酿酒酵母中的RNA解旋酶

ＲＮＡ解旋酶是一类能解开双链ＲＮＡ的酶 ,存在于所有生物体中 ,其家族成员在进化上具有保守序列。ＲＮＡ解旋酶属于分子伴侣 ,对于确保ＲＮＡ分子的正确折叠以及保持和修饰其特定的二级、三级结构必不可少。在核转录、前体ｍＲＮＡ剪接、核糖体生物发生、核质转运、翻译、ＲＮＡ降解以及结构基因表达等过程中ＲＮＡ解旋酶都发挥了一定的作用。1 .解旋酶的结构ＲＮＡ解旋酶大部分属于蛋白质超家族Ⅱ (ＳＦⅡ ) ,包含七个保守序列 (图 1 ) [1] 。除核心区域外 ,多数ＲＮＡ解旋酶具有不同的Ｎ末端和Ｃ末端部分 ,可能与底物专一性有关。目前 ,…     

靶向RNA药物检测和筛选的生物物理学方法

ＲＮＡ和ＤＮＡ不同 ,ＲＮＡ通过折叠成无数种三级结构来完成其在细胞中的不同功能。除了作为ＤＮＡ翻译成蛋白质过程中遗传信息的传递者外 ,ＲＮＡ还可以作为核糖核蛋白 (ＲＮＰ ,ｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｐｒｏｔｅｉｎ)的组成部分 ,并在一些情况下作为ＲＮＰ的催化亚基。在大多数情况下 ,ＲＮＡ是与ＲＮＡ结合蛋白 (ＲＢＰｓ)结合在一起的。天然的或化学合成的物质通过阻断或增强效应蛋白与ＲＮＡ的结合来阻断ＲＮＡ催化功能或是改变ＲＮＡ的结构[1] 。因此我们可以通过研究ＲＮＡ或ＲＮＡ 蛋白质复合物构象的变化来确定天然或化学合成物质…     

核糖核酸可含胸腺嘧啶吗

一般国内教材告诉读者：脱氧核糖核酸（ＤＮＡ）含ＡＴＣＧ４种碱基,而核糖核酸（ＲＮＡ）则含ＡＵＣＧ４种碱基。从碱基组成看,两者之间仅有一个碱基的差别,ＤＮＡ中的Ｔ在ＲＮＡ中被Ｕ取代,而Ｕ和Ｔ两者在化学结构上仅相差一个甲基。可是转移核糖核酸（ｔＲＮＡ）的ＲＮＡ,在其二级结构中有一个ＴΨＣ环的结构,其Ｔ指的是胸腺嘧啶核苷酸,那核糖核酸（ＲＮＡ）也可含胸腺嘧啶Ｔ,这与通常的观点有所不同;而事实上是怎么回事呢？一般国内参考书在讲述ｔＲＮＡ转录及转录后加工时,均提到碱基的多种加工修饰方式：如还原反应、脱氨基…     

反义RNA调控的不同方式

反义ＲＮＡ调控的不同方式宫明,宫锋（山东大学微生物系,济南２５０１００）关键词反义ＲＮＡ,调控方式反义ＲＮＡ最早发现于原核生物,但是１９８６年Ｗｉｌｌｉａｍｓ发现真核细胞中也存在天然反义ＲＮＡ。不同的反义ＲＮＡ其功能和作用方式不尽相同,它们控制着噬菌...     

发夹核酶的研究与应用

核酶 (ｒｉｂｏｚｙｍｅ)是既能特异识别又能特异切割小分子ＲＮＡ的核酸内切酶 ,其本身也是ＲＮＡ ,主要包括发夹核酶、锤头核酶、丁肝病毒、链孢霉属ＶＳ和铅依赖性ＲＮＡ ,共同特点是可逆地切割底物ＲＮＡ的磷酸二酯键 ,生成 5′ ＯＨ和 2′ ,3′ 环磷酸末端。虽然催化产物相似 ,但它们的结构和催化机制却是很不相同的。发夹核酶 (ｈａｉｒｐｉｎｒｉｂｏｚｙｍｅ)发现于三种不同植物ＲＮＡ病毒 ,即烟草环点病毒 (ｔｏｂａｃ ｃｏｒｉｎｇｓｐｏｔｖｉｒｕｓ) ,菊苣黄色斑点病毒型 (ｃｈｉｃｏ ｒｙｙｅｌｌｏｗｍｏｔｔｌｅｖｉｒｕｓｔ…     

dsRNA介导的RNA干扰

在多种生物中 ,外源或内源性的双链ＲＮＡ(ｄｏｕｂｌｅ ｓｔｒａｎｄｅｄＲＮＡ ,ｄｓＲＮＡ)导入细胞中 ,与ｄｓＲＮＡ同源的ｍＲＮＡ则受到降解 ,因而其相应的基因受到抑制。这种转录后基因沉默 (ｐｏｓｔ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌｇｅｎｅｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ,ＰＴＧＳ)机制首先在线虫 (Ｃ .ｅｌｅｇａｎｓ)中得以证实。由于这是一种在ＲＮＡ水平的基因表达抑制 ,故也称为ＲＮＡ干扰 (ＲＮＡｉｎｔｅｒｆｅｒ ｅｎｃｅ) ,简称ＲＮＡｉ[1] 。随后发现 ,在各种生物 ,如果蝇[2 ] 、拟南芥菜[3 ] 、及小鼠[4] 等均存在ｄｓＲＮＡ介导…     

丙型肝炎病毒基因组的翻译及其产物的加工

丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）是一种单正链ＲＮＡ病毒,其５’非编码区（５’ＮＣＲ）是决定病毒蛋白表达的关键区。基因突变与报道基因表达技术研究表明５’ＮＣＲ有一内部核糖体进入位点（ＩＲＥＳ）。类似于微小ＲＮＡ病毒属。ＨＣＶＲＮＡ翻译成为一条多蛋白分子,对蛋白酶的裂解加工后形成１０余种结构和非结构蛋白。研究ＨＣＶＲＮＡ的翻译及产物加工,对ＨＣＶ及其抗原表达载体有重要意义。     

核糖体失活蛋白及核糖体拓扑结构的研究进展

天花粉毒蛋白使核糖体失活的分子机制是它有ＲＮＡＮ－糖苷酶的作用。从樟树种子中纯化的两种新的核糖体失活蛋白（ＲＩＰ）——辛纳毒蛋白和克木毒蛋白也都具有ＲＮＡＮ－糖苷酶和依赖超螺旋结构的核酸内切酶活性。辛纳毒蛋白还有杀虫活性;克木毒蛋白还有超氧化物歧化酶活性。被ＲＮＡＮ－糖苷酶失活的核糖体用硼氢化钠还原或氨基酸加成反应可部分地复活,这表明失活的核糖体ＲＮＡ上产生的一个活泼醛基对其失活起着重要作用。工作中建立了荧光标记在凝胶上测定小分子ＲＮＡ序列和定性测定糖蛋白的两种新方法。     

RNA聚合酶Ⅲ启动子的结构与功能

ＲＮＡ聚合酶Ⅲ (ｐｏｌⅢ )是真核生物催化合成ｔＲＮＡ和 5ＳｒＲＮＡ及一些核小ＲＮＡ和胞质ＲＮＡ必需的酶。ＲＮＡ聚合酶Ⅲ能够识别ｔＲＮＡ基因中一些高度保守的特征性ＤＮＡ序列而启动下游ＤＮＡ的转录 ,这些序列称为ＲＮＡ聚合酶Ⅲ启动子。ＲＮＡ聚合酶Ⅲ启动子不仅广泛存在于真核细胞中ｔＲＮＡ、Ｕ6核小ＲＮＡ(ＳＮＲ6 )等的基因中 ,也是病毒催化合成一些小片段ＲＮＡ如腺病毒ＶＡＲＮＡ所必需的。ＲＮＡ聚合酶Ⅲ启动子因其能在体内外高效快速地转录某些小片段基因 ,已被人们广泛地应用于核酶和反义ＲＮＡ技术中 ,在众多的ＲＮＡ…     

风疹病毒核酸的研究现状

对风疹病毒（ＲＶ）ＲＮＡ进行广泛深入的研究是基因工程亚单位疫苗的前提。本文就近几年来国外对ＲＶＲＮＡ的研究进展进行了较详细的阐述,包括基因结构和功能、体外表达等,并将ＲＶＲＮＡ与同科的α病毒ＲＮＡ作了同源性比较分析。     

水稻蜡质基因第一内含子碱基突变引起其RNA二级结构的可能变化

通过体外转录得到籼稻品种２３２蜡质基因第一内含于５’端４３０ｂｐ的ｓｓＲＮＡ分子,以及在此区域发生了自然突变的粳稻品种寒丰蜡质基因经一内含子５’端同样长度的ｓｓＲＮＡ分子。部分变性胶电泳结果表明两种ｓｓＲＮＡ分子的迁移速率不同。将两种ｓｓＲＮＡ分子的核酸序列用计算机分析,表明此两种ｓｓＲＮＡ分子能形成不同的茎－环结构,自由能值也有差异。对突变引起的这些不同与两种水稻品种蜡质基因转录本剪接的差异进行     

RNA病毒的复制途径

ＲＮＡ病毒的复制途径聂剑初（北京师范大学生物学系１００８７５）ＤＮＡ病毒在其基因组复制和表达过程中利用许多的宿主蛋白质。ＲＮＡ病毒的复制则面临一个特殊的问题,即未受侵染的宿主细胞没有按照ＲＮＡ模板的指令合成ＲＮＡ的酶。因此,ＲＮＡ病毒必须含有合成这类...     

染色质RNA

染色质ＲＮＡ徐阿炳，王英杰（浙江省杭州大学生物科学与技术系３１００１２）染色质核酸和蛋白质的复合物，主要由ＤＮＡ、组蛋白、非组蛋白和少量ＲＮＡ构成。由于染色质中的ＲＮＡ功能不太明确，因而一般教科书中都一笔带过甚至不提。其实染色质中包含ＲＮＡ的现象，早...     

RNA病毒RNA聚合酶的研究进展

自然界仅有ＲＮＡ病毒以ＲＮＡ作为基因载体。依赖于ＲＮＡ的ＲＮＡ聚合酶在这种病毒的增殖复制期起到了非常重要的作用。它一方面以病毒ＲＮＡ为模板复制子代病毒的基因,另一方面也将病毒增殖期间需要的蛋白质和酶类的基因转录成为ｍＲＮＡ,也就是说它担负了复制酶和转...     

真核普通转录因子

三类真核ＲＮＡ聚合酶分别选择性地转录细胞核基因,其转录特异并不决定于ＲＮＡ聚合酶本身,而是取决于被转录基的启动子元件及能识别并结合这些元件的普通转录因子,它们与ＲＮＡ聚合酶相互作用,在启动子区组装成转录起始复合物,从而起动转灵,已知的三类普遍转寻因子中,大多数为相应ＲＮＡ聚合酶所专用,只有少数因子中的个别亚基是三类酶所通用。本简述这三类普通转录因子的结构,性质及其在转录中的功能。     

登革病毒感染性转录体技术

登革病毒 (Ｄｅｎｇｕｅｖｉｒｕｓ)属黄病毒科黄病毒属 ,基因组结构为单股正链ＲＮＡ ,全长约 1 0～ 1 1ｋｂ。登革病毒在复制过程中不形成ＤＮＡ中间体 ,因此要在基因水平研究其特征存在一定困难 ,因为突变、重组、克隆等分子生物学技术都是在ＤＮＡ水平上的操作。体外转录制备感染性ＲＮＡ(感染性转录体 )技术提供了解决这一难题的新途径[1]。该技术是把病毒ＲＮＡ逆转录成ｃＤＮＡ ,并置于ＲＮＡ聚合酶启动子的下游 ,在ＲＮＡ聚合酶的作用下体外转录出全长正链ＲＮＡ ,经转染易感细胞后复制出子代病毒颗粒。由于这种子代病毒来自ｃＤＮ…     

基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测

提出了基于螺旋区随机堆积的ＲＮＡ二级结构预测算法,包括三个步骤：１．根据螺旋区定义,找出所有可能螺旋区;２进行螺旋区随机堆积,形成一定数目的ＲＮＡ二级结构;３．统计处理,推测ＲＮＡ可能折叠方式。最后以酵母Ｐｈｅ－ｔＲＮＡ为例来说明方法的可行性。     

丁型肝炎病毒核酶及其应用

丁型肝炎病毒（ＨＤＶ）核酶是ＤＨＶ前体ＲＮＡ分子中一段能自我切割的ＲＮＡ序列,具有独特的二级结构,为ＨＤＶ双滚环复制所必需,通过抑制其活性可以控制ＨＤＶ感染。它又存在分子间切割活性,即反式切割作用,因而有可能应用于切割异源ＲＮＡ分子。本文就这些方面的研究进展作一综述。     

双链RNA技术在植物病毒研究中的应用

含ＲＮＡ基因组的植物病毒在复制时会产生双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）。本文介绍了用ＣＦ－－１１纤维素粉提取ｄｓＲＮＡ的步骤,并列举了ｄｓＲＮＡ在植物病毒研究中的应用,其主要应用有（１）用于检测植物病毒;（２）用于病毒株系分化;（３）用于病毒卫星ＲＮＡ及亚基因组ＲＮＡ研究;（４）用于侵染性测定及病毒基因组功能研究等。     

乙烯诱导下草莓果实采用RNA代谢与蛋白质合成活性的变化

草莓果实在乳白时期采收（开花后约４０ｄ）分别用１０μ１／Ｌ,５０μ１／Ｌ和１００μ１／Ｌ的外源乙烯进行处理。处理后的果实大分子ＲＮＡ和ｐｏｌｙ（Ａ）＾＋ＲＮＡ水平以及ｐｏｌｙ（Ａ）＾＋ＲＮＡ与总ＲＮＡ的比例均有增高,果实体内ＲＮＡ酶活性和体外蛋白质的合成水平也升高。乙烯很可能是促进草莓果实成熟衰老的因素之一。