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用于串联质谱鉴定多肽的计量方法 总被引：1，自引：0，他引：1
目前已有多种对串联质谱与数据库中多肽的理论质谱的一致性进行评估的高通量计量算法用于鸟枪法蛋白质组学 (shotgunproteomics)研究。然而这些方法操作时存在大量错误的多肽鉴定。这里提出一种新的串联质谱识别多肽序列的计量算法。该算法综合考虑了串联质谱中不同离子出现的概率、多肽的酶切位点数、理论离子与实验离子的匹配程度和匹配模式。对大容量的串联质谱数据集的测试表明 ,根据算法开发的软件PepSearch比目前最常用的软件SEQUEST有更好的鉴定准确性。PepSearch可从http : compbio.sibsnet.org projects pepsearch下载。 相似文献
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蛋白质组学多肽鉴定方法一直以基于质谱分析和数据库搜索的方法为主,随着质谱仪技术的发展,海量的质谱数据被获取,这为大规模蛋白质的鉴定提供了一个强大的数据仓库,使得以质谱数据为基础的蛋白质组学研究成为主流。传统的串联质谱图搜库方法鉴定多肽翻译后修饰时具有诸多局限,质谱网络方法可以在一定程度上弥补局限。文中系统综述了基于质谱聚类的质谱网络和质谱图库搜索方法的发展历程、理论研究和应用研究,讨论了质谱网络库方法在鉴定多肽翻译后修饰的优势,并进行了分析和展望。 相似文献
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传统中药具有毒副作用低,药物资源广泛,不易产生耐药性以及多靶点协同作用等优点.然而,中药临床应用中存在的作用物质基础不清,药物吸收、分布和代谢途径不确定,活性成分作用机制不明确等问题,在很大程度上限制了中药进一步的临床应用.因此,发现和确认中药活性成分的作用靶标,阐明中药活性成分的药效物质基础和分子作用机制是中药现代化研究中亟待解决的关键科学问题.基于软电离技术的生物质谱具有高灵敏度、高特异性、高通量、低样品消耗等优势,已成为现代药物发现领域药物靶标鉴定的有力工具,在中药活性成分靶标鉴定中也得到越来越多的应用.本文总结、评述近年来应用生物质谱分析新方法、新技术,筛选鉴定中药活性成分靶标蛋白的最新研究进展,旨在阐述生物质谱技术研究中药活性成分作用机制的基本策略和取得的研究成果,以期进一步促进生物质谱技术在中药现代化研究领域中的应用. 相似文献
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毛细管区带电泳／串联质谱联用法鉴定多肽和蛋白质 总被引：8，自引：3，他引：8
建立了毛细管区带电泳－串联质谱联用（ＣＺＥ／ＭＳ／ＭＳ）对多肽和蛋白质高灵敏度鉴定方法,对Ｍｅｔ－脑啡肽和Ｌｅｕ－脑啡肽的混合物进行了分析,用ＣＺＥ／ＭＳ／ＭＳ方法验证了各自的序列,同样对细胞色素ｃ的胰蛋白酶酶解产物用ＣＺＥ／ＭＳ／ＭＳ方法进行了肽质谱分析,几科所有肽段的序列及其与在分子中的位置都得到了确定,通过ＳＥＱＵＥＳＴ软件进行蛋白质序列数据库搜索得到准确的鉴定结果,所消耗的样品量均在低皮可 相似文献
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结合高分辨质谱法探讨淫羊藿特征药效黄酮的质谱裂解规律,并运用该规律鉴定新化合物的化学结构.Q-TOF采集样品数据,PeakView软件对已知成分进行定性分析,借助该软件的Mass Calculators、Formula Finder、Frag-ments Pane等功能对化合物二级质谱裂解规律进行剖析总结.本研究从54... 相似文献
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MALDI-TOF质谱技术研究多肽一级结构特性 总被引：3，自引：0，他引：3
海兔酸性多肽(Aplysiaacidicpeptide,AAP)和海兔胰岛素Cβ(AplysiaInsulinCβ,AICβ)的一级结构分别由27和15个氨基酸残基组成,其中前者含有6个亮氨酸残基(L),并组成3对LL键,后者仅有2个亮氨酸残基,组成1对LL键。选用基质辅助激光解吸离子化飞行时间(matrixassistedlaserdesorptionionizationtimeoffight,MALDITOF)质谱技术研究AAP,AICβ和它们分解产物的一级结构稳定性过程中,发现在弱酸性介质条件下,AAP和AICβ的LL酰氨键键能比LR键能(R表示除了L以外的氨基酸残基)更强,不易被分解。AICβ和猪血管紧张肽I(angiotensinI,AnI)样品中均含有单电荷的多聚肽。随着多肽聚合数递增,多肽质谱峰的相对强度剧减。AICβ在形成多聚肽过程中,发生释放H+的现象 。 相似文献
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《生物技术通报》2019,(2)
食品造假属于以经济利益为驱动的食品欺诈(Economically motivated adulteration,EMA),是目前影响及破坏食品安全秩序的重要因素之一。而随着人们生活水平的迅速提高,对食品品质提出了更高的要求,当下食品造假现象是公众极为关注的问题。以往,针对已知的目标物质进行定量检测的靶向代谢组学技术在食品检测中广泛应用,代谢组学技术已经成为食品科学研究中不可或缺的工具。近年来,针对食品造假现象,代谢组学的另一个分支,基于高分辨质谱(High-resolution mass spectrometry,HRMS)的非靶向代谢组学(Non-targeted metabolomics,NTM)开始运用到食品造假的鉴定中,并已取得快速的发展。对基于HRMS的非靶向代谢组学的食品造假鉴定工作流程进行了介绍,对其数据处理方式进行了概括,并就其在食品物种(品种)、产地和品质等造假鉴定相关应用分别进行了总结,最后还对基于高分辨质谱的非靶向代谢组学应用于食品检测中优点和缺点进行了概括,并对其在其他研究方向进行了展望,旨在对食品检测中代谢组学的最新研究进展进行总结和归纳。 相似文献
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戚正武 《中国生物化学与分子生物学报》1986,2(2):1-18
<正> 蛋白质结构与功能的研究自五十年代Sanger完成胰岛素的一级结构测定后蓬勃发展,已有上千个蛋白质的一级结构被阐明,上百个晶体结构被测定,获得了大量信息,把分子生物学提到新的高度。但对分子量较小,构象简单而生物功能的重要性并不低于蛋白质的活性多肽的研究却远落后于蛋白质。追其原因主要由于:1)一般多肽类激素在体内含量极低,在10~(-9)克/毫升体液的水平,代谢又快,很容易被相应的蛋白酶所降解。例如下丘脑的各种 相似文献
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《生物技术通报》1993,(4)
931282评估大肠杆,产生的人甲状旁膝滋素的分泌和N-宋姗加工的信号序列效率的方法〔英〕/Kareem,B。N。一1 Anal。Bioehem一1992,204(1)一26八,35〔译自DBA,29日2,11(20),92一11267〕 为这项评估构建了表达质拉载体pSPTH3722和ps夕P TH37ZZ。将编码人甲状旁腺激素(hP-TH)的N一末端区(残基1~37)的。DNA擂入到金黄色葡萄球菌蛋白A的编码2种不同形式的信号脸序列和2个几G结合区(22)的DNA之间。表达产物分泌到周质和培养基中,并且很容易用亲和层析法提纯。表达产物应用野生型蛋白A信号肚正确地加工成成熟的五PTH(1一37)22。应用缺… 相似文献
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《生物技术通报》1992,(10)
923629用固定化细胞转化类固醉〔英〕/Schmauder,HP.…产J .Basie Mierobiol一1991,3飞(6)。一453~477仁译自D月A,1992,11(7),92-03743〕 从以下方面综述了固定化细胞转化类固醇(不包括类固醇的侧链降解)(19了5~199。):固定化技术;用固定化细胞(细菌、真菌或植物以及专利方法)转化类固醇;生理学及工程方面;生物物理问题以及雷斯青霉(pe:￡e￡11￡。二,a￡。r,‘。无“)将13一乙基一gon一4一“n一3,17一二酮(GD)系统转变成15一a一经基一13一乙基一9011--4一ell-3,17一二酮(15一OH一GD)的初步实验。此实验初步检测人工膜的生物物理性质,… 相似文献
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924384在解淀粉芽抱杆菌中克隆和表达低妥白酶活性的人胰岛案漂甚因〔俄〕/Selivanova,G.N.…IB iotekhnologiya一1992,i一9~13[译自DBA,1992,11(11),92一06143〕 通过连续UV诱变,分离出缺失外蛋白酶活性的解淀粉芽抱杆菌A50的突变株。突变株的蛋白酶活性仅是A50的1八00和1/10。。。突变株GT32和GT74映乏中性和碱性主要蛋白酶,只能生产少量次要蛋白酶。用载体质粒pBA13。转化这些突变株,并在该菌a一淀粉酶基因的启动子、核糖体结合位点和信号肤的调控下表达。质粒pBA130由解淀粉芽抱杆菌载体质粒pBA91和pBINSI构建而成,含有人胰… 相似文献
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《生物技术通报》1989,(3)
890969用固定化的酵母转化细胞连续生产促生长因子(somatomedin)C二英]/sodc,!反.…了气1)I)1 .Miefobioi.13工ot。Chnol一1988,28(卜乱)]988,7(16)一215一221仁译 88一07936]I一)BA 应用酉拟珍。一1目子基囚M上一“一j建构J’一株分泌促生长因子C(S MC)的酿酒酵姆(Saeeharo,n夕e。;e。厂。:i“ae冲封株。将合zJ玄的SMC毯因插人到质粒p254中,得到F一g,处理后得到正确融合的u一}习子分泌质粒ps30/25。将MF一“一l/S MC融合体引入酵姆穿梭载体后,转化酿洒畔毋菌株B.I 199]o在含酪氨酸和色氮酸的51)培养基‘},培养转化细胞。将在含… 相似文献
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