Sir2基因与端粒沉默的研究进展

转录沉默是基因表达调控的重要方式,它对于保持细胞的不同分化状态和维持染色质的稳定性至关重要。沉默信息调节因子2（silent information regulator 2,Sir2）参与酵母交配型基因沉默（silent mating type）、端粒区基因沉默以及核糖体DNA（rDNA）沉默。端粒区的基因沉默可能是酵母衰老过程中的机制之一,处于沉默状态的染色质中的许多基因无转录活性,可能由此影响酵母生长。     

染色体外DNA在酵母细胞衰老中的作用

细胞衰老的影响因素甚多,机制复杂。近年来已发现酵母染色体外ＤＮＡ在细胞衰老中具有重要作用,并认为细胞的衰老受控于一种特定的染色体外ＤＮＡ复制的次数,具有精确的时间控制机制［１、２］。１．染色体外ＤＮＡ与衰老的关系酵母染色体外存在大小不等的ｒＤＮＡ环,称为染色体外ｒＤＮＡ环（ｅｘｔｒａｃｈｒｏｍｏ－ｓｏｍａｌｒＤＮＡｃｉｒｃｌｅ,ＥＲＣ）。已发现衰老的酵母细胞中含有丰富的ＥＲＣ,而年轻酵母细胞中的ＥＲＣ则很少。芽殖酵母中含有人类Ｗｅｒｎｅｒ氏综合征（一种早老症）ＷＲＮ基因的同源序列——ＳＧＳ１基因…     

酵母pac—1基因的克隆、序列分析和在大肠杆菌中的高效表达及活性测定

粟酒裂殖酵母菌 (Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｍｙｃｅｓｐｏｍｂｅ)的 ｐａｃ 1基因于 1991年Ｙｕｉｃｈｉｌｉｎｏ等首次报道。在温度敏感型的酵母突变体中 ,ｐａｃ 1基因是一个多拷贝阻遏子 ,它使酵母在限制温度培养条件下的减数分裂不受调控 ,对酵母的生长过程起着重要的调节作用。该基因有一个编码 36 4个氨基酸的开放阅读框 ,编码产物的羧基端与大肠杆菌核糖核酸酶Ⅲ有2 5 %的同源性。通过酶活性测定 ,已经确定它是一类依赖ｄｓＲＮＡ的核糖核酸酶 ,具有降解ｄｓＲＮＡ的功能[1,2 ] 。由于大多数植物病毒为ＲＮＡ病毒 ,因此无论它的基…     

一个新的白血病相关基因LRP16全长cDNA的克隆、序列分析及表达特征

 克隆一个与白血病复发相关基因 (LRP1 6)的全长 c DNA序列 ,对其进行染色体定位、组织表达谱分析 ,并对该基因编码蛋白质进行原核表达 .首先用获得的一段 3kb DNA片段在 NCBI提供的 h ESTs数据库中进行电子杂交并对重叠克隆片段组装 ,再设计引物进行 c DNA末端快速扩增(RACE技术 ) .采用 Northern印迹方法进行组织表达分析 .以高通量基因组序列 (HTGS)数据库为基础进行染色体定位 .对构建的克隆菌用 IPTG诱导重组蛋白表达后进行 SDS- PAGE,同时对重组体测序确证 .钓取了该基因全长 c DNA、推导所编码的氨基酸序列 ,并将该基因定位于染色体1 1 q1 2 .2 .原核表达筛选获得了该基因重组子的一个缺失体 .对 LRP1 6基因全长 c DNA的序列分析提示 ,该基因可能编码两种 N端不同的蛋白质 ,且该基因的转录本可能存在一种丰度较低的剪接体 .     

SOX9基因与性别决定的关系

1 .性别决定简介[1～ 5 ]哺乳动物包括人类的性别决定问题一直是科学史上的一个难解之谜。科学家们经过异常艰苦的研究才逐步揭开性别决定的神秘面纱。位于男性Ｙ染色体上的ＳＲＹ(ｓｅｘｄｅ ｔｅｒｍｉｎｇｒｅｇｉｏｎｏｆＹｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ)基因是当前被确定的睾丸决定因子 (ＴＤＦ)的主要侯选基因 ,它是哺乳动物中睾丸发育的主要诱导者。ＳＲＹ基因编码的蛋白质含有与ＤＮＡ结合的模体 ,称为ＨＭＧ盒 (与高速泳动类蛋白质相关的一种模体 )。ＨＭＧ盒存在于很多转录因子中。ＳＲＹ蛋白的ＨＭＧ盒与特定的ＤＮＡ序列结合 ,表明它在…     

人类1号、X、Y染色体基因密码子偏好性研究

随着人类基因组计划测序工作的完成,进一步数据挖掘工作已成为新的研究热点。根据人类1号、X、Y染色体数据,通过自编的Perl程序,提取3条染色体基因的CDS序列,利用密码子偏好性的理论及生物信息学方法分析其碱基组成特点和密码子使用模式,确定了偏好密码子和最优密码子,探讨影响其密码子用法的主要因素。结果表明:1)人类1号、X、Y染色体基因偏好使用以G或C结尾的密码子;2)密码子的使用受基因长度的影响,较长的基因具有较高的表达水平和密码子使用偏性;3)基因表达水平对人类1号、X、Y染色体基因的密码子使用没有影响,暗示了这3条染色体并未承受翻译选择的压力;4)人类1号、X、Y染色体基因共有32个偏好性密码子,其中编码Arg的AGG和AGA、编码Val的GTG、编码Leu的CTG、终止密码子TAG为最优密码子。     

水稻NBS-LRR类R基因同源序列

根据多数抗病基因(R)编码蛋白质的核苷酸结合区(nucleotide binding site, NBS)和富含亮氨酸重复(leucine-rich repeat,LRR)保守区域特点,设计PCR特异扩增引物,从水稻中克隆了大小约为520 bpDNA片段23个.通过序列同源比较分析发现, 它们编码的蛋白质氨基酸序列包括有NBS-LRR类基因所具有的kinase-1a,kinase-2a, kinase-3a和保守的domain 2区域,它们属于R基因同源序列(R gene homologous sequence, 简称RS).聚类结果发现它们分为4类.遗传定位结果表明它们分布在1,3,4,7~11染色体上,其中10个RS位于已知R基因所在的染色体区间.用水稻抗白叶枯病基因Xa4的近等基因系和基因累加系对克隆的NBS-LRR同源序列进行RFLP分析,发现序列RS13可能来自Xa4基因家族.     

人Era不同结构域在酵母双杂交系统中的表达及对报告基因激活作用的检测

ｅｒａ基因是 1986年在测定大肠杆菌基因组序列时发现的一个开放读框 .由于其编码的氨基酸序列与人及酵母的ＲＡＳ蛋白有部分相似之处 ,命名为Ｅ .ｃｏｌｉＲＡＳ ｌｉｋｅ(ｅｒａ)基因[1] .ｅｒａ基因广泛存在于原核生物中 ,与细胞周期和细胞分裂有关 ,是细菌生存繁殖所必需的重要基因[2 ] .在真核生物如蠕虫、小鼠和人的组织中都发现有与细菌ｅｒａ高度同源基因存在[3 ,4 ] .人ｅｒａ基因 (ｈｅｒａ)的全长ｃＤＮＡ于 1998年被克隆 ,与原核ｅｒａ基因具有很高的同源性[5] .人Ｅｒａ蛋白与大肠杆菌Ｅｒａ蛋白的氨基酸序列有 30 %相同 ,两者…     

转座子衍生基因的演变途径及对生物生长发育的影响

转座子(transposable elements,TEs)是指在基因组上能从同一条染色体的一个位置转移到另一个位置或者从一条染色体转移到另一条染色体上的一段DNA序列。广泛存在于基因组中的转座子通过复制、动员、重组基因片段以及修改原基因结构形成的新基因,被称为转座子衍生基因。该文综述了转座子衍生基因与转座子和常规基因的异同以及转座子衍生基因的演变途径,归纳了转座子衍生基因对宿主基因进化,以及对生物生长发育的影响。     

帕金森病的致病基因

在帕金森病 (ＰＤ)病人中 ,遗传因素起着重要作用 ,尤其是家族性ＰＤ病人 ,以常染色体显性方式遗传。Ｐｏｌｙｍｅｒｏｐｏｕｌｏｓ等[1] 1 996年在一个意大利人的家族性ＰＤ家系中将ＰＤ的致病基因定位于第 4号染色体的 4ｑ2 1 ｑ2 3区间 ,1 997年他们就确定其致病基因是由于α ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ的基因在第 4号外显子的一个错义点突变所致。它使其编码的第 5 3位氨基酸由Ａｌａ置换Ｔｈｒ,同时这一发现也在 3个希腊人的家族性ＰＤ病人得到证实。α ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ是由 1 40个氨基酸残基组成的疏水性蛋白质 ,广泛存在于多种膜结构 ,…