2017基因组编辑专刊序言

基因组编辑技术,作为一项生物医学领域的革新技术,已经在动物、植物和微生物基因组改造中得到了广泛的应用。以CRISPR/Cas9为主导的基因组编辑技术掀起了基因组编辑的浪潮,在功能基因组学、遗传改良育种、遗传病治疗等研究中展示出其极大的价值与潜力。本专刊报道了基因组编辑技术的总体状况、在相关领域的基础与应用研究、该技术当前存在的优缺点以及未来展望等。     

编者按: 表观遗传与基因组，且行且相随

表观遗传学是遗传学的伴生学科,发源于对多个不能被传统遗传学理论解释的意外现象的探究．早在1930年,诺贝尔生理学或医学奖得主Hermann Muller就观察到了第一个经典的表观遗传学现象,位置效应花斑现象(position effect variegation)．随后果蝇中的多梳基因沉默(polycomb silencing)、哺乳动物中的X染色体失活(X chromosome inactivation)和基因组印迹(genomic imprinting)、植物中的副突变(paramutation)等经典表观遗传现象先后被发现．对这些现象的机制研究逐渐使科学家理解到这些现象的本质是染色质对基因表达的调控．染色质的组成、结构、修饰、重塑等等都承载着表观遗传信息,它们既响应基因的转录状态,也调节基因的转录． 表观遗传体系具有基因组所不具备的可塑性,从而将一个基因组以几百个表观基因组和几百个转录组的形式呈现,使得多细胞生物能够有效地实现细胞形态与功能的分化;同时表观遗传体系具有一定的可继承性,使得每一个表观基因组能够相对稳定地存在,保证了每种细胞形态与功能的相对稳定,也使得同类细胞的增殖成为可能．总之,表观遗传伴生于基因组,帮助生命体利用同一套基因组实现多种细胞形态的分化与稳定． 表观遗传调控的分子机制、生理意义和新型研究手段始终是表观遗传研究的中心．作为《生物化学与生物物理进展》的客座编辑,此次很荣幸邀请到了国内多位表观遗传领域的精英,为杂志撰写了本期表观遗传学综述专刊．在本期专刊中,作者们基于围绕表观遗传调控的分子机制,对组蛋白去乙酰化酶的结构及应用、染色质重塑、组蛋白变体的染色质装配、30 nm染色质高级结构、非组蛋白修饰和DNA甲基化修饰展开讨论;同时对这些表观遗传机制在微生物、植物、动物中的作用,从细胞水平、发育水平到重编程事件进行论述;此外,专刊还涉及新兴的研究手段冷冻电镜技术在表观遗传研究中的应用． 通过这一专刊,我们希望向读者介绍表观遗传领域的新进展、新动向,也希望能向读者展示国内科学家在表观遗传学领域研究中亮丽的冰山一角．     

鸡基因组研究取得重大突破

中国科学院北京基因组研究所在国际合作的框架下,参与和主持完成的原鸡基因组和家鸡基因组多态性研究于12月在NATURE杂志上,以主题科学论文的形式发表。由中国科学院北京基因组研究所主持、中国、美国和欧洲科学家组成的研究小组参考红原鸡基因组框架图,分别对肉鸡、蛋鸡和乌鸡三种家鸡品种基因组进行了测序分析,     

《PLoS遗传学》：脑癌细胞系全基因组测序完成

美国加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症研究中心的科学家在1月29日的《公共科学图书馆·遗传学》（PLoS Genetics）专刊上发表论文指出,他们首次完成了脑癌细胞系全基因组测序,这也是截至目前对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。     

从基因组到多样性

<正>通过两年多的努力,"基因组与生物多样性"专刊终于与大家见面了。作为组织者之一,我是既兴奋又紧张:兴奋的是这些文章的境界和水平都是相当高的,达到或超过了最初的预期;紧张的是这些文章似乎还不足以涵盖这个主题的方方面面,有些遗憾。尽管如此,我还是非常感谢主编和编辑部几位编辑的大力支持,感谢各位作者的慷慨赐稿,感谢各位责任编委、审稿人和编辑的认真把关。此外,为了让大家对这个专刊有更多的了解,我把我们对     

北京油鸡MSAP毛细管电泳荧光检测技术的建立

采用毛细管电泳荧光检测技术, 对北京油鸡肌肉组织基因组进行甲基化敏感扩增片段多态性(Methylation sensitive amplified polymorphism, MSAP)检测。通过对基因组DNA用量、预扩产物稀释倍数、选择性引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度和电泳内标量等6个主要参数进行分析和优化, 建立了适合北京油鸡基因组DNA甲基化分析的MSAP毛细管电泳荧光检测技术。重复实验表明, 建立的毛细管电泳荧光标记的MSAP检测技术能够自动地、高通量地分析北京油鸡基因组的DNA甲基化状态, 也适用于其他动植物基因组的DNA甲基化研究。     

编者语

热心本刊的读者会发现这一期《中国生物圈保护区》在内容和版式上都有较大的改变,一是因为这是一期为纪念中国人与生物圈国家委员会成立20周年和庆祝天目山、茂兰、九寨沟、丰林4个自然保护区纳入世界生物圈保护区网络的专刊,二是利用出专刊的机会本刊做了一些向科普方向迈进的尝试。我们非常希望知道这一尝试是否符合广大读者的愿望和需求,诚请读者提出宝贵的意见和建议。     

中国最大的基因公司——华大基因

1999年9月9日,随着"国际人类基因组计划1%项目"的正式启动,北京华大基因研究中心在北京正式成立。2007年,华大基因抓住新技术突破的机遇,主力南下深圳,成立了致力于公益性研究的事业单位——深圳华大基因研究院;在各级政府部门支持和关怀下,依靠基因组平台和科技服务,以商养研,     

北京蛋白质组研究中心被确立为国际总部

北京蛋白质组研究中心成立暨人类蛋白质组研究国际学术研讨会日前在北京举行,国际人类蛋白质组计划各分计划主席等多位国际知名科学家云集北京,共同交流人类蛋白质组计划的最新研究成果,共谋未来发展大计。此次会议的召开标志着人类蛋白质组计划研究进入了一个新的发展阶段,新建成的北京蛋白质组研究中心已经被正式确立为人类肝脏蛋白质组计划的国际总部。旨在全面解读人类基因组“天书”的人类蛋白质组计划诞生于2001年2月,此后相继启动了人类血浆、肝脏等多个蛋白质组研究分计划。由中国科学院院士、北京蛋白质组研究中心主任贺福初领衔的…     

《生物技术通报》英文版(AgriBiotechnology)“转基因生物安全”专刊征稿通知

正一、期刊简介《生物技术通报》英文版(Agri Biotechnology)是中国农业部主管、中国农业科学院农业信息研究所主办的学术期刊。本刊主要报道植物科学、生命科学以及微生物科学等研究领域的研究论文和综述。二、专刊介绍转基因技术是指利用重组DNA技术将外源功能基因导入宿主生物的基因组,使生物表达所需要的表型。它克服了生物间     

中国动物学会第15届会员代表大会暨学会成立70周年纪念会在京召开

~~中国动物学会第15届会员代表大会暨学会成立70周年纪念会在京召开@张永文$中国科学院动物研究所!北京100080     

《PLoS遗传学》：脑癌细胞系全基因组测序完成

美国加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症研究中心的科学家在1月29日的《公共科学图书馆·遗传学》（PLoS Genetics）专刊上发表论文指出,他们首次完成了脑癌细胞系全基因组测序,这也是截至目前对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。通过使用最新技术,此项测序工作得以在一个月内完成,测序成本大约为3．5万美元。     

我国参与国际人类基因组计划第二届南北人类基因组国际大会在北京举行

我国参与国际人类基因组计划第二届南北人类基因组国际大会在北京举行王钦南（国家自然科学基金委员会生命学部）第二届南北人类基因组国际大会于１９９４年１１月６日－１０日在北京举行。来自美国、加拿大、法国、日本等１０多个国家的专家学者参加了大会。国务委员、国...     

编后记

本期杂志是庆祝中国动物学会成立三十周年的纪念专刊。内容包括学会历史、三十年来中国的动物学、专题报告以及有关生产问题的报告等四部分,均取材于中国动物学会三十周年学术年会上的论文报告。这次年会所收到的有关上述诸方面的论文很多,内容丰富,本期篇幅虽加扩大,但还是美不胜收。为了充分利用有限篇幅,在汇编过程中我们采取了如下措施:凡属于三十年来中国的动物学方面的文章,一律未附参考文献;专题报告仅列出一些重要文献;还有个别文章则作了一些节删。编辑纪念专刊,我们没有经验,加之发稿时     

马铃薯基因组序列框架图全球发布

9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。     

中国人群参考基因组及基因组变异图谱资源库

随着人类基因组计划和国际千人基因组计划的实施,已公开数百个中国人个体的全基因组数据。建立高精度的中国人群参考基因组序列,发现并解析中国人群特有的序列变异,是我国未来精准医学研究的基础。为满足未来精准医学研究中国人基因组数据持续增长的科学管理和深入研究的需求,中国科学院北京基因组研究所发展并建立了基于中国人群全基因组测序数据的虚拟中国人基因组数据库(Virtual Chinese Genome Database, VCGDB)和中国人群基因组变异数据库(Genome Variation Map, GVM),面向国内外用户提供数据检索、共享、下载和在线分析服务。本文重点介绍了这两个数据库的特点和功能,以及未来发展与应用前景,以期为中国人群参考基因组及基因组变异图谱资源库的推广使用、发展完善提供有益信息。     

中国遗传学会成立后第一次学术报告会简介

这本专刊,是以摘要的形式发表了在中国遗传学会成立大会期间,从1978年10月7日开始的学术报告和交流中的论文。开会期间大会共收到了二百余篇论文。由于时间的关系,不可能使全部论文在大会上宣读,于是就按照论文内容分为四个专业组,分别报告。     

生命与健康大数据中心资源

生命与健康多组学数据是生命科学研究和生物医学技术发展的重要基础。然而,我国缺乏生物数据管理和共享平台,不但无法满足国内日益增长的生物医学及相关学科领域的研究发展需求,而且严重制约我国生物大数据整合共享与转化利用。鉴于此,中国科学院北京基因组研究所于2016年初成立生命与健康大数据中心(BIG Data Center, BIGD),围绕国家人口健康和重要战略生物资源,建立生物大数据管理平台和多组学数据资源体系。本文重点介绍BIGD的生命与健康大数据资源系统,主要包括组学原始数据归档库、基因组数据库、基因组变异数据库、基因表达数据库、甲基化数据库、生物信息工具库和生命科学维基知识库,提供生物大数据汇交、整合与共享服务,为促进我国生命科学数据管理、推动国家生物信息中心建设奠定重要基础。     

一株烟草青枯雷尔氏菌烈性噬菌体RS-PⅡ-1的分离及全基因组分析

分离鉴定一株侵染烟草青枯雷尔氏菌的烈性噬菌体,观察其形态特征,并进行全基因组测序与分析,为采用噬菌体疗法防治烟草青枯病提供技术储备。以烟草青枯菌TB15-15为宿主菌,从土壤中筛选分离得到噬菌体;分离得到的噬菌体经纯化浓缩,采用透射电子显微镜观察其形态特征;提取噬菌体DNA,进行全基因组高通量测序,分析其全基因组的结构特征,比较基因组分析明确其进化关系。以TB15-15为宿主菌,从长期种植烟田土壤中分离得到一株青枯雷尔氏菌烈性噬菌体。电镜观察显示,该噬菌体属于有尾噬菌体目、短尾噬菌体科。基因组全长42 042bp,GC含量为63.2%,含有46个开放阅读框,比较基因组分析确定该噬菌体为一株新的青枯雷尔氏菌烈性噬菌体,命名为RS-PⅡ-1。以烟草青枯菌为宿主菌,分离到一株新的青枯雷尔氏菌烈性噬菌体RS-PⅡ-1,明确了其形态和基因组特征,为防治青枯病的噬菌体疗法奠定基础。     

基因组所人类全基因组关联分析国际合作研究获重大进展

日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室获“百人计划”支持的方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展,