肾透明细胞癌低氧相关基因预后模型的建立与应用

[目的]低氧是肾透明细胞癌内肿瘤微环境的重要组成部分,在肿瘤的发生与发展中起着至关重要的作用.利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库建立低氧相关基因模型.[方法]提取低氧相关基因的表达进行单因素和多因素Cox回归分析建立模型.分析模型与临床分期以及免疫细胞浸润的相关性.[结果]构建5个低氧相关基因模型(ISG20、PLI...     

泛肽系统的组成和功能(一) 一 系统组成 底物识别与蛋白质泛肽化

泛肽(Ubiquitin 简称Ub)是一个由76个氨基酸残基组成的非常保守的小蛋白质。泛肽依赖性的蛋白质降解途径(Ubiquitin-dependebt proteiytic pathway)是目前已知的最重要的、有高度选择性的蛋白质降解途径。泛肽系统由Ub、Ub活比酶、Ub结合酶、Ub-蛋白质连接酶、Ub-C末端水解酶和26S蛋白酶体组成。本文详细地介绍了泛肽系统各个组成部分的种类、结构与功能,蛋白质泛肽化及其降解机制和底物识别模式。     

泛肽系统的组成和功能(一)—系统组成、底物识别与蛋白质泛肽化

泛肽（Ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ,简称Ｕｂ）是一个由７６个氨基酸残基组成的非常保守的小蛋白质。泛肽依赖性的蛋白质降解途径（Ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ＿ｄｅｐｅｎｄｅｎｔｐｒｏｔｅｏｌｙｔｉｃｐａｔｈｗａｙ）是目前已知的最重要的、有高度选择性的蛋白质降解途径。泛肽系统由Ｕｂ、Ｕｂ活化酶、Ｕｂ结合酶、Ｕｂ＿蛋白质连接酶、Ｕｂ＿Ｃ末端水解酶和２６Ｓ蛋白酶体组成。本文详细地介绍了泛肽系统各个组成部分的种类、结构与功能,蛋白质泛肽化及其降解机制和底物识别模式。     

基于生物信息学方法分析EGLN1在肾透明细胞癌中的表达及意义

为探究egl-9家族缺氧诱导因子1(EGLN1)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达情况及临床意义,基于TCGA数据库中ccRCC患者的基因表达数据分析EGLN1在ccRCC组织和正常肾组织中的差异表达情况,应用UALCAN平台分析ccRCC中EGLN1在不同角度下的表达差异.基于TCGA数据库中ccRCC的临床数据,...     

中国石龙子一新纪录属和一新纪录种

记述了采自新疆西北部的察布查尔县的沙地泛蜥Ablepharus deserti Strauch,1868,是在中国的首次记录,同时泛蜥属Ablepharus Fitzinger,1823也是我国的新纪录属.该种与原记录分布在我国伊宁市的阿赖山裂睑蜥的主要区别是:1)环体中段背鳞少于22枚;2)成体背部一色或具暗色纵纹.标本收藏在新疆农业大学动物标本馆.     

异常激活的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶通过上调周期蛋白D1表达促进肾透明细胞癌增殖

葡萄糖6-磷酸脱氢酶（glucose 6-phosphate dehydrogenase,G6PD）为磷酸戊糖途径的调节酶。研究表明,G6PD与多种恶性肿瘤的发生密切相关。然而,G6PD在肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma, ccRCC）中的功能及其作用机制却鲜有报道。本研究通过TCGA数据分析发现,G6PD在肾透明细胞癌TNM Ⅲ/Ⅳ期mRNA表达水平显著升高,与患者的性别、原发肿瘤直径、淋巴结转移、远端转移、病灶一侧的偏重性、病理分级以及TNM临床分期密切相关。并且,G6PD异常激活有可能成为评价肾透明细胞癌患者不良预后的分子。细胞系检测结果提示,与对照293T细胞及恶性程度较低的786-O细胞相比,恶性程度较高的Caki-1细胞中的G6PD表达及活性明显增加。基因稳定转染结合CCK8分析结果显示,G6PD过表达或异常激活可显著提高293T及786-O细胞的增殖能力,并且促进786-O细胞中周期蛋白D1基因表达上调。综上,本研究通过TCGA数据库分析和稳定细胞系检测及CCK8分析,结果显示,G6PD在肾透明细胞癌中异常激活,并可上调细胞周期蛋白D1表达,进而促进肿瘤细胞增殖。该研究为进一步揭示肾透明细胞癌分子发病机制以及开发有效的靶向治疗方案提供了借鉴。     

宝兴泛树蛙和昭觉泛树蛙的染色体学研究,兼论两种的分类现状

本文选择宝兴泛树蛙模式标本产地四川宝兴居群（背部有斑点和无斑点两种类型）、大瓦山居群、瓦屋山居群,也选择了被命名为昭觉泛树蛙的模式标本产地四川昭觉的居群,共两种泛树蛙4个居群的5类52号标本,进行染色体组型、次缢痕及Ag-NORs研究。本文结果主要有三：1、首次报道宝兴泛树蛙地模标本的染色体组型,且证明背部有斑点与无斑点个体在染色体学方面没有显著区别;因此将过去文献上对宝兴泛树蛙色斑的描述作了补充。2、对昭觉泛树蛙昭觉居群的研究,证实吴贯夫与曾晓茂（1994）关于昭觉居群是与宝兴泛树蛙形态虽然相似,但染色体特征之间有极显著差别的另一个种,但按照“优先权律”,本文正式恢复刘承钊根据昭觉燕窝塘标本命名的胡氏泛村蛙学名的有效性,同时将吴与曾命名的昭觉泛树蛙学名作为前者的次定同物异名。3、本文所研究的宝兴泛树蛙属于广泛分布的种,建议有必要补充其它居群（如四川巴塘居群）的染色体学资料,再作进一步的分析是否尚有隐存种（或亲缘种）的存在。     

泛醌结合蛋白（QPs）羧基的化学修饰与重组活性

研究了羧基修饰剂ＤＣＣＤ对泛醌结合蛋白ＱＰｓ重组活力的影响;用０．１％ＴｒｉｔｏｎＸ－１００增溶ＱＰｓ后,用２５０ｍｏｌ／ｍｏｌＱＰｓ的ＤＣＣＤ于室温处理５ｍｉｎ,处理后的ＱＰｓ丧失约５０％与琥珀酸脱氢酶的重组活力。先将ＱＰｓ与琥珀酸脱氢酶重组再用ＤＣＣＤ处理没有发现重组的琥珀酸泛醌还原酶活性的降低。此结果说明ＱＰｓ中存在重组活性必需的羧基。     

"基因"一词的由来

1909年,约翰森创造"基因"(gene)一词作为遗传单位的名称.该词是由德弗里斯创造的"泛生子"(pangene)一词缩短而成的,而"泛生子"一词则衍生于达尔文提出的"泛生论"(theory of pangenesis).约翰森的这一创造堪称"推陈出新"的典范.     

沙门氏菌泛耐药基因组特征分析

【目的】分析沙门氏菌的泛耐药基因组特征。【方法】以EnteroBase数据库中16365株沙门氏菌为对象,利用课题组自主研发的泛耐药基因组分析软件(PRAP),进行泛耐药基因组结构的鉴定,通过曼-惠特尼秩和检验和皮尔逊检验,来分析耐药基因与血清型、序列型(sequence type,ST)及分离株样本来源信息间的相关性。【结果】沙门氏菌共有104种耐药基因,其中核心耐药基因18种,附属耐药基因86种,且沙门氏菌拥有一个开放型的泛耐药基因组;相同的血清型(或ST型)有相似的耐药基因谱,不同血清型(或ST型)间耐药基因的分布差异显著(P0.05),耐药基因与样本来源、分离国家及年份间也存在一定的相关性;在测试的23种获得性耐药基因中,43.48%(10/23)的占比逐年升高,73.91%(17/23)以单一亚型为优势。【结论】利用PRAP软件分析获得的这些结果揭示了近年来沙门氏菌耐药基因的时空分布规律,为沙门氏菌等食源性致病菌耐药性的研究提供了新思路。     

Roles of F-box proteins in plant hormone responses

The F-box protein is an important component of the E3 ubiquitin ligase Skpl-Cullin-F-box protein complex. It binds specific substrates for ubiquitin-mediated proteolysis. The F-box proteins contain a signature F-box motif at their amino-terminus and some protein-protein interaction motifs at their carboxyterminus, such as Trp-Asp repeats or leucine rich repeats. Many F-box proteins have been identified to be involved in plant hormone response as receptors or important medial components. These breakthrough findings shed light on our current understanding of the structure and function of the various F-box proteins, their related plant hormone signaling pathways, and their roles in regulating plant development.     

蛋白酶体的结构与功能

蛋白酶体又称26S蛋白酶体,由催化颗粒（CP）和调节颗粒（RP）构成。CP含α亚基和β亚基各7个,且各自成环,组成圆桶样结构。其中α环位于圆桶两端,β环位于中间。RP分为三倍体ATP酶亚基（Rpt)和非ATP酶亚基（Rpn)。基高级结构分为盖部和基底部。基底部位于CP的两端,由6个Rpt和Rpn组成。盖部由其他Rpn构成,位于基底部外侧。蛋白酶体具有蛋白水解酶活性,Rpt水解ATP供能。蛋白酶体水解作用需要泛蛋白参加,位于盖部的Rpn10是其受体。部分RP还具有与蛋白质水解无关的其他作用,如参与DNA修复工作等。蛋白酶体经不同的加工可以转变为免疫蛋白酶体,橄榄球蛋白酶体和杂化蛋白酶体,各有其重要的生理功能。     

湖北省无尾两栖类的新纪录

１９９０年５－６月，作者在湖北省通山县九宫山地区采得一批无尾两栖类标本。经研究鉴定，其中的大泛树蛙和三港雨蛙，为湖北省无尾两栖类的新纪录。     

酵母菌分类中泛醌类型的一种快速简便的鉴定方法

泛醌类化合物(简称UQ)是生物体内的一类非极性化合物,在电子传递及氧化磷酸化中起重要作用。近年来,已普遍将它作为酵母化学分类的一种指标。泛醌作为分类指征的基础在于其异戊烯基侧链单元的长度。存在于酵母细胞中的泛醌类型通常为UQ_6、UQ_7、UQ_8、UQ_9、UQ_(10)。目前,对酵母菌泛醌类型的确定     

呼吸链酶系结构与功能

简单综述了近年来对呼吸链酶系的研究.介绍了筛选的泛醌反应抑制剂的性质及其在醌催化机制研究中的应用,以及酶与酶之间和脂与酶之间的相互关系,及其在电子传递功能中的作用.     

人基因组的STS图谱分析

人基因组分析是现代生物学研究的前沿之一,其目标是分析人基因组3×10~9bp的全核苷酸序列,识别所有基因的位置和功能,基因组分析的第一步是要进行物理图谱分析,然后才能分段进行序列分析,最后将全部序列连成人基因组的全序列。由于人基因组之巨大,传统的图谱分析如cosmid,由于其克隆容量只有40Kb;而经典的分析方法如遗传连锁(geneticlinkage)分析的分辩力太低(1cM,相当于1Mb,megabase,百万碱基对),不宜于作为人基因组分析的第一克隆工具。1987年,美国华盛顿大学的M.Olson小组首次在成功地将长达数百Kb的人染色体片段以YAC(Yeast Artificial Chromosome)形式克隆到酵母细胞中,     

对中药指纹图谱研究现状及应用的思考

从中药指纹图谱的分析测试方法、标准指纹图谱的建立、指纹图谱的分析和应用几个方面对中药指纹图谱的研究现状及其应用进行了综述。提出了目前存在的问题与改进方向。