狐源犬瘟热病毒核衣壳蛋白基因的克隆与序列分析

根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)N基因核酸序列, 设计一对CDV N基因特异性引物, 采用RT-PCR扩增狐源CDV泰安分离株(CDV-FOX-TA)的N基因, 将PCR产物克隆入pMD18-T载体, 进行测序分析。结果表明, CDV-FOX-TA N基因含有1个ORF, 全长1572 bp, 共编码523个氨基酸。CDV-FOX-TA N基因与CDV疫苗株Onderstepoort、Convac的N基因的同源性分别为96.0%和95.9%, 与CDV野毒株N基因的同源性在98.4%~98.9%之间。CDV-FOX-TA N蛋白含有Tyr -Pro-Ala-Leu-Gly-Leu-His-Glu-Phe九肽序列, 是T细胞表位, 可致敏靶细胞, 在CDV N蛋白中高度保守。对CDV N基因进行系统发生分析, 结果发现CDV-FOX-TA与CDV强毒株的亲缘关系较为密切。     

犬瘟热病毒南京株H蛋白基因的克隆与表达

根据发表的犬瘟热病毒(CDV)参考株Ondetstepoort的序列设计一对引物,以犬瘟热病毒南京株(CDVNJ．15)感染的Vero细胞总RNA为模板,RT-PCR扩增出1．9kb的全长H蛋白基因,双酶切该全长基因,得到1058bp片段,以正确的阅读框架定向克隆于pET-28b( )中,然后将重组质粒转化宿主菌RosettaTM,在37℃1．0mmol／LIPTG诱导下获得良好表达。经SDS—PAGE鉴定,表达的融合蛋白质约38kDa,与预期值一致。免疫转印试验显示,该重组蛋白可被CDVOnderstepoort兔抗血清识别,表明该重组蛋白具备部分抗原性。     

狐源犬瘟热病毒核衣壳蛋白基因的克隆与序列分析

根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)N基因核酸序列,设计一对CDVN基因特异性引物,采用RT-PCR扩增狐源CDV泰安分离株(CDV-FOX-TA)的N基因,将PCR产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析.结果表明,CDV-FOX-TA N基因含有1个ORF,全长1572 bp,共编码523个氨基酸.CDV-FOX-TAN基因与CDV疫苗株Onderstepoort、Convac的N基因的同源性分别为96.0%和95.9%,与CDV野毒株N基因的同源性在98.4%～98.9%之间.CDV-FOX-TA N蛋白含有Tyr-Pro-Ala-Leu-Gly-Leu-His-Glu-Phe九肽序列,是T细胞表位,可致敏靶细胞,在CDVN蛋白中高度保守.对CDV N基因进行系统发生分析,结果发现CDV-FOX-TA与CDV强毒株的亲缘关系较为密切.     

犬瘟热病毒南京株H蛋白基因的克隆与表达

根据发表的犬瘟热病毒(CDV)参考株Ondetstepoort的序列设计一对引物,以犬瘟热病毒南京株(CDVNJ-15)感染的Vero细胞总RNA为模板,RT-PCR扩增出1.9kb的全长H蛋白基因,双酶切该全长基因,得到1058bp片段,以正确的阅读框架定向克隆于pET-28b(+)中,然后将重组质粒转化宿主菌RosettaTM,在37℃1.0mmol/LIPTG诱导下获得良好表达.经SDS-PAGE鉴定,表达的融合蛋白质约38kDa,与预期值一致.免疫转印试验显示,该重组蛋白可被CDVOnderstepoort兔抗血清识别,表明该重组蛋白具备部分抗原性.     

犬瘟热病毒H基因原核表达载体的构建

利用本实验以前构建的含有犬瘟热病毒H基因的pMD18-T质粒,根据pMD18-T-H序列设计带有XbalI和HindⅢ酶切位点的引物,对H基因进行PCR扩增,得到约1800bp左右的片段。该片段被克隆到pMD18-Tsimple载体上,用XbalI和HindⅢ进行单、双酶切鉴定．筛选阳性克隆。将阳性克隆再用XbalI和HindⅢ进行双酶切,纯化回收CDVH基因片段。将原核表达载体pPROEXTMHTa、pet-30b用同样的方法酶切,回收载体片段。将CDVH基因片段分别用T4连接酶连接到回收的pPROEXTMHTa、pet-30b载体上,构建原核表达载体质粒pPROEXTMHTa-H和pet-30b-H。再用XbalI和HindⅢ进行单、双酶切鉴定阳性载体。本实验为下一步H蛋白表达、纯化并作为CDV诊断用抗原及CD的免疫预防奠定了基础。     

犬瘟热病毒TN株血凝基因的克隆与序列分析

用RT PCR方法对分离的TN野毒株H基因进行了扩增 ,并将其克隆到pGEM T载体上 ,进行核苷酸序列测定。结果TN野毒株H基因ORF全长 1 ,81 5bp ,编码 60 4个氨基酸。与GenBank中己报道的 7个CDV毒株相比 ,H基因核苷酸序列的同源性在 92 %～ 99%之间 ,推导的H蛋白氨基酸序列的同源性在 91 %～ 99%之间。TN株H蛋白潜在的N 联糖基化位点为 8个 ,而Onderstepoort弱毒株H蛋白为 4个 ;其中N端第 1 9～ 2 1、 30 9～ 31 1、 5 8     

圈养狐貉源犬瘟热病毒地方分离株H基因的遗传变异分析

本研究于2004～2006年从人工饲养的发病狐貉中分离到6个CDV分离株,用RT-PCR方法扩增了其H蛋白基因片段,并对其进行了克隆和测序.测序结果表明,6个CDV分离株H基因阅读框全长均为1 824 bp,编码607个氨基酸,未发现碱基的插入和缺失.与Genbank中的34株CDV参考毒株的H基因序列进行比较和分析,现有的CDV毒株可以分为Asia-1、Asia-2、America-1、America-2、Europe和Arctic 6个基因型,本实验中的分离株HL为Arctic基因型,与来自意大利的194/97株、丹麦的Green株同分在一组,其余5株分离株与来自日本的HAMA、UENO、Tanu96等毒株以及来自中国的TN株、GP株(大熊猫株)分在一组同属Asia-1型,表现出一定的地理位置相关性;6个分离株均与Onderstepoor、Convac等疫苗株差异较大、关系较远,提示病毒变异可能是造成目前已免疫动物仍然发生犬瘟热流行的原因之一.     

犬瘟热病毒H蛋白基因重组腺病毒的构建及免疫效果评估

研究选取犬瘟热病毒H蛋白基因为目的基因,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、酶切、连接等方法构建出重组人5型腺病毒穿梭质粒和骨架质粒,两者共转染293AD细胞并包装出重组腺病毒。通过电镜负染、酶切鉴定、Western blot及一步生长曲线测定等方法进行病毒的生物学特性鉴定,证明犬瘟热病毒H蛋白基因重组腺病毒构建正确。犬分别肌肉接种CDV疫苗毒和重组腺病毒,并检测免疫后第14,28,42,56,70,84d时犬血清中抗CDV中和抗体的变化情况。结果显示,犬免疫重组腺病毒后体内产生的抗CDV平均中和抗体水平高于对照组,滴度最高达2-8。研究表明,正确构建的重组腺病毒具有良好的免疫原性,诱导产生的抗犬瘟热病毒中和抗体达到犬最低免疫保护水平,为进一步研发犬瘟热病毒活载体疫苗提供理论依据。     

RT－cDNA克隆－PCR法获取犬瘟热病毒融合蛋白基因（F）

纯化鸡胚成纤维细胞培养的犬瘟热病毒（ＣａｎｉｎｅＤｉｓｔｅｍｐｅｒＶｉｒｕｓ,ＣＤＶ）,获得病毒基因组ＲＮＡ后,反转录合成双链病毒Ｆ基因ｃＤＮＡ。将此双链ｃＤＮＡ平端插入ＰＵＣ１９质粒ＳａｍⅠ位点构建重组质粒,进行ｃＤＮＡ克隆。以重组克隆质粒为模板ＰＣＲ扩增,获得ＣＤＶ全长Ｆ基因。将此Ｆ基因插入表达载体ＰＢＶ２２０,在大肠杆菌中表达,通过对表达产物的最终鉴定,可确认所获片段为ＣＤＶ全长Ｆ基因．     

Amino-terminal precursor sequence modulates canine distemper virus fusion protein function

The fusion (F) proteins of most paramyxoviruses are classical type I glycoproteins with a short hydrophobic leader sequence closely following the translation initiation codon. The predicted reading frame of the canine distemper virus (CDV) F protein is more complex, with a short hydrophobic sequence beginning 115 codons downstream of the first AUG. To verify if the sequence between the first AUG and the hydrophobic region is translated, we produced a specific antiserum that indeed detected a short-lived F protein precursor that we named PreF(0). A peptide resulting from PreF(0) cleavage was identified and named Pre, and its half-life was measured to be about 30 min. PreF(0) cleavage was completed before proteolytic activation of F(0) into its F(1) and F(2) subunits by furin. To test the hypothesis that the Pre peptide may influence protein activity, we compared the function of F proteins synthesized with that peptide to that of F proteins synthesized with a shorter amino-terminal signal sequence. F proteins synthesized with the Pre peptide were more stable and less active. Thus, the Pre peptide modulates the function of the CDV F protein. Interestingly, a distinct two-hit activation process has been recently described for human respiratory syncytial virus, another paramyxovirus.     

Genome sequence analysis of H5N1 influenza a virus isolated from a vietnamese in 2007

Highly pathogenic H5N1 avian influenza A virus (AIV) crossed the species barrier and caused a number of deaths in humans in Vietnam and 14 other countries. Since the last report of human H5N1 infection in November 2005, the first documented H5N1 human infection was reported in June 2007 in Vietnam and was followed by 7 more cases, including 5 fatalities. In this study, we isolated and analyzed the full length of the H5N1 genome from a sample from the first patient in 2007. Phylogenetic analysis of eight genomic segments of the H5N1 virus strain (A/Vietnam/HN/2007, VNH07) revealed that this strain appears to be of genotype V and contains the HA gene, which is classified into clade 2.3.4. The deduced amino acid sequence of the HA protein has a typical affinity sequence for α2,3 linkage (SAα2,3-Gal) receptors and typical multibasic cleavage sequences. Compared with other H5N1 isolates, VNH07 showed that the possible reassortments for the NA and NP segments occurred between A/goose/Guangxi/3017/2005-like iso?lates (2.3.2) and A/human/Zhejiang/16/2006-like isolates (2.3.4).     

毛柄金钱菌gpd-Fv启动子的克隆及序列分析

根据Genbank登陆的毛柄金钱菌gpd启动子序列设计引物,对毛柄金钱菌基因组DNA进行PCR扩增,扩增获得了2条特异片段gpd-Fv1和gpd-Fv2;回收特异片段后分别克隆进T-easy载体中并进行DNA序列测序,结果表明:gpd-Fv1和gpd-Fv2长度分别为1412 bp和752bp.通过同源性分析,结果表明:gpd-Fv1和gpd-Fv2的DNA序列与已报道的毛柄金钱菌gpd启动子(Genbank:AF515622.1)的同源性分别为95%和98%.进一步通过软件预测,结果表明克隆的2条片段具有基本的启动子结构,存在多个转录因子结合位点.根据启动子的序列特点,初步构建了毛柄金钱菌gpd启动子模型.     

Establishment of a persistent mutant of canine distemper virus

We produced a B95a lymphoid cell line persistently infected with canine distemper virus (CDV), in which virus-specific antigens were present in nearly 100% of cells without causing cytopathic effect. The virus recovered from this cell line was able to infect fresh B95a cells persistently, indicating that a persistent CDV was established.     

家蚕传染性软化病病毒（桐乡株）VP1基因片段的克隆及序列分析

以首株在中国分离到的家蚕传染性软化病病毒（Bombyx mori infectious flacherie virus,BmIFV）BmIFV-CHN001基因组为模板,扩增了编码主要结构蛋白的VP1基因。克隆测序后得到VP1基因片段906 bp。该序列与已发表的日本毒株相比,核苷酸序列的相似性为99.3%,编码氨基酸的相似性为100%,证明该毒株与家蚕传染性软化病病毒日本株的同源性较高。把BmIFV-CHN001的VP1序列与同属的另外6个昆虫小RNA病毒的结构蛋白进行序列比对,构建系统发育树,对其进化关系进行了初步分析,结果显示这7种病毒具有相近的亲缘关系,而BmIFV-CHN001与蜜蜂囊雏病毒的亲缘关系最近。