Etude par spectroscopie infrarouge de la transformation hélice–chaîne statistique des polypeptides. II. Etude de l'interaction de quelques polypeptides à chaînes latérales polaires avec l'acide trifluoracétique

The various polymer–acid solvation possibilities occuring in the helix–coil transition process of polypeptides with polar side chains were systematically analyzed by infrared spectroscopy. The following samples have been considered: poly-γ-benzyl-L -glutamate (PBLG), alternating poly-γ-benzyl-D ,L -glutamate (PBD-LG), and poly-β-benzyl-L -as-partate (PBLA). The behavior of the amide A, I, II, and νC?O ester absorptions of each polymer dissolved in trifluoroacetic acid–chloroform mixtures was studied in depth. The classical assumptions concerning the interaction between a polypeptide and a proton donor solvent are discussed. This interaction was previously proposed in a theoretical model of helix–coil transition. For PBLG, the spectral characteristics of the cooperative transition are evidenced by the amide bands. These bands also show main chain–acid hydrogen bonding (I) Quantitative analysis of phenomenon (I) was performed in order to localize the “binding sites” of the polymer. In agreement with the theory, only the complexation of peptide units belonging to random coil and terminal helical regions were observed. However, in contrast to the theory in which the association constants KCO and KNH of these residues are generally kept equal, the present results have shown that the main binding site is the carbonyl group (KNH ? 0 or « KCO ). The behavior of the polar side chains of these polypeptides were analyzed during the transition. Similarly to the peptide backbone, they bind the acid by hydrogen bonding (II) Furthermore, this association is more important when the side chains are localized in the coiled regions than in the helical ones. This result suggests, by analogy with the main chain behavior, that the helix–coil transition theory should take into account two more association constants for polar side chains, namely k₁ for the helical regions and k₂ > k₁ for the coiled ones.     

Étude polarographique de la mobilisation du fer de la ferritine

Polarographic study of the mobilization of ferritin ironPolarographic study allows to propose a model for mobilization of ferritin iron: an equilibrium exists between iron core and small quantities of iron outside the protein.These iron atoms would be lying on electron acceptor sites including SH groups. The number of sites is dependent on iron content of ferritin.Therefore, the iron could be removed by the action of reducing agents such as xanthine oxidase or ascorbic acid, and then chelated by a complexing agent.     

Étude de l'interaction de la thiamine diphosphate avec l'ion magnésium

The action of magnesium ion on the exchange rate of the proton in C₂ of thiamine and thiamine diphosphate is studied at different values of pD. Above pD 5 the ion Mg²⁺ increases this exchange rate. The phenomenon is markedly enhanced for TDP rather than thiamine and increases with pD. Below pD 5 magnesium decreases the exchange rate. This decrease is greater for TDP than for thiamine. The maximum effect is reached at a magnesium concentration of 0.5/1 for thiamine and of 1/1 for TDP.T₁ measurements are made for different pH values with and without magnesium ion. Results seem to prove that an increase in pD values from 3.9 to 5.9 leads to an accentuation of the molecules «folded form. Nevertheless for a given pD value the TDP-Mg complex seems to have a more «folded form than TDP.     

Interaction entre la cochenille du manioc Phenacoccus manihoti et ses différentes plantes-hôtes: étude de la teneur de la sève en acide aminé et en sucre

Résumé L'analyse (acides aminés et sucres) d'extrait de feuille, de 5 variétés de manioc (Manihot esculenta), du Faux caoutchouc (Hybride deM. esculenta x M.glaziovii), du Poinsettia (Euphorbia pulcherrina) et du Talinum (Talinum triangularae), caractérisés par différents degrés de résistance par antibiose à la cochenille du manioc (Phenacoccus manihoti (Mat. Ferr.)) (Homoptera: Pseudococcidae), a été réalisée sur des extraits obtenus par centrifugation du matériel foliaire. Les teneurs en acids aminés, très différentes d'une plante à l'autre, apparaissent aussi importantes entre les variétés de l'espèce manioc qu'entre les différentes espèces végétales avec respectivement un rapport de variation de 4,5 et 5,5. De même, les teneurs en sucres (exprimées en équivalent saccharose), sont très différentes d'une plante à l'autre avec un rapport de variation de 1 à 33 entre les deux extrêmes, si l'on ne considère que l'espèceM. esculenta, il n'est plus que de 3,5.Des différences dans les proportions relatives des acids aminés libres d'extrait de feuille sont observées aussi bien entre les variétés de manioc qu'entre les espèces végétales. Cependant pour toutes les plantes étudiées l'acide glutamique, la glutamine, l'ethanolamine, et l'alanine représentent près de 50% des acides aminés de l'extrait de feuille; l'acide aspertique, l'asparagine et la sérine près de 20% tandis que la tyrosine, la méthionine, l'isoleucine, la leucine et la lysine sont présents en très faibles pourcentages.Le degré de résistance à la cochenille du manioc des différentes plantes-hôtes n'a pu être relié, ni à la teneur de leur extrait de feuille en acides aminés et en sucres, ni à leur composition relative en acides aminés. Il n'a pu être non plus relié au rapport Sucres/Acides aminés Nos résultats suggèrent que des caractéristiques biochimiques autres que celles étudiées dans ce travail interviennent dans les mécanismes de résistance vis-à-vis de la cochenille du manioc.

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Summary The levels of sugars and amino acids were determined in leaf extracts from a number of plants showing different levels of resistance to the cassava mealybug,Phenacoccus manihoti (Homoptera: Pseudococcidae). There were five varieties of cassava (Manihot esculenta), as well as a hybrid obtained by crossingM. esculenta andM. glaziovii, poinsettia (Euphorbia pulcherrina) and talinum (Talinum triangularae). The variability in the total concentration of amino acid concentrations was as great between varieties of cassava as at the species level. In contrast, there was much less variability in the concentration of sugars at the intervarietal that at the interspecies level.While there were both intervarietal and interspecific differences in the amino acid composition, glutamic acid, glutamine, ethanolamine and alanine represented nearly 50% of the total in all plants examined. Aspartic acid, asparagine and serine accounted for approximately 20%, while tyrosine, methionine, isoleucine, leucine and lysine are present at low levels.The different levels of resistance noted in the different plants were not associated with the concentrations of either amino acids or sugars, the ratios of sugar/amino concentrations or the amino acid compositions obtained from leaf extracts. This suggests that other aspects of plant chemistry confer resistance to cassava mealybugs.

     

Analyse,en olfactomètre tabulaire,de l'influence de différents stimulus olfactifs dans la recherche du partenaire sexuel par Zabrotes subfasciatus

Pour rechercher son partenaire sexuel Zabrotes subfasciatus doit utiliser les signaux olfactifs émis soit par les mâles ou par les femelles. Le pouvoir attractif de l'odeur des mâles et des femelles sont donc étudiés et comparés par olfactométrie. Le comportement de mâles et de femelles vierges et inséminées, mis en contact des graines de la plante hôte ou non, est observé en fonction de l'âge des imagos. En aucun cas, les odeurs des mâles n'exercent une attraction sur les femelles. Les femelles vierges en absence de graines de haricot (Phaseolus vulgaris) n'exercent pas d'attraction sur les mâles vierges. Par contre les odeurs des femelles vierges mises en contact avec les graines de haricot sont très attractives pour les mâles vierges et varie en fonction de l'âge: il est plus affirmé chez les femelles plus âgées. L'émission de la phéromone sexuelle est interrompue après l'insémination des femelles mais reprend au bout d'un certain temps après celle-ci.     

La répartition spatiale des différents stades de Coccinella septempunctata dans un champ de blé: variation au cours de la saison

Résumé Au début du printemps les adultes de Coccinella septempunctata L. (Col., Coccinellidae) issus des sites d'hivernation, les larves et les nymphes qui en proviennent, fréquentent le sol et les parties basses du blé. En juin, les adultes nés dans le champ et leur descendance sont dispersés sur toute la hauteur des talles bien qu'une fraction non négligeable de leur population se rencontre à l'extrémité supérieure. La plupart des pontes sont déposées sous les mottes de terre, les pierres et les petites adventices qui constituent des sites privilégiés. Ces variations de la distribution de cette coccinelle peuvent être mises en relation avec le climat, en particulier la température, avec la thermophilie de cette espèce et avec la répartition sur les différentes parties des talles des 3 espèces de puceron qui se succèdent au cours de la saison. Ces observations sont importantes à considérer lors du choix ou de la mise au point d'une méthode d'échantillonnage.     

Interactions de la chloroquine avec la ferriprotoporphyrine IX: Étude par résonance magnétique nucléaire

Chloroquine is still the antimalarial drug which is the most utilized. Nevertheless the molecular mode of action of this drug is not very well understood. When mouse erythrocytes injected with Plasmodium berghei are exposed to chloroquine, the first biochemical event is rapid accumulation of the drug. This process is energy dependent, saturable and competively inhibited by drugs of the same therapeutic class (Quinine, Amodiaquine, Mefloquine). Receptors for chloroquine have been proposed for the process of accumulation. The nature of the chloroquine receptor is presently the subject of debates. The latest hypothesis proposed by Chou and coll. [12], is that ferriprotoporphyrin IX, formed by the degradation of hemoglobin by the parasite, binds to chloroquine with a dissociation constant of 3.5.10⁻⁹ M. We studied here the molecular interactions between these two species by Proton Nuclear Magnetic Resonance in order to elucidate the nature and the geometry of were undertaken.The perturbations of the NMR spectra of chloroquine (10⁻² M) induced by addition of hematin or hemin were measured. Two types of measures were indertaken.The first study carried out in organic solvent (DMSO) has shown that the interaction occured between the acidic functions of hemin and the sidechain nitrogen of chloroquine. The iron atom was not implicated in this process.The second study carried out in aqueous medium (phosphate buffer; 0.1 M; pH = 7) allowed us to demonstrate that chloroquine is able to intercalate into a polymer of hematin. The quinoleic nucleus of chloroquine was intercalated between two dimers of hematin as shown by the broadening of the signal of the quinoleic protons due to very large increase in the correlation time.Finally it was shown that chloroquine is associated as a dimer in aqueous medium by hydrophobic interactions. The association constant is 5.5 M⁻¹.     

Approche discriminante de la contribution de différents échelons microplanctoniques aux mesures globales d'ETS dans des échantillons d'eau de mer. a. Phytoplancton

Discriminating Approach of Various Microplanktonic-stage Contributions to Whole ETS Measurements in Sea-water Samples. a. Phytoplankton Data obtained from algal cell cultures were applied to various sea water samples in order to estimate the specific contribution of phytoplanktonic organisms to whole ETS (electron transport system) measurements of these samples which have been collected at eleven stations in the northwest Mediterranean Sea. When the phytoplankton ETS contributions were quantified by cell enumerations or by other indirect-biomass-indicator measurements, the results are in good accordance to the recorded ETS measurement values of the sample. More specific of the phytoplankton stage is the index used for such an estimation (as chlorophyll a), and better is the relationship between both estimated and measured ETS values.     

Biosynthèse de cellulose bacterienne à partir de glucose sélectivement deuterié en position 6: Étude par RMN

D-glucose specifically deuterated at C-6 was prepared and used for the biosynthesis of bacterial cellulose with Acetobacter xylinum. The material obtained was converted into glucitol hexaacetate and analyzed by 250 MHz n.m.r. and mass spectrometry. These spectra indicated that about 70% of the starting D-glucose was incorporated without modification of deuteriation at the C-6 position. However an explanation is required of the finding that deuterium was also incorporated at the C-2 and C-1 positions of the cellulose, arising respectively from the 6 pro-R and 6 pro-S positions of the initial D-glucose.     

La diversité floristique de la végétation psammophile de la région de Tlemcen (nord–ouest Algérie)

This study is devoted to the analysis of the psammophyte of the coastal and semi-continental dunes in Tlemcen. Interesting results have been obtained, in particular, on the biological and ecological aspects of the psammophyte. The interpretation from Factoriel analysis of correspondences enabled us to identify the different phytosociological classes (Cakiletea maritimae, Ammophiletea, Quercetea ilicis, Therobrachypodietea and Stellarietea mediae). Some of these classes (Cakiletea maritimae and Ammophiletea) inhabit, exceedingly well, the embryonic dunes. Some species (Therobrachypodietea) colonize the quickset dunes. Lastly, some others (Quercetea ilicis) settle in the more mature and stable dunes. By using the phytosociological and phytodynamical data, we have been able to understand the vegetation and its diversity. To cite this article: H. Stambouli-Meziane et al., C. R. Biologies 332 (2009).     

Étude des principaux facteurs influençant l‘émission d'attractifs sexuels synthétiques à partir de diffuseurs en caoutchouc et en plastique

Deux types de diffuseurs en caoutchouc (Michelin) et en plastique polystratifié (Hercon^®) sont testés en laboratoire pour étudier quelques aspects des phénomènes de diffusion. Trois composantes phéromonales, le Z9-12: Ac, le 12: Ac et le Z9-14: Ac imprégnées dans ces différents supports servent à détermineer le rôle joué par la longueur de la chaîne de la molécule et la présence de doubles liaisons sur la vitesse de diffusion. L'influence de la température, de la vitesse du vent et de l'humidité est déterminée en cellules climatisées.Parmi les facteurs relatifs à la structure chimique, l'influence de la longueur de la chaîne est prédominante par rapport à la présence d'une double liaison. Parmi les facteurs climatiques, le vent agit plus que la température sur la diffusion, alors que l'humidité paraît secondaire.     

Étude de la fixation de faible affinité du Ca par les membranes externe et interne des mitochondriest et par le réticulum endoplasmique lisse et rugueux de foie de rat

Two classes of low-affinity Ca²⁺-binding sites have been shown to exist. One type dissociates as pH rises, thereby increasing the amount of bound Ca²⁺. The other type, which does not change in number, has an affinity for Ca²⁺ which is dependent on ionic strength. The former is possibly a phospholipid, the latter possibly a protein.Under our experimental conditions, the inner mitochondrial membrane contained binding sites of the second class ony while other membranes contain both types. Rough endoplasmic reticulum contains yet another class of sites at the ribosomal level.

Résumé

L'existence de deux catégories de sites de fixation de faible affinité du Ca²⁺ a été mise en évidence. Les uns se dissocient de plus en plus quant le pH s'éléve permettant une augmentation des quantités de Ca²⁺ fixé, les autres sont invariables en nombre, mais leur affinité pour le Ca²⁺ est dépendante de la force ionique du milieu. Les premiers pourraient étre de nature phospholipidique, les seconds de nature protéique.Dans nos conditions expérimentales, la membrane interne des mitochondries possède uniquement des sites de la seconde catégorie. Les autres membranes renferment simultanément les deux sortes de sites. Le réticulum endoplasmique rugueux possède des sites supplémentaires au niveau des ribosomes.     

Étude ultrastructurale du cycle nucléolaire de Physarum polycephalum après mise en évidence préférentielle des RNP par la réaction régressive à l''EDTA

Nucleolar cycle in Physarum polycephalum was studied using EDTA preferential stain for RNP. We have been able to establish the following.

1. 1. The nucleolar remnants that are observed during mitosis correspond to the fibrillar zones of the interphase nucleolus.

2. 2. In prometaphase and metaphase the nucleolar remnants lie peripherically around the chromosomal mass with which they are only superficially associated.

3. 3. Preribosomal granules appear 10–15 min after metaphase in the prenucleolar bodies.

The results shown that the interphase nucleolus is an assembly of multiple subunits. The relationship between the nucleolar remnants and chromosomes is discussed in the light of the recent understanding of the extrachromosomal nature of rDNA.Le cycle nucléolaire de Physarum polycephalum a été étudié en microscopie électronique après réaction régressive à l'EDTA qui met préférentiellement en évidence les RNP. Nous avons suivi ainsi la dispersion du nucléole en prophase, le devenir des restes nucléolaires au cours de la métaphase et de la télophase, puis l'apparition des corps prénucléolaires en début d'interphase.