DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备

DRE顺式作用元件能与DREB转录因子特异结合,在诱导逆境（干旱、高盐、低温）基因表达过程中起重要作用。dsDNA（double strand DNA）微阵列芯片技术能够有效地检测序列特异性DNA结合蛋白质（转录因子）与大量DNA靶点（顺式作用元件）的特异性结合,可有效分析生物分子结合作用。根据DRE顺式作用元件核心序列设计并化学合成含发夹结构的单链DNA探针,采用Taq DNA聚合酶在片延伸,并对其在片延伸体系的反应温度、Mg^2＋浓度以及单链探针是否变性等条件进行了优化。结果表明,50％的反应温度,2．5mmol／L的Mg^2＋浓度和单链不变性是TaqDNA聚合酶在片延伸的最佳条件。优化方法制备的dsDNA芯片将更有利于DRE顺式作用元件与DREB抗逆转录因子相互作用的研究。     

利用基因组数据分析水稻基因顺式作用元件

为了研究籼粳亚种基因调控序列的总体特性,我们利用籼粳稻以及拟南芥基因组和全长mRNA序列获取了大量高可信度的调控序列,通过这些序列,分析了水稻基因调控序列顺式作用元件(信号)的数量、分布以及与GC含量的关系等．研究结果表明:一些信号在水稻基因调控序列中发生显著的数量变化,同时一些信号数量在水稻与拟南芥基因间存在明显差异, 这说明这两种单双子叶植物间信号的使用上存在偏好,同时水稻不同类型基因以及特有与非特有基因间在信号的使用上也存在差异．这些差异信号的分布直接导致了调控序列GC含量的波动．本研究没有发现水稻籼粳两个亚种间在调控序列方面(顺式调节因子和GC含量等)存在明显差异．     

利用进化比较的方法确定β珠蛋白基因簇调控的顺式元件

利用进化比较的方法对我、兔子和灵长类Ｇａｌａｇｏ的β珠蛋白基因以及所在的β珠蛋白基因簇进行分析,确定了可能的基因调控的顺式元件,并与一些实验结果进行比较,发现利用进行比较的方法确定基因调控的顺式元件是一种简单可行的方法。     

脊椎动物肌动蛋白顺式作用元件分布的进化

具有组织和发育表达特异性的基因,很可能具有独特的顺式作用元件的分布模式,这种模式在很大程度上决定表达的特异性。脊椎动物肌动蛋白各亚型的表达具有严格的组织特异性。为改进和完善１种顺式元件匹配预测方法,在实验资料的基础上,统计出５各顺式元件的核苷酸分布权重矩阵模式,对脊椎动物肌动蛋白基因的５’７调控区进行顺式元件的区配预测和序列分析,获得了相应亚型的物异性的顺式元件编码分布模式,并分析了其进化趋势。     

胰岛素基因及其顺式作用元件和反式作用因子

胰岛素基因及其顺式作用元件和反式作用因子杨绍华,陈俊杰（华西医科大学生化与重组ＤＮＡ室,成都６１００４１）关键词胰岛素基因,顺式作用元件,反式作用因子胰岛素基因迄今虽已从多种脊椎动物分离克隆、但对它的研究主要是以鼠和人的基因为对象进行的。除三种鼠（大...     

抗逆基因AtRPK1启动子关键顺式作用元件的研究

为确定拟南芥抗逆相关基因AtRPK1启动子的顺式功能元件,对其启动子区进行了分段克隆。通过5'端缺失方法得到203、316、604、809 bp 4个启动子片段,分别构建成p1300-pro-GUS表达载体,并转入拟南芥,进行GUS染色和GUS定量检测。通过对809 bp全长启动子转基因拟南芥GUS染色发现,转基因拟南芥的叶片、茎、花、根中均有表达,在分生能力强的组织和维管束集中的组织,AtRPK1基因启动子具有较高启动表达能力。5'端缺失启动子检测结果表明,转录起始点到启动子上游-114位点区域包含AtRPK1基因启动子的关键顺式作用元件。对启动子缺失片段转基因植株利用200 mmol·L-1NaCl胁迫3 h后,β-葡萄糖苷酸酶活力定量检测结果表明,在启动子上游-19位点处的GT-1顺式作用元件GAAAAA可能直接与盐胁迫应答相关。     

雌激素调节人血管紧张肽原基因表达的顺式作用元件分析

为了鉴定人血管紧张肽原（ＡＧＴ）基因的雌激素调控元件,在ＡＧＴ基因转录起始点和ＴＡＴＡ框之间的一段核苷酸序列与雌激素应答元件共有寡核苷酸序列高度同源,通过电泳迁移率变动分析,证明该ＤＮＡ序列为雌激素应答元件（ＨＡＧ ＥＲＥ）。将带有ＨＡＧＥＲＥ的ＡＧＴ基因核心启动子同氯霉素乙酰转移酶（ＣＡＴ）报道基因融合,或将多拷贝ＨＡＧ ＥＲＥ同ＴＫ核心启动子连接,再与ＣＡＴ基因融合,构成表达载体,与人雌激素     

多个顺式作用元件调节血管紧张素原基因表达

血管紧张素原是最强的血管活性物质——血管紧张素Ⅱ的唯一前体,在不同的生理和病理条件下,其水平各异．为了研究血管紧张素原基因表达的调控,将人血管紧张素原基因５′端侧翼序列１．２ｋｂ同氯霉素乙酰转移酶（ＣＡＴ）基因编码序列连接,构成表达载体,并且在此基础上构建５′端系列缺失的突变表达载体,用这些表达载体转染ＨｅｐＧ２和ＣＯＳ－７,确定了正负调控元件;同时应用ＤＮＡ－蛋白质凝胶泳动检测技术,发现核蛋白质与该顺式元件的结合,从而证明多个顺式作用元件调节血管紧张素原基因的表达．     

植物非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件的研究方法

非生物胁迫严重影响植物生长发育,降低作物产量。植物通过各种途径忍受或抵抗非生物胁迫,主要表现是各种抗非生物胁迫基因的表达。基因表达受其上游启动子及转录因子的调控,目前对抗非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件及转录因子的研究成为热点。本文综述了植物非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件及转录因子的研究方法,并展望了顺式作用元件及转录因子研究的方向及前景。