中国苋属nrDNA的ITS序列分析及其系统学意义

运用ＰＣＲ直接测序法,对苋属（Ａｍａｒａｎｒｈｕｓ Ｌ．）１５个种及外类群鸡冠花（Ｃｅｌｏｓｉａ ｃｒｉｓｔａｔａ Ｌ．）ｎｒＤＮＡ的ＩＴＳ区（包括ＩＴＳ－１,５．８５ｒＤＮＡ和ＩＴＳ－２）进行序列测定。结果表明苋属植物的ＩＴＳ序列总长度为６２９－６３２ｂｐ,长度变异仅发生在ＩＴＳ－１区（２５０－２５３ｂｐ）。采用ＰＡＵＰ软件进行系统发育分析表明：分布于中国的苋属植物可分为３组,即刺苋组（ｓｅｃｇ     

斜纹夜蛾核多角体病毒基因组全序列分析

已完成斜纹夜蛾核多角体病毒 (Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａｌｉｔｕｒａｍｕｌｔｉｃａｐｓｉｄｎｕｃｌｅｏｐｏｌｙｈｅｄｒｏｖｉｒｕｓ,ＳｐｌｔＭＮＰＶ)基因组全序列测定。ＳｐｌｔＭＮＰＶ基因组全长 1 39341ｂｐ ,碱基组成中Ｇ Ｃ含量为 42 .7% ,与已发表的Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａｅｘｉｇｕａｍｕｌｔｉｃａｐｓｉｄｎｕｃｌｅｏｐｏｌｙｈｅｄｒｏｖｉｒｕｓ (ＳｅＭＮＰＶ) (44 % )和Ｂｏｍｂｙｘｍｏｒｉｎｕｃｌｅｏｐｏｌｙｈｅｄｒｏｖｉｒｕｓ (ＢｍＮＰＶ) (40 % )相似 ,而与Ｌｙｍａｎｔｒｉａｄｉｓｐａｒｍｕｌｔｉ ｃａｐｓｉ…     

四川东北部箭竹属一新种

甜箭竹　甜竹 (四川万源 )　新种　图 1Ｆａｒｇｅｓｉａ　ｏｓｔｒｉｎａＹｉ,ｓｐ .ｎｏｖ .ＴＹＰＥ :Ｓｉｃｈｕａｎ (四川 ) ,Ｗａｎｙｕａｎ (万源 ) ,Ｈｕａｅｓｈａｎ(花萼山 ) ,ａｌｔ.2 1 0 0ｍ ,ｔｈｉｃｋｅｔｓ ,1 998- 1 1 - 2 1 ,Ｔ .Ｐ .Ｙｉ (易同培 ) 9882 3(ｔｙｐｅ ,ＳＩＦＳ) ;ｓａｍｅｌｏｃａｌｉｔｙ ,ａｌｔ.1 980～ 2 30 0ｍ ,1 998- 1 1 - 2 1 ,Ｔ .Ｐ .Ｙｉ (易同培 ) 9882 1 (ＳＩＦＳ) .ＳｐｅｃｉｅｓＦ .ｍｕｒｉｅｒａｅ (Ｇａｍｂｌｅ)Ｙｉａｆｆｉｎｉｓ ,ｓｅｄｃｕｌｍｉｓｊｕｎｉｏｒｉｂｕｓｐｒ…     

鸡马立克氏病病毒B抗原片段在大肠杆菌中表达

鸡马立克氏病病毒ＢａｍＨＩ基因文库Ｉ３质粒中含有编码Ｂ抗原膜外Ｄｏｍａｉｎ的ＤＮＡ序列。经ＳｃａＩ和ＳｐｈＩ双酶酶解Ｉ３质粒,分离获得７６４ｂｐＤＮＡ片段,并克隆进Ｍ１３ｍｐ１９中。ＤＮＡ序列测定分析表明克隆片段为ＭＤＶ－Ｂ抗原基因的４９４－１２５８ｂｐ部分序列。进一步分离ＮｃｏＩ－ＨｉｎｄＩＩＩ部分基因片（５３０ｂｐ）,克隆于ＰＬＰｒｏｍｏｔｅｒ控制下的含有修饰型ｃＩｔｓ８５７基因的表达载体中,     

水稻脂质转移蛋白基因的分离和分析

用水稻脂质转移蛋白（ｌｉｐｉｄｔｒａｎｓｆｅｒｐｒｏｔｅｉｎ,ＬＴＰ）的ｃＤＮＡ（ｐＦＤＲＳＣ１１０）为探针,从水稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．ｓｐ．ｉｎｄｉｃａ）“广陆矮４号”基因文库中筛选出ＬＴＰ基因,完成了１．８ｋｂ长片段的序列测定。该基因编码一个１２１个氨基酸组成的肽,编码区中间有一个９０ｂｐ的内含子,基因的调控区除有２个ＴＡＴＡｂｏｘ和ｐｏｌｙＡ加工信号外,还存在多个回文序列和逆向重复序列。该基因编码的蛋白质Ｎ端是由２８个氨基酸组成的信号肽,同源性比较表明它具有典型的植物ＬＴＰ特征。     

鸡蛋花花叶病毒3'端序列的克隆与分析

根据烟草花叶病毒组（Ｔｏｂａｍｏｖｉｒｕｓｅｓ）３’端非编码区保守区域,人工合成下游引物Ｐ１,Ｐ２,Ｐ３,分别以这些引物引导在反转录酶作用下合成双链ｃＤＮＡ,并克隆到ｐＢＳ载体上。ＨｉｎｄⅢ＋ＰｓｔⅠ双酶切分析重组子后,得到１５个阳性重组子,其中重组子ｐＢＦ３含有２ ４３２ ｂｐ外源ＤＮＡ。序列分析结果表明：该２ ４３２ ｂｐ的序列含２个开放读框,即鸡蛋花花叶病毒移动蛋白基因序列和外壳蛋白基因序列     

不依赖甲硫氨酸的翻译起始

Ｓａｓａｋｉ等在ＰｒｏｃＮａｔｌＡｃａｄＳｃｉＵＳＡ 2 0 0 0年第 4期上报道了一种不依赖甲硫氨酸的翻译起始方式[1] 。ＰＳＩＶ (Ｐｌａｕｔｉａｓｔａｌｉｉｎｔｅｓｔｉｎｅｖｉｒｕｓ)是一种昆虫ＲＮＡ病毒 ,属蟋蟀麻痹样病毒组 (Ｃｒｉｃｋｅｔｐａｒａｌｙｓｉｓ ｌｉｋｅｖｉｒｕｓｅｓ) ,为正链ＲＮＡ病毒。属于该组的还有ＤＣＶ、ＲｈＰＶ、ＨｉＰＶ等。该组病毒的理化性质与哺乳动物的小ＲＮＡ病毒 (ｐｉｃｏｒｎａｖｉｒｕｓ)相似 ,但基因图 1　 (Ａ)ＰＳＩＶ基因组结构 ;(Ｂ)预测的外壳蛋白编码区上游的茎环结构组织不同。…     

CS3纤毛抗原表达调控机理的研究

ＣＳ３是某些肠毒素大肠杆菌菌体表面上的多聚物,它能使病原菌粘附于宿主的小肠上皮细胞上,是致病的重要因素．为了探索ＣＳ３菌毛抗原基因的表达调控机制,根据ＣＳ３亚基结构基因的核苷酸序列分析表明,在其翻译起始位点的上游存在着ｒｂｓ位点及原核启动子的－１０区和－３５区ＤＮＡ序列．采用基因重组技术将ＣＳ３结构基因上游１２０ｂｐ的ＤＮＡ片段亚克隆进缺乏启动子而只含报告基因ｌａｃＺ的质粒ｐＣＢ２６７中．凝胶滞留和启动报告基因表达的实验证明了ＣＳ３亚基结构基因具有自身的启动子（Ｐｓ）．将该启动子上游区域不同长度的核苷酸片段克隆进ｐＣＢ２６７中,报告基因表达结果表明ＣＳ３结构基因的表达受其上游区域的抑制．核苷酸序列分析发现,在Ｐｓ－３５区上游５５０ｂｐ和８４０ｂｐ处各存在一个富Ａ－Ｔ簇．结合原核启动子的一般作用规律推知,ＣＳ３的表达可能受ＤＮＡ结合蛋白型的正向调节因子的作用．用ＣＦＡ／１菌毛抗原基因的正向调节基因ｃｆａＤ对ＣＳ３基因进行的互补表达试验表明ｃｆａＤ基因不仅可消除上游区对Ｐｓ的抑制,而且可大幅度地提高Ｐｓ的启动能力．在分析表达调控的基础上获得ＣＳ３重组高效表达．同时提出了其表达调控模型．     

大樱桃矮化砧木吉塞拉（Gisela）的微体繁殖

1　植物名称　大樱桃矮化砧木 (Ｐｒｕｎｕｓｃｅｒａｓｕｓ×Ｐ .ｃａｎｅｓｃｅｎｓ)吉塞拉 (Ｇｉｓｅｌａ) 5、6、7号。2　材料类别　休眠枝条。3　培养条件　ＭＳ为基本培养基。 ( 1 )丛生芽诱导培养基 :ＭＳ 6 ＢＡ 1ｍｇ·Ｌ- 1 (单位下同 ) ＩＢＡ0 .1。 ( 2 )继代增殖培养基 :ＭＳ 6 ＢＡ 0 .5 ＺＴ0 .1。 ( 3)生根培养基 :1 /2ＭＳ ＩＢＡ 0 .3。培养基中蔗糖为 3% ,琼脂为 0 .6% ,ｐＨ 5 .8,温度 2 5℃ ,每天光照 1 6ｈ ,光照度为 1 5 0 0ｌｘ。4　生长与分化情况4.1　无菌材料的获得　将外植体用洗衣粉溶液洗净表面 ,再以…     

嗜热脂肪芽孢杆菌中转座因子IS5376的转座行为研究

ＩＳ５３７６和ＩＳ５３７７是在嗜热脂肪芽孢杆菌（Ｂａｃｉｌｕｓｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）中发现的两个转座因子。随机取样分析的结果说明,ＩＳ５３７６由ＣＵ２１染色体向质粒ｐＦＤＣ５和ｐＦＤＣ１２的转座受温度的影响,而ＩＳ５３７７则不。温度影响的原因还不清楚,从现有证据看来,这由ＩＳ５３７６本身的性质所决定。另外,测得ＩＳ５３７６的转座作用有一定程度的专一性,还测得转座后所造成的目标序列的顺向重复为４或５ｂｐ。     

水稻矮缩病毒最外层外壳蛋白基因（S2）cDNA克隆,序列分析及其在大？…

从水稻矮缩病毒（Ｒｉｃｅｄｗａｒｆｖｉｒｕｓ,ＲＤＶ）中国福建分离物中克隆分离了最外层外壳蛋白基因（Ｓ２）全长ｃＤＮＡ并对其进行序列分析,结果表明ＲＤＶＳ２ｃＤＮＡ全长３５１２ｂｐ,仅含一个３３４８ｂｐ的阅读框架,编码一人含有１１１６个氨基酸的蛋白（Ｐ２）。与基因库中已知基因序列比较,发现它与日本ＲＤＶＨ株系相应片段的核苷酸和氨基酸同源率分别为９４．６％和９５．４％与轮状病毒ＶＰ２氨基酸序列有一定     

棉铃虫核型多角体病毒p35基因的PCR扩增和克隆及其在原核细胞中的表达

用苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒（ Ａｃ Ｎ Ｐ Ｖ） 凋亡抑制基因ｐ３５ 的合成引物,从棉铃虫核型多角体病毒（ Ｈａ Ｎ Ｐ Ｖ） 基因组中用 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增到了１ｋｂ 片段。采用 Ｐ Ｃ Ｒ－ 双脱氧核苷酸链终止银染法,测定了所扩增到的１ ０１０ｂｐ 全序列,发现其开放阅读框完整,长８９７ｂｐ ,编码２９９ 个氨基酸。用 Ｄ Ｎ Ａ Ｓ Ｉ Ｓ 和 Ｐ Ｒ Ｏ Ｓ Ｉ Ｓ 软件分析发现,此片段与 Ａｃ Ｍ Ｎ Ｐ Ｖ ｐ３５ 基因同源区核苷酸同源性为９１ ％ ,氨基酸同源性也达８１ ％ ,证明了所扩增的片段是 Ｈａ Ｎ Ｐ Ｖ 的ｐ３５ 基因。为了研究此ｐ３５ 基因的功能及其效应机制,克隆了这一基因并在大肠杆菌细胞中实现了表达。     

水稻矮缩病毒最外层外壳蛋白基因(S_2)cDNA克隆、序列分析及其在大肠杆菌中的表达

从水稻矮缩病毒（Ｒｉｃｅｄｗａｒｆｖｉｒｕｓ,ＲＤＶ）中国福建分离物中克隆分离了最外层外壳蛋白基因（Ｓ２）全长ｃＤＮＡ,并对其进行了序列分析,结果表明ＲＤＶＳ２ｃＤＮＡ全长３５１２ｂｐ,仅含一个３３４８ｂｐ的阅读框架,编码一个含有１１１６个氨基酸的蛋白（Ｐ２）。与基因库中已知基因序列比较,发现它与日本ＲＤＶＨ株系相应片段的核苷酸和氨基酸同源率分别为９４６％和９５４％,与轮状病毒ＶＰ２氨基酸序列有一定的同源性。Ｓ２核苷酸序列二级结构预测结果表明,５’端５０个核苷酸的二级结构为一个发夹结构和一个茎环结构。Ｐ２有４个富含亮氨酸的区域,位于Ｎ端亲水区域的１０个氨基酸（ＡＡ６９～７８）残基形成一个α螺旋,这些特点均与轮状病毒ＶＰ２的结构特征相似。ＳＤＳＰＡＧＥ和Ｗｅｓｔｅｒｎ印迹分析表明在大肠杆菌中分段高效表达了Ｓ２编码蛋白的Ｎ端和Ｃ端。     

猴免疫缺陷病毒SIV核心蛋白基因在大肠杆菌中表达的研究

应用多聚酶链反应（ＰＣＲ）,直接从ＳＩＶ感染的猴艾滋病（ＳＡＩＤＳ）模型猴的外周血淋巴细胞总ＤＮＡ中扩增出７６７ｂｐ的ＳＩＶ核心蛋白Ｐ２７基因片段。扩增产物经ＥｃｏＲＩ及ＳａｌＩ双酶切后,克隆入相同酶切的表达质粒ｐＢＶ２２０中,获得含ＳＩＶ核心蛋白基因片段的重组质粒ｐＢＶＳＧ,并进行ＤＮＡ序列分析。用该重组质粒转化大肠杆菌ＤＨ５ａ经筛选、增殖及４２℃温度诱导,ＳＤＳ－ＰＡＧＥ表明外源基因表达蛋白含量占菌体总蛋白１４．５％,Ｗｅｓｔｅｒｎ－ｂｌｏｔ证实表达产物能被ＳＩＶＰ２７单克隆抗体及ＳＡＩＤＳ模型猴血清中特异性抗体识别。     

树Qu载脂蛋白CI cDNA序列及其组织表达

分离提取树Ｑｕ肝组织ｍＲＮＡ,经皮为模板,反转录构建了ＴＳ肝组织ｃＤＮＡ文库。利用制备的兔抗ＴＳ载脂蛋白ＣＩ多抗血清为探针筛选该文库,获得两个阳性克隆。测序及序列分析表明：两个克隆均为ＴＳａｐｏｉＣＩｃＤＮＡ基因。大的克隆由３８０个核苷酸要成,包括２１ｂｐ,９５ｂｐ组成的５’和３‘非编码区,２６４ｂｐ组成的一个完整开放阅读框架,编码８８个氨基酸的ａｐｏＣＩ前体,含２６个氨基酸构成的信号肽和６２肽的     

沉默调控基因Sir2的结构与功能

首先在酵母 (Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉａｅ)中发现的Ｓｉｒ基因家族 (Ｓｉｒ1、Ｓｉｒ2、Ｓｉｒ3、Ｓｉｒ4)是调节染色质沉默的重要基因。在酵母的衰老过程中 ,染色质的沉默可能是衰老的机制之一 ,处于沉默状态的染色质中的许多基因无转录活性 ,可能由此影响酵母生长。Ｓｉｒ基因的突变能影响酵母的寿命[1] 。1 .Ｓｉｒ2基因酵母共有 1 7条染色体 ,Ｓｉｒ2位于第 4条染色体的左臂上 ,全长 464 9ｂｐ。编码一个 562个氨基酸的蛋白质 ,编码区的前端有一段前导序列 (ＳＬ)。其ｃＤＮＡ序列包括一个 1 689全碱基开放阅读框架 ,一…     

黄芪毛状根GBSSI基因cDNA克隆及其结构分析

根据多种已发表的淀粉粒结构淀粉合成酶（ＧＢＳＳ）基因的比对分析,以它们保守区的核酸顺序为基础,设计一对简并引物。从膜荚黄芪（Ａｓｔｒａｇａｌｕｓ ｍｅｍｂｒａｎａｃｅｕｓ（Ｆｉｓｃｈ）Ｂｕｎｇｅ）毛状根提取ｍＲＮＡ,用ＲＴ－ＰＣＲ的方法扩增出５６０ｂｐ的ｃＤＮＡ片段。序列测定表明,此片段与发表的豌豆和马铃薯ＧＢＳＳＩ基因相应序列同源性分别达８９．６％和７３．０％,通过５′／３′ＲＡＣＥ（ｒａｐｉｄ     

A New Journal From China:Genomics ,Proteomics & Bioinformatics

Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ,Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ＆Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ (ＧＰＢ)ｉｓｓｐｏｎｓｏｒｅｄｂｙｔｈｅＢｅｉｊｉｎｇＧｅｎｏｍｉｃｓＩｎｓｔｉｔｕｔｅ (ＢＧＩ) ,ｔｈｅＩｎｓｔｉ ｔｕｔｅｏｆＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌＢｉｏｌｏｇｙｉｎＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ (ＣＡＳ) ,ａｎｄｔｈｅＧｅｎｅｔｉｃｓＳｏｃｉｅｔｙｏｆＣｈｉｎａ ,ａｎｄｐｕｂｌｉｓｈｅｄｂｙｔｈｅＳｃｉｅｎｃｅＰｒｅｓｓ ,Ｂｅｉｊｉｎｇ .Ｔｈｅｆｉｒｓｔｉｓｓｕｅｏｆｔｈｉｓｑｕａ…     

辣椒疫霉产毒共分离RAPD标记的研究

辣椒疫毒（Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ）毒素的产生是由一个不完全显性基因所控制,通过ＲＡＰＤ／ＢＳＡ分析证明,用ＯＰＷ１２扩增得到一条约１３００ｂｐ的ＲＡＰＤ标记带,该带与辣椒疫霉产毒共分离。纯化回收ＯＰＷ１２１３００ＤＮＡ,共转化感受态Ｅ．ｃｏｌｉ ＤＨ５α,筛选出３个白色阳性克隆,序列分析发现该标记ＤＮＡ为１２９１ｂｐ。这一标记ＤＮＡ序列的阐明为进一步分析产毒遗传机理提供了新的信息     

探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值

测定了果蝇ｎａｓｕｔａ亚群７个分类元和外群Ｄ．ｉｍｍｉｇｒａｎｓ的核糖体基因转录间隔区（ＩＴＳ,ｉｎｔｅｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｓｐａｃｅｒ）,包括５．８ＳｒＤＮＡ和２ＳｒＤＮＡ长约１．１ｋｂ的ＤＮＡ片段序列。结果表明：Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓ、Ｔａｘｏｎ Ｉ、Ｔａｘｏｎ Ｊ享有共同的序列;Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ则与Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ共享１个序列。序列之间存在少量的插入缺失和碱基替代。