出94个可分析位点,多态位点比率(PPB)为65.96%,表明长筒石蒜具有比较高的遗传多样性。经POP-GENE32分析表明:Nei’s基因多样性指数(h)为0.1897,香农多样性指数(Ⅰ)为0.2945,基因分化系数(GST)为0.1191,基因流(Nm)为3.6980。经WINAMOVA分析表明:居群内遗传变异占71.75%,而居群间只占28.25%。遗传多样性分析表明,各居群的遗传多样性水平由高到低为琅琊山居群>宝华山居群>盱眙居群。遗传分化表明:长筒石蒜各居群间遗传分化程度较低;大部分遗传变异存在于居群内部,表明其具有较强的进化潜力,自然情况下不会处于濒危状态,野生种质资源的破坏,主要来自于人为干扰。     

红臂尾轮虫和壶状臂尾轮虫生活史特征比较

应用单个体培养方法,以浓度为3．0×10^6 cells／ml的斜生栅藻（Scenedesmus obliquus）为食物,在18、23、28℃和33℃下,对分类存疑种类红臂尾轮虫（Brachionus rubens）和壶状臂尾轮虫（B．urceolaris）的生活史特征进行了比较研究。结果表明,随着温度的升高,两种轮虫的生殖前期和生殖期历时、平均寿命、世代时间和生命期望均逐渐显著地缩短,而种群内禀增长率却极显著地增大。红臂尾轮虫在28℃下的生殖后期历时与23℃和33℃间均无显著的差异,壶状臂尾轮虫在28℃和33℃下的生殖后期历时也无显著的差异。红臂尾轮虫的产卵量和净生殖率均在33℃下最小,在其他3个温度间都无显著的差异;壶状臂尾轮虫的产卵量和净生殖率均在33℃下最小,28℃下最大。18、23℃和28℃下红臂尾轮虫的生殖前期历时、平均寿命、生命期望和世代时间都显著短于壶状臂尾轮虫,而生殖期历时在两者间无显著差异;33℃下红臂尾轮虫的生殖期历时、平均寿命、生命期望和世代时间都显著长于壶状臂尾轮虫,而生殖前期历时在两者间无显著差异。各温度下,红臂尾轮虫的产卵量、种群内禀增长率和净生殖率均极显著地高于壶状臂尾轮虫,但两种轮虫的生殖后期历时无显著的差异。红臂尾轮虫偏向于r-对策者,体现在其较低的生命期望、较高的繁殖率和种群增长率;而壶状臂尾轮虫则显示出较高的生命期望、较低的种群增长率和繁殖率,偏向于k-对策者。     

食物浓度对三个地理品系角突臂尾轮虫种群增长、个体大小和卵体积的影响

以浓度分别为 3 0× 10 6、 6 0× 10 6、 9 0× 10 6和 12 0× 10 6cells/mL蛋白核小球藻 (Chlorellapyrenoi dosa)为食物 ,在温度为 (2 5± 1)℃下 ,应用群体累积培养法研究了食物浓度对分布于长江、珠江和淮河水系的 3个地理品系的角突臂尾轮虫 (Brachionusangularis)种群的增长、个体和卵的体积的影响。结果表明 ,食物浓度、地理品系及两者间的交互作用对轮虫种群增长率、个体和卵的体积均有显著影响。同一食物浓度下 ,广州品系的种群增长率最大 ,芜湖品系的个体和卵体积最大 ;同一品系中 ,当食物浓度为 9 0× 10 6cells/mL时轮虫有较大的种群增长率。各品系轮虫的种群增长率与食物浓度均呈曲线相关 ,但种群增长率达最大时所需的食物浓度在各品系间存在着差异。在食物浓度和品系两因素中 ,品系对轮虫个体体积有较大的影响     

温度对三品系角突臂尾轮虫生活史策略的影响

应用群体累积培养法 ,以浓度为 6 .0× 10 6cells/mL蛋白核小球藻 (Chlorellapyrenoidosa)为食物 ,研究了温度(2 0℃、2 5℃和 30℃ )对青岛、广州与芜湖等品系的角突臂尾轮虫 (BrachionusangularisGosse)的种群增长、个体大小和卵大小的影响。结果表明 ,温度对各品系轮虫的种群增长率和个体大小等均有显著影响。青岛品系和广州品系轮虫种群增长的最适温度分别为 30℃和 2 5℃ ,芜湖品系轮虫则在 30℃下不能生存。青岛品系和广州品系的种群增长率均与温度呈曲线相关 ,回归方程分别为 :Y =0 .0 0 0 9X2 - 0 .0 0 6 1X 0 .4 0 90和Y =- 0 .0 14 4X2 0 .74 12X - 8.375 1。各品系轮虫个体大小和卵大小均随温度的升高而呈现出下降趋势。在本研究的温度范围内 ,广州、青岛和芜湖各品系轮虫个体变异分别达 4 2 .90 %、14 .4 3%和 6 .2 3% ;2 0℃和 2 5℃下芜湖品系分别高出青岛品系达 74 .91%和87.98%。在温度和品系两因素中 ,品系对轮虫个体体积有较大的影响     

食物浓度对角突臂尾轮虫种群增长、个体大小和卵大小的影响

以蛋白核小球藻为食物 ,应用群体累积培养法研究了食物浓度对角突臂尾轮虫种群增长、个体大小和卵大小等的影响 .结果表明 ,食物浓度对角突臂尾轮虫种群增长率、个体大小和卵大小均有极显著影响 .其中 ,轮虫种群增长率与食物浓度间呈曲线相关 ;当食物浓度为 8.2 4 5 3× 10 6cells·ml-1时 ,种群增长率达最大值 0 .6 0 85d-1;在所研究的食物浓度范围内 ,轮虫个体具有随食物浓度的增大而增大的趋势 ,轮虫卵体积在中等食物浓度范围 (6 .0× 10 6～ 9.0× 10 6cells·ml-1)时较大     

四种臂尾轮虫rDNA16S-23S基因间隔区的序列测定与分析

轮虫是一类小型无脊椎动物,在水生态系统中具有重要的作用。有关轮虫的分类,以往的研究手段主要局限于传统的外部形态和内部特征的比较。       

海南岛臂尾轮属物种多样性

于2010年11月、2011年5月和8月调查了海南岛臂尾轮虫的多样性,共检出臂尾轮虫25种。其中,东洋界特有种3种:双叉异棘臂尾轮虫(Brachionus donneri bifurcus)、墨氏臂尾轮虫(B.murphyi)和黄氏臂尾轮虫(B.huangi);东洋界新纪录种1种,刻纹臂尾轮虫(B.sericus);对折臂尾轮虫(B.dimidiatus)、褶皱二叉臂尾轮虫(B.dichotomus reductus)和奇异方形臂尾轮虫(B.quadridentatus mirabilis)是中国的新纪录种或亚种。方形臂尾轮虫(B.quadridentatus quadridentatus)、萼花臂尾轮虫(B.calyciflorus)、镰形臂尾轮虫(B.falcatus)和角突臂尾轮虫(B.angularis)为常见种类。海南岛臂尾轮属种类多样性高于我国其他地区,并由广布种、全热带种和泛热带种类组成。海南岛与我国其他地区的臂尾轮虫种类组成Bray-Curtis距离指数随着纬度的增加而增加。     

褶皱臂尾轮虫的培养试验

本文是作者于1989年5—10月间,于广西防城县在锯缘青蟹人工育苗试验中进行的试验,试验用普通面粉及黄豆加工成发酵面粉与豆浆作轮虫的主饵料,用动物性饵料如小鱼汁、螺肉汁、蛤肉汁、发酵人尿等含有机质丰富的液体作辅助饵料,用7个25m~3的大池培养,共培养出了约900×10~(10)多个轮虫,供给锯缘青蟹幼体足够的活饵料,使当年培养出C_1期以上的幼蟹达22.269万只。本试验中,光照对轮虫的生长繁殖有较大影响。     

蒙古冰草遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD技术对蒙古冰草（Agropyron mongolicum Keng)6个天然居群和2个栽培品种（系）的45个个体进行了遗传多样性检测。17个引物共检测到101个位点,其中多态位点81个,占80.2%,相对于其它小麦族植物,显示出了较高的遗传多样性,多样性指数（DC）分析的结果表明,遗传多样性在居群内和居群间的分布存在不均衡现象,但总体来看,居群内的遗传变异高于居群间,这是由蒙古冰草异花,风媒传粉的外繁育系统所决定的,在天然居群与栽培品种（系）间,前者的DC值为0.250,后者的DC值为0.181,而且前者的平均遗传距离（0.290)也高于后者（0.213),表明天然居群间的遗传分化大于栽培品种（系）,这与天然居群间环境的异质性密切相关,同时也反映了栽培品种（系）间较近的亲缘关系,UPG-MA聚类分析的结果表明,8个居群基本上可被分为与其生境特点及生长条件相适应的3个类群,反映了自然选择及人工选择对居群间遗传分化的巨大影响。     

利用RAPD标记评价小豆种质遗传多样性

本研究利用10个RAPD引物对180份小豆种质的基因组DNA进行扩增,共扩增出44条带,其中35条具有多态性,比例为79.5%,平均每个引物扩增出3.5条多态性带;平均遗传距离为0.274,变异幅度为0.05～0.60,平均遗传多样性指数为0.692;基于RAPD标记,把180份小豆种质聚类划分为4个组群,该组群的划分与小豆的生态地域性似乎不存在明显的相关性.     

螅状独缩虫(Cachesium polypinum)遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术对武汉的汉口（ＣＰ－１）、汉阳（ＣＰ－２）和武昌（ＣＰ－３）三个地区缘毛类的螅状独缩虫（Ｃａｃｈｅｓｉｕｍ ｐｏｌｙｐｉｎｕｍ）进行了遗传多样性分析。结果表明：这种动物存在广泛的变异,三个地域群体之间的遗传相似度为０．６５２２－０．７３８５（平均值为０．６９２１）,各群体之间遗传相似度大小依次为：ＣＰ－２－ＣＰ－３〉ＣＰ－１－ＣＰ－２〉ＣＰ－１－ＣＰ－３。本文对     

天然红松遗传多样性在时间尺度上变化的RAPD分析

应用RAPD技术对凉水国家自然保护区的天然红松(Pinus koraiensis)种群在时间尺度上的遗传多样性变化和遗传分化进行了分析。选择树龄为1~100 a的红松个体,每10 a为1个龄级,共采集样本245个。10个随机引物共检测到61个位点,其中多态位点50个,多态位点比率为81.97%。Shannon指数龄级间遗传多样性占总多样性的16.43%,Nei指数龄级间遗传分化为13.64%,两种指数都表明,红松在时间尺度上的遗传分化比空间尺度的低,红松的遗传变异主要存在于龄级内。本研究结果证实,凉水保护区内的红松遗传多样性在近100 a的时间内出现过大小两次波动,目前该地区的红松遗传多样性正处于上升时期;历史上小规模的采伐虽然暂时降低了红松的遗传多样性,但由于保护区的及时建立,红松的遗传多样性得到了有效的恢复。     

RAPD分析花椰花不同品种的遗传变异

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）方法,对13个花椰花品种的基因组DNA进行多态性分析。选用20个10bp随机引物,共扩增出175条DNA片段,其中多态性片段118例,占67．4％,结果表明,花椰花品种间具有丰富的遗传多样性。依据扩增结果进行遗传相似系数分析,构建聚类分析树状图。初步探讨了各品种间的遗传变异关系及RAPD技术在花椰花种质资源分类鉴定和育种工作中的应用前景。     

濒危灌木长叶红砂遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD分子标记对濒危灌木长叶红砂(Reaumuria trigyna)种群遗传多样性进行了分析.应用18条随机引物对长叶红砂5个种群的95个个体进行扩增,检测到118个位点,其中多态位点105个.结果表明:长叶红砂种群的多态位点比率(P)为88.98%,显示出长叶红砂种群存在较高的遗传多样性.Shannon多样性指数(0.4966)、Nei基因多样性指数(0.3303)和基因分化系数(Gst=0.1425)的分析结果显示,长叶红砂种群遗传变异大多存在于种群内,种群间的遗传分化占14.25%.聚类分析表明,长叶红砂种群遗传距离与地理距离之间无直接相关关系.遗传多样性水平与物种特性和所处不同群落有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低.     

长叶榧(Torreya jackii Chun)遗传多样性分析

利用RAPD技术分析了长叶榧(Torreya jackii Chun)的遗传结构,用18个引物对来自福建省泰宁县的3个不同居群的66个长叶榧样本进行分析.结果显示,长叶榧群体水平的多态位点百分率达87%,居群水平的多态位点百分率分别为83%、68%和80%.群体水平上的Nei基因多样性指数为0.247 9,居群水平上分别为0.218 2、0.168 4和0.188 1.群体水平上的平均杂合度达到0.244 7,居群水平上分别为0.221 5、0.172 9和0.195 0.30.35%的遗传变异存在于居群间,69.65%的遗传变异存在于居群内.长叶榧居群的基因流量为1.689 9,显示长叶榧仍具有通过群体间的基因交流来防止遗传漂变造成的群体分化的能力.     

RAPD analysis of genetic diversity among the isolates of Aspergillus flavus from different hosts and locations

Aflatoxin contamination is a major problem in maize, groundnut, chillies, cotton and tree nuts. These aflatoxins are low molecular weight toxic and carcinogenic secondary metabolites produced by Aspergillus flavus, A. parasiticus and A. nomius. In the present study, a total of 11 isolates of A. flavus isolated from groundnut, maize and chilli collected from different locations of Tamil Nadu, India were tested for their ability to produce aflatoxin B1 (AFB1) in vitro by indirect competitive enzyme-linked immunosorbent assay. The results show that the isolates vary in their level of toxin production. The amount of AFB1 produced by the toxigenic isolates of A. flavus ranged from 6.6 to 108.1?ng?ml^?1. Among the various isolates of A. flavus, the isolate VKR produced the highest amount (108.1?ng?ml^?1) of AFB1. The isolates viz. CBE1, CBE2, BSR1, BSR3 and BSR4 were found to be non-toxigenic. The genetic variability among these isolates was assessed by Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. DNA fragments of between 0.15 and 3.0?kb were obtained using 13 random primers, and each isolate differed in the size and number of PCR products indicating considerable polymorphism. Cluster analysis using Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean clearly separated the isolates into four main clusters confirming the genetic diversity among the isolates of A. flavus. Both toxigenic and non-toxigenic isolates were intermingled in these four groups, indicating that no relationship exists between RAPD profile and the production of aflatoxin by A. flavus.     

青藏高原东部矮生嵩草遗传多样性的RAPD研究

基于随机扩增多态DNA（RAPD）方法分析了青藏高原东部矮生嵩草（Kobresia humilis）8个居群的遗传多样性及分化程度。14条随机引物共扩增出194个位点数,其中多态性片段168个。研究表明,矮生嵩草无论是在物种水平（多态条带比率PPB（％）为86．60％,Nei’s基因多样性（h）为0．2622,Shannon’s信息指数（I）为0．3983）,还是在居群水平（PPB=62．65％,h=0．2126．I=0．3185）,都具有较高的遗传多样性,居群的遗传多样性大小与生境有相关性。而且,用SPSS分析得出,8个居群的遗传多样性大小与海拔没有明显相关性。用AMOVA数据表明矮生嵩草的遗传变异主要分布在居群内（83．04％）,居群间变异较小（16．96％）。遗传分化指数Gst也显示了相似的结果（0．1891）。从矮生嵩草8个居群的遗传距离和聚类分析发现,以及用NTSYS对矮生嵩草8个居群的的遗传距离矩阵与地理距离矩阵间的关系进行Mantel检测,其结果表明各居群间的遗传距离与地理距离之间没有明显相关性（r=0．37779,P=0．9718〉0．05）。     

柱花草RAPD反应体系的建立及其8个品种遗传多样性分析

采用两种不同的方法分别从柱花草嫩叶及种子萌发芽中提取了高质量的DNA ,并对柱花草RAPD反应中的各组分浓度及热循环因素进行优化 ,建立了柱花草RAPD反应的最佳条件。在此基础上 ,用 2 0条随机引物对 8个柱花草品种进行了RAPD扩增 ,结果表明 ,其多样性达 5 1 .9% ,品种间的遗传相似系数在 0 .5 3～0 .88之间 ;根据非加权成对平均数法 (UPGMA)进行分类 ,获得了品种聚类树形图 ,8个柱花草品种均被明显分开。