地高辛精标记酪氨酸羟化酶RNA探针的制备研究

为制备用地高辛精（Ｄｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎ,Ｄｉｇ）标记的酶氨酸羟化酶（ＴｙｒｏｓｉｎｅＨｙｄｒｏｘｙｌａｓｅ,ＴＨ）ＲＮＡ探针,本研究用分子生物学技术重组质粒ＰＧＥＭＴＨＩ,即分别将携带Ｔ７和Ｓｐ６启动子的ＰＧＥＭ－３ｚｆ质粒和携带ＴＨ基因的ＰＫＳＴＨ质粒用限制性内切酶消化并行分离纯化,得到带Ｔ７和ｓｐ６启动子的ＤＮＡ片段和ＴＨ基因片段;经Ｔ４ＤＮＡ连接酶连接后转入大肠杆菌,得到ｐＧＥＭＴＨ１重组克隆。经小量提取质粒井用酶切分析检测,证实其确有ＴＨ基因且方向正确。将此质粒再经限制性内切酶消化则得到线状ＤＮＡ片段,用Ｔ７ＲＮＡ聚合酶转录合成带有Ｄｉｇ标记的高比活度的单链ＲＮＡ探针;经斑点杂交试验证实该探针具有较高的可靠性。这将为基因治疗帕金森氏病动物模型的疗效检测提供有效手段。     

生物素标记HBV RNA探针的制备及应用

本文首次采用ＳＰ６５特殊质粒与人类的乙型肝炎病毒ＤＮＡ重组,制备了Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＲＮＡ探针,能特异地与ＨＢＶ ＤＮＡ杂交,将该探针与缺口转移方法标记的Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＤＮＡ探针进行了比较,结果显示出Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＲＮＡ探针比Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＤＮＡ探针的敏感性提高１０倍,并分别应用两种探针同时检测７０例乙肝病人血清中ＨＢＶ ＤＮＡ,阳性率各为３１．４２％、２８．５７％（Ｐ＞０．２５）。对Ｂｉｏ－     

双歧杆菌地高辛标记寡核苷酸基因探针制备和应用研究

目的探讨地高辛标记寡核苷酸基因探针应用于微生态研究的可行性和实用性。方法制备双歧杆菌属和部分种的地高辛标记16S rRNA寡核苷酸探针,初步应用于微生态制剂鉴定和临床肠道微生态检测,评价寡核苷酸探针杂交在肠道微生态研究和检测中的应用价值。结果地高辛标记寡核苷酸探针具有较好的特异性与灵敏度：地高辛标记的双歧杆菌属和种的共6种寡核苷酸基因探针与标准菌株杂交后灵敏度和特异度分别为属探针95％、75％,青春双歧87．5％、90％,两歧双歧87．5％、87．5％,短双歧87．5％、92．5％,婴儿双歧75％、95％,长双歧75％、100％。结论寡核苷酸基因探针用于肠道细菌的鉴定显示出一定前景,加大探针的种类与扩大调查范围有可能使该技术替代现有细菌培养技术。     

地高辛标记反意RNA探针检测脑组织切片生长抑素mRNA

本实验采用含大鼠生长抑素基因的ｐＳＰ６５ｃＤＮＡ质位通过转化至噬菌体内大量扩增,经提取,纯化后,用限制性内切酶进行酶切使质枝线性化,并将其作为模板,用地高辛（ＤｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎＤｉｇ）作为标记物,体外转录合成生长抑素反意ＲＮＡ（ｃＲＮＡ）探针。实验动物选用ｗｉｓｔａｒ新生大鼠。冰冻切片,端、间脑切片经杂交前用Ｄｉｇ－ＵＴＰ标记的ｃＲＮＡ探针杂交,杂交后用抗Ｄｉｇ－碱性磷酸酶复合物进行酶联免疫反应。Ｘ－磷酸盐－ＮＢＴ显色。结果显示新生大鼠脑内生长抑素ｍＲＮＡ神经元着紫蓝色。杂交反应物集中于核周的胞浆及短小的突起内。胞核不着色。胞体轮廓清晰,周围背底浅淡。结果表明Ｄｉｇ标记ｃＲＮＡ探针不仅具备非同位素标记探针的优点而且能快速和准确检测组织细胞内ｍＲＮＡ的表达。     

分子生物学技术讲座（五）：放射性标记的DNA和RNA探针的制备

放射性标记的核酸探针（DNA和RNA探针）目前已被广泛地应用于分子生物学的各个领域,例如克隆的筛选,Southern杂交分析,基因表达水平的测定等等。放射性核酸分子探针是指特定的已知核酸分子片段,内含放射性核素（例：‘千、‘H和”S）,并能与被检测的核酸分子退火杂交（核酸序列互补）,因此可用于待测核酸样品中特定基因序列片段的探测。1探针的种类和选择根据核酸分子探针的来源及其性质可将其分成3大类,即：DNA探针、RNA探针和人工合成的寡聚核青酸探针。而DNA探针又可分为基因组DNA探针和。DNA探针。探针的选择是根据不…     

银松素合酶基因地高辛标记RNA探针的合成

目的:体外转录合成银松素合酶(PS)基因地高辛标记反义RNA探针。方法:通过双酶切把PScDNA全长序列接到pBlueskriptⅡKS( )的多克隆位点上;同时,经由NCBI比对确定PScDNA的特异序列,设计含有SalⅠ和XbaⅠ这2个酶切位点的上、下游引物,用PCR法扩增含有该位点的目的片段,并连接到pBlueskriptⅡKS( )的多克隆位点上;最后利用pBlueskriptⅡKS( )上的启动子T7,用T7RNA聚合酶在体外转录合成地高辛标记PS全长及特异序列的反义RNA探针。结果:通过对构建探针的单、双酶切,PCR及电泳鉴定,表明成功合成了PS基因地高辛标记的全长及特异序列的反义RNA探针。结论:RNA探针的合成为后续马尾松PS基因表达的RNA原位杂交研究打下了基础。     

人βNGFDNA地高辛标记探针的制备及在小鼠颌下腺中的基因表达

本研究在国内首先制备非放射性地高辛标记的人βＮＧＦＤＮＡ（ｄｉｇ－ｈ－βＮＧＦＤＮＡ）探针,并应用原位杂交技术结合计算机图像分析,对ＮＧＦｍＲＮＡ在ＩＣＲ雄性小鼠颌下腺中的分布进行了观察。实验结果显示ＮＧＦｍＲＮＡ主要分布于颌下腺纹状管（ＳＳＴ）和颗粒曲管（ＧＣＴ）的上皮细胞,其细胞基底部胞质呈杂交反应强阳性,细胞顶部呈弱阳性,图像分析显示二者具有显著性差异。本实验制备的ｄｉｇ－ｈ－βＮＧＦＤＮＡ探针灵敏度高达０．１ｐｇ／ｍｌ,并且特异性强,分辨力高,重复性好,是研究ＮＧＦｍＲＮＡ基因表达和调控的有力工具。     

热启动PCR快速制备地高辛标记探针

介绍了一种在热启动PCR中,以Dig-11-dUTP部分代替dTTP,从少量基因组DNA中快速制备大量的地高辛标记的探针的方法,此探针灵敏度达0.03pg,并只和相关的DNA特异杂交.     

视黄酸对小鼠早期胚胎结构及0tx2基因表达的影响

以全反式视黄酸 ( all trans-retinoic acid,AT-RA)体外处理 EB( early allantoic bud)期和 LB( lateallantoic acid)期的小鼠胚胎 ,然后用洋地黄毒苷 ( digoxigenin)标记的 0 tx2反意义 RNA探针对整体胚胎进行原位杂交。以 4× 1 0 - 6 mol/ l的 AT— RA处理 ,抑制或减少了胚胎的前肠形成 ,经处理的胚胎的头褶没有对照的那样明显向腹部突出 ,其神经沟也不整齐 ;经处理的 EB期胚胎 ,其 0 tx2表达范围剧烈地向前退缩或只有很微弱的表达 ;但以同样浓度处理 LB期胚胎时 ,与对照相比 ,0 tx2的表达除了在极少数胚胎中变得弱一些以外 ,在绝大多数胚胎中其表达模式没有变化     

应用小鼠整体原位杂交技术检测MDM2在鼠胚发育不同阶段的表达

整体原位杂交(whole-mountinsituhybridization,WMH)已经成为基因表达定位和表达分布模式研究的一种重要手段.该技术能在整体水平上精确地研究胚胎发育过程中基因表达的三维信息,而且为大规模筛选区域及组织特异性候选克隆提供了有利的技术手段.采用体外转录地高辛标记的RNA探针,检测已知基因MDM2在鼠胚胎发育不同阶段的表达模式.     

RNA原位杂交技术的一些应用技巧

目的:检测基因在动物组织或细胞中的时空表达模式。方法:转录反义RNA探针;利用RNA原位杂交技术检测人和小鼠牙原基中若干基因的表达。结果与结论:通过优化条件,转录出完整的反义RNA探针,并成功地利用RNA原位杂交技术在组织中检测到基因的表达;分析了一些在RNA原位杂交的过程中可能碰到的问题及其解决方法。     

柯萨奇病毒B3 cDNA生物素探针的制备研究

本文将柯萨奇B组3型病毒(CVB3)cDNA的重组质粒DNA(pGP51B)转化到E.coli HB101菌株中.筛选转化阳性菌株,经培养扩增后,提取重组质粒DNA,用缺口求移法制备生物素标记探针,通过原位杂交技术检测CVB1.CVB3感染的Hela细胞及正常Hela细胞对照.结果该探针只与CVB杂交,而不与细胞对照杂交,且可检测出病毒感染5h尚未出现病变细胞中的病毒核酸.表明该探针具有良好的特异性和敏感性.     

生物素标记的人IL-6受体基因探针的制备及在细胞原位杂交中的应用

制备了人IL-6受体cDNA 1.7 kb片段及其胞外区近膜侧区段0.5kb片段,分别用生物素标记制备了人IL-6受体基因探针,用斑点杂交分析了探针的灵敏度和特异性,并将探针用于四种白血病细胞系的原位杂交。结果表明,探针的灵敏度可达15～125pg/μl、特异性较好,所检测的四种细胞的IL-6受体mRNA表达水平与其细胞膜表面IL-6受体表达水平相一致。     

In Situ Hybridization at the Electron Microscopic Level Using a Bromodeoxyuridine Labeled DNA Probe

A bromodeoxyuridine (BrdU) labeled DNA probe was used for in situ hybridization at the electron microscopic (EM) level. A BrdU labeled DNA probe was hybridized in situ to cryostat sections of paraformaldehyde fixed OCT compound embedded cultured HL-60 cells. After hybridization, some sections were incubated with FITC-conjugated anti-BrdU monoclonal antibody for fluorescence microscopy (FM). and others were embedded in Quetol for electron microscopy (EM). The ultrathin sections of Quetol-embedded specimens were incubated with the anti-BrdU monoclonal antibody and the immunoglobulin: gold colloid. In both FM and EM studies, the signals were concentrated in the rough endoplasmic reticulum. Moreover, some label was arranged from the nucleus to the cytoplasm at the EM level. Relatively simple methods using the BrdU labeled DNA probe for the detection of the defined nucleic acid sequence with reasonable tissue preservation and high resolution are described here. This method may be useful for developmental and disease related studies of specific mRNA in cells and tissues.     

PCR 扩增人型结核杆菌 DNA 及结核杆菌属 DNA 探针的制备

用多聚酶链反应(PCR)方法扩增人型、牛型结核杆菌基因组 DNA,获得特异的158 bpDNA 片段,而从另外十三种分枝杆菌未见到特异的扩增产物.回收158 bpDNA 片段作探针,它除与人型、牛型结核杆菌有特异的杂交信号外,与金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌及一些分枝杆菌皆没有杂交反应.结果表明,PCR 可用于检测结核杆菌基因组 DNA,扩增产物158 bp DNA 片段可作为探针用于检测人型、牛型结核杆菌并鉴别结核杆菌与其它分枝杆菌.     

Assessment of the state of activity of individual bacterial cells by hybridization with a ribosomal RNA targeted fluorescently labelled oligonucleotidic probe

Abstract A fluorescently labelled oligonucleotide probe complementary to an evolutionarily conserved domain of the small subunit ribosomal RNA sequence has been used with an image analysis equipment to quantify cellular rRNA contents during the successive phase of a bacterial culture ( Escherichia coli ). The amount of hybridization increased steadily upon inoculation of stationary phase bacteria into a new medium, while cell divisions were delayed. This hybridization signal was abruptly reduced by 50% at the onset of the exponential growth phase during which it then remained stable. A further slow decrease took place during stationary phase. The amount of rRNA per cell is thus maximal immediately before the beginning of active cell division. The implications of these results are discussed in terms of bacterial ecology.     

不吸水链霉菌基因文库的构建及初步筛选

采用碱裂解法从不吸水链霉菌提取染色体DNA,用Sau3AI对染色体DNA进行部分水解,利用透析袋法回收3.5～9kb之间的DNA片段。以pUC18为载体,用BamHI对其进行酶切,再用热敏磷酸酶去磷酸化,酶切产物与外源DNA按一定比例混合后,加入T4DNA连接酶进行连接。连接产物用受体菌E.coliDH5α进行转化,根据α-互补性质产生的颜色反应,挑选白色菌落,构建了相应的不吸水链霉菌基因文库。分别利用特异性探针2-1-1及1-2-1对不吸水链霉菌基因文库进行筛选,利用DIG-Ⅱ-dUTP对特异性探针进行标记,与基因文库中的阳性转化子进行Southern杂交,通过显色反应对杂交结果进行检测,由于时间关系,暂未筛选出阳性克隆,但这些工作对以后的相关实验研究具有很好的借鉴作用。