DNA 顺序分析

遗传信息寓于核酸之中，而组成核酸的4 种核昔酸的排列次序体现了这种信息。因此，核 酸的顺序测定显然就很重要了。     

懒猴高重复顺序DNA的核苷酸顺序分析及其与类α-DNA顺序的比较

为确知懒猴高重复顺序与灵长类类α顺序间的相互关系,我们将懒猴DNA经EcoRI酶切所得到的高重复顺序DNA的最小片段重组到质粒pUC~(12)上,经转化、筛选、鉴定得到含有懒猴高重复顺序片段的克隆,命名为pLS(EcoR Ⅰ)-1,测定其全部核苷酸顺序为641bp,发现该顺序有与类α顺序的相似性,但变异性较大,我们对此进行了讨论。     

重复顺序与基因表达

一、真核基因组与重复顺序 重复顺序DNA在真核生物基因组中普遍存在,最早研究是在随体中出现。1968年Britten等采用了复性动力学的研究方法获得了可靠的实验证据,并提出了真核基因组中都有高重复顺序,中重复顺序与单考贝DNA顺序。     

大鼠高重复顺序DNA的核苷酸顺序分析及其与灵长类类α-DNA顺序的比较

 啮齿目动物高重复顺序DNA的结构特征,虽已有人进行过分析,并提出大鼠DNA中有酶切位点分布独特的高重复顺序,也有人认为在Sprague-Dawlay大鼠中有类似于α-DNA大小的高重复顺序,并命名为α型(α-type),是否大鼠中也含有类α顺序,并没有人讨论过。我们对Wistar大鼠高重复顺序DNA进行了分离、纯化、分子克隆及核苷酸序列分析,测定了全序列为370bp,它也是具有酶切点分布独特的高重复顺序,但与前者存在着18％的差异性。我们对此顺序与灵长类类α-DNA进行了比较分析,发现二者在几方面都不存在相似之处,如此序列G-C含量占全部碱基组成的37.3％,而类α顺序的G-C含量约在40％以上,一些酶切位点也与类α-DNA完全不相同,另外在此序列的相应位置上也不具有灵长类类α-DNA的三个“冷点区”等等,由此得出大鼠这一高重复顺序并非类α顺序,而类α顺序只是灵长类动物所特有的。     

高温反向顺序测定

单链克隆DNA的反向测序是一个简单和快速的方法,这个方法可利用原来的DNA再进行反向顺序测定,从而达到校正和积累DNA数据的作用。由于反向测序的本质是双链测序,所得到的DNA顺序的图谱背景较深,伴有杂带,或在x光显影上是不清晰的。本文报道利用我们实验室所开发的热稳定性的Bst聚台酶系统,进行反向测序克服了这些缺点,获得的图谱可以和单链DNA模板测序的图谱相媲美。我们以nod D 487-mp 8 ss-DNA为模板进行反向测序,证明Bst聚合酶在65℃反应能得到满意的结果。     

刺猬高重复顺序DNA的分子克隆及核苷酸顺序分析

为了分析比较食虫目高重复顺序的结构特征,我们将食虫目动物刺猬的高重复顺序DNA进行了分离、纯化、分子克隆,并测出了1186bp的核苷酸顺序。经分析发现在碱基组成上它与食虫目另一动物臭鼩有许多相似之处,如:G-C碱基对与A-T碱基对在整个片段中分布很不均衡;片段内部含有许多连续多次重复的短片段等,很可能为食虫目动物所特有。     

全基因组DNA顺序测定

自１９２６年摩尔根《基因论》发表以来，许多遗传学工作者都在寻找基因的化学实体，到１９２８年格里菲斯（Ｇｒｉｆｉｔｈ）和１９４４年埃弗里（Ａｖｅｒｙ）的转化实验，才首次证明了基因的本质是ＤＮＡ，基因是ＤＮＡ分子上的功能单位。１９５３年沃森（Ｗａｔｓｏｎ...     

蛋白质的微量顺序分析

蛋白质结构功能的研究是分子生物学领域中的一个重要方面。遗传工程、蛋白质工程的相继发展,到最后表达产物的分离、纯化和鉴定仍然需要蛋白质化学作为基础。近年来生物科学中很多重要的进展是由于细胞和细胞器中极少量的蛋白质或多肽的分离分析和了解结构功能后而取得的。这些都促进了蛋白质化学的发展。特别是应用了一些新的微量方法导致对基本细胞过程有了较好的了解,这包括:多肽激素及其相关的释放因子、生长因子和肿瘤、生物能力学、质子泵、离子泵和通道、拓扑基因学、蛋白质分泌、分子病毒学和免疫学、膜蛋白分析和受体研究等。     

树鼩高重复顺序TSr(Bgl-Ⅱ)-1的核苷酸顺序分析及与灵长类α-顺序的比较

为了确知树鼩高重复顺序与灵长类动物的类α顺序有无相似处,我们再次把TSr(BglⅡ)-1片段克隆在质粒pWR33上,用“双链引物测序法”测得全部核苷酸顺序为353bp。并将此顺序与灵长类动物的类α顺序进行比较,发现其中有三个对应位置上与类α顺序的“冷点”保守区序列相似,其中还有一个有碱基变异的EcoRⅠ酶切点和四个潜在的HindⅢ酶切点,另外有两个与“凉点”区一致的小顺序,对这些相似性进行了讨论。     

关于马的进化顺序问题

在中学《生物》课本中写到:“现代马是由躯体较小的始祖马,经过漫长的地质年代逐渐进化而来的。”又写到:“在晚近一些的地层中,发现了马的较近祖先——三趾马的化石。”这样,许多人对马的进化顺序往往理解为:现代马的远祖是始祖马,而近祖是三趾马。这种理解是否正确呢?为了回答这个问题,本文就马的进化历程中出现的各种化石简述如下。     

重复顺序与真核生物的基因表达

真核生物的基因组中重复顺序的发现,是近年来分子生物学研究的重大成果之一。现在已知,几乎所有的真核生物基因组中都有大量的重复顺序。这些重复顺序以两种形式分布在DNA链上。一种是与单一顺序相间地排列的,另一种则是呈丛生状态集中地排列在DNA的某一段区域内的。基因组中相同的重复顺序称为一个“家族”。     

红花菜豆凝集素的寡糖顺序分析

纯化的红花菜豆凝集素经肼解,Ｂｉｏ－ＧｅｌＰ－２柱分离,得到的寡糖部份用硼氢化钠还原,再红Ｂｉｏ－Ｇｅｌ Ｐ－４柱层析,获得两条寡糖链。通过甲醇解,乙酰化反应,最后制成三甲基硅醚衍生物。气相色谱分析表面两个寡糖的组成为;Ｍａｎ８Ｘｙ１ＧｌｃＮＡｃ２和Ｍａｎ６ＸｙｌＧｌｃＮａ２Ｆｕｃ。     

臭鼩高重复顺序DNA的核苷酸顺序分析及其与树鼩TSr(Bgl Ⅱ)-1顺序的比较

将臭鼩DAN经过Bam H Ⅰ酶切得到的高重复顺序DNA最小片段重组到质粒pAT153上,转化后得到了含有臭鼩BMS(Bam H Ⅰ)-1高重复顺序DNA片段的克隆。再把此片段重组到M_(13)mp19噬菌体DNA上。用末端终止法测得全部苷酸顺序为495个碱基对。对臭鼬BMS(Bam H Ⅰ)-1片段的结构特点进行了分析,并和树鼩TSr(BglⅡ)-1高重复顺序DNA进行了比较。为确定树鼩在分类学上的地位,提供了一定的分子遗传学证据。     

灵长类恒齿的出牙顺序

灵长类学家舒尔茨(A.H.Schultz)曾提出灵长类中由低级到高级的各种动物恒齿出牙顺序的差别是有规律地发展的。他提出了这样的顺序: I 代表门齿,C 代表犬齿,P 代表前臼齿,M 代表臼齿。每一字母右下角的数字代表各该齿的顺次,如 M_1代表第一臼齿。单线的字母代表在原来乳齿齿列后面新增加的恒齿;双线的字母代表替换乳齿的恒齿。括号内的各齿是出牙先后次序可能颠倒的,放在前面的则是通常长出较早的。     

核酸顺序的计算机辅助分析系统

本文介绍了一个在微机(IBM PC)上实现的、用于核酸顺序分析的计算机程序系统.该系统由三个层次和18个功能块构成,菜单及人机对话使得用户能较快地掌握和使用它.在编程中,采用了树结构、先进后出栈和稀疏矩阵等数据结构技巧,运用了Bayes法等统计分析方法,Kruskal算法和Floyd算法等一系列图论方法也被得到应用,这个软件系统的推出对于分子生物学研究具有一定的积极作用.