野生鸡油菌子实体可培养微生物多样性及其功能分析

采用多种培养基对采自贵州省贵阳市3个样地的鸡油菌Cantharellus cibarius子实体内细菌和真菌进行分离、培养、鉴定和多样性分析。利用FAPROTAX和FUNGuild数据库分别对其功能类群进行注释,从而探究微生物群对鸡油菌生长发育的影响。结果表明,鸡油菌子实体内共分离获得细菌49株,分属于2门、4纲、6目、9科、12属和27种,其中,优势属为假单胞菌属Pseudomonas;真菌90株,分属于3门、7纲、12目、26科、32属和44种,优势属为蜡蚧菌属Lecanicillium。功能分析结果显示,细菌主要集中于潜在氮代谢、芳香性气味物质代谢,以及难溶性化学物质的溶解等方面;真菌主要集中于分解复杂有机物、辅助菌根真菌与植物根系建立共生,以及潜在抑制虫害、病原菌侵染等方面。     

鸡油菌属的研究概况与展望

鸡油菌属Cantharellus Adans. ex Fr. 在担子菌中是一个具有独立演化路线的类群, 隶属于担子菌门,同担子菌纲, 鸡油菌目, 鸡油菌科。该属全球分布广泛, 目前有65种, 中国曾记载9种。本文回顾了该属的研究历史, 结合自己的研究成果,着重对本属各分类单元的划分和命名, 相近种的区分, 鸡油菌C. cibarius Fr. 和管形鸡油菌C. tubaeformis Fr.: Fr. 复合群以及生态保护和仿生栽培等方面研究中存在的疑问和纷争进行了论述。最后,作者对我国鸡油菌属的生物多样性     

鸡油菌的25S rDNA部分序列及其系统学意义

菌物分类学家通常根据形态学、解剖学和显微观察特征的分析把鸡油菌类真菌（cantharelloidfungi）置于非褶菌目Aphyllophorales中或在非褶菌目和其他真正的伞菌之间,但由于缺乏足够的科学证据,有关其进化历史及其在担子菌中的系统发育位置等方面的关系等的各种假设,一直都存在着激烈的争论。本文从分子系统学角度出发,对鸡油菌Cantharelluscibarius的255rDNA部分序列进行了测定,并与另外10目的13个担子菌代表种和一个接合菌代表种的255rDNA序列进行比较分析,以接合菌总状毛霉Mucorracemosus为外类群构建出这些担子菌的系统树图,探讨鸡油菌与其他担子菌的关系及其系统学上的意义。从所构建的100多个进化树图来看,鸡油菌几乎总是在树图中最远的分枝的末端,与同担子菌中的各类肉质的伞菌目Agaricales和牛肝菌目Boletales的类群（乳菇属Lactarius、褶孔菌属Phylloporus、鹅膏属Amanita和口蘑属Tricholoma）最接近,其次是同担子菌中的非褶菌目的类群（侧耳属Pleurotus和灵芝属Ganoderma）,然后才是木耳Auricularia等有隔担子菌的类群。用于比较的鸡油菌DNA片段长度最长,有258个碱基,而其他类群则只有214至此241个碱基。本文认为鸡油菌与其他各肉质的伞菌类群的关系相对较密切,但它应该有其相?     

广义金钱菌属真菌研究概况

广义金钱菌属分布广泛,物种多样性丰富,包括了许多具有食药用价值的种类,具有较高的经济、生态和科研价值,但我国对该类真菌的关注较少。本文回顾了金钱菌属的建立与发展历程,以及分子生物学研究方法应用于该类真菌后其系统学的变化过程;介绍了欧洲与北美地区对栎裸脚伞复合群物种的区分过程;总结了广义金钱菌属真菌在生物防治和药用功效及化学成分研究等方面的研究进展。同时,还发现了各地对广义金钱菌属真菌的分类学研究水平差异较大,各地区研究水平不均衡和分子系统学研究不完善等问题,所以我国亟需对该类真菌资源调查与挖掘,以期为后续研究提供参考依据。     

海拔对乌拉山油松根围真菌群落结构的影响

为了解海拔对油松Pinus tabulaeformis根围土壤真菌多样性及群落结构的影响及探究真菌群落结构对土壤理化性质变化的响应,采用Illumina Miseq高通量测序平台对内蒙古乌拉山国家森林公园油松根围土壤真菌群落组成进行了研究。结果表明,4个海拔的土壤样本测序得到油松根围真菌有效序列共256 991条,划分为1 026个OTU,分属于13门、37纲、84目、145科、192属。在门水平上,油松根围优势真菌主要分布于子囊菌门Ascomycota、担子菌门Basidiomycota和被孢霉门Mortierellomycota;在属水平上,主要归属于青霉属Penicillium（14.4%）、被孢霉属Mortierella（7.6%）、双担菌属Geminibasidium（5.3%）、丝盖伞属Inocybe（1.8%）、枝孢霉属Cladosporium（1.6%）、棉革菌属Tomentella（1.6%）、异多棒菌属Xenopolyscytalum（1.4%）、镰刀菌属Fusarium（1.3%）、蜡蚧菌属Lecanicillium（1.3%）、土赤壳属Ilyonectria（1.1%）、热子囊菌属Thermoascus（1.0%）、蜡壳耳属Sebacina（1.0%）和一些未定名属。对油松根围土壤真菌的α多样性指数分析以及NMDS聚类结果的分析表明,海拔1 700m和1 800m的油松根围土壤真菌群落结构相似,而与1 500m的真菌群落结构差异显著,在海拔相对较高的1 700m-1 800m的真菌多样性及丰度显著高于海拔较低的1 500m处。对油松根围优势真菌与土壤理化性质的冗余（RDA）分析及相关性分析表明,土壤真菌的群落结构受土壤理化性质（硝态氮NN、含水量WC、速效钾AK、铵态氮AN、pH值、有效磷AP、含碳量CC和总氮TN）的显著影响,其中NN和WC对油松根围土壤真菌群落结构的影响最为显著。     

中国种子植物内生真菌资源及菌植协同进化

综述了中国种子植物内生真菌资源研究概况,比较了裸子植物和被子植物内生真菌种类,它们都具有肉座菌目(Hypocreales),粪壳菌目(Sordariales),散囊菌目(Eurotiales),毛霉目(Mucorales)及不产孢类(Myceliasterilia)内生真菌。裸子植物内生真菌涉及52个属,既包括高等的子囊菌和担子菌,也包括低等的卵菌(Oomycetes)和接合菌(Zygomycetes)类。被子植物涉及60个属,主要为高等的子囊菌(Ascomycetes)和担子菌(Basidiomycetes),低等的卵菌和接合菌报道很少。双子叶植物涉及40个属,单子叶植物内生真菌涉及30个属,两类被子植物所报道的内生真菌只有11个属相同。裸子植物与双子叶植物内生真菌相似程度较高,都具有炭角菌目(Xylariales)、格孢腔菌目(Pleosporales)、柔膜菌目(Helotiales)和白粉菌目(Erysiphales),刺盘孢菌属(Colletotrichum)、拟茎点霉属(Phomopsis)、枝孢霉属(Cladosporium)、地霉属(Geotrichum)等内真菌,共20个属相同。各类种子植物具有自己独特的一些内生真菌。还对植物与其内生真菌的协同进化关系进行了分析。     

黄山地区松树林外生菌根菌资源及生态分布

1998～2003年,对黄山地区松树林下外生菌根菌资源及生态分布进行了调查,鉴定出外生菌根菌43种,隶属于10科17属.其中马尾松林下有43种、黄山松林下有12种.马尾松幼林下的外生菌根菌种类单一,彩色豆马勃、硬皮马勃类为优势菌种;马尾松成熟林下外生菌根菌种类丰富,其优势种类为红菇科、鹅膏菌科、牛肝菌科和鸡油菌科的一些种类.并分析了树种植被对外生菌根菌分布的影响,菌根真菌的分布与温度、湿度及土壤条件的关系.     

中国大型高等真菌生物多样性的关键类群

由于生物多样性的关键类群在科学研究、社会经济及生态系统中所处的重要地位,有必要对其进行筛选和确定。在多年的野外考察和有关文献资料分析的基础上,参照植物和动物关键类群的划分原理及方法,结合高等真菌的特点将大型高等真菌划分为3种类型：濒危类群、重大科学价值类群和重要经济类群。其中,濒危类群指在近年的考察和报告中发现的数量急剧减少或由于过度的采集资源明显受到威胁的种类,其中有虫草属(Cordyceps)的中华虫草(C．siaensis)、块菌属(Tuber)的中华块菌(T．sinense)、假下陷块菌(T．pseu—doexcawatum)、喜马拉雅块菌(T.himalayense)、革菌属(Thelephora)的干巴菌(T．ganbajun)、口蘑属的松茸(Tricholoma matsuatke)及其近缘种和蒙古口蘑(T．mongolicum);重大科学价值类群指在真菌系统演化或与动、植物和其它真菌协同进化中的一些重要类群,或在应用研究领域具重要价值的类群,如鸡Zong菌属(Termitomyces)、鹅膏属(Amanita)、腹菌与伞菌的过渡类型如地红菇属(Macowanites)、粉褶包属(Richoniella)、轴腹菌属(Hydnangium)、腹牛肝菌属(Gastroboletus)等、牛肝菌类中的一些特殊单种属和寡种属如圆花孢牛肝菌属(Heimiel-la)、圆孔牛肝菌属(Gyroporus)等;重要经济类群指广为利用的食用菌、药用菌和外生菌根菌,其中主要有虫草属的中华虫草、块菌属的中华块菌、鸡Zong菌属盾尖鸡Zong菌(T．dypeatus)、鸡Zong菌(T.ewrhizus)、球形鸡Zong菌(T．gtoulus)、口蘑属的松茸群及蒙古口蘑、牛肝菌属(Bolaus)的美味牛肝菌(B．edulis)、小美牛肝菌(R．speciosus)、茶褐牛肝菌(B．brunneissimus)等,乳菇的红汁乳菇(L,hatsudake)、松乳菇(L．deliciosus)、多汁乳菇(L．volemus）、红菇属的变绿红菇(R．vir-escens)、蓝黄红菇(R．cyanoxantha)、鹅膏属的红黄鹅膏(A．hemibapha)、隐花青鹅膏(A．mang-iniana)、灵芝属(Ganoderma)的灵芝(G,lucidum)及紫芝(G,sinense)、竹荪属(Dictyophora)、豆马勃属(Pisdithus)的一些种。这些种由于具有重要的经济价值而受到过度的采集,故往往与濒危的种类一致。关键类群的筛选与提出为大型高等真菌的研究、应用和保护提供参考。     

培菌白蚁菌圃和粪便微生物多样性分析

【背景】培菌白蚁是属于白蚁科的一类与鸡枞菌属真菌共生的高等白蚁,其与体内肠道微生物和体外菌圃微生物形成三维共生体系。【目的】分析培菌白蚁菌圃和粪便的微生物多样性,并与肠道微生物进行比较。【方法】通过Illumina MiSeq高通量测序方法对培菌白蚁菌圃和粪便样品进行细菌16S rRNA基因和真菌ITS测序分析。【结果】高通量测序获得培菌白蚁菌圃和粪便样品细菌和真菌的有效序列和OTU数目。5个样品细菌OTU数目在90-199之间,而真菌OTU在10-58之间,细菌的种类多样性明显大于真菌。不论是细菌还是真菌,粪便样品的OTU数目多于菌圃样品。经物种分类分析,菌圃样品主要优势细菌是变形菌门(Proteobacteria),其相对含量超过82.4%;其次是拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes);粪便样品中优势细菌为拟杆菌门,其次是变形菌门,粪便优势菌属为别样杆菌属和营发酵单胞菌属,这与培菌白蚁肠道菌多样性组成一致。培菌白蚁菌圃和粪便样品共生真菌主要为担子菌门(Basidiomycota)和子囊菌门(Ascomycota)。菌圃优势真菌为鸡枞菌属(Termitomyces),相对含量在51.83%以上,菌圃中还鉴定到炭角菌属(1%,Xylaria)。【结论】为今后培菌白蚁-体内外微生物共生关系研究以及微生物的分离培养提供了依据和参考。     

荚孢腔属真菌次生代谢产物的研究进展

荚孢腔属(Sporormiella)真菌,属于座囊菌纲格孢腔菌目荚孢腔菌科(Sporormiaceae),种类较多,目前已收载了87种。研究发现,该属真菌的次生代谢产物资源丰富,迄今已报道的新化合物就有近50个,包括生物碱及含氮类、聚酮类、萜及甾体等化合物,其中已发现一些结构新颖、生物活性独特的化合物,为药物的研发提供了潜在的先导化合物,具有很好的研究价值。然而,目前对该属真菌的次生代谢产物研究的报道还较少,为使该属真菌资源能引起人们的关注和更多认识,本文对荚孢腔属真菌次生代谢产物的化学结构及其生物活性的研究进展进行了较为全面的综述。     

西藏墨脱的植物资源调查

1990年秋作者对西藏墨脱进行了近3个月的野外考察,现将结果简述如下: 一、墨脱的自然地理环境 墨脱位于西藏东南部,东喜马拉雅南翼,93°44′～96°08′E,27°33′～29°40′N,面积约30000km~2。雅鲁藏布江大拐弯后贯穿境内,南与印度东北部阿萨姆平原热带雨林接壤。地形复杂,流水侵蚀强烈,峡谷深切,地势北高南低,西北部的南迦巴瓦峰海拔7756m,南部海拔仅200～500m,是一个较完整的地貌单元。降水充沛,年降水量2000mm以上,中印边境则在4000mm以上,多集中在7～9月份热带北界伸入境内北纬29°,县城年均温15℃,低海拔地区最热月平均气温22～23℃。     

Q’eqchi’ Maya healers’ traditional knowledge in prioritizing conservation of medicinal plants: culturally relative conservation in sustaining traditional holistic health promotion

This ethnobotanical study in the spirit of transdisciplinarity, and in collaboration with Q’eqchi’ Maya traditional healers, compares traditional Q’eqchi’ Maya ecosystem constructs or environmental zones with scientific ecosystems. To determine which categorization method better accommodates Q’eqchi’ Maya medicinal plant diversity, we analized 26 transects representing 160 medicinal plant occurrences. Our transect array encompasses a representative sampling of Q’eqchi’ Maya medicinal plant repertoire with use values broadly distributed over 17 usage categories. With a cumulative frequency of 2,235 medicinal plants through ecological zones, we conducted one-way ANOVA on the mean number of medicinal plant species identified in transects of the two conceptual schemes being contested. Our analysis reveals the Q’eqchi Maya environmental zones are the most salient. That is, knowledge of the Q’eqchi’ Maya environmental zones improves one’s ability to predict whether there will be a high or low abundance of Q’eqchi’ Maya medicinal plant species in a particular region, whereas knowledge of scientific ecosystems does not accomplish this feat as well. This is a notable finding as it suggests that if indeed Q’eqchi’ Maya medicinal plant diversity is better accounted for by the zones as envisioned by the Q’eqchi’ Maya, then it should be this mode of conceptualization that should be adopted by scientists and conservationists when trying to locate and protect regional Q’eqchi’ Maya medicinal plant diversity. These efforts serve as a model internationally in the conservation of medicinal plant biodiversity supportive of culturally relative holistic health promotion.     

Ethnobotany of caiçaras of the Atlantic Forest coast (Brazil)

Caiçaras are inhabitants of the Atlantic Forest coast in SE Brazil. We studied the uses of plants by five Caiçara communities and compared medicinal plant citations by informants in coastal and island communities. We use diversity indices to evaluate the use of plants and to compare communities. There is a high diversity of plants used in the Atlantic Forest coasts: we found 276 species used for food, medicine and construction. Caiçaras rely on folk medicine, and medicinal plants were especially cited in interviews. Following predictions of island biogeography theory, we found a lower diversity of medicinal plants cited in islands compared to continental communities.     

Conservation of medicinal plants of Western Ghats,India and its sustainable utilization through <Emphasis Type="Italic">in vitro</Emphasis> technology

Climate change, alien species, and use of land for intensive farming and development are causing severe threat to the plant genetic diversity worldwide. Hence, conservation of biodiversity is considered fundamental and also provides the livelihoods to millions of people worldwide. Medicinal plants play a key role in the treatment of a number of diseases, and they are only the source of medicine for majority of people in the developing world. The tropical regions of the world supply the bulk of current global demand for “natural medicine,” albeit with increasing threat to populations in the world and its genetic diversity. India is a major center of origin and diversity of crop and medicinal plants. India poses out 20,000 species of higher plants, one third of it being endemic and 500 species are categorized to have medicinal value. The Western Ghats is one of the major repositories of medicinal plants. It harbors around 4,000 species of higher plants of which 450 species are threatened. Currently, the number of species added to the red list category in this region is increasing, and the valuable genetic resources are being lost at a rapid rate. Demand for medicinal plants is increasing, and this leads to unscrupulous collection from the wild and adulteration of supplies. Providing high-quality planting material for sustainable use and thereby saving the genetic diversity of plants in the wild is important. During the last 25 years of intensive research, Tropical Botanic Garden and Research Institute has developed in vitro protocol for rapid regeneration and establishment of about 40 medicinally important rare and threatened plants of Western Ghats. In situ conservation alone would not be effective in safeguarding these important species. Thus, utilizing the biotechnoligical approach to complement ex situ conservation program is becoming vital. Propagating biotechnology tools in plant conservation program is a prerequisite to succeed in sustainable use and to complement the existing ex situ measures. In addition to propagation, storage of these valuable genetic resources is equally important. In vitro slow growth of 35 species and cryopreservation using embryo/meristem/seed in 20 different species of rare medicinal plants of this region is accomplished. Plants developed in vitro of ten medicinal plants, which have restricted distribution, were reintroduced in the natural habitat as well.     

唐家河国家级自然保护区药用植物资源及多样性特征分析

为探究四川盆地唐家河国家级自然保护区药用植物资源种类、分布状况及保护现状,为该区药用植物的有效保护和管理提供科学依据。该研究于2014至2017年采用覆盖全区的野外样线实地考察、照片收集、走访和查阅文献等方法,对唐家河自然保护区药用植物多样性进行分析。结果显示:(1)唐家河保护区药用植物130科399属602种,其中蕨类植物17科26属36种,裸子植物3科3属3种,被子植物110科370属563种。在种属构成多样性上,寡种科(2~5个种)优势明显,占总科数的40.77%,共有165种,占总种数的27.41%;单种属有284属,占总属数的71.18%。(2)在生活型多样性上,草本药用植物占有明显的优势,共有450种,占总种数的74.75%。(3)全草(全株)类、根与根茎类是唐家河药用植物的主要药用部位。(4)唐家河药用植物在植物区系上表现为以温带分布为主。研究表明:唐家河保护区药用植物种类丰富,药用植物生活型、部位、功效等类型多样,具有科研、保护和利用价值。     

药用植物多样性特征分析——以陕北米脂县为例

为研究陕北米脂县野生药用植物资源现状及其分布规律,通过野外调查及查阅文献等方法,对该地区药用植物多样性及其特征进行研究。结果显示：（1）米脂县共有野生药用植物45科110属148种,其中裸子植物2科2属2种、被子植物43科108属146种,集中分布于单种科和寡种科及单种属内;（2）从生长型来看,草本植物最多,其次是乔木,灌木最少;（3）药用部位以全草类、根及根茎类最多,分别占药用植物总种数的52.03%和14.86%;（4）药用功效以清热和利水渗湿为主,分别占药用植物总数的23.65%和11.49%;（5）从药用植物属的分布类型来看,有13个分布区类型8个变型,区系成分复杂多样,温带性质明显。本研究表明米脂县药用植物资源多样性较高,生长型、药用部位、功效、区系成分丰富多样,明确了该地区野生药用植物资源的分布及生存现状,为加强资源的保护及开发利用提供了依据。     

Genetic diversity and structure of an endangered medicinal plant species (Pilocarpus microphyllus) in eastern Amazon: implications for conservation

Few studies have evaluated the genetic status of medicinal plants exposed to commercial harvesting. Here, we examine the genetic variability of Pilocarpus microphyllus, an endemic and threatened medicinal plant species from the eastern Amazon, across its largest remaining wild population. Popularly known as jaborandi, species of Pilocarpus genus are the unique known natural source of pilocarpine, an alkaloid used to treat glaucoma and xerostomia. However, Populations of P. microphyllus has experienced a severe decline in the last decades. Using RAD sequencing, we identified a total of 5,266 neutral and independent SNPs in 277 individuals collected from the Carajás National Forest (CNF). We quantified genetic diversity and gene flow patterns and estimated the minimum number of individuals necessary to establish a germplasm bank. Our results revealed high genetic diversity and four spatially distinct clusters of P. microphyllus with substantial admixture among them. Geographic distance and temperature dissimilarity were the factors that best explained the relatedness patterns among individuals. Additionally, our findings indicate that at least 40 matrices sampled randomly from each population would be required to conserve genetic diversity in the long term. In short, P. microphyllus showed high levels of genetic diversity and an effective population size (N_E) sufficient to reduce the likelihood of extinction due to inbreeding depression. Our results indicate that diversity has been maintained despite the continuous harvesting of raw leaf material in the area over recent decades. Finally, the results provide information essential for the design of a germplasm bank to protect the endangered medicinal plant species.

     

滇西北香格里拉县大型真菌资源及其利用现状

香格里拉县（中旬县）位于云南省西北部,该区域内地形地貌复杂,海拔高差悬殊,兼有温带和寒温带高山气候类型。该区具有典型的温性、寒温性针叶林和寒温性常绿阔叶林以及针阔混交林,其中有不少是能与大型真菌形成共生关系的树种,如云南松（Pinus yunnanensis Franch．）、高山松（P．densata Mast．）、川滇高山栎（Quercus aquifolioides Rehd．etWils．）、灰背栎（Q．senescens Hand．-Mazz．）以及高山桦（Betula delavayi Franch．）和白桦（B．platyphylla Suk．）等。     

红菇属研究进展

红菇属Russula是一类具有较高经济和研究价值的食药用真菌,部分种类有毒。从红菇属的资源和分类、分子系统学、遗传多样性与应用研究等方面,本文对近年的研究进展进行了综述。红菇属研究存在的主要问题是形态特征记述误差较大导致的鉴定不准确,现有分子系统学研究和遗传多样性研究只涉及了少数种类的单基因片段,我国已报道的大量原初描述于欧洲和北美洲的种名是否在我国有分布尚存在争议,解决上述问题是今后红菇属研究的主要方向。     

西藏米林县珍稀濒危药用植物优先保护评价

通过设置样方和路线踏查,对米林县的野生药用植物资源进行调查,并利用多个指标定量计算各濒危植物的优先保护值,确定其珍稀濒危物种优先保护序列,对珍稀濒危药用植物的种类、药效和入药部位多样性进行了分析。结果表明:米林县共有药用保护植物37科72属97种,分别占药用植物总科数、总属数、总种数的48.05%、32.00%、30.70%。其中,被子植物有35科69属95种,裸子植物有2科2属2种。97种珍稀濒危药用植物中,处于Ⅰ级保护的药用植物有9科11属11种,处于Ⅱ级保护的药用植物有18科25属27种,处于Ⅲ级保护的药用植物有28科46属59种。从珍稀濒危药用植物的药效来看,清热功效和补虚功效的药用植物较多,分别有32种和20种,各占濒危药用植物总种数的32.99%、20.62%;从药用部位统计,根与根茎类和全草类的药用植物分别有34种和26种,占珍稀濒危药用植物总数比例较大,分别为35.05%、26.80%。该区评估的优先保护等级和濒危等级与保护植物名录有一定差异,桃儿七在本区的保护等级由Ⅲ级升为Ⅰ级,另外有7种植物的濒危程度在本区加强。基于调查和研究结果分析了米林县珍稀濒危药用植物的致濒原因,并就此提出了一些具体的保护建议和措施。