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染色质结构与基因表达调控 总被引:1,自引:0,他引:1
ChromatinStructureandGeneExpresionHUJian-GuangYANGJin-Shui(InstituteofGenetics,FudanUniversity,Shanghai200433)真核细胞中DNA与蛋白质结合形... 相似文献
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目的:研究人β神经生长因子(β-NGF)基因中稀有密码子及其mRNA二级结构对其在大肠杆菌中表达量的影响。方法:根据对人β-ngf中稀有密码子及其mRNA二级结构的研究,同义突变人β-ngf基因,通过PCR得到人β-ngf的5’端同义突变基因rh-β-ngfp32和全同义突变基因rh-β-ngfmu,将这2个序列克隆入载体pET3a中,得到重组质粒pET3a-ngfp32和pET3a-ngfmu,分别转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态,IPTG诱导表达,收集菌体,SDS-PAGE检测其表达量的改变。结果:构建的pET3a-ngfp32和pET3a-ngfmu表达载体酶切和测序结果正确,SDS-PAGE结果显示,与在重组菌pET3a-NGF总蛋白中的表达量相比,目的蛋白rh-β-NGF在重组菌pET3a-NGFP32和pET3a-NGFmu中的表达量均明显增高,并且在重组菌pET3a-NGFmu中的表达量高于重组菌pET3a-NGFP32。结论:目的蛋白rh-β-NGF在重组菌pET3a-NGFP32和pET3a-NGFmu中表达量的增高,说明人β-ngf基因中稀有密码子和mRNA的二级结构对其在大肠杆菌中的表达有较为明显的影响,结果为构建rh-β-NGF的大肠杆菌工程菌株奠定了基础。 相似文献
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大肠杆菌中外源基因表达的研究进展 总被引:10,自引:0,他引:10
工程技术已使许多生物活性蛋白基因在大肠杆菌中中得到表达,但不同外基因表达效率并异很大,本文综述了影响外源基因表达的一些因素,以便采取有效方法提高外源基因在大肠杆菌中的表达效率。 相似文献
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RNA分子众多、结构复杂、功能重要,已经成为当前重要的研究热点之一。RNA的功能与结构密切相关,伴随RNA分子及功能的发现,建立了有关RNA二级结构的数据库,一方面有助于理解RNA功能的结构基础,一方面有助于开发各种有关RNA结构的预测模型。本文对近年常见的RNA二级结构数据库作一概述,希望有助于相关工作者更好地了解与应用相关数据。 相似文献
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自七十年代基因工程建立以来,对基因的分离、导入及其在受体中的表达等方面进行了大量的研究,也取得了可喜的成果.本文把能表达产物并可检测的外源基因重组质粒导入大肠杆菌不同受体菌株中,观察了不同受体对外源基因表达的影响.发现同一基因在不同的大肠杆菌受体中的表达量有很大差异,这说明不同受体对外源基因表达的影响是不同的。 相似文献
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牛凝乳酶原基因在大肠杆菌中表达调控的研究 总被引:4,自引:0,他引:4
Shine-Dalgarno序列与起始密码子之问的距离与组成对凝乳酶原基因表达有明显的影响,可导致其表达水平有15倍之差。SD序列至ATG之间为15bp不利于表达,表达质粒中sD-ATG在7-11bp之间都有可能获得高效表达;但决定因素不是简单的长度,而是RBS附近可能的二级结构即△G的大小、SD序列及ATG中参与配对的碱基数目。将pTLC23中凝乳酶原cDNA3'端端非翻译区插入终止密码子TGA与转录终止子rrnBT1T2之间适当位置可提高凝乳酶原基因的表达,这可能是因为这段序列能形成由53个碱基对和8个碱基组成的稳定的mRNA二级结构,起到转录终止子的作用,而一般认为串联终止子对终止转录更为有效。 相似文献
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RNA二级结构预测系统构建 总被引:9,自引:0,他引:9
运用下列RNA二级结构预测算法:碱基最大配对方法、Zuker极小化自由能方法、螺旋区最优堆积、螺旋区随机堆积和所有可能组合方法与基于一级螺旋区的RNA二级结构绘图技术, 构建了RNA二级结构预测系统Rnafold. 另外, 通过随机选取20个tRNA序列, 从自由能和三叶草结构两个方面比较了前4种二级结构预测算法, 并运用t检验方法分析了自由能的统计学差别. 从三叶草结构来看, 以随机堆积方法最好, 其次是螺旋区最优堆积方法和Zuker算法, 以碱基最大配对方法最差. 最后, 分析了两种极小化自由能方法之间的差别. 相似文献
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施凯文李伍举刘涛 《中国生物化学与分子生物学报》2017,(8):768-773
RNA分子众多、结构复杂、功能重要,已经成为当前重要的研究热点之一。RNA的功能与结构密切相关,伴随RNA分子及功能的发现,建立了有关RNA二级结构的数据库,一方面有助于理解RNA功能的结构基础,一方面有助于开发各种有关RNA结构的预测模型。本文对近年常见的RNA二级结构数据库作一概述,希望有助于相关工作者更好地了解与应用相关数据。 相似文献
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对68个外显子-内含子-外显子序列片段以及相应的外显子-外显子序列片段的二级结构进行分析后发现,内含子5‘端和3’端的碱基G(剪拉位点)中大约90%们一级结构的环区或是茎区的端部并靠近环,贿位于环区的G也多靠近环的基部;92%的外显子拼接位点也有类似性质,约82%的分枝点A位于环区或环与茎的连接部位,折叠结构的形成使剪接位点和分枝点在空间上彼此靠近。 相似文献
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RNA二级结构的最小自由能算法 总被引:1,自引:0,他引:1
RNA(即tRNA,rRNA,mRNA和SnRNA)有两大主要功能:一是某些病毒的遗传物质;二是参与蛋白质的合成,这些与细胞分化、代谢、记忆的储存等有重要关系,这些功能与RNA二级结构的稳定性。自由能密切相关.常用的计算自由能的方法有热力学微扰法及热力学微积分法等.本文以寻找最小自由能二级结构为目的,给出了RNA二级结构的最小自由能算法,该算法的时间复杂性不超过O(n^4)。 相似文献
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真核生物细胞核内有类似于细胞区室(compartment)的亚结构,称为核区室(nuclear compartment)。核区室主要分为两类;染色体域(CT)和染色质间区室(IC)。核仁也是一种经典的核区室。CT和IC相互联系,相互作用,在细胞核呈现区室化的核结构,对基因表达进行高层次的调控。 相似文献
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大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系 总被引:1,自引:0,他引:1
从GenBank获得大肠杆菌K-12MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱。另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析。 相似文献
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影响大肠杆菌中外源基因表达的因素 总被引:40,自引:1,他引:40
大肠杆菌已经被广泛地应用于表达各种外源基因,但是,不同的外源基因在表达效率上却有很大的差异,文章综述了影响大肠杆菌中外源基因表达的因素,这将有助于认识大肠杆菌中外源基因表达的规律,以便采取有效的方法提高外源基因在大肠杆菌中的表达效率. 相似文献
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