鳇亚科似鳇属鱼类的物种界定和系统发育关系

逗亚科似逗属鱼类的物种界定保持争议, 系统发育关系尚待解决。研究取样似逗属鱼类所有种, 使用核基因多位点序列重建似逗属鱼类的系统发育关系, 运用分子的物种界定方法并结合形态特征分析厘定我国似逗属鱼类的分类。贝叶斯系统发育树结果表明: 桂林似逗与平江似逗是单系种; 似逗与扁嘴似逗是多系种, 前者包括五个谱系A至E, 后者包括两个谱系A与B。POFAD距离分析和Structurama分析的结果表明似逗和扁嘴似逗的每个谱系是独立遗传种群, BP & P分析结果强烈支持它们是不同种。*Beast物种树结果揭示: 扁嘴似逗谱系B位于似逗属鱼类的基部位置; 似逗谱系A与B是姊妹群关系, 似逗谱系C是扁嘴似逗谱系A的姊妹群, 它们一起与桂林似逗形成姊妹群关系; 似逗谱系D与E是姊妹群关系, 它们一起是平江似逗的姊妹群。结合形态证据, 对我国似逗属鱼类分类厘定如下: 限定严格意义似逗包括似逗谱系A+B; 恢复长吻似逗(Pseudogobio longirostris Mori, 1934)给予似逗谱系C分类名; 似逗谱系D与E是隐存种, 桂林似逗与平江似逗是有效种。     

似鮈类鱼类的系统发育研究（鲤形目：鲤科）

本文通过对似类８属１３种和外类群７属１０种鱼类的比较研究,选取３７个骨骼及外部特征,运用外类群比较法进行特征分析,根据分支系统学原理重建了似类的系统发育。特征分析和系统发育分析表明似类是具有许多共同离征的单系群,朝着流水性底栖生活和刮食性的主干方向发展;其中以似属最原始,胡属最特化构成７对姐妹群。蛇属是较早分化出的相对特化的类群,棒花鱼属和小鳔属的关系相对较远。     

似Ju类鱼类的系统发育研究（鲤形目：鲤科）

本文通过对似Ｊｕ类８属１３种和外类群７属１０种鱼类的比较研究,选取３７个骨骼及外部特征,运用外类群比较进行特征分析,根据分支系统学原理重建了似Ｊｕ类的系统发育。特征分析和系统发育分析表明似ｊｕ类是具有许多共同离征的单系群,朝着流水性氏栖生活和刮食性的主干方向发展;其中以似Ｊｕ属最原始的,胡Ｊｕ属最特化构成７对姐妹群,蛇Ｊｕ属是较早分化出的相对特化的类群,棒花鱼属和小鳔Ｊｕ属的关系相对较远。     

基于四个线粒体基因片段的银鱼科鱼类系统发育

银鱼科鱼类是我国重要的经济鱼类,但其属间系统发育关系与属、种的界定尚存争议。研究使用线粒体12S/16S核糖体RNA、细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因部分序列以及NADH脱氢酶亚基1全长序列重建银鱼科属间的系统发育。结果显示银鱼科鱼类是单系群,白肌银鱼属在银鱼系统发育的基部,"大银鱼属+新银鱼属"、"间银鱼属+银鱼属"形成两个单系亚群,但日本银鱼属的位置没有很好解决。基于COI基因序列计算的"短吻-陈氏-太湖-近太湖新银鱼复合群"种间遗传距离为0—0.19%、"乔氏-寡齿新银鱼复合群"种间遗传距离为0%。整合研究结果与前人形态、分子证据,详细地讨论了银鱼的属、种分类。     

菝葜科基于形态学证据的系统发育分析

对全世界范围分布的菝葜科Smilacaceae的79个代表种(包括了全部的属和组), 以分布于南美洲的Philesia Comm. ex Juss.和Lapageria Ruiz &; Pav.属为外类群, 选取包括花粉和染色体性状在内的47个广义的形态学性状进行了分支分类系统发育分析, 同时以表征分类的方法构建了距离树(NJ)辅助分析, 首次对世界分布的菝葜科各属间及属内的系统发育关系作了探讨。(1)Ripogonum与菝葜属Smilax +肖菝葜属Heterosmilax互为姐妹群, 但是距离较远, 支持将类菝葜属(新拟中文名)Ripogonum独立为科的观点; (2)肖菝葜属在菝葜科内处于较为进化的分支上, 并与菝葜属土茯苓组sect. Coilanthus的部分种组成一个具较高支持率(88%)的单系分支, 分析表明肖菝葜属并非是一个好属, 应归入菝葜属; (3)菝葜属6个组的划分大都没有得到支持, 只有东亚北美间断分布的草本菝葜组sect. Nemexia的单系得到很好的支持(93%); (4)分布于南美洲巴西的种类聚为一个单系类群, 表明它们可能有共同的起源, 但由于取样局限, 南美洲种类的系统地位有待进一步研究。     

雪雀属系统发育关系的研究（雀形目：文鸟科)

雷雀属Montifringilla7种36个形态特征作为分类单元,进行支序分析。以麻雀属Passer、石雀属Petronia部分种类作为比较外群,讨论雪雀属的分类地位及其与近缘属麻雀属、石雀属系统发育关系;分析了雪雀属内种间的系统发育。支序分析的结果表明雪雀属为单系群,建议将雪雀属划分成两个亚属,讨论了雪雀属种类在进货上的位置,在3个近缘属的系统发育关系中,麻雀属类群较原始,雪雀属类群较进化,石雀属在进货中介于二之间。     

舌鳎亚科鱼类单系起源和同种异名的线粒体DNA证据

舌鳎亚科鱼类因形态特征的特殊性, 其分类及系统发育关系一直存在争议。本研究测定了中国沿海14种舌鳎亚科鱼类线粒体DNA的16S rRNA和Cyt b基因的部分片段。两个基因构建的舌鳎亚科系统发育树结果显示, 中国沿海舌鳎亚科鱼类为明显的单系群, 但舌鳎亚科鱼类内部的系统发育关系与形态分类划分的亚属并不完全一致, 日本须鳎(Paraplagusis japonica)与其他舌鳎属(Cynoglossus)种类并未形成不同的分支。虽然舌鳎属内的舌鳎亚属(Cynoglossus)、拟舌鳎亚属(Cynoglossoides)和三线舌鳎亚属(Areliscus)均可以聚为独立分支, 但长吻红舌鳎(C. lighti)与短吻红舌鳎(C. joyneri)、短吻三线舌鳎(C. abbreviatus)与紫斑舌鳎(C. purpureomaculatus)、半滑舌鳎(C. semilaevis)与窄体舌鳎(C. gracilis)及褐斑三线舌鳎(C. trigrammus)这三组物种可能存在同种异名现象。这一结果提示, 基于形态学对舌鳎亚科的种属分类鉴定尚存在不足, 线粒体DNA的系统发育关系可为其分类的修订提供有意义的参考和佐证。     

槭树科植物广义形态学性状分支分析

通过45个广义的形态学性状对槭树科(Aceraceae)尤其是槭属(Acer L.)的主要类群做了分支分析,结果显示：1)槭属内由于各类群分布着较多的同塑性状状态,而难以为属下组间关系的解决提供更多有价值的信息;通过对具体的性状状态分布分析显示,对于象槭属这样在形态上分化较大的类群,由于多数分类性状在不同类群间经历了平行和逆转演化,因而在较低分类阶元水平很难选择合适的性状来通过分支分析构建其系统发育;2)鸡爪槭组(section Palmata)作为整个槭属的基部类群,虽然支持率较低,但与其它类群相比在槭属内维持了较多的原始性状;3)金钱槭属(Dipteronia Oliv.)的两个种作为单系得到了100％的靴带支持,且和槭属作为姐妹群也得到了较好的支持。     

线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育

东方鲀属的红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）是后基因组时代的一种重要模式生物。本研究中,利用东方鲀属11种鱼类（18尾）的D-loop基因序列,对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究。经序列比对排定后,分析中D-loop序列有841个位点,其中395个位点为可变位点,267个位点为系统发育信息位点。分别采用邻接法（NJ）、最大简约法（MP）、最大似然法（ML）和贝叶斯方法构建了分子系统树。研究结果表明：（1）东方鲀属鱼类为一单系类群;（2）由横纹东方鲀（T. oblongus）和铅点东方鲀（T. alboplumbeus）构成的姊妹群位于这个类群的基部。此外,本属鱼类物种分类现状还需要进一步的澄清。     

云南曲靖下泥盆统西山村组四营鱼属(Siyingia)一新种(英文)

主要采用形态学与比较解剖学的方法,对采自云南曲靖地区下泥盆统西山村组中的1件盔甲鱼类标本进行了详细的形态学研究,建立了多鳃鱼类四营鱼属1新种:宽棘四营鱼(Siyingia perlatuspinosa sp.nov.),并据此修订了四营鱼属的特征。在此基础上,应用分支系统学对多鳃鱼类属一级的系统发育关系进行了重新分析与探讨,确定了四营鱼在多鳃鱼类中的系统发育位置。系统发育分析结果显示,四营鱼(Siyingia)与多鳃鱼(Polybranchiaspis)亲缘关系最近,二者形成了一个单系类群,与宽甲鱼(Laxaspis)+坝鱼(Damaspis)组成的单系类群互为姊妹群。宽棘四营鱼的发现不仅拓宽了四营鱼在华南的时空分布范围,而且丰富了多鳃鱼类的多样性,并为多鳃鱼类的深入研究提供了可靠的化石新证据。     

渭河陕西段鱼类群落结构组成及变化研究

为了解渭河陕西段鱼类资源状况及其变化趋势, 于2016—2017年分4次对渭河陕西段的鱼类资源进行了调查。研究共调查到鱼类49种, 隶属于6目11科36属, 优势种为短须颌须(Gnathopogon imberbis)、拉氏大吻鱥(Rhynchocypris lagowskii)、棒花鱼(Abbottina rivularis)、?(Hemiculter leucisculus)、鲤(Cyprinus carpio)和鲢(Hypophthalmichthys molitrix)。与1984年调查结果比较分析发现: 该河段鱼类物种减少36种, 物种多样性下降明显; 相似度为0.49, 为中等不相似, 物种组成变化明显。经Shannon-wiener指数、Pielou’s指数、Marglef指数、Jaccard’s指数和G-F指数分析发现: 渭河陕西段鱼类物种组成已发生明显变化, 物种多样性下降60%。通过个体生态学分析, 渭河陕西段现存鱼类以喜缓流、杂食型、栖息于砾石底质类群为主, 群落结构已发生改变。研究表明: 该河段鱼类物种多样性下降明显, 群落结构已发生明显变化, 资源量明显下降; 水体污染、水资源减少和生境适宜度下降是导致鱼类群落结构变化的主要原因。     

东亚似鮈类鱼类的起源和演化

本文采用分支扩散法和分支离散法两种生物地理学方法分析了似　类的起源和演化。结果说明似类于第三纪末起源于中国北方的原始类,逐步向南扩散。在其物种分化过程中可能存在南北两个分化中心。     

Phylogeny of the Anomala (Crustacea, Decapoda, Reptantia) based on the ossicles of the foregut

We present a cladistic analysis of the Anomala based on 66 ingroup species and 5 outgroup representatives. Based on a comparative analysis of the morphology of the foregut we scored 124 characters related to size, shape, and fusion of foregut ossicles and other foregut structures. Our parsimony analysis resulted in 30 equally parsimonious trees which differ mainly at the lower hierarchical level. Our study reveals two large clades within Anomala. One large clade consists of Galatheoidea and Chirostyloidea. The internal relationships show a monophyletic Porcellanidae nested within a group comprising paraphyletic Galatheidae, and Munididae as well as Munidopsidae. The other large clade contains Aegla as sister group to a monophyletic group consisting of the Hippoidea and a clade formed by Lomis and the Paguroidea. Coenobitidae are nested within paraphyletic Diogenidae and Lithodidae are nested within paraphyletic Paguridae. The results are discussed in the context of other morphological and molecular analyses. Furthermore, some aspects of carcinization are touched upon; in particular, an anomalan stem species with a, at least to some extent, ventrally folded pleon is suggested.     

Molecular phylogeny of Osmanthus(Oleaceae)based on non-coding chloroplast and nuclear ribosomal internal transcribed spacer regions

The phylogenetic relationships of Osmanthus Lour.were investigated using the nuclear ribosomal internal transcribed spacer(ITS)regions and non-coding chloroplast regions(psbA-trnH,trnL-F).The two datasets support the conclusion that Osmanthus is polyphyletic.with some species of the subtribe Oleinae nested within Osmanthus.Osmanthus didymopetalus P S.Green is nested within the clade formed by species of section Osmanthus in two trees.Osmanthus attenuatus P.S.Green.O.Funnanensis P.S.Green,and O gracilinervis R.L.Lu of traditional section Osmanthus are clearly divergent from other accessions,and do not form a monophyletic group with other Osmanthus accessions.Osmanthus marginatus Hemsl.is embedded in the clade formed by species of section Osmanthus in the ITS tree.In cpDNA trees all species of section Osmanthus are placed in the large clade and all species of section Leiolea formed a group.The taxonomic incongruence among trees for ITS and cpDNA indicate hybridization.as introgression may have occurred among some species of sections Osmanthus and Leiolea.Phylogeny of Osmanthus is discussed in light of molecular and morphological data,and a revised infrageneric classification with three sections(Leiolea,Siphosmanthu,and Osmanthus)is presented.The section Linocieroides is abandoned and united with section Osmanthus.     

中国淡水胭脂藻属植物形态及分子系统发育分析

以云南省玉溪市和河南省焦作市新采集的2株淡水胭脂藻标本为材料, 对其进行形态特征观察和分子系统发育分析, 联合我国已报道的其他胭脂藻序列信息, 构建该属植物可靠的系统发育关系。根据其现代地理分布模式, 对胭脂藻属进行了祖先地理起源重建。基于rbcL、psbA和UPA序列, 利用贝叶斯法、最大似然法和邻接法构建的系统发育树高度一致, 研究中的标本与鸡公山胭脂藻H. jigongshanensis聚合为一个独立分支, 并得到了很高的支持率, 根据分子生物学证据, 将其鉴定为鸡公山胭脂藻。通过研究中所采集2株鸡公山胭脂藻的形态特征比较, 发现传统的形态分类特征包括藻体高度和细胞直径, 在不同的环境条件下是可变的, 不适合作为胭脂藻属植物种类鉴定的依据。对于胭脂藻属这一形态结构较为简单的类群, 必须借助分子生物学证据和系统发育分析手段对其进行种类鉴定和系统发育分析。分子系统发育分析结果表明, 中国特有种鸡公山胭脂藻H. jigongshanensis形成单系类群, 其与日本胭脂藻H. japananense亲缘关系较近, 所有淡水胭脂藻种类形成一个独立的聚类群, 与海洋种类遗传差异较大。祖先地理重建的分析结果表明, 淡水胭脂藻的祖先起源地位于北美洲, 然后逐渐向东加勒比海区域、拉丁美洲和欧亚大陆扩散, 形成现代地理分布模式。胭脂藻属独特的种类地理分布特点, 可能与其较为古老的起源时间和漫长的进化历史相关, 同时淡水胭脂藻在北美洲区域起源时间较早, 进化历史漫长, 遗传多样性大, 这与该地理区域分布的种类H. angolensis为多系类群是相一致的。     

陷胸式蜂亚科（昆虫纲）化石在我国辽西上侏罗统的发现及其系统演化

描述产自辽宁北票上园地区黄半吉沟上侏罗统义县组下部膜翅目昆虫化石1新属新种Trematothoracoides liaoningensis gen.et sp.nov.,归入薤式产（Sepulcidae)中的陷胸茎蜂亚科（Trematothoracinae)。这是首次在我国发现可行的陷胸茎蜂化石,也是该亚科在侏罗纪的产次报道,分支分析结果表明Trematothoracinae为一单系类群。Thoracotrema与Prosyntexis进化程度较高,构成一对姊妹群,同时又是Trematothorax的姊妹群,Trematothoracoides最为原始,为Thoracotrema Prosymtexis Trematothorax的姊妹群。     

鳅鮀鱼类鳔囊结构及系统发育研究(鲤形目:鲤科)

本文应用分支系统学原理对鳅(鱼它)鱼类的鳔囊、鳔及相关结构进行了特征分圻,并以(鱼句)亚科作为外类群。解剖结果表明,鳅(鱼它)鱼类的鳔分四种类型;分析结果进一步证实鳅(鱼它)鱼类是一个单源群,作为一亚科可分为异鳔鳅(鱼它)属和鳅(鱼它)属,后者又分为原鳅(鱼它)和鳅(鱼它)二个亚属。     

A Paedomorphic parasite associated with a neotenic amphibian host: phylogenetic evidence suggests a revised systematic position for Sphyranuridae within anuran and turtle Polystomatoineans

The phylogenetic relationships of the families Polystomatidae and Sphyranuridae (subclass Polystomatoinea) within tetrapod monogenean parasites were investigated using partial 18S rDNA sequences. About 600 nucleotides of 11 species were sequenced, including 7 species of the most common subfamilies of Polystomatidae found in anurans and turtles, 1 species of the family Sphyranuridae parasitizing exclusively urodelans, and 3 species of the subclass Oligonchoinea infesting teleostean fishes. The phylogenetic analyses were performed using three reconstruction methods: neighbor-joining, maximum-parsimony, and maximum-likelihood. Polystomatoineans but not polystomatids were shown to be monophyletic. Within the polystomatoineans there are two clades: one includes the amphibian monogeneans (anuran polystomatids and urodelan sphyranurids) and the other includes the turtle polystomatids. Polystomatoineans may have coevolved with amphibian hosts, and an ancestral "polystome" dispersed at least 200 million years ago, either from the basal stem of lissamphibians or from an anuran ancestral stock, to freshwater turtles. Furthermore, the urodelan genus Sphyranura, initially assigned to the family Sphyranuridae on the basis of morphological and ontogenetic evidence, is clearly nested within polystomatids, suggesting that its systematic status must be revised. This supports recent findings which argue that species of the family Sphyranuridae may be paedomorphic parasites exclusively infesting neotenic mudpuppies.