家蚕核型多角体病毒广东株bro基因家族分析

对BmNPV广东株进行了空斑纯化,并对该基因组的bro基因家族进行克隆,获得4个bro基因序列(bro-a、bc、、d),与GenBank数据库中BmNPVbro基因序列及本实验室测定的重庆株的bro基因序列进行比较分析,结果表明广东株BmNPVbro基因存在插入及缺失,其氨基酸的改变主要发生在对应蛋白的N端部分;同时进行的bro基因的系统发生分析表明,广东株bro基因分别位于3个亚组中,广东株bro-d与日本T3、重庆CQ1株bro-d以及法国SC7株bro-Ⅲ属于亚组A,广东株bro-a、c与T3、CQ1株bro-a、c以及SC7株bro-Ⅱ属于亚组B,广东株bro-b与T3、CQ1株bro-b、e以及SC7株bro-Ⅰ属于亚组C,bro基因进化与地理位置的相关性不明显。根据bro基因在四个不同株系基因组中的位置特征,进一步支持了Kang等的观点:bro-d是BmNPV生存所必需的,bro-a和bro-c相互间功能互补。同时推测:SC7株的3个bro基因可能是BmNPVbro家族出现的最简约形式。     

重组家蚕核型多角体病毒表达乙肝病毒S区抗原

报道了将乙型肝炎病毒（ａｄｒ亚型）Ｓ区基因（共６８１ｎｔ）克隆于家蚕核型多角体病毒的基因组中,并将其导入家蚕细胞,通过多轮筛选得到纯的重组家蚕杆状病毒,用该病毒接种家蚕,初步证明能够得到乙肝表面抗原的高效表达,在家蚕幼虫的血淋巴和蛹体中其用ＰＲＨＡ法检测的滴度可达１∶４０９６。     

油桐尺蠖核型多角体病毒的空斑测定

在油桐尺蠖卵巢细胞系上对油桐尺蠖核型多角体病毒(BsNPV)进行了空斑测定。用此方法测定了BsNPV的感染力,并将所得的结果与其TCID_(50)进行比较,结果显示这两种方法在测定病毒感染力时敏感性相似。     

家蚕核型多角体病毒山东株p35基因的克隆及序列分析

根据家蚕核型多角体病毒T3株p35基因非编码区序列设计一对特异性引物,应用PCR技术从家蚕核型多角体病毒山东株中扩增得到一条1 080 bp的片段。测序结果表明,该片段含有p35基因,开放阅读框长900 bp,编码299个氨基酸,分子量为34.91kDa,pI=6.4。序列分析表明,BmNPV山东株的p35基因与T3株存在差异。 Abstract:According to the 5′ and 3′ untranslated region sequences of p35 gene from Bombyx mori nuclear polyhedrosis virus isolate T3,a pair of primers was designed employing computer analysis.With the primers,polymerase chain reaction (PCR) was performed and a 1 080 bp fragment was obtained from BmNPV strain Shandong.Sequencing result showed that it was p35 gene (GenBank accession number：AY157746),and it included an open reading frame of 900 bp,encoding 299 amino acids with Mr=34.91kDa and pI=6.40.BLAST analysis indicated that there were seven bases and three amino acids difference between p35 from BmNPV strain Shandong and that from BmNPV isolate T3.     

家蚕核型多角体病毒的PCR检测及其部分序列分析

为研究应用PCR技术进行家蚕核型多角体病毒广东株的敏感性检验以及探讨不同地理株系的基因水平的相互关系,本文通过对家蚕核型多角体病毒BmNPV广东株的人工繁殖与纯化,引用了一对根据多角体蛋白基因设计的引物phy35/phy36,对BmNPV的基因组模板DNA进行了PCR扩增,并对其产物进行测序分析.结果显示,PCR技术均可扩增检测出3×108个/mL至3×102个/mL不同浓度的BmNPV模板DNA,特异目标片段大小约为680 bp,且扩增带的亮度随着病毒液浓度的降低而减弱,说明应用引物phy35/phy36进行PCR方法可以有效地应用于检测BmNPV病毒感染的家蚕.同时,测序获得了BmNPV广东株多角体蛋白polyhedrin基因674 bp大小的片段,GC含量为46.4%.经过BLAST比对分析,与BmNPV泰国株的相似性为99%,暗示家蚕BmNPV广东株与泰国株的BmNPV (登录号AY779044)亲缘关系非常相近,两者可能属于BmNPV的不同地理株系.通过系统发育树的进一步分析发现,家蚕核型多角体病毒广东株polyhedrin基因部分序列与家蚕NPV分离株S9多角体蛋白基因(DQ231336)关系很近.     

家蚕核型多角体病毒水平转移基因分析

为了探讨杆状病毒基因组的遗传进化模式,文章利用家蚕核型多角体病毒(BmNPV)和其宿主家蚕全基因组数据,进行了全基因组的同源性搜索和系统进化分析,结果显示,BmNPV的几丁质酶(Chi)基因、凋亡抑制蛋白3(IAP3)基因和尿苷二磷酸葡萄糖转移酶(UGT)基因为水平转移基因。这3个基因都来源于其宿主昆虫。通过核苷酸组成、密码子偏好性、选择压力等基因特征分析,发现BmNPV水平转移基因与其基因组序列存在明显差异,进一步验证水平转移基因的外源性。对3个水平转移基因的功能分析发现它们有利于杆状病毒在宿主昆虫中的侵染与繁殖,并提高杆状病毒在昆虫中的生存能力。     

家蚕核型多角体病毒中国株和日本株vp39基因的比较研究

以苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒(AcNPV)的核衣壳蛋白基因vp39设计引物,用PCR技术扩增了家蚕核型多角体病毒中国株(BmNPV-Ch)～1.3kb片段,并测定了其全序列长1230bp。推导的氨基酸351个,其与BmNPV日本株(BmNPV-Ja)vp39基因核苷酸序列同源性达97.5%,氨基酸同源性达97.1%。该片段在E.coli BL21中诱导表达能产生分子量约为38kD 的特征性蛋白带,证明所扩增片段为BmNPV-Ch的vp39基因。经与BmNPV-Ja比较,其625位 有3个核苷酸(CGA),985～910位有6个核苷酸(GTCGGC)的插入,未造成码组移动。有17处点突变,但取代突变(replacement mutation)仅7处,对两株病毒VP39蛋白的亲疏水性和酸碱 性质未产生显著影响。由于点突变带来氨基酸改变,使BmNPV-Ch的vp39蛋白的α-螺旋由13.2%增加到15.4%,无规卷曲由7.2%减少到5.8%,β-折叠和β-转角维持不变,约为79.6%,仍保持以β-折叠为主要二级结构单元的片层状折叠结构。     

一株乙肝病毒的基因组克隆及系统学分析

乙型肝炎病毒HBV的基因分型在基础研究和临床治疗中具有重要意义。PCR扩增并克隆了来自蒙古的乙肝病毒HBV199的全长基因组。分析表明HBV199基因组全长为3 145 bp,属于基因型D。HBV199与乙肝病毒基因型D代表菌株x02496的基因组序列差异为1.9%;与参比菌株AF280817和AY161157具有更高的亲缘关系,它们的基因组序列差异分别为1.1%和1.5%。不同于所有其他HBV基因组,HBV199基因组缺失了HBc-ORF处nt 2021~nt 2057之间的37个碱基。     

速成单层法半微量病毒空斑技术的研究

本文报道一种不需预先制备细胞单层的速成单层法半微量病毒空斑技术(简称速成法)及其在空斑中和试验与空斑纯化试验中的应用。作者以脊髓灰质炎病毒为代表,对速成法的实验条件、可靠性、敏感性、重复性等作了系统研究,并以此法对单纯疱疹病毒、呼吸道合胞病毒和水泡性口炎病毒进行了空斑滴定。结果提示速成法简单快速、经济方便、敏感稳定、可靠易行,可能具有较大的实用和推广价值。     

Plaque purification of cricket paralysis virus using an agar overlay on Drosophila cells

Cricket paralysis virus, an insect picorna-like virus, grown and assayed on Drosophila malanogaster cells, gave titers in excess of 10⁹ PFU/ml. The virus was plaque purified using an agar overlay and the intracellular polypeptides induced by “crude” and plaque-purified virions were demonstrated to be very similar.     

Recovery of a Far-Eastern Strain of Tick-Borne Encephalitis Virus with a Full-Length Infectious cDNA Clone

Virologica Sinica - Tick-borne encephalitis virus (TBEV) is a pathogenic virus known to cause central nervous system (CNS) diseases in humans, and has become an increasing public health threat...     

超声造影技术评价颈动脉粥样硬化斑块稳定性的临床研究

目的:探讨超声造影技术评价颈动脉粥样硬化斑块稳定性的临床价值,为动脉粥样硬化诊断准确性提供参考。方法:根据实时超声造影检查的回声图像特点将该院53例(59个斑块)颈动脉粥样硬化斑块患者分为软斑组(24个)、混合斑组(18个)、硬斑组(17个),比较3组的造影增强率、造影增强程度分级,并对各类型斑块的时间-强度进行定量分析。结果:59个斑块中有40个呈现不同程度的增强,增强率为67.80%,其中软斑组、混合斑组、硬斑组超声增强率分别为87.50%、72.22%、35.29%,差异具有统计学意义(P0.05);造影增强程度Ⅰ级和Ⅲ级在三组间差异具有统计学意义(P0.05),其中硬斑组造影增强程度Ⅰ级个数较软斑组和混合斑组多,软斑组造影增强程度Ⅲ级个数较混合斑组和硬斑组多,差异均有统计学意义(P0.05);软斑组达峰时间、平均渡越时间均低于混合斑组和硬斑组,斑块峰值强度高于混合斑组和硬斑组,混合斑组达峰时间、平均渡越时间均低于硬斑组,斑块峰值强度高于硬斑组,差异均具有统计学意义(P0.05)。结论:超声造影技术可无创性地通过造影增强实时反映出颈动脉粥样硬化斑块内的新生血管情况,提供参数成像与定量分析,正确评价斑块的稳定性。     

活血丹的克隆形态、显微结构与化学成分研究进展

本文对活血丹的克隆形态、显微结构、主要药用成分等方面进行了综述,为活血丹的进一步研究提供理论依据。     

柳蚕卵黄原蛋白cDNA的克隆及序列分析

经RT-PCR和RACE合成了柳蚕卵黄原蛋白(Vg)cDNA,经序列分析其长度为5701个碱基,由一个ORF组成,编码了1 774个氨基酸。氨基酸序列中有2个保守的多聚丝氨酸区域。并推测氨基酸序列中有8个天冬酰胺连接的糖基化位点(N-linked glycosylation sites)。与樟蚕、天蚕、柞蚕、野桑蚕、家蚕、樗蚕、蓖麻蚕的VgcDNA序列比对后发现有很高的同源性,分别为83.1%、81.1%、81.0%、64.7%、64.6%、79.7%、79.2%,同其它昆虫Vg cDNA序列也具有很高的同源性。根据7种蚕(家蚕、天蚕、柞蚕、蓖麻蚕、樟蚕、野桑蚕、樗蚕)VgcDNA序列建立了系统发生树。     

A Physical Map of the Genome of a Unicellular Cyanobacterium Synechocystis sp. Strain PCC6803

An accurate physical map of the genome of a cyanobacterium,Synechocystis sp. strain PCC6803, was constructed on the basisof restriction and linking clone analysis. The genome contained6 recognition sites for AscI, 25 sites for MluI, and 31 sitesfor SplI, and the entire genome size was estimated to be 3.6Mb. Sixteen genes or gene clusters, including those involvedin the photosynthetic systems, were localized on the physicalmapof the genome by hybridization. In the course of the above analysis,two extra chromosomal units with approximate sizes of 110 kband 125 kb were identified.     

他克莫司和卡泊三醇软膏治疗四肢斑块状银屑病的疗效和安全性分析

目的:探讨他克莫司和卡泊三醇软膏治疗四肢斑块状银屑病的疗效和安全性。方法:选取2011年4月至2013年8月于我院诊治的84例四肢斑块状银屑病患者,将患者随机分为A组和B组,每组各42例,分别采用他克莫司和卡泊三醇软膏治疗。评定PASI以及疗效指数,并对用药过程中患者的不良事件进行观察记录。结果:A、B两组患者治疗后各时间点PASI评分与治疗前相比较均显著降低,差异有统计学意义(P0.05);但同一时间组间对比,差异并无统计学意义(P0.05)。A组银屑病患者的总有效率为64.29%,与B组的69.05%相比,差异无统计学意义(P0.05)。结论:他克莫司与卡泊三醇软膏治疗四肢斑块状银屑病均安全有效,且二药相比,疗效相当。     

长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究

NrDNA作为一个重要的工具,在许多分类等级上被广泛地应用于系统发育的分析。以长苞铁杉(Nothotsuga longibracteata)为实验材料,通过nrDNA ITS区特异拷贝的克隆及假基因化分析,在序列水平上探讨假基因化的特征,进而探讨引起多拷贝基因家族假基因化的分子机制。实验结果表明:假基因化拷贝的序列长度为1 745 bp,比其它拷贝短11 bp-12 bp;GC含量明显偏低,特别是5.8 S区和ITS2区的GC含量分别比其它克隆低6.15%-6.17%和5.75%-6.15%;5.8 S区和ITS2区序列变异大,遗传距离(d)分别为0.0718 0.0221和0.0691 0.0178;在系统发育的分析中出现异常的长枝现象。