拟诺卡氏菌属中的一个新种

自云南省昆明市郊区的土壤中,分离到一株细胞壁化学组分III型的诺卡氏菌形放线菌,编号4—4C。该菌株产生灰白色有分隔和分枝的气丝。成熟的气丝断裂成短杆状小体。气丝分枝末端时常形成类似于链霉菌的孢子丝。分生孢子链由为数不多的大小两种孢子形成。基丝黄色或黄褐色,分隔并断裂威柱形小体。有时产生微黄褐色可溶性色素。与拟诺卡氏菌属中的已知近似种比较,有明显区别。因此,认为是个新种,命名为链孢拟诺卡氏菌(Nocardiopsisstreptosporus n. sp.)。     

诺卡氏菌属中的两个新种

由土壤中分离的两株诺卡氏菌形放线菌A-100菌株和186菌株．经鉴定,其形态和细胞壁化学组分均属诺卡氏菌属,但培养特征和生理生化特性与该属中的已知种不同。因此认为这两株菌是诺卡氏菌属中的两个新种,并分别命名为鲜黄诺卡氏菌Nocardia galba n.sp和绛红色诺卡氏菌Nocardia purpurea n. sp.。     

养殖鱼类致病诺卡氏菌研究进展

综述了国内外有关养殖鱼类诺卡氏菌病的发生情况及其病原生物学、分类学、致病性、组织病理学、诊断检测技术和防治等方面的研究进展,提出了一些问题和建议,以为相关研究提供参考。     

拟孢囊菌属放线菌的研究进展

拟孢囊菌属(Kibdelosporangium)是一个经典的丝状放线菌类群。自Shearer等于1986年建立该属以来,不断有新的菌株从不同生境中被纯培养分离得到,目前已有效发表8个种、2个亚种。拟孢囊菌属作为稀有放线菌属,是获得新型抗生素类次生代谢产物的重要资源。本文结合我们分离到的一株该属菌株的功能研究、基因组分析和相关文献资料,系统综述了拟孢囊菌属放线菌的建立、分类学特征、属内种的分布、活性次级代谢产物的发现以及其他功能应用和开发前景,以期为该属其他新分离菌株的分类鉴定、新颖次级代谢产物的发现、功能基因资源的挖掘与开发提供借鉴。     

类诺卡氏属放线菌的研究进展

Prauser H.最初于1976年从土壤中分离到17株诺卡氏形态放线菌,综合形态、生理生化特性和部分化学分类特征的研究结果,提议建立了一个新属——类诺卡氏属(Nocardioides),并以新种白色类诺卡氏菌(N.albus)为典型种。之后,随着分离、纯培养和分类方法的发展,越来越多的新成员从各种不同环境中分离得到。尽管这些菌来源广泛,形态和生理生化等特征各异,但他们拥有共同的属的特征。过去的50年中,随着放线菌研究的发展,该属中部分成员历经了分类地位的变迁和修订。到目前为止,该属共收纳了56个有效描述种。类诺卡氏属(Nocardioides)放线菌在农业、工业、化工业等方面也曾有应用研究报道。本文就类诺卡氏属放线菌的建立依据,属的特征,属内种的分布和变更以及它们在工农业上的应用研究前景及进展进行了综述。     

拟诺卡氏放线菌YIM90087的代谢产物研究

对拟诺卡氏菌YIM90087的固体发酵提取物进行了化学成分研究,从中分离得到10个化合物。通过波谱数据分析,鉴定其结构分别为:(3S)-3-苄基-2,5-哌嗪二酮(1)、(3S,6S)-3-(2-丁基)-6-(1-羟乙基)-2,5-哌嗪二酮(2)、(3S,6S)-3-(2-丁基)-6-羟甲基-2,5-哌嗪二酮(3)、(4S)-4-苄基-1,3-恶唑-2,5-二酮(4)、6'-羟基-4,2',3',4'-四甲氧基-对三联苯(5)、(3S,6S)-3-(4-羟苄基)-6-异丁基-2,5-哌嗪二酮(6)、(3R,8aS)-3-异丙基-六氢吡咯并[1,2-a]吡嗪-1,4-二酮(7)、(3S,6S)-3-异丁基-6-甲基-2,5-哌嗪二酮(8)、(3S,6S)-3-苄基-6-(1-羟乙基)-2,5-哌嗪二酮(9)和(3S,6S)-3-苄基-6-(1-羟丙基)-2,5-哌嗪二酮(10)。化合物4目前只见化学合成报道,为新天然产物。     

诺卡氏菌型放线菌的分类

诺卡氏菌型放线菌在分类学上属于细菌域 ,厚壁菌门 ,放线细菌纲 ,放线菌目中的一类形态相似的微生物。在自然界中分布广泛 ,但由于分离、分类方法所限 ,绝大多数 ( 85%以上 )还没有被人们所认识。诺卡氏菌型放线菌是一类重要的自然资源 ,某些种能产生抗生素 ,如利福毒素等 ;有些种产生可供利用的重要的代谢产物 ,如 2、3 二羟基 苯甲酸、环已乙酸、羟基苯酮丁酸、Ｌ 组氨酸、1 6α 羟基甾体等 ;某些种产生重要的酶类 ,如胆固醇氧化酶、葡萄糖异构酶、溶菌酶等 ;有些种可用于废水 (物 )的生物处理。另一方面 ,也有些种引起人和动物的诺卡氏…     

诺卡氏菌科分类的研究II．诺卡氏菌属中的两个新种和一个新变种

从我国各地的土壤中分离得到百余株诺卡氏菌形放线菌,其基丝形成横隔并断裂成秆状或球状体,细胞壁化学组份IV型,属于诺卡氏菌科诺卡氏菌属(Nocardia)。经形态、培养特征及生理生化特性等鉴定为15个种。本文只报道其中两个新种及一个新变种：念球状诺卡氏菌(Noeaedia nostocoidea n. sp．);紫褐诺卡氏菌(Nocardta violaccofusca n. sp.);鲑色诺卡氏菌桔橙变种(Nocardia salmontcolor var. aurantiaca n. var.)。     

假诺卡氏菌科的分类学研究进展*

假话卡氏菌科是一类进化上相近、形态各异、胞壁肽聚精含有Meso－－DAP（内消族二氨基庚二酸）、全细胞水解液中含有半乳糖和阿拉伯糖、不含枝菌酸的放线菌[1-3]。该科的许多成员都能产生重要的生物活性物质,见表1[4],包括抗生素、酶类、维生素等。其中如红霉素、利福霉素等已商业化,产生了巨大的社会和经济效益。在当今的生物活性物质筛选中,这类放线菌被看作是最有希望获得新的抗生素、酶制剂等生物活性物质的资源菌;此外,该科在环境污染的治理上也有广阔的前景,如假诺卡氏菌属的一些种可以将工业上大量产生的甲基硫化物分解为无…     

拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析

为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建。研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度。比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致。因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性。     

梭菌属分类研究进展:现状和展望

目前构成梭菌属的微生物在系统发育和表型特征上不一致。多相分类数据表明,梭菌属物种之间差异大。大量基于16S rRNA 基因的系统发育研究表明,梭菌属应被限定为梭菌属类群I,作为狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)。尽管有这方面认识,梭菌属新物种仍持续增加,这些新物种并不能与梭菌属类群I 和标准种丁酸梭菌(C. butryicum)形成一致分支,引发梭菌属分类上的混乱。本文明确了梭菌属物种的范围,即只包括模式种和梭菌属类群I。此外,4 个物种念珠状真杆菌(Eubacterium moniliforme)、旋舞真杆菌(Eubacterium tarantellae)、最大八叠球菌(Sarcina maxima)和胃八叠球菌(Sarcina ventriculi)应被调至梭菌属,分别命名为念珠状梭菌(Clostridium moniliforme)、旋舞梭菌(Clostridium tarantellae)、最大梭菌(Clostridium maximum)和胃梭菌(Clostridium ventriculi)。一个新属哈撒韦氏菌属(Hathewaya)被提议成立,3 个梭菌属物种溶组织梭菌(Clostridium histolyticum)、泥渣梭菌(Clostridium limosum)和解朊梭菌(Clostridiumproteolyticum)重新归为溶组织哈撒韦氏菌(Hathewaya histolytica)、泥渣哈撒韦氏菌(Hathewaya limosa)和解朊哈撒韦氏菌(Hathewaya proteolytica),其中Hathewaya histolytica 为模式种。     

Molecular phylogenetics of the hummingbird genus Coeligena

Advances in the understanding of biological radiations along tropical mountains depend on the knowledge of phylogenetic relationships among species. Here we present a species-level molecular phylogeny based on a multilocus dataset for the Andean hummingbird genus Coeligena. We compare this phylogeny to previous hypotheses of evolutionary relationships and use it as a framework to understand patterns in the evolution of sexual dichromatism and in the biogeography of speciation within the Andes. Previous phylogenetic hypotheses based mostly on similarities in coloration conflicted with our molecular phylogeny, emphasizing the unreliability of color characters for phylogenetic inference. Two major clades, one monochromatic and the other dichromatic, were found in Coeligena. Closely related species were either allopatric or parapatric on opposite mountain slopes. No sister lineages replaced each other along an elevational gradient. Our results indicate the importance of geographic isolation for speciation in this group and the potential interaction between isolation and sexual selection to promote diversification.     

The genus Setulipes (Marasmiaceae) in Madagascar and the Mascarenes, including a key to other African taxa

The authors report first records for the genus Setulipes in Madagascar, with the presence of Setulipes cf. hakgalensis and two new species, Setulipes funaliformis and S. moreaui, as well as a new species from Mauritius: S. mauritiensis. A key to these taxa, as well as to other African species, is supplied.     

篮状菌属微生物次级代谢产物研究进展

天然产物的主要来源之一是微生物,不同于其他的生物资源,真菌菌种相对容易选育和保藏、适应力较强,可通过大规模发酵获取产物,更具有利于自然资源的可持续发展性和利用价值。篮状菌（Talaromyces sp.）及其次级代谢产物在天然色素上的研究受到科学家的青睐,同时在食品、环境、农业和医药等方面发挥了重要作用,尤其是海洋来源的篮状菌及其次级代谢物表现出显著的生物活性,例如杀虫、抗肿瘤、抗菌、抗病毒等。近来研究表明,篮状菌次级代谢产物根据生物合成的方式可以分为六大类：萜类（terpenes）、生物碱类（fumiquinazolines）、聚酮类（polyketides）、聚酯类（lactones）、醌类（quinones）和甾体类（steroids）,这些活性物质对促进药物的先导物质挖掘与开发具有重要意义。本文通过对文献和资料的查阅,总结了近年来篮状菌及其次级代谢物的研究开发进展,希望为后续研究和应用提供参考。     

Genetic variation amongst viviparid snails in the genus Mekongia (Prosobranchia: Viviparidae) in Thailand

Allozyme variation in viviparid snails from the genus Mekongia in Thailand were examined across the different species, subspecies and geographical locations (river drainage systems). Using horizontal starch gel electrophoresis, 11 presumed allozyme loci (eight polymorphic) from eight enzyme systems were screened. Heterozygosity was moderately low (Hexp = 0.000–0.109, mean = 0.037). One population of Mekongia pongensis (Nong Khai) was monomorphic at all 11 examined loci in contrast to the other two populations, suggesting bottleneck within this population. Populations were more differentiated in the Mekongia sphaericula complex (F_ST = 0.587) than in either the Mekongia swainsoni complex (F_ST = 0.161) or M. pongensis species (F_ST = 0.073). Mekongia sphaericula sphaericula and Mekongia sphaericula extensa exhibited fixed allele differences at two loci, a high genetic distance (D = 0.265–0.300) and a potential polyphyletic relationship, suggesting two distinct lineages (species).     

Discovery of the Large Blue Flycatcher Cyornis [banyumas] magnirostris breeding in northern Kachin State (Burma/Myanmar) and taxonomic implications for the Cyornis-group

The little-known taxon Cyornis [banyumas] magnirostris has long been treated as a race of the widespread Hill Blue Flycatcher C. banyumas, with which it was thought to be allopatric during the breeding season. On the basis of morphology, magnirostris has lately been considered a full species, endemic as a breeder to northeastern India. Our recent field work during migration and the breeding season (September 2005 and June–July 2006) has, however, resulted in the first records of magnirostris from northern Burma/Myanmar, establishing that its breeding range broadly overlaps the range of C. banyumas whitei. We demonstrate how historical factors, sources of error, including fraud, errors of omission and commission, and inferences based on lack of data have all negatively affected assessment of species limits and conservation status in this speciose group of flycatchers. We also provide evidence that the taxon C. [banyumas] lemprieri is highly distinct and should be treated as a full species.     

鱼藤属植物优异物种筛选及引种栽培研究

为了解粉垄“145”模式在新植蔗上的应用效果,解析其生理生态基础,该研究以桂柳05136为材料,设置常规耕作(CK)和粉垄“145”模式(FL145)2个处理,通过大田试验研究粉垄“145”模式对土壤性质以及新植蔗农艺性状、光合特性和产量品质的影响,并分析其经济效益。结果表明：(1)与CK相比,FL145的0～20 cm、20～40 cm根区,土壤容重显著降低1.25%～5.98%,土壤孔隙度显著提高1.08%～4.77%,土壤含水量显著提高1.78%～8.23%。(2)FL145促进新植蔗根系生长,出苗效果和农艺性状表现良好,株高显著增加2.20%～7.86%。(3)FL145的新植蔗单株叶面积显著增大15.88%,叶绿素含量、净光合速率、气孔导度、胞间CO₂浓度分别显著提高1.41%、6.84%、18.67%、10.06%,光合能力增强,单株干物质积累量显著增加9.26%。(4)收获时,FL145的新植蔗有效茎数、茎长、茎径显著增加,理论产量和实际产量分别显著提高5.07%和5.11%,蔗汁蔗糖分和锤度分别显著提高1.61%和1.50%,还原糖分显著下降12....     

白粉菌BGP(TG)在不同抗性草地早熟禾叶片上的侵染过程观察

【背景】草地早熟禾(Poa pratensis)白粉病是气传性病害,种植抗病品种是防治白粉病最经济、环保和有效的方法。【目的】明确禾布氏白粉菌BGP(TG)在3个不同抗性草地早熟禾叶片上的侵染过程和乳突在草地早熟禾抗白粉病中起的重要角色。【方法】利用考马斯亮蓝染色结合显微镜观察的方法,对不同抗性的3个草地早熟禾品种进行白粉菌侵染过程观察,统计分生孢子形成次生芽管的速度、吸器和乳突的形成情况,分析白粉菌对不同抗性草地早熟禾侵染过程的差异。【结果】‘探险家’草地早熟禾病症较其他2个品种更为严重,禾布氏白粉菌BGP(TG)侵染不同抗性品种的侵染过程基本一致,但‘探险家’叶片上初生吸器形成早于其他2个品种;接菌1-2 d后,在‘太行’叶表面分生孢子形成5级芽管的速度显著低于‘探险家’和‘黑杰克’;接种1d后,‘太行’草地早熟禾有效乳突形成率显著高于‘黑杰克’(P<0.05),‘黑杰克’有效乳突形成率显著高于‘探险家’(P<0.05)。【结论】明确了白粉菌在草地早熟禾叶片上的侵染过程和乳突在草地早熟禾抵御白粉菌侵入过程中起的重要作用,为草地早熟禾白粉病的预防和防治提供了理论基础和参考...     

Morphology and taxonomy of chain-forming species of the genus Cochlodinium (Dinophyceae)

The morphology of an unarmored chain-forming harmful dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides and its similar species such as Cochlodinium catenatum, Cochlodinium fulvescens, and Cochlodinium convolutum was carefully observed, emphasizing the single cell stage for clarifying taxonomically important morphological features. To differentiate C. polykrikoides from C. convolutum, the shape and the position of the nucleus are useful characters. C. polykrikoides also differs from C. fulvescens in being smaller in size, possessing many rod-shaped chloroplasts and having the sulcus running just below the cingulum on the dorsal surface. Careful observation of the ichnotype of C. catenatum suggests that C. catenatum sensu Kofoid and Swezy collected from off La Jolla, CA, USA, is not identical to C. catenatum sensu Okamura and is probably a different species, in having no chloroplasts and a nucleus positioned at the center of the cell. In addition, C. polykrikoides has many morphological features in common with C. catenatum sensu Okamura except for slightly elongate cells and is probably a junior synonym of this species.