我国中医人才培养状况与趋势的可视化分析研究

文章借助信息可视化工具,以中国知网建库时间--2017年12月31日期间发表的文献为样本数据,对CNKI(中国知识资源总库)收录的中医人才培养领域的相关文献进行可视化分析,借助文献作者、机构、基金项目的分布来分析中医人才培养研究主体的构成;通过绘制关键词共现图谱并结合词频与中心度来解析我国中医人才培养的研究主题与热点,旨在为大家直观展示我国中医人才培养研究现状、研究热点和未来的研究趋势,从而辨识和探测我国中医人才培养的基本动向和整体发展脉络。     

基于文献可视化分析的近30年肠道菌群研究趋势及展望

目的 全面分析近30年国内外肠道菌群相关研究的发展现状、研究热点及前沿动态,为本领域研究方向提供可视化分析数据.方法 以中国知网、Web of Science为来源数据库,检索肠道菌群相关文献,应用CiteSpace(5.5.R2)软件对作者、机构、关键词和被引文献进行共现分析、聚类分析和可视化表达,并对关键词进行突显...     

基于文献计量的森林生态学学科发展态势研究

聚焦森林生态学领域,通过文献计量研究方法全景式、多维度揭示该领域学科发展特点。以Web of Science数据库1905—2014年110年间森林生态学领域研究文献数据为研究对象,借助文本挖掘软件(DDA)、知识图谱分析软件(SCI2)、Excel等工具,从总体发展态势(论文产出、国际合作关系、主题相似度),基于文献增长中不同阶段的研究主体论文产出分布,高频词时序与高被引论文研究主题3个层面,全面揭示该学科领域110年以来全球发展态势、研究主体力量和主题演变。研究结果表明：(1)近110年森林生态学研究论文逐年持续增长,根据文献增长特点,可以将森林生态学研究划分为孵化期、培育期、发展期、加速期以及爆发期5个阶段;(2)全球森林生态研究合作网络可划分为大、中、小3种类型;(3)不同国家之间由于科研合作、地理地貌等因素在主题研究上既存在共性,也不乏差异与特色;(4)不同阶段的研究力量呈现不同特点,其中美国在各个时期的论文产出均位居首位,且在国际科研合作中处于核心地位,与多个国家在研究主题上具有显著相似度,是领跑、推动森林生态学研究的主要力量;(5)各阶段研究主题呈现较强的阶段性和生态发展...     

基于CiteSpace的金花茶研究知识图谱分析

对金花茶研究领域的文献信息进行知识图谱可视化分析,可以为研究者准确把握该领域的研究进展提供理论参考。该文利用引文分析软件CiteSpace对1979年—2018年金花茶的相关研究成果进行了计量学和可视化分析,绘制知识图谱,揭示金花茶研究的发展和知识结构。结果表明:(1)金花茶的研究逐渐被重视,年均研究文献逐渐增多;载文期刊的所在地主要为广西。(2)虽已形成核心作者群,但核心作者团队之间合作并不紧密;研究机构集中在广西,已形成"研究机构-高校-企业"的合作方式。(3)研究主要经历了三个阶段,即起步探索期(1979年—1985年)、平稳发展期(1986年—2006年)和快速增长期(2007年—2018年)。(4)金花茶化学成分、繁殖技术以及产品研发的研究正在发展为新前沿。金花茶研究中存在一些问题亟需解决,建议加强对金花茶研究的重视,围绕现实需求深入开展金花茶研究,以实现生态与经济协调发展。     

水稻转基因研究的竞争态势分析

以科学引文索引SCIE数据库为数据源,下载水稻转基因研究领域的文献记录,利用TDA软件、Histcite软件和可视化工具Citespace,重点对1988年到2013年间的文献数据进行统计与分析。通过分析该领域的发文数量、发文期刊、主要研究机构、发文作者和主题词,绘制可视化图谱,揭示水稻转基因研究领域的研究趋势、国家、机构、研究者以及研究热点和前沿,并以此帮助科研人员快速把握该研究领域的脉络和概貌。     

基于VOSviewer和CiteSpace的昆虫肠道微生物领域可视化分析

【背景】近年来,昆虫肠道微生物领域受到科研工作者的广泛关注,相应发表了大量的科研论文和著作。然而目前尚缺乏对昆虫肠道微生物全面、系统的文献计量分析。【目的】了解国内外昆虫肠道微生物领域的历史、研究热点和新兴趋势。【方法】以昆虫肠道微生物为搜索主题对中国知网(China National Knowledge Infrastructure, CNKI)数据库和Web of Science (WOS)数据库进行检索,利用文献计量工具VOSviewer和Cite Space对关键词进行分析。【结果】1991-2022年间该领域全球研究发文量整体呈现上升趋势,国内外对昆虫肠道微生物领域的关注点和研究方向逐渐扩大。关键词聚类锚定了3个新兴研究领域：昆虫饮食(insect meal)、次生代谢物(secondary metabolites)和生物降解(biodegradation)。【结论】基于文献计量学研究的发现提供了昆虫肠道微生物领域的现状和趋势,可能有助于确定该领域的热点话题和探索新的方向。     

基于CiteSpaceV的国内生态工程研究文献可视化分析

生态工程是生态文明建设的重要组成部分,利用CiteSpaceV文献可视化分析工具对1992-2017年《中国学术期刊(网络版)》中生态工程领域文献进行研究,绘制研究作者、研究机构和研究热点关系图谱,分析国内生态工程研究现状并对该领域研究热点进行分类讨论,旨在为我国生态工程研究提供导向。研究表明:(1)国内生态工程领域研究在1997年开始出现井喷式增长,2000年之后波动幅度减小。(2)苗泽华、颜京松、钦佩等8位作者为生态工程领域核心作者,在作者群方面,基本上呈现"部分集中、整体分散"的特征。(3)石家庄经济学院、中国科学院地理科学与资源研究所和黄河上中游管理局是主要发文机构。(4)热点词聚类分为"生态学基础理论"、"生态工程应用领域"和"生态工程监督评价体系",其中"生态工程监督评价体系"是最薄弱的研究方向。(5)强度最高的突现词是"黄河",持续时间最长的突现词是"新农村建设","利益相关者"是出现最晚突现词,表明生态工程领域研究具有较强的政策针对性。     

利用分子生物学技术研究大熊猫的进展

分子生物学手段为大熊猫研究注入了前所未有的活力,并将大熊猫的研究工作带入一个崭新的阶段。本文着重回顾了最近十几年来分子生物学技术在大熊猫研究中的应用与研究成果。尤其是PCR、RAPD、RFLP等技术及新的遗传标记(如微卫星、小卫星等)的出现,使得人们在大熊猫的遗传多样性、分子系统发育及生态学等领域的研究取得的进展。最后,对分子生物学技术在这一领域中的应用前景进行了展望。     

秦岭大熊猫种群扩散格局及研究方法

种群扩散格局是研究种群扩散规律和机制的关键信息,也是制定物种保护对策的重要基础。大型动物种群扩散格局研究方法为扩散生态学研究的薄弱领域,并制约扩散生态学的发展。以秦岭大熊猫为研究对象,根据2000年以来的种群调查数据,基于大熊猫领域的特性,利用GIS的扩展区分析功能和景观分析方法研究了大熊猫种群分布区及动态;基于聚集的特性,利用GIS的核密度分析功能对大熊猫种群多度和聚集状况及空间变化进行了分析。发现2012年的秦岭大熊猫种群分布区较2000年增加5.5%(即15307.8hm~2),高密度种群聚集区从2处变成1处,种群聚集程度进一步增加、聚集格局的完整性大大提升,尤以中密度聚集区增长最显著,种群格局呈明显的分布区扩张、聚集度增加的态势。表明基于物种的生物学特性,立足于种群分布和多度格局变化,通过长期调查和监测可以有效掌握物种的种群扩散格局;大型动物可根据其生物学特性探索可行的方法与量化种群扩散的参数来研究其扩散格局,从而促进大型动物种群扩散研究的开展。     

唐家河自然保护区大熊猫的夏季栖息地和种群数量的调查研究

作为“国宝”大熊猫Ailuropoda melanoleuca的主食竹类(箭竹)自1975年大面积开花以来至今已经十年了,在受灾后,大熊猫的数量发生了急剧的变化,现在大熊猫的灾情是学术界和全世界热爱大熊猫的人们所关注的问题。1985年7月初至9月底,在四川省林业厅的组织领导下组成了大熊猫考察队,对唐家河自然保护区的大熊猫作了近三个月的考察和研究,现把考察结果报告于后,以供有关单位在当前的大熊猫救灾工作中制定较全面的保护计划和措施,提供科学的依据。调查方法根据以往调查大熊猫的方法并结合夏季的特点,主要采用路线调查法。按照一定的顺序,对区内…     

基于文献计量法的中国景观连接度应用研究进展

景观连接度反映了景观对物种或某种生态过程在生境斑块之间运动的促进或阻碍作用,对维持景观格局及生态过程的完整性和连续性具有重要指示意义。在当前全球环境变化,自然生境丧失和破碎化不可避免的情况下,景观连接度的评价、模拟与应用已成为景观生态学、保护生物学等相关学科的研究热点。基于CNKI和Web of Science数据库,检索1999—2015年间国内发表的景观连接度期刊论文,通过文献计量法,分别从年发文量、来源期刊、研究机构、研究区域、研究目的、景观类型、景观尺度以及研究方法等多个视角分析国内该领域应用研究进展以及发展趋势。经检索共得到文献240篇,其中英文43篇。分析发现,近20年国内该领域年发文量总体呈显著增长趋势;《生态学报》、《生态学杂志》和Urban and Landscape Planning为主要刊载期刊;研究力量集中分布在北京、南京等东部18所科研机构,文献量占到43.75%;研究目标区域也以东部为主(52.2%),而对中西部生态敏感脆弱区研究较少;研究目的以景观规划为主,但针对物种保护的研究较弱,仅占11.25%,且主要关注大熊猫等被公众熟知的珍稀濒危物种;城市、城乡等人工景观是常见的景观研究类型,相比之下,自然景观所占比例较低;研究的空间尺度集中在5000 km2的中小尺度域,占72.5%,景观粒度以30 m的中等分辨率居多。识别出14种具体度量方法,常用的包括最小费用模型、基于图论原理的功能连接度指数和网络结构指数,以及景观格局指数等;关注功能性连接和多方法的综合应用已成为当前研究的趋势;度量方法的一些参数,如最小费用模型阻力赋值或距离阈值选择主要依据专家经验或已有文献,而针对目标物种采用实证研究的则较少。最后,对国内当前该领域的研究现状和不足展开讨论并展望了未来发展,以促进我国景观连接度后续研究。     

基于发育网络识别模型的大熊猫面部识别

个体识别是动物行为学与生态学研究工作的基础,也是制定珍稀野生动物保护政策的重要依据。为了丰富大熊猫个体识别和种群数量调查的方法,我们于2017年7月分别在四川省雅安市碧峰峡大熊猫基地和四川省汶川县耿达镇的中华大熊猫苑共计拍摄18只大熊猫个体,每只大熊猫拍摄6~13张高质量面部照片（共计131张）,利用发育网络（Developmental Network）建立大熊猫面部识别模型。利用此模型对存在部分背景的大熊猫面部照片进行识别检测,得到的个体识别率为79.41%,对完全去除背景的大熊猫面部照片进行识别检测,得到的个体识别率为58.82%。研究表明,发育网络具有足够的大熊猫个体识别能力,不同背景比例的照片对大熊猫个体识别的实际结果具有较大的影响。随着发育网络识别模型的发展,我们建议更多的野生动物保护研究者结合这一技术深入地开展珍稀野生动物（如大熊猫）个体识别研究,逐步提高识别准确度,并应用到关键区域大规模的动物调查中。     

野生大熊猫行为谱及PAE编码系统

行为谱是动物行为学研究的基础。大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)是生物多样性保护中的旗舰物种,其行为生态的研究备受关注,然而由于大熊猫数量稀少且警惕性强,很难在野外进行观察,有关其行为谱等基础行为研究结果主要是基于圈养大熊猫的观察研究。为了促进野生大熊猫行为学的深入研究,2015年1月—2016年6月,2018年8月— 2019年4月我们在卧龙自然保护区基于红外相机图片和视频数据,利用PAE编码系统建立了野生大熊猫行为谱和PAE编码系统。研究共计在14种环境背景中记录到大熊猫12种姿势、52种动作、56种行为。一方面,本研究结果基本涵盖了大熊猫的主要行为,并发现了一些未在圈养大熊猫行为谱中记录到的行为,如野生大熊猫利用植物的茎进行自我除雪行为;另一方面丰富了观察大熊猫行为的环境因素。以上结果为深入研究野生大熊猫行为生态学提供了基础信息。       

微卫星标记在大熊猫研究中的应用进展

大熊猫是我国保护最为成功、研究最为深入的珍稀动物之一,可以为其它珍稀濒危物种的保护研究工作提供参考。20世纪70年代末期借助无线电颈圈,大熊猫的生态学研究工作取得了突破性进展,近20年来微卫星标记和非损伤性遗传取样技术的联合使用,将大熊猫的保护研究工作提升到一个崭新的高度。本文在综合所有已发表大熊猫微卫星标记的基础上,梳理了微卫星标记在圈养大熊猫亲子鉴定与遗传管理,野生大熊猫个体识别与种群数量调查、遗传多样性评估、扩散和种群遗传结构研究中的应用情况,并着重介绍了其中29个重要的微卫星标记。同时指出目前微卫星标记的使用存在标记选择不统一、等位基因读数无统一规程等问题,并对应用前景进行了前瞻。     

Important population viability analysis parameters for giant pandas (Aliuropoda melanoleuca)

Population viability analysis(PVA) is a tool to evaluate the risk of extinction for endangered species and aid conservation decision-making.The quality of PVA output is dependent on parameters related to population dynamics and life-history;however,it has been difficult to collect this information for the giant panda(Aliuropoda melanoleuca),a rare and endangered mammal native to China,confined to some 30 fragmented habitat patches.Since giant pandas are long-lived,mature late,have lower reproductive rates,and show little sexual dimorphism,obtaining data to perform adequate PVA has been difficult.Here,we develop a parameter sensitivity index by modeling the dynamics of six giant panda populations in the Minshan Mountains,in order to determine the parameters most influential to giant panda populations.Our data shows that the giant panda populations are most sensitive to changes in four female parameters:initial breeding age,reproductive rate,mortality rate between age 0 and 1,and mortality rate of adults.The parameter sensitivity index strongly correlated with initial population size,as smaller populations were more sensitive to changes in these four variables.This model suggests that demographic parameters of females have more influence on the results of PVA,indicating that females may play a more important role in giant panda population dynamics than males.Consequently,reintroduction of female individuals to a small giant panda population should be a high priority for conservation efforts.Our findings form a technical basis for the coming program of giant panda reintroduction,and inform which parameters are crucial to successfully and feasibly monitoring wild giant panda populations.     

云南禄丰晚中新世的大熊猫祖先化石

本文对1981年以前和1983年在云南禄丰古猿产地发现的,为本文后一作者于1984年和1985年订为Ursavus depereti的化石材料进行了再研究。通过对标本的仔细观察及与有关属种的对比,作者将上述化石材料订为一新属新种Ailurarctos lufengensis gen.et sp.nov.。此种动物在形态特征和系统关系上介于Ursavus和Ailuropoda之间,它很可能代表了目前已知大熊猫类最早的祖先类型。     

Major histocompatibility complex class II variation in the giant panda (Ailuropoda melanoleuca)

Habitat destruction and human activity have greatly impacted the natural history of the giant panda (Ailuropoda melanoleuca). Although the genetic diversity of neutral markers has been examined in this endangered species, no previous work has examined adaptive molecular polymorphisms in the giant panda. Here, the major histocompatibility complex (MHC) class II DRB locus was investigated in the giant panda, using single-strand conformation polymorphism (SSCP) and sequence analysis. Comparisons of DNA samples extracted from faecal and blood samples from the same individual revealed that the two materials yielded similar quantities and qualities of DNA, as well as identical SSCP patterns and allelic sequences, demonstrating the reliability of DNA isolation from panda faeces. Analysis of faecal samples from 60 giant pandas revealed relatively low number of alleles: seven alleles. However, the alleles were quite divergent, varying from each other by a range of 7-47 nucleotide substitutions (4-25 amino acid substitutions). Construction of a neighbour-joining tree and comparisons among DRB alleles from other species revealed that both similar and highly divergent alleles survived in the bottlenecked panda populations. Despite species-specific primers used and excellent faecal DNA isolated, a lower level of heterozygosity than expected was still observed due to inbreeding. There were three types of evidence supporting the presence of balancing selection in the giant panda: (i) an obvious excess of nonsynonymous substitutions over synonymous at the antigen-binding positions; (ii) trans-species evolution of two alleles between the giant panda and other felids; and (iii) a more even distribution of alleles than expected from neutrality.     

An improved,chromosome-level genome of the giant panda (Ailuropoda melanoleuca)

BackgroundThe iconic giant panda (Ailuropoda melanoleuca), as both a flagship and umbrella species endemic to China, is a world famous symbol for wildlife conservation. The giant panda has several specific biological traits and holds a relatively small place in evolution. A high-quality genome of the giant panda is key to understanding the biology of this vulnerable species.FindingsWe generated a 2.48-Gb chromosome-level genome (GPv1) of the giant panda named “Jing Jing” with a contig N50 of 28.56 Mb and scaffold N50 of 134.17 Mb, respectively. The total length of chromosomes (n = 21) was 2.39-Gb, accounting for 96.4% of the whole genome. Compared with the previously published four genomes of the giant panda, our genome is characterized by the highest completeness and the correct sequence orientation. A gap-free and 850 kb length of immunoglobulin heavy-chain gene cluster was manually annotated in close proximity to the telomere of chromosome 14. Additionally, we developed an algorithm to predict the centromere position of each chromosome. We also constructed a complete chromatin structure for “Jing Jing”, which includes inter-chromosome interaction pattern, A/B compartment, topologically associated domain (TAD), TAD-clique and promoter-enhancer interaction (PEI).ConclusionsWe presented an improved chromosome-level genome and complete chromatin structure for the giant panda. This is a valuable resource for the future genetic and genomic studies on giant panda.     

Basic Fibroblast Growth Factor Stimulates the Proliferation of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells in Giant Panda (Ailuropoda melanoleuca)

It has been widely known that the giant panda (Ailuropoda melanoleuca) is one of the most endangered species in the world. An optimized platform for maintaining the proliferation of giant panda mesenchymal stem cells (MSCs) is very necessary for current giant panda protection strategies. Basic fibroblast growth factor (bFGF), a member of the FGF family, is widely considered as a growth factor and differentiation inducer within the stem cell research field. However, the role of bFGF on promoting the proliferation of MSCs derived from giant panda bone marrow (BM) has not been reported. In this study, we aimed to investigate the role of bFGF on the proliferation of BM-MSCs derived from giant panda. MSCs were cultured for cell proliferation analysis at 24, 48 and 72 hrs following the addition of bFGF. With increasing concentrations of bFGF, cell numbers gradually increased. This was further demonstrated by performing 3-(4,5-dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2-H-tetrazolium bromide (MTT) cell proliferation assay, 5-Bromo-2-deoxyUridine (BrdU) labeling and cell cycle testing. Furthermore, the percentage of MSCs that were OCT4 positive increased slightly following treatment with 5 ng/ml bFGF. Moreover, we demonstrated that the extracellular signal-regulated kinase (ERK) signaling pathway may play an important role in the proliferation of panda MSCs stimulated by bFGF. In conclusion, this study suggests that giant panda BM-MSCs have a high proliferative capacity with the addition of 5 ng/ml bFGF in vitro.     

Black and white and read all over: the past,present and future of giant panda genetics

Few species attract much more attention from the public and scientists than the giant panda (Ailuropoda melanoleuca), a popular, enigmatic but highly endangered species. The application of molecular genetics to its biology and conservation has facilitated surprising insights into the biology of giant pandas as well as the effectiveness of conservation efforts during the past decades. Here, we review the history of genetic advances in this species, from phylogeny, demographical history, genetic variation, population structure, noninvasive population census and adaptive evolution to reveal to what extent the current status of the giant panda is a reflection of its evolutionary legacy, as opposed to the influence of anthropogenic factors that have negatively impacted this species. In addition, we summarize the conservation implications of these genetic findings applied for the management of this high‐profile species. Finally, on the basis of these advances and predictable future changes in genetic technology, we discuss future research directions that seem promising for giant panda biology and conservation.