生物谱系命名法规简评

基于林奈命名法和林奈分类系统的生物分类系统已经存在250多年并仍然为广大生物学工作者使用,由此产生的国际动物、植物、细菌的命名法规亦执行了100年(1905年,国际植物命名法规第1版产生),并在不断修订.随着分类方法的不断进步,林奈分类系统的一些缺陷逐渐显露,一种被称为生物谱系命名法规(PhyloCode)的新的命名法出现在人们眼前.这种基于系统发育系统学的命名法规一经问世就引起诸多争论,但是,作为一种新的命名法规,无论与传统的命名法规融合还是独立发展,对于已有的分类系统都是一个新的机遇和挑战.     

分类学的新进展和我们的对策

1 面貌一新的分类学以林奈的《植物种志》(1753)为标志而诞生的分类学,已有239年历史,是生物学中历史最久的学科。生物分类学,按我的理解,要回答三个问题,亦即有三大目标:①我们的星球上有多少生物?就是说,分类学要揭示生物多样性的面貌,并予以分门别类,这就是分类的任务;②生物之间存在何种关系?这就要揭示生物之间的亲缘关系,并按这种关系建立系统;③生物的亲缘关系是如何产生的?分类学家必须研究生物的起源、物种的形成和生物的进化。二百多年的分类学历史已积累了大量标本,记载了170万种生物,进行了按国际命名法规的命名,并     

微生物的多样性及其某些特征

微生物的多样性及其某些特征陈健斌（中国科学院微生物研究所,北京１０００８０）生物,形形色色,千姿百态。地球上已被描述和命名的生物约有１４４万种￣［１］或１７０余万种￣［２］,而更多的生物物种尚未被认识。所谓生物多样性（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｄｉｖｅｒｓ...     

2020年中国蜘蛛分类年报

本文总结了2020年发表的中国蜘蛛新分类单元和中国分类学者发表的国外蜘蛛新分类单元。基于国内标本, 2020年共发表中国蜘蛛223个新分类单元, 其中中国学者在12种期刊的56篇文章中命名了1新亚科、12新属和201新种, 国外学者命名了9新种, 合计210新种。云南是发现新种数量最多的省份, 占全国发现新种总数的38.1%。基于缅甸等12个国家标本, 2020年中国分类学者发表了外国蜘蛛95个新分类单元, 包括2新科、7新属和86新种。本文还总结了过去5年中国分类学者对全球蜘蛛分类的贡献, 2016‒2020年有1位中国学者发表771个新分类单元。     

生物的系统分类

生物是我们这个世界上最独特的一部分,它在地球上可能存在近40亿年了。在漫长的进化历程中,生物形成了庞杂的类群,仅现存的种类可能就大大超过500万种,据说这尚不足曾生存过种类的1％;其中约150万种(包括一些化石种)已被记录下来。为了更好地认识、利用这数目繁多的生物,明确它们各自在生物世界中的地位,则必须探讨各生物种类之间进化上的联系,对其加以鉴别并归类,即按生物的系统加以分类。     

民间生物分类的研究进展

民间生物分类是一种基于当地文化的方言命名系统,是指在科学分类以外、存在于民间的对生物进行分门别类的方法和过程。许多研究证明,民间分类与科学分类法十分相似,在生物多样性调查与编目、生物文化多样性保护和资源的可持续利用等方面有着非常重要的作用。随着文化同质性和生物多样性丧失的日益加剧,许多珍贵的民间分类传统知识在没有被记录或被发现之前就已经消失,亟待抢救。本文对民间生物分类的概念、主要研究内容和进展进行全面回顾,并对目前民间生物分类存在的问题进行展望,以期为人们全面了解民间生物分类提供参考,并为今后民间生物分类的相关研究提供资料。     

病毒命名与分类系统研究进展

病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。为了力求分类和命名的统一,１９９２年Ｍａｒｔｅｌｌｉ首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,１９９３年８月在英国格拉斯哥召开的第９届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会（ＩＣＴＶ）采纳了这一分类原则,并且新设立了一些植物病毒的科、属［１］,１９９５年在ＩＣＴＶ所公布的病毒…     

中国古代生物命名的双名法思想

1623年,瑞士植物学家G.鲍欣提出了属和种作为植物分类等级,并使用了由属名后面接上能指示出不同种的单个种加词的双名法。1753年,瑞典博物学家林奈用拉丁文固定地采用了双名法给每种生物命名。事实上,生物命名的双名法思想在中国可以追溯到上古时期。我国最早的象形文字甲骨文中就已经记录了这种思想,即形部十声部。形部表示该字的意义所属于的类别,声部表示该字的读音。当然,也是根据其属性读音的。如“枫”,“木”是形部,表示枫是树木类的植物,风是声部,表示枫的读音。明代万历六年     

生物多样性的研究内容与目标

一个区域和一个生态系统保护得是否完整,在很大的程度上要以其生物多样性保护和利用是否合理来决定。当前,许多地方景观单调,鼠害、病虫害严重发生与蔓延、地力衰退、资源枯竭与环境恶化等,都与生物多样性受到破坏有着密切的关系。 (一)生物多样性的现况和保护问题当前,被科学家正式命名和描述过的物种约140万,其中昆虫75万种,脊椎动物41,000种,高等植物25万种,其它为无脊椎动物、真菌和微     

AeDNA: 水生生物eDNA数据库

环境 DNA (eDNA) 技术是一种生态和生物多样性监测和评价的新手段, 完整和准确的参考序列库是eDNA技术应用于水生生物多样性调查的基础。当前, 不同水生生物eDNA参考序列还存在诸多问题, 如不同类群使用的标记基因不同且资源较为分散, 部分参考序列分类不准确, 以及针对我国各类水体中水生生物eDNA参考序列不多等。针对上述问题, 研究构建了水生生物eDNA数据库(AeDNA, http://aedna.ihb.ac.cn/)。 AeDNA整合了DNA条形码和基因组两种类型参考序列。其中18S、28S、ITS、COΙ、12S、rbcL 等各类DNA条形码60余万条, 涉及2万余种鱼类、1万余种水生植物、1万余种底栖动物、1万余种浮游动物和1万余种浮游植物; 基因组包含线粒体、叶绿体等细胞器基因组6199个及万种鱼类基因组计划和万种原生生物基因组计划所产生的物种基因组。涉及的生境有江、河、湖、海、冰川和温泉等各类水环境, 尤其数据库构建团队贡献的6万余条参考序列, 具有我国丰富的各类水体生境信息。总体来说, AeDNA是一个数据量大、类群覆盖全、准确性高且具有我国水生生物特色的综合性eDNA参考序列库, 是水生态和水生生物多样性监测的重要基础资源。     

溶脲脲原体生物变种2与非淋球菌性尿道炎[英]Deguchi T…／／Sexual Transm Dis．

支原体微小菌株[tiny(T)-strain mycoplasmas]于1974年被划归为脲原体属,称为溶脲脲原体(UU),其分为2个生物型,即生物变种1和生物变种2。1999年,依据系统进化分析法,生物变种1被指定为1个单独的种,称小型脲原体(ureaplasrna parvum),生物变种2保留溶脲脲原体的命名。这2种脲原体与非淋球菌性尿道炎(nongonococcal urethritis,NGU)的相关性仍不清楚。作者以聚合酶链反应(PCR)为基础,     

酶的命名规范化及有关问题

在微生物、植物和动物体内,迄今已发现的酶有数千种之多。为了避免混乱,国际酶学委员会在1961年曾提出一个关于酶的分类命名的报告。1972年出版的《酶分类法》中,收录了当时所知的所有酶的分类命名资料。国际酶学委员会关于酶的分类命名原则已被各国酶学工作者广泛接受。鉴于这一原则有充分的科学依据,又便于国际交流,我国的各种出版物中也应     

谈谈生物分类系统的两种功能

阐述了生物分类系统具有的 2种功能 :( 1 )指导识别鉴定生物种类 ;( 2 )表达生物的系统发育关系。讨论了分类系统有无可能和有无必要同时担负 2种功能。分析了 2种功能互相混淆所带来的问题 ,并就澄清分类系统的 2种功能提出了一些建议。     

国际生物命名法规的协调与统一

根据林奈双名制原则,不同的生物学科曾先后制定出相应的命名法规,使各自学科的生物命名规范化。现行的国际生物命名法规有5个,即动物命名法规、植物命名法规、细菌命名法规、栽培植物命名法规以及病毒命名法规（草案）。这些法规经过不断地修改,逐渐使生物的命名严谨和完善。在制定这些法规时,拟定者虽参考了其它生物命名的原则、规则和条例,但主要是考虑自身学科内生物的实际情况而定的,因此,上述5个不同的命名法规之间存在着一定的差异,自然会出现一些混乱。为了使国际生物命名的统一化,在国际科协（ICSU）的支持下,1994年国…     

广东鼎湖山自然保护区生物主模式标本内容分析

为了解鼎湖山物种分类学研究的历史,采用内容分析法对采自广东鼎湖山自然保护区的生物主模式标本信息进行了分析。结果表明,鼎湖山自然保护区的生物主模式标本共含202种生物(亚种或变种),分属3界10门20纲54目104科146属,其中植物界63种、动物界68种、菌物界71种。有194份标本(另8份无采集人信息)涉及77位采集人(或其团队),有67家机构的147人参与新种命名, 67种期刊的140条文献参与新种发表, 38个国内外机构保存了200种的标本,物种在30%的科、目、采集人、第1命名人、期刊和存放地各分配了约70%的数量,呈现类似"二八定律"所述的不平衡现象。1978至1997年是标本采集并命名的高峰期,标本采集率为55.45%、标本命名率为58.91%;植物标本的采集和命名早于动物和真菌。鼎湖山物种的橱柜时间(标本采集到命名间隔的时间)平均为7.56 a,且植物的长于动物和菌物。鼎湖山主模式标本生物的物种密度比邻近保护区的要高。     

内容丰富的《真菌、酵母、细菌、噬菌体和rDNA载体分类手册》

<正> 美国菌种收藏所(简称 ATCC)的《真菌、酵母、细菌、噬菌体和 rDNA 载体分类手册》第十六版现已出版。有关真菌和酵母菌的231页的目录中包括有18,500个菌株,列出了它们的种名、工业用途、以及在 ATCC 的登记号。目录中有株系来源、命名、分类、生物技     

BioNET－INTERNATIONAL：生物系统学全球网络

ＢｉｏＮＥＴ－ＩＮＴＥＲＮＡＴＩＯＮＡＬ：生物系统学全球网络生物系统学是识别、命名生物和对生物分类的学科。“生物系统学二十一世纪议程（ＳｓｓｔｅｍａｔｉｃｓＡｇｅｎｄａ２０００）”提出了生物系统学的三个使命：１）发现生物多样性：调查、发现、鉴定和描述...     

昆虫病毒分类最新进展

自1970年国际病毒分类与命名委员会(IC-TV)成立起,就将昆虫病毒纳入整个病毒分类系统中进行分类与命名。从此昆虫病毒有了与其它病毒进行比较的机会。到1982年的十余年里,ICTV先后四次讨论对包括昆虫病毒在内的整个病毒界(Kingdom: Vita)进行分类和命名。谢天恩(1986)曾对1982年以前昆虫病毒分类状况做了详细的综述。近年来,昆虫病毒的研究又取得了许多新进展。1984年在     

中国蚋属蚋亚属盾纹组分类记要并三新种记述(双翅目,蚋科)

记载中国蚋属蚋亚属盾纹蚋组Simulium striatum-group)计8种。其中包括1新纪录种。泰国蚋S.(s.)thai-landieumTakaoka et Suzuki,1984和3新种：即坝河蚋S.(S.)bahense sp.nov,勐腊蚋S.(s.)menglaense sp.nov和五指山蚋S.(s.)wuzhishanense sp.nov,分别以其产地命名,文中对其不同虫期进行描述并与其近缘种进行分类讨论,模式标本均存放于贵阳医学院生物教研室。     

人类生态学(七):野生动物管理(1)

地球上的生物已有大约40亿年的进化史,而人类的起源和进化大约只经历了400万年,约占整个生物进化史的1‰。人类是地球上最晚出现的一种智慧生物,人类起源于生物界,而又离不开生物界。在人类进化历史的绝大部分时期内,人类几乎完全依赖野生生物为生(靠狩猎和采集野生植物),只是在1万多年以前,当农业和畜牧业产生以后,人类才逐渐减少了对野生生物的依赖性(目前仍有许多国