利用RAPD标记分析鸵鸟种群的遗传变异

为探讨分子遗传标记在鸵鸟（Struthio camelus)育种中的应用,利用RAPD技术分析了我国养殖的三个主要要鸵鸟品种内和品种间的遗传变异。蓝颈鸵鸟、澳洲灰和非洲黑三个品种在品种内和品种间显示出低水平的变异。品种间的遗传距离好地说胆了三个品种的育种改良过程。同时预示出用澳洲灰与其他品种鸵鸟进行杂交育种的可行性。选择的20条在鸡中能稳定扩增的RAPD引物其75％能在鸵鸟基因组中扩增出产物。显示出两种禽类DNA具有同源性、为今后利用鸡的微卫星引物对鸵鸟进行基因扫描（genome scan）分析奠定基础。     

草鱼和鲤群体遗传变异的RAPD指纹分析

利用随机扩增多态ＤＮＡ技术对革鱼,兴国红鲤,野鲤的种群内,种群间以及种间的遗传变异亏待进行了定量分析。结果表明;草鱼与鲤的ＲＡＰＤ指纹图谱带型差异显著,草鱼与红鲤和鲤种间的平均带纹相似系数分别为０．２５８３和０．２３９４,遗传距离分别达到０．９３６２和１．２２７７。     

凉水国家自然保护区天然红松林遗传变异的RAPD分析

采用随机扩增多态ＤＮＡ（ｒａｎｄｏｍ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃＤＮＡ ＲＡＰＤ）技术,研究了凉水国家自然保护区天然红松林的遗传变异水平及其分布规律。１６个１０ｂｐ长度的随机引物在８个实验样地内７２个个体中共检测了９６个位点,其中５５个是多态位点。在种水平上,红松的多态位点比率为Ｐ＝５８．５１％;Ｎｅｉ’ｓ遗传变异指数为Ｈ＝０．２８６８;Ｓｈａｎｎｏｎ’ｓ指数为Ｉ＝０．３６５４,所     

孓遗植物桫椤RAPD分析中主要反应参数的影响

为得到桫椤RAPD扩增的最佳条件,对影响桫椤RAPD扩增的模板纯化方法、模板含量、酶浓度、Mg²⁺浓度、dNTP浓度和引物浓度及扩增程序等多种因素进行了探讨.结果表明,用玻璃奶和蛋白酶K纯化后获得的DNA作为模板进行RAPD反应,其扩增带比用未纯化的和仅用无水乙醇再沉淀的DNA为模板更亮,更清晰,重复性更好;模板浓度、酶浓度、Mg²⁺及dNIT浓度、引物浓度及退火温度这些因素都会对RAPD产生影响.经过本实验的探索,发现桫椤RAPD扩增的最佳体系是(2.5×10^-2mL反应体积):模板浓度为70ng,Mg²⁺浓度为2.5mmol·L^-1,dNTP为0.2mmol·L^-1,引物3×10^-4mL;最佳扩增程序为:94℃200s,一个循环;94℃60s,36℃60s,72℃120s,40个循环:72℃600s,一个循环:4℃保存.     

利用RAPD标记分析濒危植物白豆杉种群的遗传结构

以我国特有的濒危裸子植物白豆杉为材料,采用RAPD标记对其分布于浙江、江西、湖南和广西的11个天然种群予以检测,通过贝叶斯法估测了种群的遗传分化程度,并和由其他算法得出的结果进行了比较.求出的θ^B（Hickory）、GST（Nei）及φST（AMOVA）值分别为0.5018、0.5865和0.5436;而经由Shannon指数计算出的种群间遗传多样性所占比例为0.4839,同贝叶斯法估计出的结果最为接近.和其他松杉类植物相比,白豆杉种群间发生了极其显著的遗传分化,这可能是因为：（1）种群长期处于星散分布状态;（2）雌雄异株,而生于林下的雌株经常不能正常受粉;（3）种群取样跨越的地理范围宽广.Mantel检验表明,种群间的遗传分化程度和地理距离之间显著相关（r=0.719,P=0.003）.此外还发现白豆杉的遗传变异水平偏低,推测瓶颈效应和遗传漂变对小种群的作用是造成这一后果的重要因素.对白豆杉种群的保育和管理提出了建议.     

孑遗植物中华桫椤2个群体遗传多样性的ISSR分析

为阐明小尺度范围内濒危物种孑遗植物中华桫椤种群的遗传多样性,保护和恢复种质资源,本文采用ISSR分子标记技术对云南屏边大围山的大围山红旗水库和大围山山谷2个中华桫椤种群的遗传多样性进行分析。结果表明用从100个随机引物中筛选出的20个能高产稳定扩增的ISSR引物对2个群体共57个样品进行扩增,共获得132个可分析位点,其中大围山红旗水库的多态性位点83个,占62.87%,而大围山山谷的多态性位点97个,多态位点百分率(P)为73.48%,两者Nei's基因多样性分别为0.2614和0.2832,Shannon's信息指数分别为0.3762和0.4135,两个种群的遗传分化系数Gst为0.0701,分析结果表明中华桫椤种群内的遗传多样性较高,但两种群间的遗传分化不明显。本研究结果将对中华桫椤自然群体的保育和管理具有重要意义。     

孑遗植物桫椤叶化学成分的研究

采用甲醇浸泡提取,依次用石油醚、乙酸乙酯和正丁醇萃取,通过反复硅胶柱色谱分离的方法研究桫椤叶的化学成分,得到7个化合物,根据光谱数据和理化性质鉴定分别为牡荆素(vitexin)(1)、异荭草素(isorientin)(2)、芹菜素(apigenin)(3)、木犀草素(luteolin)(4)、diploterol(5)、胡萝卜苷(daucosterol)(6)、β-谷甾醇(β-sitosterol)(7).7个化合物均为首次在桫椤中分离获得.     

利用RAPD标记分析鸵鸟种群的遗传变异

为探讨分子遗传标记在鸵鸟(Struthiocamelus)育种中的应用,利用RAPD技术分析了我国养殖的三个主要鸵鸟品种内和品种间的遗传变异.蓝颈鸵鸟、澳洲灰和非洲黑三个品种在品种内和品种间显示出低水平的变异.品种间的遗传距离较好地说明了三个品种的育种改良过程,同时预示出用澳洲灰与其他品种鸵鸟进行杂交育种的可行性.选择的20条在鸡中能稳定扩增的RAPD引物其75%能在鸵鸟基因组中扩增出产物,显示出两种禽类DNA具有同源性,为今后利用鸡的微卫星引物对鸵鸟进行基因组扫描(genomescan)分析奠定基础。 Abstract:To evaluate the molecular genetic markers on ostrich (Struthio camelus)breeding,we have analyzed the genetic variability of three main ostrich breeds by using RAPD.The studies show that the Blue,Australia Grey and African Black have low genetic variability.The genetic distance between breeds clearly illustrates the breeding history,at the same time,it also showes the possibility that cross breeding can be applied to Australia Grey and the breeds.75 percent selected RAPD primers working well in chicken could stably amplify products in ostriches,which implied DNA identity between chicken and ostrich.The work provided a foundation for genomic scanning.     

几种肉鸡遗传变异的RAPD分析

本实验采用RAPD标记技术对河田鸡（H）,丝毛乌鸡（S）,隐性白鸡（W）,从尤溪麻鸡中选育的3个种鸡群;麻羽（M0）,麻羽黑肉（MB0）和黑羽黑肉（BB0）,以及隐性白与尤溪麻鸡3个种鸡群的杂交种;黑羽黑肉（BB1）,黑羽（B1）,麻鸡（M1）共9个群体用28个引物进行遗传变异分析。结果表明,9个群体的平均相似指数为64.8%,尤溪麻鸡与隐性白杂交后代中黑羽黑肉与丝毛乌鸡的相似程度较高,相似指数达72.1%。这与两者具有乌肤乌肉特征有关。河田鸡与丝毛乌鸡两者比较接近。相似指数为66.1%。尤溪麻鸡麻羽种鸡群与河田鸡,丝毛乌鸡血缘关系较远,相似指数分别为59.4%和58.8%。聚类分析表明,黑羽黑肉,黑羽,隐性白先聚为一类,相似指数达69.0%,这与引入隐性白为杂交母本有关。麻羽,黑羽黑肉（原种群）和其他7个群体最聚为一类。说明对尤溪麻鸡按两种肉色（白肉,黑肉）进行选育使遗传变异增加。     

凉水国家自然保护区天然红松林遗传变异的RAPD分析

采用随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA RAPD)技术,研究了凉水国家自然保护区天然红松林的遗传变异水平及其分布规律。16个10bp长度的随机引物在8个实验样地内72个个体中共检测了96个位点,其中55个是多态位点。在种水平上,红松的多态位点比率为P=58.51%;Nei's遗传变异指数为H=0.2868;Shannon's指数为I=0.3654,所有的变异中,有92.47%的变异存在于样地内, 7.53%的变异存在于样地间。根据各遗传多样性在不同样地的分布,初步探讨了红松遗传变异水平与其种群发生及生境的相互关系。     

Spatial genetic analyses reveal strong genetic structure in two populations of the outcrossing tree fern Alsophila firma (Cyatheaceae)

The development of spatial genetic structure (SGS) in seed plants has been linked to several biological attributes of species, such as breeding system and life form. However, little is known about SGS in ferns, which together with lycopods are unique among land plants in having two free‐living life stages. We combined spatial aggregation statistics and spatial genetic autocorrelation analyses using five plastid microsatellites and one nuclear gene to investigate SGS in two populations of the outcrossing tree fern Alsophila firma (Cyatheaceae). We assessed how the observed patterns compare with those estimated for other ferns and seed plants. Populations of A. firma exhibited strong SGS, spatial clustering of individuals, substantial clonal diversity and no inbreeding. SGS in ferns appears to be higher than in most seed plants analysed to date. Contrary to our expectations, an outcrossing breeding system, wind dispersal and an arborescent life form did not translate into weak or no SGS. In ferns, SGS is probably being affected by the life cycle with two free‐living life stages. The reproductive biology of ferns appears to be more complex than previously thought. This implies that SGS in ferns is affected by some factors that cannot be inferred from the study of flowering plants. © 2015 The Linnean Society of London, Botanical Journal of the Linnean Society, 2015, 177 , 439–449.     

桫椤植物群落区系进化保守性

植被进化是生态系统进化研究的重要议题之一,而对"活化石"植物生物学、生态学特性的研究则是其基础.选以乐山五通桥桫椤自然保护区-桫椤群落的种子植物区系与蕨类植物区系组成为研究对象,发现种子植物区系在属的水平上热带成分与古华夏成分占到近2/3,在科的水平上则更高;种子植物区系中有9个中国特有属,其中8个为残遗或原始类型的古特有属,表现出典型的古特有现象;而在蕨类植物区系中热带成分和华夏成分所占比重更大.将之与我国不同气候带15代表性地点的植物区系进行DCA排序,发现其种子植物区系与蕨类植物区系组成都与更低纬度的一些区系更相近,表现出强烈的热带残遗性和亲缘性.将之与中国晚白垩纪和新生代第三纪中国东北、辽宁抚顺、云南景谷、山东山旺化石植物类群相比,发现桫椤群落中蕨类植物成分与其晚白垩纪化石植物群有着高度的相似性,而其种子植物组成与其后兴起的第三纪被子化石群不甚相似.由此可见,桫椤群落区系组成与起源年代都十分古老;与桫椤伴生的成分中存在较大比例的中生代甚至古生代的古老遗存物种,也明显表现出其在植被进化中的保守性和种系发生的古老性.     

福建永定桫椤群落内主要灌木种群的种间联结性研究

采用X^2检验、联结系数（AC）和种间共同出现百分率（PC）等指标,分析了福建省永定桫椤群落内主要灌木树种的种间联结性,结果表明：除少数种对外,绝大多数种群间的联结性不显著;在联结性显著的种对中,下述4个种对之间有较高的正联结性;赤楠-杜茎山、蔷薇属一种=细齿叶柃、沿海紫金牛-杜茎山,青冈-冬青,表明这4个种对间的生态习性和对环境的需求较一致。     

Study on Interspeciffic Association of Main Shrub Populations in Alsophila spinulosa Community in Yongding County,Fujian

Using the 2×2 contigency table and different indices, the interspecific associations of main shrub populations in Alsophila spinulosa community in Yongding, Fujian were analyzed. The result of X2 test shows that the imterspecific association is not obviously correlative in most of the species-pair, except the minority species-pair. After the association coefficient (AC) and the percentage of co-ocurrence (PC)were calculated, there was closely the plsitive association among Syzygium buxifolium and Maesa japonica, Rosa sp. and Eurya nitida, Ardisia japonica and Maesa japonica, Cyclobalanopsis glauca and Ilex chinensis. It shows that there are similar in ecologcal characteristics and habitat among these four species-pairs     

涪陵磨盘沟自然保护区桫椤种群分布格局的分形特征

利用分形理论中的计盒维数探讨了重庆市涪陵磨盘沟桫椤种群的分形特征。结果表明,桫椤种群的分布格局具有分形特征。桫椤种群在不同海拔高度分布格局的计盒维数各不相同,与生境密切相关。在6个不同植物群落中,桫椤种群的计盒维数大小依次为黄牛奶树淡竹叶>黄杞水麻>盐肤木腹水草>血桐芒>白栎扁穗莎草>毛叶木姜子火炭木。计盒维数定量地反映了该自然保护区桫椤种群占据生态空间的能力,随机型的桫椤种群对空间占有能力比聚集型的低。     

贵州赤水桫椤自然保护区桫椤内生真菌多样性研究

桫椤Alsophila spinulosa是白垩纪时期遗留的古老孑遗蕨类植物,具有较高的药用价值和观赏价值。本研究采用形态特征和ITS序列分析方法,从250个组织块中共分离获得84个菌株,隶属于2门3纲10目18科25属。子囊菌门Ascomycota为优势菌门,其相对丰度高达92.86%,而担子菌门Basidiomycota仅为2.38%;粪壳菌纲Sordariomycetes和座囊菌纲Dothideomycetes为优势纲,其相对丰度分别为78.57%和13.10%;小丛壳目Glomerellales和炭角菌目Xylariales为优势目,其相对丰度分别为33.33%和25.00%;小丛壳科Glomerellaceae和炭角菌科Xylariaceae为优势科,其相对丰度分别为32.14%和19.05%;刺盘孢属 Colletotrichum和炭角菌属Xylaria为优势属,其相对丰度分别为32.14%和14.29%。这些菌株存在一定的组织差异,属水平上,叶轴中共获得15属,特有属9属;羽状复叶中共获得16属,特有属10属,两组织间共有属为6属,其中刺盘孢属Colletotrichum和炭角菌属Xylaria均为两组织的优势属,但其相对丰度存在一定差异。从不同组织多样性来看,桫椤叶轴的Shannon、Simpson多样性指数和Pielou均匀度均高于桫椤叶。     

涪陵磨盘沟桫椤种群格局的分形特征-信息维数

应用分形理论中的信息维数探讨了涪陵磨盘沟桫椤种群分布格局的分形特征.结果表明桫椤种群的分布格局具有分形特征,信息维数适用于涪陵磨盘沟桫椤种群分布格局分形特征的定量描述.6个不同植物群落中桫椤种群的信息维数大小依次为桫椤+毛叶木姜子(1.584)>桫椤+血桐-火炭木(0.947)>桫椤+盐肤木-腹水草(0.828)>桫椤+黄牛奶树(0.779)>桫椤+黄杞-南川楼梯草(0.635)>桫椤+白栎+异叶榕(0.535),这种差异反映了桫椤在各群落中更新状况的差异.集群型的信息维数比随机型的高,信息维数揭示了桫椤种群格局强度的尺度变化程度和表征了种群个体分布的非均匀性.