海南捕鸟蛛毒素-Ⅰ(HNTX-Ⅰ)的1H-NMR信号归属和二级结构分析

海南捕鸟蛛毒素-Ⅰ(HNTX-Ⅰ)是从海南捕鸟蛛(Ornithoctonus hainana)的粗毒中纯化的一种新型神经毒素.应用二维1H-NMR技术研究HNTX-Ⅰ的溶液结构特点,通过分析水和重水中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY谱,识别出HNTX-Ⅰ全部33个氨基酸残基自旋体系;通过NOESY谱中的dαN、dβN、dNN和dαδ联系完成了序列专一的谱峰归属,从而确认了HNTX-Ⅰ所有的主链质子和大于96%的侧链质子的化学位移.并通过分析3JNH-CαH耦合常数、序列间的NOE联系以及慢氢交换质子等,确定HNTX-Ⅰ的二级结构主要是由三股反平行的β-折迭组成(Lys7-Cys9,Tyr20-Asn23和Trp28-Val31),这些结构特点与已经探明结构的其它蜘蛛毒素的基本相同.这些结果为完全解析HNTX-Ⅰ的溶液三维结构奠定了基础.     

海南捕鸟蛛毒素-Ⅰ(HNTX-Ⅰ)的1H-NMR信号归属和二级结构分析

海南捕鸟蛛毒素-I(HNTX-I)是从海南捕鸟蛛(Omithoctonus hainana)的粗毒中纯化的一种新型神经毒素．应用二维^H-NMR技术研究HNTX-I的溶液结构特点,通过分析水和重水中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY谱,识别出HNTX-I全部33个氨基酸残基自旋体系;通过NOESY谱中的dαN、dβN、dNN和dαβ联系完成了序列专一的谱峰归属,从而确认了HNTX-I所有的主链质子和大于96％的侧链质子的化学位移。并通过分析^1JNH-OxH耦合常数、序列间的NOE联系以及慢氢交换质子等,确定HNTX-I的二级结构主要是由三股反平行的β-折迭组成(Lys7-Cys9,Tyr20-Asn23和Trp28-Val31),这些结构特点与已经探明结构的其它蜘蛛毒素的基本相同．这些结果为完全解析HNTX-I的溶液三维结构奠定了基础。     

虎纹捕鸟蛛毒素-X的1H-NMR信号归属

虎纹捕鸟蛛毒素-X(huwentoxin-X,HWTX-X)是从虎纹捕鸟蛛(Ornithoctonus huwena)的粗毒中纯化的一种新型N-型电压敏感钙离子通道抑制剂.应用二维1H-NMR技术研究HWTX-X的溶液结构特点,通过分析水和重水中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY谱,识别出全部28个氨基酸残基自旋体系;利用NOESY谱中的dαN、dβN、dNN和dαδ联系完成了序列专一的谱峰归属,从而确认了HWTX-X所有的主链质子和大于95%的侧链质子的化学位移,为完全解析HWTX-X的溶液三维结构奠定了基础.     

虎纹捕鸟蛛毒素HWTX—Ⅱ的^1H—NMR信号归属和二级结构分析

虎纹捕鸟蛛毒素HWTX-Ⅱ是从虎纹捕鸟蛛Selenocosmia huwena的毒液中分离出的一种新型杀虫肽。应用2D－NMR技术研究该毒素分子的溶液结构特点,通过分析水及重水DQF－COSY、COSY、TOCSY和NOESY等^1H－NMR谱,识别出HWTX-Ⅱ全部37个氨基酸残基自旋体系;通过NOESY谱中的dαN、dαδ、dβN和dNN联系完成了序列专一的谱峰归属,确认了所有主链质子和除了Lys侧链εNH2质子外的所有侧链质子的化学位移,为完全解析HWTX-Ⅱ的溶液三维象奠定了基础,并且通过核磁数据分析,确定HWTX-Ⅱ的二级结构特点是含有较多的伸展构象,尤其是C端有一个典型的双股反平行的β折叠（Trp27-Cys29和Cys34-Lys36),分子中缺乏螺旋结构,这些二级结构特点与已探明结构的其他蜘蛛毒素的基本相同。     

新型抗菌多肽LC1的1H—NMR谱峰归属和二级结构分析

LC1是从枯草杆菌A0 14的分泌物中分离出的一种新型抗菌多肽 ,具有很强的抗水稻白叶枯致病菌的能力。应用 2D NMR技术研究LC1的溶液构象 ,通过分析其在水和重水中的DQF COSY、TOCSY和NOESY等1H NMR谱 ,识别了LC1全部 4 7个氨基酸残基的自旋体系 ,并通过分析NOESY谱中dαN、dNN、dβN和dαδ的联系完成了序列专一谱峰归属 ,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移。谱峰归属结果和NMR数据分析表明LC1的二级结构主要为伸展构象 ,其中肽段Phe2 5～Asp3 1和Tyr3 6～Glu42 构成反平行 β折叠 ,并由Ser3 2 ～Gly3 5所形成的β转角相连接。LC1不含或仅含少量α螺旋。同时 ,通过对LC1的大量疏水氨基酸残基之间NOE联系的分析 ,推测LC1具有一个以Trp2 3 为中心的疏水核心。     

虎纹捕鸟蛛凝集素-I(SHL-I)的核磁共振氢谱谱峰的完全归属

描述了从虎纹捕鸟蛛毒液分离的凝集素ＳＨＬ－Ｉ的核磁共振氢谱谱峰的完全归属。通过分析二维ＤＱＦ－ＣＯＳＹ,ＣＯＳＹ,ＴＯＣＳＹ和ＮＯＥＳＹ谱,鉴别出全部３２个氨基酸残基自旋体系。然后由ＣＯＳＹ,ＮＯＥＳＹ谱指纹区的ｄαＮ连系推测出序列专一归属,并得到了ＴＯＣＳＹ和ＮＯＥＳＹ谱中ｄαＮ,ｄＮＮ的验证。从而明确分辨了除Ｃｙｓ２外所有主链质子和大于９６％的侧链质子。这一结果为最终确定ＳＨＬ－Ｉ的溶液构象奠定了基础。     

耐热甜味蛋白brazzein的溶液NMR结构研究——二级结构和分子骨架

brazzein是从非洲西部野生植物PentadiplandrabrazzeanaBaillon的果实中提取的一种甜味蛋白 .在所有已知的甜味蛋白质中 ,brazzein的分子量最小 ,水溶性最好 ,并且具有很好的热稳定性 .利用二维核磁共振 ( 2DNMR)技术研究brazzein的溶液三维结构 ,完成了包括主链和侧链在内的所有质子共振峰的序列归属 .brazzein的二级结构包含一段α螺旋 ( 2 1～ 2 9) ,一段较短的 310 螺旋 ( 1 4～ 1 7)和两股反平行 β折叠 ( 34～ 39,44～ 5 0 ) ,分子N端可能形成了第 3股 β链 ( 5～ 7) .比较研究发现 ,该甜味分子骨架CSαβ与蝎毒、昆虫防卫素和植物抗菌蛋白γ 硫素的分子支架基本相同 .以此为基础 ,讨论了这种多功能分子支架的意义 ,可能的甜味活性中心及其热稳定性的结构基础 .     

2D－NMR归属两个合成十八肽的~1H共振谱线

ＢＢ１０４和ＪＫ分别是两个合成的十八肽,前者是与ａ－ＢＧＴＸ有结合作用的乙酰胆碱受体的活性部位,后者是前者的修饰多肽。为了研究发生结合作用时它们三维结构的变化,有必要首先归属它们的共振谱线。本文利用ＣＯＳＹ．ＴＯＣＳＹ、ＮＯＥＳＹ等２Ｄ－ＮＭＲ技术,对这两个十八肽的共振谱线进行了归属,这些归属为进一步研究它们与ＢＧＴＸ的相互作用奠定了基础。     

海南捕鸟蛛毒素-IV突变体的固相合成和生理活性分析

海南捕鸟蛛毒素_IV(HNTX-IV)是从我国海南捕鸟蛛粗毒中分离出的一种TTX-敏感型的钠离子通道阻断剂 ,由 35个氨基酸残基组成 ,含 3对二硫键。为了研究HNTX-IV结构与功能的关系 ,用芴甲氧羰基 (Fomc)固相多肽合成方法合成了用丙氨酸 (Ala)替代HNTX-IV第 12位丝氨酸 (Ser12 )的突变体S12A_HNTX_IV和替代第 29位精氨酸 (Arg29)的突变体R29A-HNTX-IV。合成的突变体经谷胱甘肽法氧化复性和纯化后 ,分别用MALDI-TOF质谱进行分子量鉴定 ,用一维核磁共振波谱法分析空间结构的变化 ,膜片钳电生理方法分析生物学活性。结果表明 ,Ser12和Arg29被Ala突变后没有明显影响分子的空间结构 ,S12A-HNTX-IV的生物学活性与天然HNTX-IV的相近 ,提示Ser12与HNTX-IV的生物学活性无关或关系不大 ;而R29A-HNTX-IV的生物学活性下降了155倍 ,说明Arg29是与HNTX-IV生物学活性相关的关键残基之一。推测R29A-HNTX-IV活性的降低是由于Ala替代Arg后改变了HNTX-IV与受体作用的位点,而不是由于毒素分子整体空间结构变化所致。     

杀菌肽及膜蛋白螺旋结构预测

杀菌肽是昆虫免疫系统的能够杀死细菌的一类重要的多肽。实验方法测蛋白质的二级结构很困难,汇集已有的八种预测螺旋结构的方法,通过计算机实现,对比杀菌肽、光合反应中心的预测结果和实验结果,推测了杀菌肽的作用机理．     

油松茎次生结构中树脂道的结构分布和发育的研究

油松茎的次生结构中树脂道存在于次生维管组织中。其中,次生木质部内具有水平的和垂直的两类树脂道,而次生韧皮部内则仅有水平的树脂道。两类树脂道都由上皮细胞和鞘细胞包围着胞间道构成,其中木质部内的树脂道具有死鞘细胞,而韧皮部中的则都系生活细胞。在心材中,垂直树脂道形成拟侵填体。在次生木质部内,垂直树脂道常分布于早材的外部区域和最初形成的晚材中,它们与水平树脂道连接,腔道贯通,从而形成二维网状结构。垂直树脂道来源于纺锤状原始细胞的衍生细胞,而水平树脂道来源于射线原始细胞,两者都以裂生方式发生。     

用模式识别方法预测膜蛋白RC、BR和RH的二级结构

膜蛋白的结构预测在目前比较困难.本文利用已建立的模式识别方法预测了三个典型的膜蛋白RC,BR和RH的二级结构,预测结果与实验资料的符合率与该方法用于球蛋白时的结果相仿,是成功的.本文进一步完善了模式识别预测蛋白质二级结构的方法.建立了针对球蛋白二级结构预测的多分类方法,预测精度大于60%.事实证明这是一种较好的结构预测方法,鉴于目前国内外运用模式识别方法进行结构预测研究的还不多见,我们拟进一步发展完善这一方法.     

二维核磁共振谱在二萜生物碱结构测定中的应用

本主综述了二维核磁共振谱在测定二萜类生物碱结构中的最近进展。     

付里叶变换红外光谱法研究胰岛素的二级结构

付里叶变换红外光谱法测定了胰岛素的二级结构,讨论了信/噪比、谱解析、曲线拟合和吸收组分的指认对结构测定的影响。测定的胰岛素二级结构与X—光结构分析结果吻合。     

P53蛋白质N末端的二级结构预测及其三维构象

以编码Ｐ５３Ｎ末端１２０个残基的ｍＲＮＡ二级结构为基础,结合Ｃｈｏｕ－Ｆａｓｍａｎ蛋白质二级结构预测原则,预测出Ｐ５３蛋白质Ｎ端的９３个残基包含四段α螺旋结构（１４－２６;３８－４６;５１－５６;６８－７０）,没有发现β片层。与四种以多重序列联配为基础的蛋白质二级结构预测方法（准确率均为７３．２０％左右）相对照,结果十分相近。在ＳＧＩ工作站上以此为初始结构建立的三维构象提示,Ｐ５３Ｎ末端前８０个氨基酸肽段呈弧型板块结构,其转录激活区由两段主要螺旋组成,呈上下构形,占据弧型板块的顶部及底部外侧缘。Ｃ端１３个富含脯氨酸肽段则呈弯曲松散状。这些构象与Ｐ５３Ｎ末端的生物功能是相吻合的     

抗菌多肽LC1的圆二色性和二级结构预测以及初步晶体学研究

由远紫外圆二色谱算得枯草杆菌Ａ０１４（Ｂａｃｉｌｌｕｓｓｐｐ．）所分泌的新型抗菌多肽ＬＣＩ在水溶液中的各种构象含量为：α螺旋４．７—６．０％,β折叠６７．２－７２．８％,无规卷曲和转角２１．１－２８．１％。对多种方法的二级结构预测结果进行综合分析表明,ＬＣＩ可能含有３个β转角,４个β折叠片段,仅含少量或不合α螺旋．晶体最大线度可达０．２×０．２×０．４ｍｍ,属于三方晶系。其六方Ｈ晶胞为ａ＝ｂ＝５１．２１空间群为Ｒ３２。