噬菌体介导的病原菌—宿主相互作用的进化

微生物学作为生命科学最基础学科之一 ,历来都是推动生命科学整体进步的原动力。在微生物世界建立发展起来的分子遗传学、数量分类学、分子系统发育进化理论 (例如Ｗｏｅｓｅ生命 3域和系统发育树 )及其研究方法 ,奠定了 2 0世纪生命科学基础研究整体取得重大突破的坚实基础[1 ] 。如何认识利用和改造微生物世界奇特的生命现象和丰富的生物资源 ,一直是人类求生存斗争实践中最迫切的永恒研究主题。全球性“暴发性感染疾病”现象就是研究热点领域之一[2 ] ,近年来研究表明该现象与病原菌的“遗传因子转移”有密切关系 ,这类转移事件还加速了…     

纤毛虫分子系统发育学的研究进展

在回顾纤毛虫分子系统发育学产生发展历史的基础上,介绍了随着20年中RFLP、RAPD和DNA序列分析等分子生物学技术作为该学科的主要研究方法在种群遗传多样性与进化、种上阶元系统发育学两方面取得的研究成果和近期研究进展,最后在探讨纤毛虫分子系统发育学存在的一些问题和解决方法的同时,预测了纤毛虫分子系统发育学今后将极大地推动真核生物的起源与进化,内共生等重要生物进化问题的研究。     

等位基因杂合子现象及其在系统发育学分析中的研究概述

系统发育研究已是澄清所有进化历史问题的必由之路。选择合适的分子标记以及最大限度地挖掘和利用其所包含的系统发育信息是构建可靠的系统发育树的关键。等位基因杂合子(Intra-individual allele heterozygotes, IIAHs)是核基因内含子作为系统发育研究中的分子标记时常常出现的现象。如何挖掘并利用其中所包含的系统发育信息成为近年来系统发育学的研究热点。文章从此现象的产生、杂合子的分离以及现有的研究方法3个方面详尽概述, 阐述了IIAHs及其在系统发育分析中的最新研究进展。     

我国蛋白质组学研究现状及展望

蛋白质组学是系统研究分子机器、亚细胞器、细胞、组织、器官乃至整体等生物体系内蛋白质全组成及其活动规律的科学,已成为21世纪生命科学的焦点之一。本文简要介绍了蛋白质组学研究背景,我国蛋白质组学研究现状、存在问题和前景展望。     

青藏高原黄绿蜜环菌纯培养菌种的分离培养及分子鉴定

首次从采自青藏高原、与高原牧草嵩草属Kobresia草本植物形成外生菌根的黄绿蜜环菌Armillarialuteo-virens子实体中分离获得一组织分离菌株,运用rDNA-ITS和rDNA-IGS-1测序技术对该组织分离菌株是否为黄绿蜜环菌的纯培养菌种进行分子鉴定,并基于黄绿蜜环菌的5.8S/ITS和IGS-1序列进行核酸序列数据库GenBank同源性检索比对、构建系统发育树。结果表明,本研究获得的黄绿蜜环菌子实体组织分离菌株即为其纯培养菌种。基于ITS的系统发育分析表明黄绿蜜环菌与口蘑科内其它属间物种的系统发育关系较远;基于IGS-1的系统发育分析表明黄绿蜜环菌与蜜环菌属内的其它种序列差异较大,系统发育关系较远,而与Lepiota属内的部分种具有较近的系统发育关系。本研究首次基于分子手段对我国青藏高原的黄绿蜜环菌种进行了分离培养、分子鉴定和系统发育分析,为黄绿蜜环菌的科学分类提供了分子依据。     

鸟类形态特征的同质性比较

鸟类作为脊椎动物中的主要类群之一,其内部演化关系一直是动物学研究的重点。形态特征及分子特征在推断鸟类内部类群间的系统发育关系时被广泛应用,但长久以来受制于同质性的影响,不同形态特征难以得到一致的系统发育关系。随着基因组测序技术及分析方法的快速发展,基于大量DNA序列数据所建的物种树成为领域内普遍认可的鸟类系统发育关系。在此基础之上,重新挖掘形态特征的研究价值成为可能。本研究基于Prum发表于2015年的鸟类科级水平系统发育树,比较了不同形态特征同质性水平的差异,讨论了形态特征对于提高分子特征系统发育信号及分子树支持率的作用。研究发现,不同种类形态特征的同质性水平存在显著的差异,以一致性指数为标准,杂项特征(包括神经、肌腱及肠道的特征)的得分显著高于骨学特征和肌学特征(P < 0.01),颅骨特征的得分显著高于非颅骨、躯干及腿部特征的得分(P < 0.05);加入形态特征能够显著提高分子特征的系统发育信号(P < 0.05),也提高了分子树的支持率。综上所述,不同的形态特征在同质性水平的得分上具有显著差异,在分子特征上加入形态特征既能够提高分子特征的系统发育信号,也能够提高分子树的支持率。     

1991年度生命科学的资助范围(部分)

生命科学的研究对象是生物(包括人在内)的分子、细胞、整体和群体层次上的结构和功能。生命科学部受理有关生命科学的基础研究和应用基础研究的资助申请(不受理纯属应用性的研究及开发性的申请项目)。所资助的研究工作跨越相当大的学科范围——生物学、农学、医学等学科,也包括人口问题,国土整治问题、经济区域规划问题以至企业管理、社会治安中的生命科学问题,此外还和数学、物理学、化学、工程材料学,地球科学等基础学科相互渗透或形成边缘学科。随着工业化的发展,在环境受到污染,生态平衡受到破坏,自然资源遭受掠夺性利用的情况下,生命科学研究就显得更为重要和迫切了。     

流式细胞术在水体微型生物分子生物学研究中的应用

流式细胞术(FCM)是利用流式细胞仪对微小生物颗粒物的多种物理、生物学特性进行定量,并对特定细胞群体进行分选的分析测量技术。流式细胞仪是当代激光、流体力学、光学和电子计算机等学科技术高度发展的产物,是生命科学研究领域中先进的仪器之一。FCM最早应用于海洋生物学是在80年代中期,特别是1988年发现原绿球藻后[1],FCM成为研究水生微型生物(包括超微型生物)的重要手段。近年来,该领域的有关研究已成为海洋生命科学的研究热点,并从最初区分、记数不同微型浮游植物种群,发展到现在DNA分析和以荧光分子探针为辅助手段的系统发育分析…     

基因树冲突与系统发育基因组学研究

随着越来越多的基因序列被运用于系统发育重建中,随之产生的基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题.因此,在分子系统发育研究中,应正确理解基因树和物种树之间的差异,充分注意和分析基因树冲突的原因,正确解释分子系统发育的结果.本文通过一些典型实例分析了在多基因系统发育研究中引发基因树冲突的三类主要原因:随机误差、系统误差和生物学因素.在此基础上,对近年来兴起的系统发育基因组学进行了介绍,并以稻属Oryza研究为例,阐述了系统发育基因组学方法在解决基因树冲突以及系统发育研究中的优势和应用价值,并进一步探讨了解决基因树冲突的策略和方法,以期为分子系统发育研究提供一些肩示和帮助.     

DNA在鸟类分子系统发育研究中的应用

鸟类分子系统发育研究中常用的DNA技术有DNA杂交、RFLP和DNA序列分析等。DNA杂交技术曾在鸟类中有过大规模的应用,并由此诞生了一套新的鸟类分类系统。在鸟类的RFLP分析中,用的最多的靶序列是线粒体DNA。DNA序列分析技术被认为是进行分子系统发育研究最有效、最可靠的方法。在DNA序列分析中,线粒体基因应用最广泛,但由于其自身的一些不足,近年来,不少学者把目光投向了核基因,将线粒体基因和核基因结合起来进行系统发育研究。目前在鸟类分子系统发育中,应用较多的核基因是scnDNA,其内含子可以用于中等阶元水平的系统研究,而外显子主要用于高等阶元的系统研究。除了分子标记自身的问题之外,鸟类分子系统发育研究中还存在着方法上的问题,包括分子标记的选择,样本数量以及数据处理等。今后鸟类分子系统发育研究应该更加注重方法的标准化。