梭菌属分类研究进展:现状和展望

目前构成梭菌属的微生物在系统发育和表型特征上不一致。多相分类数据表明,梭菌属物种之间差异大。大量基于16S rRNA 基因的系统发育研究表明,梭菌属应被限定为梭菌属类群I,作为狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)。尽管有这方面认识,梭菌属新物种仍持续增加,这些新物种并不能与梭菌属类群I 和标准种丁酸梭菌(C. butryicum)形成一致分支,引发梭菌属分类上的混乱。本文明确了梭菌属物种的范围,即只包括模式种和梭菌属类群I。此外,4 个物种念珠状真杆菌(Eubacterium moniliforme)、旋舞真杆菌(Eubacterium tarantellae)、最大八叠球菌(Sarcina maxima)和胃八叠球菌(Sarcina ventriculi)应被调至梭菌属,分别命名为念珠状梭菌(Clostridium moniliforme)、旋舞梭菌(Clostridium tarantellae)、最大梭菌(Clostridium maximum)和胃梭菌(Clostridium ventriculi)。一个新属哈撒韦氏菌属(Hathewaya)被提议成立,3 个梭菌属物种溶组织梭菌(Clostridium histolyticum)、泥渣梭菌(Clostridium limosum)和解朊梭菌(Clostridiumproteolyticum)重新归为溶组织哈撒韦氏菌(Hathewaya histolytica)、泥渣哈撒韦氏菌(Hathewaya limosa)和解朊哈撒韦氏菌(Hathewaya proteolytica),其中Hathewaya histolytica 为模式种。     

酪酸梭状芽胞杆菌研究进展

酪酸梭状芽胞杆菌（Clostridium butyricum）是属于硬壁菌门（Firmicutes）梭菌纲（Clostridia）梭菌目（Clostridiales）梭菌科（Clostridiaceae）梭菌属（Clostridium）的一种革兰阳性菌（以下简称酪酸梭菌）。早在1877年就开始了对酪酸梭菌的研究。近130年以来,不同国别的不同研究者曾经先后用了10来种不同的名称记录或描述这个菌种（表1）,1980年学术界规范地将其统一命名。尽管早已有文献报道酪酸梭菌是人的正常肠道菌,但是在i999年2月由联合国粮农组织（FAO）和世界卫生组织（WHO）联合在罗马召开的第52次食品添加剂专家委员会的会议文件中还是再次指出了酪酸梭菌是人的正常肠道菌这一事实。酪酸梭菌是严格的厌氧菌,产生丁酸,所以也有人将其称为丁酸梭菌。它们不仅存在于人的肠道中,也存在于动物肠道和土壤中。在一定条件下形成孢子。     

酪酸梭菌与婴双歧杆菌对艰难梭菌体外生物拮抗作用的作用

用酪酸梭菌（Clostridium butyricum)和婴双歧杆菌（Bifidobacterium infantis)单独或联合艰难菌（Clostridium difficile)进行试管内的生物拮抗作用,将酪酸梭菌、婴儿双歧杆菌单独或酪酸梭菌和婴儿双歧杆菌联合分别与艰难梭菌以一定的比例等量混合后,接种于GAM液体培养基中进行厌氧培养。证明酪酸梭菌和婴儿双歧杆菌能明显抑制艰难梭菌的生长,并且两菌联合比各自单独培养时显示出更强的生物拮抗作用。     

酪酸梭菌与婴儿型双歧杆菌对产气荚膜梭菌试管内生物拮抗作用的研究

用酪酸权菌（Clostridium butyricum）和婴儿型双歧杆菌（Bifidobacterium Infantis）对产气荚膜梭菌（Clostriduim perfringens）进行试管内的生物拮抗试验。将酪酸梭菌、婴儿型双歧杆菌及酪酸梭菌和婴儿型双歧杆菌分别对产气荚膜酸菌以一定的比例等量混合接种于GAM液体培养基中进行厌氧培养。实验证明酪酸梭菌和婴儿型双歧能明显抑制产气荚膜梭菌的生长,并且比各自单独培养时显示了较强的生物拮抗作用。     

梭菌属分类研究进展:现状和展望（英文）

目前构成梭菌属的微生物在系统发育和表型特征上不一致。多相分类数据表明,梭菌属物种之间差异大。大量基于16S rR NA基因的系统发育研究表明,梭菌属应被限定为梭菌属类群I,作为狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)。尽管有这方面认识,梭菌属新物种仍持续增加,这些新物种并不能与梭菌属类群I和标准种丁酸梭菌(C.butryicum)形成一致分支,引发梭菌属分类上的混乱。本文明确了梭菌属物种的范围,即只包括模式种和梭菌属类群I。此外,4个物种念珠状真杆菌(Eubacterium moniliforme)、旋舞真杆菌(Eubacterium tarantellae)、最大八叠球菌(Sarcina maxima)和胃八叠球菌(Sarcina ventriculi)应被调至梭菌属,分别命名为念珠状梭菌(Clostridium moniliforme)、旋舞梭菌(Clostridium tarantellae)、最大梭菌(Clostridium maximum)和胃梭菌(Clostridium ventriculi)。一个新属哈撒韦氏菌属(Hathewaya)被提议成立,3个梭菌属物种溶组织梭菌(Clostridium histolyticum)、泥渣梭菌(Clostridium limosum)和解朊梭菌(Clostridium proteolyticum)重新归为溶组织哈撒韦氏菌(Hathewaya histolytica)、泥渣哈撒韦氏菌(Hathewayalimosa)和解朊哈撒韦氏菌(Hathewaya proteolytica),其中Hathewaya histolytica为模式种。     

粪菌移植治疗艰难梭菌感染的研究进展

艰难梭菌感染(Clostridium difficile infection,CDI)是院内抗生素相关性腹泻的最重要因素之一,其主要临床表现包括血便、腹泻、中毒性巨结肠、伪膜性肠炎等。近年来,CDI发病率、复发率、死亡率和治疗费用均明显增加,但其各种治疗方法均有局限性,尤其是抗生素治疗复发性艰难梭菌感染已面临许多棘手问题。目前证实肠道菌群失调和CDI感染关系密切,肠道菌群紊乱后导致艰难梭菌过度繁殖并释放毒素,可导致艰难梭菌感染。粪菌移植作为重建肠道菌群的重要方式,已成为复发性、难治性艰难梭菌感染最有效的治疗方式之一,不良反应极少。本文就国内外粪菌移植治疗艰难梭菌感染的研究进展作一综述。     

艰难梭菌相关性腹泻的治疗进展及对我国的启示

艰难梭菌相关性腹泻（Clostridium difficile associated diarrhea,CDAD）是艰难梭菌感染（Clostridium difficile Infection,CDI）引起的一种机体严重疾病。随着艰难梭菌感染率的增加及高毒力株027／NAP1／BI的出现,导致该病在全球特别是北美、及欧洲等地区爆发性流行,对于该病的控制引起全球研究者的高度重视。本文就其治疗进展进行综述,并结合我国实际分析该病防治中存在的问题并提出建议。     

粪菌移植通过微生物-肠-脑轴改善抑郁症的研究进展

人类粪菌移植(fecal microbiota transplantation,FMT)早在19世纪50年代的西方医学中便有临床应用.FMT已被证明可以很好地缓解艰难梭菌感染(Clostridium difficile infection,CDI)的胃肠道疾病,在调节微生物-肠-脑轴(microbiota-gut-br...     

丁酸梭菌活菌制剂对肠道菌群影响的研究

通过动物实验和人体试食试验,对丁酸梭菌活菌制剂一泰平扯对肠道菌群的影响进行了研究。结果表明：受试对象肠道内的双歧杆菌的数量增加,差异有极显著性（Ｐ≤０．０１）,乳杆菌的数量增加,差异有显著性（Ｐ≤０．０５）。说明丁酸梭菌活菌制剂一泰平片具有一定的增殖肠道内有益菌和抑制有害菌的作用。     

炎症性肠病与艰难梭菌感染相关性研究的文献计量学和可视化分析

【背景】近年来,炎症性肠病患者中艰难梭菌（Clostridium difficile）感染率逐年上升,受到国内外学者广泛关注。我国在该领域的研究起步较晚,但患者数量众多,学习国际上对于炎症性肠病合并艰难梭菌感染的研究,对推动我国在该领域的深入发展具有重要意义。【目的】通过文献计量和可视化分析帮助研究者把握炎症性肠病与艰难梭菌感染相关性研究中的研究主题、方向、热点与前沿。【方法】同时检索Web of Science （WOS）中Science Citation Index Expanded （SCI-E）和CNKI中收录的关于炎症性肠病和艰难梭菌的相关文献,应用CiteSpace 6.2.2r软件进行国家/地区、机构、作者、关键词共现及被引文献、期刊共被引分析,同时进行可视化分析。【结果】经过数据检索和查重,最终可供分析的文献为WOS数据库1 030篇、CNKI数据库80篇。全球范围内,发文最多的国家是美国,主要研究机构有Harvard University、University of California System和Mayo Clinic等,高产作者有Khanna S、Shen B和Ananthakrishnan AN等,高频关键词包括Inflammatory bowel disease、Ulcerative colitis、Clostridium difficile、Clostridium difficile infection和Crohn’s disease等,聚类方向有#0 Diarrhea、#1 Ulcerative colitis、#2 Probiotics、#3 Pouchitis、#4 Gut microbiota、#5 Fecal microbiota transplantation、#6 Depression、#7 Entamoeba histolytica、#8 Pseudomembranous colitis、#9 Clostridium difficile和#10 Clindamycin。国内主要研究机构有南方医科大学和河北医科大学,高产作者有王浦、王斯淇等,高频关键词包括粪菌移植、艰难梭菌、肠道菌群、危险因素和克罗恩病等,聚类方向有#0艰难梭菌、#1益生菌、#2危险因素、#3腹泻和#4粪菌移植。【结论】利用CiteSpace软件对炎症性肠病和艰难梭菌感染相关性研究进行计量及可视化分析可知,该方向仍得到全球各医疗机构及研究者的关注,腹泻及粪菌移植这两个关键词分别代表了WOS数据库和CNKI数据库关于炎症性肠病合并艰难梭菌感染研究的热点。     

酪酸梭菌活菌片联合马来酸曲美布汀、谷维素对IBS患者的疗效

目的 探讨酪酸梭菌活菌片联合马来酸曲美布汀、谷维素对肠易激综合征患者的临床疗效。方法 选择80例肠易激综合征患者,随机分为治疗组（n=40）和对照组（n=40）。治疗组患者采用酪酸梭菌活菌片联合马来酸曲美布汀、谷维素进行治疗,对照组患者采用马来酸曲美布汀和谷维素进行治疗。结果 治疗组患者有效率高于对照组,两组疗效比较差异有统计学意义（P<0.05）。结论 酪酸梭菌活菌片联合马来酸曲美布汀、谷维素对肠易激综合征患者疗效显著。     

奶犊牛直肠主要正常菌群的检测及其定植规律

采用稀释滴种法,对奶犊牛直肠内容物8种主要正常菌群（双歧杆菌、乳杆菌、真杆菌、类杆菌、大肠杆菌、消化球菌、梭菌、肠球菌）进行定性和定量分析,将所得结果进行统计学处理,得到奶犊牛直肠八种主要正常菌群的对数均值。犊牛出生6h后可检测到大肠菌、类杆菌和梭菌;12h后,8种菌群全部检测出来,并以大肠杆菌、类杆菌和梭菌为优势菌。随着厌氧菌大量增殖,需氧菌和兼性厌菌逐渐下降,1周后形成以乳杆菌、双歧杆菌为优势菌群的微生态区系。8种细菌的数量随饲草采食量增加呈下降趋势。断奶后1个月完成定植,此时直肠的优势菌是双枝杆菌、真杆菌,为7－8（logCFU/g),然后依次为乳杆菌、梭菌7(logCFU/g),类杆菌、大肠杆菌、消化球菌6(logCFU/g) ,肠球菌5（logCFU/g)。     

产气荚膜梭菌促进黑腹果蝇的生长和发育

【目的】黑腹果蝇Drosophila melanogaster肠道中栖生着众多微生物,通过分离和研究其内共生菌,以研究肠道菌群的多态性和作用。【方法】利用Hungate滚管技术从黑腹果蝇成虫肠道分离厌氧细菌;通过记录果蝇的发育历期和生长速率,检测该细菌对果蝇发育和生长的影响。【结果】首次从黑腹果蝇肠道内分离到一株产气荚膜梭菌Clostridium perfringens。该菌能够有效地定植到果蝇肠道内,是果蝇肠道共生菌。产气荚膜梭菌显著地缩短无菌果蝇的发育历期,将无菌果蝇成蛹天数由20 d缩短到8.1 d,羽化天数由30 d缩短到12.7 d。该菌还可以提高果蝇生长速率。【结论】本研究揭示了产气荚膜梭菌是果蝇的内共生菌,可以通过提高生长速率而有效地促进果蝇的生长和发育。     

不同地理纬度笼养狼肠道菌群多样性比较研究

动物肠道菌群关系其健康状态,而菌群组成受到生活环境等因素的影响,探究其中关系有利于更好地进行物种保护。本研究基于非损伤性取样,利用16S rDNA高通量测序技术,开展不同地理纬度笼养国家二级重点保护野生动物狼（Canis lupus）的肠道菌群结构比较和初步功能预测。针对取自天津市动物园（38°88′N）和南京市红山森林动物园（31°14′N）两地饲养的狼粪便样本（分别简称为天津样本和南京样本）进行高通量测序,利用生物信息学比较分析两组样本的微生物组成和多样性差异。结果表明：Student’s t和Welch’s t检验显示南京样本的α多样性显著高于天津样本。在门水平上,厚壁菌门（Firmicutes）和放线菌门（Actinobacteria）是两组样本中的优势菌门,天津样本中弯曲杆菌门（Campilobacterota）的丰度显著高于南京样本。在属水平上,两组样本的肠道菌群中优势菌属均包括艰难梭菌属（Peptoclostridium）、柯林斯菌属（Collinsella）和狭义梭菌属（Clostridium＿sensu＿stricto＿1）。基于Unweighted UniFrac距...     

艰难梭菌及其致病力

艰难梭菌(Clostridium difficile)被发现于1935年,命名为艰难芽孢杆菌(Bacillus difficilis)。1938年由Prevot根据其厌氧性质,将其划入梭菌属,改为现名。发现该菌时就发现它能产生毒素,引起实验动物死亡,但长期未引起重视。     

兼性厌氧复合菌群H纤维素降解和产乙醇能力及生态组成初探

通过限制性培养条件和连续继代培养,筛选获得了一组具有高效稳定降解纤维素能力的复合菌群H。该菌群在传代30代以上仍能保持各项性状稳定,其工作pH为6～9,3 d可以完全降解置于100 mL PCS缓冲液培养基中的滤纸,发酵液中能够检出1.54 g/L乙醇。通过16S rDNA扩增和DGGE的方法,对菌群在不同阶段的微生物组成进行了研究,确定了琥珀酸嗜热梭菌Clostridium thermo succinogene、产气荚膜梭菌Clostridium straminisolvens和紫色板蓝根梭菌Clostridium isatidis等多种可直接实现纤维素到乙醇转化的菌株。菌群通过菌种之间的协同作用,共同维持了体系的稳定及降解能力的稳定。明确菌系的组成,对于进一步研究菌群降解机理、优化菌群和提高乙醇产率意义重大。     

典型产纤维小体梭菌的遗传改造及其在纤维素乙醇中的应用研究进展简

以解纤维梭菌（ Clostridium cellulolyticum）和热纤梭菌（ Clostridium thermocellum）为代表的产纤维小体梭菌可以直接完成从木质纤维素原料到乙醇的生物转化,是用于通过整合生物加工技术生产纤维素乙醇的优良候选菌株。然而,这些产纤维小体梭菌的纤维素降解效率及乙醇产量尚不能满足工业化生产的要求,其遗传改造技术的不成熟严重制约了通过定向代谢工程改造提高生产性能的进程。针对这些典型的产纤维小体菌株,各国科学家近年来在基于二类内含子的嗜中温及嗜高温遗传改造平台建立方面取得了较大突破,并通过靶向代谢工程改造,显著提高纤维素乙醇的产量。笔者对这些前期研究工作以及国内外相关研究成果进行系统的总结,并对构建的遗传改造工具的应用前景进行展望。     

酪酸梭菌活菌散联合葡萄糖酸锌治疗儿童急性腹泻的疗效观察

目的探讨酪酸梭菌活菌散联合葡萄糖酸锌治疗儿童急性腹泻的疗效。方法选取急性腹泻患儿76例,随机分为观察组和对照组各38例。两组患儿均予以调整饮食、口服或静脉补液和纠正水电解质酸碱失衡紊乱等常规治疗。观察组患儿予以酪酸梭菌活菌散和葡萄糖酸锌联合治疗,对照组患儿予以单纯酪酸梭菌活菌散治疗。观察两组患儿治疗后主要症状和体征改善的时间,并比较其临床疗效及治疗后3个月内腹泻的复发率。结果观察组患儿治疗后的止泻、呕吐、腹痛和粪常规等恢复正常时间均明显短于对照组（P〈0.05）;同时治疗3 d后,观察组患儿临床总有效率为94.74%,明显高于对照组的78.95%（χ2=4.15,P〈0.05）。两组患儿治疗后随访3个月,其中观察组和对照组分别腹泻复发5例（13.16%）和13例（34.21%）,观察组腹泻的复发率明显低于对照组（χ2=4.66,P〈0.05）。结论酪酸梭菌活菌散联合葡萄糖酸锌治疗儿童急性腹泻的疗效较肯定,能明显改善患儿腹泻症状,缩短腹泻病程,并能减少腹泻的复发。     

圈养大熊猫粪便中微生物多样性的研究

本试验采集了5只圈养成年大熊猫的新鲜粪便,用高通量测序技术,研究了大熊猫粪便中细菌和古菌的结构和组成。试验结果表明:圈养成年大熊猫粪便细菌主要由变形菌门Proteobacteria(74.45%)、厚壁菌门Firmicutes(15.66%)、拟杆菌门Bacteroidetes(4.34%)、蓝藻门Cyanophyta/色球藻纲Chroococcophyceae(4.01%)等组成,其中变形菌门主要以埃希氏杆菌属Esherichia/志贺氏菌属Shigella(49.84%)为主;厚壁菌门主要以梭菌属Clostridium(4.65%)为主;拟杆菌门主要以稳杆菌属Empedobacter(3.51%)为主;蓝藻门全部为未分类的色球藻纲(4.01%)。古菌主要由泉古菌门Crenarchaeota(55.99%)和广古菌门Euryarchaeota(42.33%)组成,其中优势古菌是热变形菌纲Thermoprotei(55.99%)中未分类的属和产甲烷菌属Methanogenium(24.70%)。     

信息库

1.营养对热嗜酸梭菌生产醋酸的影 响 用热嗜酸梭菌（Clostridium thermoaceticum）生产醋酸比传统醋酸法有很多好处。首先,热嗜酸梭菌生产醋酸是一种厌氧过程,应该比传统的需氧酿醋法便宜。其次,它至少可以利用生物原料衍生的三种糖（木糖,果糖和葡萄糖）,并且醋酸的产量较高。理论上每克葡萄糖产醋酸一克,实际报道的产量是0.8—0.93克。热嗜酸梭菌是一种同型乙酸产生菌,可以醋酸为其唯一产物。它的主要限制是野生型菌株产酸浓度较低（～20g/l）,产率也较低（0.15—0.25g/l/h）。本实验室最近培育的菌株（ATCC 49707）产醋酸量比亲本（野生型）菌株高5倍;但是,这个菌株和其他高产菌株一样,培养和产醋要求的营养条件较高。用它来生产醋酸钠（一种酸化剂）,醋酸钾(一种热交换液）,和醋酸钙镁（CMA,一种道路化冰剂）等的成本价（例如每公斤葡萄糖＄0.16,每公斤酵母提取物的最低价＄8.5;