高效率提取λ噬菌体DNA离体包装抽提物

λ噬菌体DNA在与被克隆的DNA片段结合成重组体后,需进行体外包装才能形成侵染性的噬菌体颗粒。这里仅就如何提取高效能人噬菌体DNA包装抽提物（包装蛋白）谈谈体会。（1）菌落的选择从BHB2688和BHB2690的不同菌落中提取的包装抽提物的包装效率（讨U小g／＊＊A）可相差10倍以上。因此在大量制备以前,有必要先挑选多个菌范小批量制备抽提物并测定其包装效率,取优良者进行制备。（2）热诱导后的培养时间文献所载,在热诱导后培养至细菌可被氛仿裂解时即可停止。但我们的经验是12”IX10’养一段时间可明显提高抽提物的效价（见图1）…     

热诱导速度对噬菌体包装蛋白提取物效价的影响

 <正> 利用D蛋白和E蛋白基因缺陷λ的溶原菌热诱导制备蛋白质提取物,进行噬菌体的体外包装,提取物的效价高低,对重组噬菌体的包装是至为关键的,直接影响到外源基因库的完整性和随机性。目前一般包装效价为10~7—10~8Pfu/μgDNA本文比较了快、慢诱导对效价的影响,快诱导的体外包装效价可达2.8×10~8Pfu/μgDNA,而慢诱导包装效价低。     

用粘粒载体克隆霍乱弧菌染色体基因方法的建立

本文采用我国 El Tor 型霍乱弧菌805菌株(稻叶血清型,噬菌体-生物型 ld)为实验菌株,对粘粒载体(Cosmid)基因克隆的方法,进行了探索.首先从感染噬菌体λ突变体的溶原菌(HB 2688,HB2690)制备包装抽提物。制备方案有二:一是直接制备 HB2688,HB2690混合包装抽提物;另一是用超声波处理制备 HB2690抽提物;用冻融法制备 HB2688抽提物.包装时再将两者混合.本文认为以 pHC79为载体进行包装时,两方案效果一样,第一方案操作较简便些.在核酸操作中,从805菌株提取染色体 DNA,要求 DNA 的长度约为100kb;进行染色体 DNA部分消解时,应使大部分 DNA 片段在30～40kb 之间;连接时,碱性磷酸酶处理过的载体量应为30～40kb DNA 的10倍.本文以 pHC79为载体,建立805菌株染色体 DNA 无性繁殖系,得到500多个克隆子。     

N_3质粒对λ噬菌体发育途径的影响

诱导试验表明N_3质粒抑制λ溶源菌诱导处理时的裂解性发育途径,使λ噬菌体产率大大降低,仅为对照的10~(-5)—10~(-6)。感染实验表明N_3质粒主要抑制λ噬菌体的溶源性发育途径,其溶源菌形成率仅为对照的1.3—1.9％。从N_3质粒对λ噬菌体感染时与λ溶源菌诱导时的发育途径的不同作用的事实推测N_3质粒的某种产物(蛋白质)与λ噬菌体cI蛋白相作用,以障碍cI蛋白正常解离或聚合的方式而干扰其发育途径。     

志贺氏菌属弗氏2a染色体基因文库的构建

以λ噬菌体EMBL3作载体,用体外包装技术构建了志贺氏菌属弗氏2a染色体基因文库。该体外包装系统的包装效率达1.6×10~2pfu/μg DNA,重组噬菌体的产量达2×10~6pfu/μg DNA。对重组噬菌体进行了遗传分析,即分别对7个标记(leu,pro,his,arg,thr,purIaroA)作了测定。测得当噬菌体母液的效价为8.7×10~8pfu/ml时,带有以上标记的重组噬菌体的效价为5×10~4-8.2×10~5pfu/ml。这个令人满意的结果为尔后克隆志贺氏菌属弗氏2a染色体上的与群抗原3,4和型抗原Ⅱ有关的基因打下了基础。     

采用Red重组系统构建包装菌株DH-gⅢ

选择感染性噬菌体技术是研究蛋白相互作用的良好手段,获得基因Ⅲ缺陷的辅助噬菌体是构成SIP体系的关键.为制备基因Ⅲ缺失的辅助噬菌体,利用λRed重组系统将完整的噬菌体基因Ⅲ和氯霉素抗性基因整合到大肠埃希菌DH5α的染色体上组氨酸操纵元位点构建包装菌株,经氯霉素抗性筛选并用PCR及组氨酸表型鉴定,获得包装菌株DH-gⅢ;将缺失功能基因Ⅲ的缺陷型噬菌体基因组转化到包装菌株中培养制备辅助噬菌体,以集落形成试验来检测缺陷型噬菌体的感染能力,结果滴度可达到4.3×108,只具备一次感染力,表明包装菌株构建成功,能用来制备辅助噬菌体,有望用于SIP体系.     

改进大肠杆菌(E.coli)局限性转导实验的探索

在大肠杆菌(E.coli)局限性转导(restricted transduction)实验中,通常用λ噬菌体特异性转导半乳糖发酵基因(gal)的现象来说明转导的基本原理和掌握转导实验的基本方法。近年来,我们在指导学生进行这一实验过程中,对实验菌株的选择、噬菌体(λ)的诱导、噬菌体裂解液的效价测定和进一步提高转导频率等方面进行了一些改进,收到了较好的效果。本文     

MS2噬菌体衣壳蛋白与包装位点结合特异性及其生物学应用进展

MS2噬菌体为正义单链RNA噬菌体,基因组含有3569个核苷酸,编码成熟酶蛋白、衣壳蛋白、复制酶蛋白和裂解蛋白。MS2噬菌体复制酶编码基因5'端一个由19个碱基组成的茎环结构(又称包装位点)是衣壳蛋白二聚体与RNA相互作用的部位,二者相互作用形成的复合物是启动噬菌体自我包装的信号。MS2噬菌体衣壳蛋白与包装位点结合的特异性已被应用于RNA病毒核酸检测的标准物质、校准品和质控品的研究,实时动态监测活细胞内RNA的运动,以及RNA体内递送载体的研究等领域。     

T4噬菌体表面展示技术的研究进展

噬菌体表面展示技术(phage display)是由Smith于1985年首先建立起来的一种新的生物技术[1],它能将表达的外源多肽或蛋白以融合蛋白的形式展示在噬菌体的表面,保持相对独立的空间构象和原有的生物活性[2].常用的噬菌体表面展示系统主要有丝状噬菌体、λ噬菌体及T4噬菌体展示系统等.虽然它们都具有噬菌体展示系统的优点,但对于丝状噬菌体来说,它不能展示那些难以分泌的肽和蛋白质,而且它的N端可融合外源多肽的容量有限,较大蛋白的融合会造成空间障碍,影响噬菌体的装配,使其失去感染力.而对于λ噬菌体,大分子蛋白的融合会抑制噬菌体的组装,使其生长受到影响,因此这两种噬菌体更适用于构建短肽库和cDNA表达文库[3],而不适于构建重组疫苗和表达分子量大具有完整结构域的蛋白质[4,5].     

λ噬菌体及其在基因克隆中的应用

就λ噬菌体的分子生物学研究的主要成果进行了简介,包括进行裂解生长的早期基因表达,ＤＮＡ复制,包装和裂解;进行溶源生长的基因表达,免疫区域和诱导等,并简述了λ作为基因克隆载体的某些重要特点。