基于国际贸易的植物检疫性菌物数据库平台建设及应用

<正>国际贸易中的植物检疫性菌物是保障全球农产品安全、防止疫病传播的重要环节。为有效管控病菌传播,建立一个基于国际贸易的植物检疫性菌物数据库平台尤为重要。该平台汇集了全球范围内的植物检疫性菌物信息,为各国植物检疫部门、科研机构和农业生产者提供全面准确的数据支持,以促进国际贸易顺利进行,保障全球农产品安全。因此,探讨该平台的建设方法以及应用策略,对于提高植物检疫工作效率,减少疫病传播风险,进而促进全球农业可持续发展具有重要意义。     

中国、日本、加拿大及EPPO植物检疫性菌物名录的比较分析

【目的】分析中国、日本、加拿大及欧洲和地中海植物保护组织(European and Mediterranean Plant Protection Organization, EPPO)现行植物检疫性有害生物名录,以期为我国科学合理制定检疫性菌物名录提供参考。【方法】结合世界三大菌物名称注册库Fungal Name、Mycobank及Index Fungrum信息,对上述名录中检疫性菌物学名、种类、数量等信息进行比较研究。【结果】4个国家或地区的名录共涉及检疫性菌物218种,分布在2界4门30目61科114属中。其中,中国有82属130种,日本有43属61种,加拿大有30属41种,EPPO有41属67种。在检疫性菌物涉及类群方面,4个国家或地区各类群所占比例不同,4个国家或地区名录中子囊菌门占比均为最高,中国和日本名录中卵菌门和担子菌门占比相近,加拿大卵菌门占比较高,EPPO担子菌门占比较高。4个国家或地区独有的检疫性菌物情况分别为中国77种,日本34种,加拿大22种,EPPO 25种。4个国家或地区共有的检疫性菌物有5种,分别是栎枯萎病菌、栎树猝死病菌、马铃薯癌肿病菌、小麦印度腥黑穗病菌和马铃薯黑粉病菌。【结论】由于菌物分类学的快速发展,许多检疫性菌物的分类地位已经发生变化,4个国家或地区中,我国检疫性菌物名录与国际公认现用学名不一致情况最为明显,我国检疫性菌物名录亟待修订完善。     

我国进境植物检疫性有害生物检疫鉴定标准浅析

进境检疫性有害生物的检疫鉴定标准是检疫鉴定工作的重要参考依据,目前我国进境植物检疫性有害生物共计446种(属),并发布了479项相关检疫鉴定标准,覆盖了我国进境植物检疫性有害生物名录中的423种(属)有害生物。为了解我国检疫鉴定标准的制定发展现状、发现其中问题并及时改进,本文对现有检疫鉴定标准进行统计分析,并对其进行特点总结和问题剖析。目前我国检疫鉴定标准制定与修订工作快速发展,呈现不断更新、多方合作、方法多样化、综合化等特点,但我国检疫鉴定标准在完整性、现势性、规范性、创新性、体系规划性等方面仍存在一定的问题。因此,系统完善检疫鉴定标准,综合发展先进鉴定技术,加快建设标准化体系,有助于植物检疫工作的长足发展,对维护我国经济贸易及生物安全具有重要意义。     

深圳植物学大会有关菌物命名法的重要决定（英文）

2017年7月在深圳召开的第十九届国际植物学大会是该国际会议第一次在亚洲举行的大会。在大会正式日程之前一整周的命名法分会上,代表们专门就有关藻类、菌物与植物的命名法规问题进行了大量的讨论并做出了相关的决定。本文总结了有关菌物命名的相关讨论和决议。(1)菌物命名法管理:会议讨论了菌物命名法管理特别小组委员会的报告(2016),主要涉及菌物命名法分会要在国际菌物学大会上进行(其程序与国际植物学大会上的命名法分会并行,但提案表决不设机构投票权),有关菌物命名法规的提案要在《IMI Fungus》上发表、指导性电子邮件投票的参加人员、菌物命名法分会的官员为主席和秘书以及菌物命名法委员会要在国际菌物学大会选举等问题。这个一揽子的提案获得65.8%的赞成票通过,带来了具有里程碑意义的变化,决定了此后在国际命名法规中如何引入、修改或删除与菌物命名相关的规则。(2)保护名:这是在深圳会议上通过的关于菌物保护名的非常重要的议题,凡列入这些名单上的菌物名称可得到保护,不受未列入名单的其他名称的影响。(3)多型性菌物:有关废除以形态类型命名的多型性菌物名称在上一届国际植物学大会(2011)上就已通过,但保留了有关有性型名称对无性型具有优先权的规则。在这次深圳会议上,这个规则(57.2)也被彻底清除。现在确定菌物名称的使用不再以其为无性型或有性型模式所标定的名称来决定,而完全遵循发表日期的优先律。(4)地衣型真菌:地衣型真菌从来不受多型性真菌名称的影响,但由于上届大会上保留了有性型对无性型的优先权(规则57.2),有几位地衣学家为了避免在地衣方面引起争论,当时在会上提出地衣的名称不受这一规则管辖。随着深圳大会清除了规则57.2,任何有关地衣的特殊规定都一起消失。(5)模式标定:包括有模式注册、培养物作为模式、DNA序列作为模式、解释模式、图片后选模式等问题。从2019年1月1日起,指定菌物名称的后选模式、新模式或解释模式必须在3个认可的菌物名称注册网站(即Fungal Names,Index Fungorum或Myco Bank)上注册,获得注册号。从2019年1月1日开始,任何被指定为模式的培养物都必须指明是保留在代谢不活跃的状态,如果没有这个说明,该模式标定将被作为不合格发表。有关DNA序列作为模式的提案没有得到通过,但成立了一个专门委员会对这个问题进行研究。指定解释模式必须是因为现有的模式明显模糊不清才有必要进行。在没有实物标本情况下是否必须指定图片作为后选模式,而不管图片能否显示鉴别特征的问题没有得到解决,但由新成立的模式标定专门委员会进一步研究。(6)作者引证:关于删除名称作者引证中冒号":"的提案没有得到通过,但同意推荐可以"nom.sanct."作为替代使用,以表明其认可名称的地位。(7)同名:从2019年1月1日起,新发表的菌物名称如果与已有的细菌或原生动物名称相同将被判定为不合格的名称。(8)注册:此次大会除了规定后标定的模式必须注册外,没有其他注册问题的变化。(9)特型(special forms):有关接受那些以特型发表、符合基原名要求的名称的提案在会上获得通过。     

菌物代谢组学应用及存在的问题

代谢组学是一个可灵敏捕捉各种生物或非生物因素导致的供试样本中小分子代谢成分变化及其规律的实验方法,被广泛应用于生理生化、病理药理、生物工程、化学生态等很多方面.由于菌物种群数量庞大、未知结构次生代谢产物众多,严重影响到生物标记物的鉴定和进一步深入分析.为此,在总结目前菌物代谢组研究成果的基础上,结合十年的菌物代谢组学研...     

青藏高原植物种质资源数据库及应用平台建设

为了实现青藏高原植物种质资源信息数据的有效管理、保藏、共享、交流和利用,根据科技部基础性工作专项对项目成果共享的要求和青藏高原极端环境下野生植物种质资源调查和采集项目执行管理的需求,针对青藏高原植物种质资源本身固有的特征,通过关系数据库模式构建了青藏高原植物种质资源信息数据库,设计和开发了数据采集、审核、入库等实用工具.利用微软.NET技术,基于三层架构模式,构建了基于青藏高原植物种质资源数据库的应用平台,实现了植物种质数据的数字化存储、开放共享等功能.为青藏高原极端环境下植物种质资源调查和资源利用奠定了基础.     

中国植物名称数据库的建设及若干问题的探讨

中国植物物种信息数据库是中国科学院科学数据库参考型数据库,中国植物名称数据库（CPNI）是中国植物物种信息数据库最重要的组成部分,是中国植物物种信息数据库收录植物的目录和索引,也是其他数据库的参考和联系的桥梁。以《中国植物志》和《Flora of China》为基础数据来源,加上少量参考数据作为补充,设计建设了中国植物名称数据库,并从现有已建成同类数据库的评价、数据来源和数据组成,以及建库策略实现对中国植物名称数据库建设进行了分析和探讨。中国植物名称数据库是植物名称的参考型数据库,能够辅助植物学相关学科研究中关于植物名称的研究和利用。     

人尿源性干细胞的分离培养及应用研究新进展

人尿源性干细胞(human urine-derived stem cells,hUSCs)是从人尿液中通过常温离心分离培养出来的具有良好增殖活性和多向分化能力的成体干细胞,具有间充质干细胞的生物学特性,其在组织器官修复、疾病治疗、药物活性及毒性替代筛选等领域均有重要的应用前景,且已能实现多种途径向尿源性多潜能干细胞(urine-induced pluripotent stem cells,u-iPSCs)转化,但在研究过程中发现仍然存在一些值得深入研究的问题,如人尿液源性干细胞的来源尚不明确,定向诱导多潜能干细胞分化的条件选择及如何提高重编程效率等.本文对hUSCs的来源、分离培养方法、生物学特性及其应用研究最新进展进行综述,总结了由hUSCs向u-iPSCc诱导的方法及其应用前景,为hUSCs的研究和应用提供参考.     

金课视域下基于布鲁姆认知目标分类法的组织学与胚胎学过程性评价体系的构建及应用

目前,过程性评价虽已广泛应用于高校教学,但仍然存在着系统性不高、针对性不强、高阶性不足等问题,同时对学生能力的培养大多停滞于低阶水平。本研究以布鲁姆认知目标分类法为指导,聚焦金课标准,构建以能力为导向的评价体系,强化评价体系的系统性和针对性,并使过程性评价与医师胜任力紧密联系,以助力“两性一度”教学目标的实现。     

基于CNKI分析的我国农田捕食性昆虫资源与应用

【目的】了解我国农田捕食性昆虫资源与应用研究态势。【方法】应用文献计量学方法,分析中国知网(CNKI)收录的全部年代的我国农田捕食性昆虫的中文文献。【结果】提取到544篇与农田捕食性昆虫相关文献及包含在这些文献中的1 747条关键信息词,研究内容主要包括以下5个方面:农田节肢动物群落与捕食性优势种;农田重要捕食者;捕食作用、食物网关系与生态服务价值评价;人工繁育、人工饲料与天敌释放应用;主要农作物的重要害虫种群及其综合管理。水稻与棉花生态系统及其中的捕食昆虫与害虫被重点关注。异色瓢虫Harmoniaaxyridis、七星瓢虫Coccinellaseptempunctata、龟纹瓢虫Propyleajaponica、黑肩绿盲蝽Cyrtorhinuslividipennis、青翅蚁形隐翅虫Paederusfuscipes、稻红瓢虫Micraspisdiscolor、尖钩宽黾蝽Microveliahorvathi等是农田中的优势性捕食性昆虫。【结论】在我国主要农田生态系统中,存在着丰富的捕食性昆虫资源,它们扮演着农作物害虫天敌的角色,实现对农作物害虫的生物防治或自然控制。建议加强对重要害虫种群发生机制研究,促进有利于天敌生存、保存的条件与方法研究,提高天敌的生态防控效能。     

保护我国生物安全的检疫对策研究

本文提出广义生物安全的概念应包括人类健康,农业和环境生物（生物多样性）安全三个方面,通过回顾与其相关的国际和国内组织及法规的发展历史,分析了生物安全管理的发展方向和存在问题,并从口岸卫生和检疫的角度对我国的生物安全保护提出了对策。     

三种进境林木检疫性有害真菌名称的更正

2007年中华人民共和国农业部公布的《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物》中包括了3种木材腐朽病原真菌,即松干基褐腐病菌Inonotus weirii (Murrill) Kotlaba et Pouzar、木层孔褐根腐病菌Phellinus noxius (Corner) G.H. Cunn.和橡胶白根病菌Rigidoporus lignosus (Klotzsch) Imaz.。基于国内外最新分子系统学研究,上述3种名称均发生了较大变化,为了适应进境林木检疫的需要及为今后植物检疫性有害生物名录的更新做好技术储备,我们对这3种重要的对外检疫性林木病原菌的名称说明和更改如下：松干基褐腐病菌Inonotus weirii (Murrill) Kotlaba et Pouzar的拉丁学名应改为Coniferiporia weirii (Murrill) L.W. Zhou & Y.C. Dai,相应的汉语学名也应改为韦氏松柏卧孔菌;木层孔褐根腐病菌Phellinus noxius (Corner) G.H. Cunn.的拉丁学名应改为Pyrrhoderma noxium (Corner) L.W. Zhou & Y.C. Dai,相应的汉语学名也应改为有害红皮孔菌;橡胶白根病菌Rigidoporus lignosus (Klotzsch) Imaz.是小孔硬孔菌Rigidoporus microporus (Sw.) Overeem的同物异名,因此其名称应叫做小孔硬孔菌Rigidoporus microporus (Sw.) Overeem。另外,有害红皮孔菌 Pyrrhoderma noxium和小孔硬孔菌Rigidoporus microporus已经在我国广泛分布,因此今后在修订进境植物检疫性有害生物名录时对有关有害生物种类进行增删应予以考虑。     

我国植物病原真菌最新研究进展——植物病原真菌专刊序言

本期《菌物学报》"植物病原真菌专刊"刊登了12篇文章,其中关于病原真菌种类调查、鉴定及形态描述的文章5篇,病原真菌检测与检疫的文章2篇,病原真菌种群结构的文章2篇,基因组学研究进展的文章3篇。本期内容基本体现了我国植物病原真菌研究的最新进展,对今后的植物病原菌形态分类、分子分析和基因组学研究都具有重要的参考价值。     

检疫性昆虫DNA条形码检测技术的研发与应用实例

【目的】DNA条形码技术是近年来生物分类鉴定的研究热点之一,已成为植物检疫性昆虫鉴定的有力工具。为快速、准确地鉴定口岸截获的昆虫种类,实现"检得出、检得准、检得快"的要求,我们研发了昆虫DNA条形码试剂盒检测技术(Insect DNA barcoding identification kit)。【方法】该检测技术针对出入境植物检疫性及危险性昆虫的主要类群,选择合适的基因片段、设计引物、对目标基因进行扩增测序,找出基因片段上区分每个物种的多态位点规律,作为该物种的鉴定特征并建立数据库,应用于植物检疫性及危险性昆虫的物种鉴定。【结果】以检疫性昆虫木蠹象属Pissodes为例,确定了木蠹象属5种昆虫的多态位点规律(鉴定特征),构建了用于物种鉴定的数据库。通过比对数据库里的鉴定特征,将未知样品鉴定为榛梢木蠹象P.terminalis(相似度100%),与形态鉴定结果一致。本文介绍了检测技术的原理、方法、技术流程及应用实例,并展望了其在有害生物检测中的推广应用前景。【结论】昆虫DNA条形码试剂盒检测技术为建立标准化,准确性高的物种鉴定平台打下基础,有着良好的推广应用前景。     

Mycelial growth inhibition of plant pathogenic fungi by extracts of South African plant species

Eleven plant species were collected from the Blyde River Canyon area, Mpumalanga, South Africa. Methanolic crude extracts of the plant samples were concentrated to dryness, dissolved in sterile distilled water and bioassayed in the laboratory for their fungicidal potential against seven plant fungal pathogens, namely Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum, Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia solani, Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea and Pythium ultimum, at equal concentrations. A modified agar dilution method was used to determine the inhibitory effect of the plant extracts on the mycelial radial growth of the plant pathogens. Antifungal activity was confirmed in all the plants, but not in all plant parts and also not against all the test organisms. The crude extract of Eucomis autumnalis performed best of all the plant extracts tested, as it showed significant antifungal activity against all seven of the plant pathogenic test organisms and compared favourably to the inhibition of the mycelial growth by a broad spectrum synthetic fungicide (carbendazim/ difenoconazole). The crude extract of Schrebera alata came out second best, in the sense that at least one plant part inhibited the mycelial radial growth of four of the seven test organisms by at least 50%.     

Taqman real-time quantitative PCR for identification of western flower thrip (Frankliniella occidentalis) for plant quarantine

Western flower thrip (Frankliniella occidentalis) is a major global pest of agricultural products. It directly damages crops through feeding, oviposition activity or transmission of several plant viruses. We describe a Taqman real-time quantitative PCR detection system, which can rapidly identify F. occidentalis from thrips larvae to complement the traditional morphological identification. The data showed that our detection system targeted on the ribosomal RNA gene regions of F. occidentalis has high sensitivity and specificity. The rapid method can be used for on-site testing of samples at ports-of-entry in the future.     

The contributions of mycorrhizal fungi to the determination of plant community structure

While it is now widely accepted, even by ecologists, that most plants in the majority of ecosystems are infected by mycorrhizal fungi, few experiments have been designed to investigate the function of the mutualism at the community level. Those involved with mycorrhizal research have been largely preoccupied with questions of the mineral, particularly phosphorus, nutrition of individual plants, while plant community ecologists have too often found it convenient, even when acknowledging the presence of infection, to ignore its possible function in the ecosystem. This presentation examines a selected number of seminal papers written by plant community ecologists and highlights some of ‘the most striking mysteries’ which they reveal. It describes experiments designed to determine whether knowledge of the presence and activity of the mycorrhizal mycelium can help us to unravel the ‘mysteries’ which they define. It is revealed that by having direct adverse effects upon seedlings of many ‘r’ selected species, while at the same time being beneficial, if not essential, to those that are ‘K’ selected, the activities of the mycelium of VA fungi have a direct bearing upon community composition. The extent to which ‘turf compatibility’ is actually a reflection of the compatibility of plant species with the VA mycorrhizal mycelium is discussed and the possible role of the mycelium in consigning some species to the ruderal habit is considered. It is concluded that those attempting scientifically to understand, or managerially to manipulate, plant communities, without recognizing the role of the mycorrhizal mycelium, do so at their peril, and it is recommended that scientists involved in research on mycorrhiza extend their vision beyond the limited horizons which are currently so often defined by considerations of the phosphorus nutrition of individual host plants.     

Antifungal activity of herbal extracts against plant pathogenic fungi

The present study was designed to evaluate in vitro antifungal activity of herbal extracts against three plant pathogenic fungi (viz. Rhizopus stolonifer, Botrytis cinerea and Colletotrichum coccodes). Extracts of leaves and rinds of Garcinia indica, rhizomes of Curcuma aromatica, roots of Glycyrrhiza gahliae, leaves of Nyctanthes arbour-tristis and seeds of Vernonia anthelmintica were used for screening. Screening was done using poisoned food technique. Relatively potent extracts were shortlisted from this study and were further assayed to find out their minimum fungicidal concentration (MFC). From the above studies, it was observed that ethyl acetate extract of rhizomes of C. aromatica and unripe fruit rinds of G. indica have shown the lowest MFC values amongst the other tested plant extracts. This study indicates that the potential of these plant extracts in the management of diseases caused by plant pathogenic fungi.