奥利亚罗非鱼DMO和DMT蛋白二级结构和B细胞抗原表位的预测

以DMO和DMT氨基酸序列为基础,采用Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schulz法预测蛋白质的二级结构;按Kyte-Doolittle法、Emini法和Jameson-Wolf法预测DMO和DMT蛋白的B细胞抗原表位。预测结果表明：在DMO蛋白N-端第80～112,144～147,193～194,251～255,260～269区段和279～283区段,DMT蛋白N－端61～86,98～105,140～146,239～241区段和第269～273区段,可能是α-螺旋中心;DMO蛋白N-端第59～61,69～70,148～150区段和383～390区段,DMT蛋白的N-端第125～129,207～213,255～264区段和第281～284区段,可能是β-折叠中心;在DMO蛋白分子N-端40～41, 44～45,50～51,128～129,189～192,204～207,216～222,226～233,244～246,298～299区段和第323～326区段和DMT蛋白分子N-端第12～13,26～27,43～44,58～60,93～95,115～120,136～139区段和第149～151区段具有较柔软的结构,这些区段有可能进行一定幅度的摆动或折叠而形成较复杂的三级结构。DMO蛋白N-端第1～5,41～51,65～67,86～89,98～110,154～170,183～203,205～248,258～264,284～291,293～298,270～375,389～392,402～410区域和DMT蛋白N-端第1～9,17～28,77～84,114～123,131～139,157～184,196～207区域可能是B细胞表位优势区域。以蛋白质的二级结构预测作为辅助手段,用抗原指数,亲水性参数和可及性参数预测DMO和DMT蛋白的B细胞表位,为DMO和DMT蛋白单克隆抗体的制备提供了线索,为系统研究奥利亚罗非鱼DMO和DMT基因的性别调控机理研究提供参考。     

奥利亚罗非鱼DMO蛋白结构和功能预测的研究

目的:对奥利亚罗非鱼DNO蛋白的结构和功能进行预测研究.方法:利用生物信息学的方法对DMO基因推导的氨基酸序列进行结构特征和功能域预测分析,探讨了DMO的信号肽、亲/疏水性、跨膜拓扑结构、卷曲螺旋结构、基序、功能域及高级结构.结果:DMO在第1～17,39～113,153～301.372～410区段为高亲水性区域,属亲水性基团,具有两个螺旋卷曲区域,97～112,155～168氨基酸区域,没有信号肽,含有两个跨膜结构域,发生跨膜运动;DMO包含两个保守的DM-domain和DNA锌指结构等功能结构域;DNO含有1个亮氨酸拉链结构(21～42),7个蛋白激酶C磷酸化位点(49～51,184～186,191～193,235～237,270～272,294～296,333～335),5个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(189～192,225～228,227～230,231～234,233～236).1个cAMP-andcGMP-依赖蛋白激酶磷酸化位点(296～299)10个肉豆蔻酰化位点(59～64,121～126,125～130,129～134,135～140,301～306,304～309,307～312,310～315,350～355);DMO蛋白含有27.38%的α-螺旋,8.8%的β-转角和53.79%的无规卷曲;DMO的高级结构中含有两个α-螺旋区域.结论:DMO蛋白与性别调控有关,并在细胞信号传导中发挥作用,且其生物活性可能接受信号途径中多种信号的调控,这为进一步研究奥利亚罗非鱼DMO基因编码蛋白的功能,明确DMO基因与性别调控的关系奠定了基础.     

柘木果实的调查研究

柘木成熟果实的粒径为纵径3.24～4.26 cm,横径3.43～4.23 cm,果重17.75～33.8 g,聚合果有种子25～44粒;出种率5.52%～10.18%;种子百粒重5.04～5.06 g;种子粒径长0.504～0.716 cm,宽0.412～0.564 cm,高0.27～0.37 cm.     

SARS病毒M蛋白的二级结构和B细胞表位预测

以SARS病毒基因组序列为基础,采用GarnierRobson方法、ChouFasman方法和KarplusSchulz方法预测蛋白质的二级结构;按KyteDoolittle方案、Emini方案和JamesonWolf方案预测SARS病毒M蛋白的B细胞表位。预测结果表明,在SARS病毒M蛋白N端第11～20、27～36区段和第133～141区段可能是α螺旋中心;M蛋白分子N端第20～27、34～37,44～56,61～64,70～76,79～97,117～132,142～147,165～176区段和第216～221区段可能是β折叠中心。在M蛋白N端第5～6、40～44、105～107、112～116、189～190、202～203区段和第210～215区段具有较柔软的结构,有可能进行一定幅度的摆动或折叠而形成较复杂的三级结构。SARS病毒M蛋白N端第1～15、37～47、99～120、181～192区段和第196～215区段内或附近很可能是B细胞表位优势区域。以蛋白质的二级结构预测作为辅助手段,用抗原指数,亲水性参数和可及性参数预测SARS冠状病毒M蛋白的B细胞表位,为实验确定SARS病毒M蛋白的B细胞表位和免疫识别研究奠定了基础 。     

大豆中皂甙的分布及其变化规律

通过测定大豆中皂甙的含量分布,结果为:胚芽(182～198%)>绿叶(072～084%)>全粒种子(031～036%)>豆节(030～034%)>子叶(024～030%)>侧根(019～021%)>豆荚(014～016%)>主根和豆茎(006～009%)>种皮(未检出);从品种上来看,全粒种子皂甙的含量是青刀豆(040～044%)>豇豆(037～040%)>赤豆(035～039%)>黄大豆(031～035%)>黑豆(023～028%)>绿豆(007～009%);同品种不同生长期的不同器官的皂甙含量呈现规律性的变化;不同区域的同品种大豆种子的皂甙含量存在着差异;不同播种期的各器官皂甙含量也存在差异。     

山西芦芽山自然保护区灰头鵐的繁殖记述

1998～2000年4～9月,对芦芽山自然保护区灰头的繁殖生态进行了考察.该鸟每年4月11日～14日迁来,居留期150～151天,5月下旬进入繁殖盛期.营巢期5～6天,窝卵数4～5枚,孵卵期11～12天,孵化率77.8%,离巢率85.7%,巢内育雏8～9天,巢外育雏6～7天.     

树麻雀血清甲状腺激素的季节性变化及其对产热调节的影响

对1～2月、3～4月、5～6月、7～8月、9～10月和11～12月自然环境条件下,黑龙江齐齐哈尔地区的树麻雀Passer montanus血清中甲状腺激素的含量进行了测定,同时对其代谢产热进行了测定.结果显示树麻雀血清T3浓度在季节性驯化中具显著性的变化,于温度较高的夏季最低,于温度较低的冬春季较高.与之相伴随,树麻雀的单位体重和整体代谢率于3～4月、5～6月和7～8月较低,于1～2月和11～12月最高,表明甲状腺激素可能参与了树麻雀的产热调节.     

宁夏东部荒漠草原灌丛引入下土壤水分空间异质性

结合地理信息系统(GIS),运用经典统计学和地统计学方法对宁夏东部荒漠草原人工灌丛引入下0～200 cm土层土壤水分空间异质性进行研究.结果表明: 0～200 cm土层土壤含水量为0.6%～19.0%,均值为4.4%,土壤水分含量较低,变异系数为49.5%～86.3%,属于中等变异.不同土层半变异函数的最佳理论模型分别为:0～60、80～120 cm各层土壤水分符合球状模型,60～80 cm符合指数模型,120～200 cm符合高斯模型.不同土层土壤含水量均呈不同程度的空间相关,0～40、60～80、120～200 cm各层土壤水分的块金系数C₀/(C₀+C)为26.1%～49.9%,为中等程度空间相关;40～60、80～100、100～120 cm各层土壤含水量的块金系数为15.5%～22.1%,具强烈空间相关.0～200 cm不同土层土壤水分含量变程不同,0～20 和 20～40 cm土层变程较大,为37.10～45.18 km,40～200 cm各层土壤含水量的变程较小,为3.58～8.66 km.荒漠草原人工灌丛引入过程中加速土壤水分利用和深层水分消耗,导致土壤水分的空间异质性和破碎化程度加强,且对深层次土壤水分作用更强.     

中国平鳍鳅科鱼类一新纪录种

20 0 2年 6月于云南省河口瑶族自治县采集到鱼类标本 3尾 ,经鉴定为我国华吸鳅属鱼类之新纪录种———红河华吸鳅 (Sinogastromyzonchapaensis)。测量标本 3尾均保存在台湾清华大学。体长 35～ 5 0mm。背鳍iii,8;臀鳍ii,5 ;胸鳍xiv～xv ,14～ 16 ;腹鳍x～xi,11～ 12。侧线鳞 6 0～ 6 4。体长为体高的 7 0～ 7 2倍 ,为体宽的 4 3～ 4 6倍 ,为头长的 4 9～ 5 1倍 ,为尾柄长的 5 4～ 6 0倍 ,为尾柄高的 12 7～ 14 0倍 ,为背鳍前距的 2 2倍 ,为腹鳍前距的 2 4～ 2 7倍。头长为头高的 1 8～ 1 9倍 ,为头宽的 0 9～ 1 1倍 ,为吻长的 2 0～2 1倍 ,为眼径的 4 7～ 5 0倍 ,为眼间距的 2 0～ 2 3倍。尾柄长为尾柄高的 2 2～ 2 6倍。头宽为口宽的 3 7～4 6倍。     

生物工程技术预测

一、医药与医疗方面利用重组DNA技术商品化生产胰岛素(84.2～87.1)、干扰素(84.6～87.7)、牛生长激素(84.12～88.2)、人生长激素(85.8～89.2)、肝炎疫苗(85.9～89.1)和癌疫苗(93.10～97.6)。利用重组DNA技术开发感冒疫苗(85.G～89.1)和癌疫苗的生产技术(89.7～93.1)。