抗胃癌鼠单抗3G_9轻链可变区基因的克隆和序列分析

本文报导了用ＰＣＲ方法（ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ）从抗胃癌单抗３Ｇ９杂交瘤细胞的基因组ＤＮＡ中,扩增出３３３ｂｐ的轻链可变区基因,克隆至ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔⅡｋｓ十／一载体上,筛选到阳性克隆。核苷酸序列分析．表明：有５３％的核苷酸序列与抗体基因库中的一般序列相符。证明已获得抗胃癌单抗轻链可变区基因．     

抗甜菜坏死黄脉病毒单抗轻链可变区基因的克隆及全序列测定

甜菜是温带地区主要糖料作物,甜菜丛根病是其一种毁灭性病害,在世界范围内广泛蔓延,发病田块可以造成２０％—５０％以上的减产,甚至绝收,糖度可以降低４—８度。甜菜坏死黄脉病毒（ＢＮＹＶＶ）是丛根病的主要病源,目前没有好的防治方法。为了探索用基因工程抗体技术与植物转化技术防治丛根病的可行性,首先要把抗ＢＮＹＶＶ的单克隆抗体的可变区基因扩增和克隆出来,本文报道轻链可变区基因的扩增、克隆和全序列分析的结果。材料和方法抗甜菜坏死黄脉病毒的单抗杂交瘤（３Ｃ４）由北京农业大学植物病毒研究室制备［１］。细胞培养于…     

抗胃癌鼠单抗3Gg轻链可变区基因的克隆和序列分析

本文报导了用ＰＣＲ方法（Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ）从抗胃癌单抗３Ｇｇ杂交瘤细胞的基因组ＤＮＡ中,扩增出３３３ｂｐ的轻链可变区基因,克隆至ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ Ⅱｋｓ ＋／－载体上,筛选到阳性克隆。核苷酸序列分析表明：有５３％的核苷酸序列与抗体基因库中的一般序列相符。证明已获得抗胃癌单抗轻链可变区基因。     

抗人CD3单抗重、轻链可变区基因的体外扩增、克隆和序列分析

根据免疫球蛋白重链和轻链可变区基因５’端序列和Ｊ区序列,化学合成适合于体外扩增抗体重、轻链可变区基因的二对引物。从体外培养的ＯＫＴ３杂交瘤细胞中提取总ＲＮＡ,反转录生成ｃＤＮＡ,以ｃＤＮＡ为模板,分别加入合成的重、轻链可变区引物进行ＰＣＲ,扩增出抗体重、轻链可变区基因片段。将扩增产物分别插入ｐＵＣ１９质粒,筛选出阳性克隆,用链终止法进行ＤＮＡ序列测定。所测重链可变区基因全长３５７ｂｐ,编码１１９个氨基酸,轻链可变区基因全长３２１ｂｐ,编码１０７个氨基酸。     

抗人肺腺癌单克隆抗体重,轻链可变区基因的分离克隆和序列测定

根据鼠免疫球蛋白重。轻链可变区基因ＦＲ１和ＦＲ４的序列保守性,化学合成了适于体外扩增Ｉｇ重、轻链可变区基因（Ｖ_Ｈ和Ｖ_Ｌ）的数对引物。以分泌抗人肺腺癌单抗的杂交瘤细胞株ＷＬＡ－２Ｃ４的基因组ＤＮＡ为模板,ＰＣＲ扩增Ｖ_Ｈ和Ｖ_Ｌ基因,分别克隆人ｐＵＣ１９载体。转化子经蓝、白斑筛选,酶切鉴定,双脱氧测序证实确为鼠单抗可变区基因,其中Ｖ_Ｈ基因全长为３４８ｂｐ,编码１１６ａａ,属重链ⅡＢ亚类;Ｖ_Ｌ基因全长３１８ｂｐ,编码１０６ａａ,属Ｋ轻链Ⅵ亚类。     

抗乙型脑炎病毒单抗重链可变区基因的筛选和鉴别

为了制备抗乙型脑炎病毒的人-鼠嵌合抗体,以分泌抗乙型脑炎病毒单抗的51-8杂交瘤细胞株为材料,分离这一单抗的重链可变区基因。杂交瘤细胞的大分子量DNA经Bam HI部分酶切后,以λEMBL-3为载体,构建了总数为2×10~7pfu的基因文库。以抗乙脑病毒单抗重链可变区cDNA为探针,从360000个噬菌斑中筛选出9个阳性斑,经点杂交及Southern杂交证明它们都含有重链可变区基因的片段。进一步以J_(11)探针(含J_3、J_4和重链增强子)对其中4个重组体进行鉴别。经EcoRI酶切后,有3个重组体含有与肝细胞和Sp2/0细胞相同的3.8kb片段,而第4个重组体(λ8a4)没有这一片段,却有一个4.5kb片段,这是在肝细胞和Sp2/0细胞中不存在的。从而证明前3个重组体的插入片段是未经重排的重链可变区基因片段,而λ8a4中的插入片段含有经过重排的功能性可变区基因。这一4.5kb片段不能与含有J_1—J_2的探针杂交,却同时含有V_H、J,或/和J_4和增强子。进一步证明,这是一个功能性的可变区基因。因此,将这一4.5kb片段分离出来之后,在pUC19中亚克隆并作酶切图。为构建抗乙脑病毒的人-鼠嵌合重链基因奠定了基础。     

细胞内POCR法克隆抗体可变区基因

报道一种克隆免疫脾细胞中抗体可变区基因的新方法。抗原免疫小鼠的脾细胞经分散、固定、渗透处理,直接在细胞内进行反转录,再采用半巢式PCR扩增,获得的序列经测序证明是抗体可变区编码序列。这种不经mRNA纯化、从细胞内直接获取目的的方法既可用于抗体库的建立,亦可用于新基因的快速克隆。     

Basic Properties of Rotary Dynamics of the Molecular Motor Enterococcus hirae V1-ATPase

V-ATPases are rotary molecular motors that generally function as proton pumps. We recently solved the crystal structures of the V₁ moiety of Enterococcus hirae V-ATPase (EhV₁) and proposed a model for its rotation mechanism. Here, we characterized the rotary dynamics of EhV₁ using single-molecule analysis employing a load-free probe. EhV₁ rotated in a counterclockwise direction, exhibiting two distinct rotational states, namely clear and unclear, suggesting unstable interactions between the rotor and stator. The clear state was analyzed in detail to obtain kinetic parameters. The rotation rates obeyed Michaelis-Menten kinetics with a maximal rotation rate (V_max) of 107 revolutions/s and a Michaelis constant (K_m) of 154 μm at 26 °C. At all ATP concentrations tested, EhV₁ showed only three pauses separated by 120°/turn, and no substeps were resolved, as was the case with Thermus thermophilus V₁-ATPase (TtV₁). At 10 μm ATP (⪡K_m), the distribution of the durations of the ATP-waiting pause fit well with a single-exponential decay function. The second-order binding rate constant for ATP was 2.3 × 10⁶ m⁻¹ s⁻¹. At 40 mm ATP (⪢K_m), the distribution of the durations of the catalytic pause was reproduced by a consecutive reaction with two time constants of 2.6 and 0.5 ms. These kinetic parameters were similar to those of TtV₁. Our results identify the common properties of rotary catalysis of V₁-ATPases that are distinct from those of F₁-ATPases and will further our understanding of the general mechanisms of rotary molecular motors.     

人FKBP52的基因克隆、表达及活性研究

为获得具有生物学活性的hFKBP52,来筛选新型的促神经再生药物.采用半巢式、桥联PCR及亲和层析方法,从人胎脑cDNA文库中成功扩增出hFKBP52基因,在pET28a（+）中实现了高效、可溶性的融合表达,表达量约30%.重组的蛋白质经亲和纯化至电泳纯,纯化后的hFKBP52显示出肽基脯氨基顺反异构酶活性.表明原核表达的hFKBP52具有类似于其天然蛋白质的生物学活性.     

三种猕猴属动物Fas基因的克隆

从腹股沟淋巴结或血液中提取总RNA,根据人的Fas基因的cDNA序列设计上、下游引物,通过RT-PCR扩增出三种猕猴属动物Fas基因的cDNA片段,将片段克隆到pGEM-TEasy载体中,筛选阳性克隆并进行序列测定。恒河猴Fas基因编码序列为1005bp,GenBank收录号为AY007572;熊猴的编码序列为996bp,GenBank收录号为AF326208;短尾猴的编码序列为933bp,GenBank收录号为AF332357。对五种已知的灵长类动物的Fas基因进行序列比较,结果表明Fas基因的保守区域具有高度保守性,而处于编码序列中间的一段低复杂度序列在不同的物种间具有很高的变异性。 Abstract：Total RNA were extracted from inguinal lymph nodes o r blood.The Fas cDNA fragments of three macaca species were obtained by RT-P CR using the upper and low primers according to the Fas gene of human,and th en cloned into pGEM-T Easy vector.The positive clones were sequenced.For the fir st time we cloned the Fas genes of Macaca mulatta,Macaca assamensis and Macaca arctoides,the encoding sequences are 1005bp, 996bp and 933bp, respect ively.Finally we compared the sequences of Fas genes among five primate spec ies that have already been submitted to GenBank.The results confirmed the conser vation of regions in two ends of Fas genes,and the high variability of a low complexity region in middle of every Fas gene.     

一个新的人类睾丸特异基因的cDNA克隆和表达分析

运用“数据库消减杂交”(DigitalDifferentialDisplay)方法筛选人类睾丸特异表达新基因 ,获得了有差异显示的代表新基因的克隆重叠群 ,挑选其中一个克隆重叠群HS .12 9794进行多组织RT PCR ,初步证实该重叠群在人睾丸中有高表达。然后从包含该重叠群的IMAGE克隆出发 ,采用生物信息学的方法快速克隆了一个人类新基因的全长cDNA序列 ,其全长 2 4 30bp ,开放阅读框为 6 76～ 12 4 8bp ,定位于 3p2 1 1,编码由 190个氨基酸组成 ,分子量为 2 0 4 17 8Da ,等电点为 5 2 3的一个偏酸性蛋白质 ,该蛋白与已知蛋白质无明显同源性。克隆实验验证该基因阅读框完全正确 ,半定量RT PCR进一步显示该基因在人不同发育时期的睾丸及精子细胞中有表达 ,推测其可能与精子生成相关 ,暂命名为SRG5 (TestisSpermatogenesisRelatedGene 5 ,SRG5 ) (GenBank登录号 :AY2 2 1117)。SRG5基因的成功克隆表明 ,“数据库消减杂交”与实验验证相结合的技术路线是一种快捷高效的发现更多人类功能新基因的新策略。     

抗HFRSV人单抗可变区基因克隆及其序列测定

从杂交瘤细胞株87—2提取细胞总RNA．反转录合成cDNA链,进行PCR反应。其中扩增重链可变区一对引物分别与人免疫球蛋白重链v区基因5＇端和J区基因3＇端互补;扩增人λ轻链可变区引物与人免疫球蛋白λ轻链v区基因5＇端和J区基因3＇端互补。将重、轻链可变区基因的PCR扩增产物分别插入M13噬菌体．经转化筛选分别获得重组克隆。双脱氧法测定其序列,所得核苷酸序列经计算机分析,轻、重链可变区基因长度分别为309bp和405pb,编码103个氨基酸和135个氨基酸,有明显抗体可变区特征,具有骨架区和抗原互补区。     

Molecular action of lidocaine on the voltage sensors of sodium channels

Block of sodium ionic current by lidocaine is associated with alteration of the gating charge-voltage (Q-V) relationship characterized by a 38% reduction in maximal gating charge (Q(max)) and by the appearance of additional gating charge at negative test potentials. We investigated the molecular basis of the lidocaine-induced reduction in cardiac Na channel-gating charge by sequentially neutralizing basic residues in each of the voltage sensors (S4 segments) in the four domains of the human heart Na channel (hH1a). By determining the relative reduction in the Q(max) of each mutant channel modified by lidocaine we identified those S4 segments that contributed to a reduction in gating charge. No interaction of lidocaine was found with the voltage sensors in domains I or II. The largest inhibition of charge movement was found for the S4 of domain III consistent with lidocaine completely inhibiting its movement. Protection experiments with intracellular MTSET (a charged sulfhydryl reagent) in a Na channel with the fourth outermost arginine in the S4 of domain III mutated to a cysteine demonstrated that lidocaine stabilized the S4 in domain III in a depolarized configuration. Lidocaine also partially inhibited movement of the S4 in domain IV, but lidocaine's most dramatic effect was to alter the voltage-dependent charge movement of the S4 in domain IV such that it accounted for the appearance of additional gating charge at potentials near -100 mV. These findings suggest that lidocaine's actions on Na channel gating charge result from allosteric coupling of the binding site(s) of lidocaine to the voltage sensors formed by the S4 segments in domains III and IV.     

人canstatin基因的克隆

为深化研究血管生成抑制剂canstatin的生物学性能和用于肿瘤生物治疗的可能性,针对canstatin cDNA序列设计引物,运用逆转录聚合酶链反应（RT－PCR）从人胚肝组织中钓取canstatin cDNA,将其克隆入pMND18-T载体中,通过酶切鉴定出重组体并测序分析,结果表明,获得684bp人canstatin基因,成功构建人canstatin cDNA 克隆载体pMB18-T/canstatin,为进一步进行canstatin蛋白表达及活性研究奠定了基础。     

刺五加甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因的克隆与表达分析

利用RACE技术克隆刺五加甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(mevalonate diphosphate decarboxylase,MDD)基因的全长cDNA序列,运用生物信息学方法对该基因进行分析,并通过RT-PCR法检测MDD在刺五加不同生长发育时期和不同器官中的表达情况。结果表明:(1)刺五加MDD基因cDNA序列全长1 769bp(GenBank登录号为JQ905594),开放阅读框全长1 263bp,编码420个氨基酸残基,包含GHMP激酶超家族的特异性识别序列;刺五加MDD蛋白的二级结构中含有161个α螺旋,占38.33%;68个延伸链,占16.19%;19个β折叠,占4.52%;172个无规则卷曲,占40.95%;刺五加MDD蛋白无跨膜区域,定位于膜外。(2)刺五加MDD基因在不同生长发育时期和器官中均有表达,但表达量具有显著差异(P<0.05)。在整个生长期中,MDD的表达呈现高-低-高-低的变化趋势,第一个表达高峰出现在萌芽期至叶片完全展开时,第二个高峰出现在果实体积快速增长期,最高表达量(叶片完全展开期)为最低表达量(叶片衰老期)的4.51倍;不同器官中,幼茎的表达量最高,为最低表达量(叶片)的7.22倍,但叶片、叶柄和根中的表达量差异不显著。研究结果为阐明刺五加皂苷的生物合成及对其进行表达调控奠定了基础。     

人vasostatin的克隆、表达、纯化及活性检测

从成人肝脏cDNA文库中,PCR扩增得到人vasostatin基因编码区序列,将此序列插入原核表达载体pQE30进行表达,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)测定表明产物以包涵体形式存在,表达量占菌体总蛋白量的50%以上.包涵体洗涤后溶于8 mol/L尿素溶液,在变性条件下通过镍-氨三乙酸(Ni-NTA)金属螯合亲和层析柱进行纯化后,再经透析进行复性.N端氨基酸序列、分子质量、等电点等理化指标的测定结果与理论值相符.用内皮细胞增殖试验、内皮细胞迁移试验以及鸡胚尿囊膜血管生成试验等方法进行活性检测,证实复性的表达产物具有抑制内皮细胞增殖和迁移、抑制鸡胚尿囊膜血管生成的功能.     

人趋化因子受体CXCR4基因的克隆及原核表达

目的:构建人CXCR4原核表达载体并在大肠杆菌中进行表达。方法:从健康人外周血单个核细胞提取总RNA,以RT-PCR获得CXCR4基因全长1059bp的完整编码序列,将其克隆入载体pMD-18T中,经限制性内切酶和菌落PCR分析并测序证实的阳性重组子与表达载体pET-28a( )连接并转化大肠杆菌BL21(DE3)。结果:12%SDS-PAGE分析表明,在30℃以IPTG诱导获得分子量为43ku的His-CXCR4融合蛋白表达带,诱导4h后此蛋白表达量约为全菌总蛋白的25%。结论:成功获得人CXCR4基因融合蛋白。