依赖细胞骨架的 mRNA 定位

mRNA定位是产生细胞极性的一种重要机制,在卵母细胞发生、早期胚胎发育及某些细胞特定功能的建立和维持中起重要作用。沿细胞骨架进行mRNA的主动转运是mRNA定位的主要机制之一,在mRNA的运输和锚定过程中,定位元件、特异的RNA结合蛋白、发动蛋白和细胞骨架分别起着重要的作用。     

真核细胞中mRNA的降解机制

细胞中不同的ｍ ＲＮＡ 半寿期差异很大,ｍ ＲＮＡ 的稳定性受到多种因素的影响,现在已经发现了许多对ｍ ＲＮＡ 的稳定性有影响的顺式因子和反式因子。大量的研究证明在真核细胞内存在复杂的机制调节ｍ ＲＮＡ 的稳定与降解及其所引起的基因表达。现在可以肯定在真核细胞中至少存在着三种ｍ ＲＮＡ的降解方式：依赖于脱腺苷酸的降解,无义密码介导的ｍ ＲＮＡ 的降解和核酸内切酶的水解。其中依赖于脱腺苷酸的降解方式是细胞内大多数ｍ ＲＮＡ 降解的主要途径。     

慢性束缚应激大鼠海马脑啡肽mRNA和前强啡肽mRNA 表达及中药复方的影响

目的:研究慢性束缚应激时大鼠海马脑啡肽和前强啡肽mRNA基因表达的变化以及逍遥散、四君子汤、金匮肾气丸三种中药复方对其的影响.方法:用特制束缚架连续束缚7 d与21 d,每天3 h的方法制作大鼠束缚应激模型;以RT-PCR反应,扩增脑啡肽和前强啡肽基因,同时以β-actin作为内对照,用凝胶图像分析系统进行扫描并分析,把目的基因的光密度与内参照条带的光密度进行比较后进行半定量分析.结果:7 d模型组大鼠海马前强啡肽mRNA的表达明显增强(P＜0.01),21 d模型组海马脑啡呔mRNA和前强啡肽mRNA的表达明显增强(P＜0.01);三个复方均能降低海马内前强啡肽mRNA的表达(P＜0.01),逍遥散和四君子汤能降低脑啡呔mRNA的表达(P＜0.01).结论:逍遥散对脑啡呔mRNA前强啡肽mRNA的基因表达的改善作用明显优于金匮肾气丸组.     

寻找mRNA的选择性剪接

在真核生物的基因中,mRNA选择性剪接现象十分普遍。mRNA选择性剪接导致一个基因多转录本的产生,被认为是高等生物增加蛋白质多样性的主要机制,且已发现与许多人类疾病密切相关。发现这些转录本的选择性剪接位点、新的外显子和外显子组合,乃至获得这些剪接变异体的完整克隆,对于基因功能的深入研究十分必要。简要介绍了几种在mRNA水平探索选择性剪接的方法。     

两种哺乳动物mRNA的编辑

ＲＮＡ编辑的研究始于１９８６年Ｂａｎｎｅ等［１］对锥虫（ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａｔｉｄｓ）线粒体ｍＲ－ＮＡ中插入非编码尿嘧啶的研究。此后,又在植物及一些低等生物的线粒体或叶绿体中相继发现了以尿嘧啶插入ｍＲＮＡ为编辑模式的ＲＮＡ编辑。哺乳类中载脂蛋白Ａｐ...     

发展中的mRNA差别显示技术

随着ＰＣＲ技术的出现（１９８５）,在分子生物学界又相继出现了两个很有影响的新技术──ＲＡＰＤ技术（１９９０）和ｍＲＮＡ差示法（１９９２）,前者用于分子标记,后者用于基因分离。ｍＲＮＡ差示法的生物学基础是基因的差别表达,既：单个细胞中表达的基因仅占基因总数的１５％。这种基因的差别表达决定了生命的所有过程,如：发育和分化、对逆境的反应、细胞分裂、老化等,图一给出了该方法最初的技术路线。提取要比较的两种或两种以上样品的ｍＲＮＡｓ,分别逆转录成ｃＤＮＡｓ,经过ＰＣＲ扩增后,直接进行测序胶电泳即可识别有差别的ｍＲＮＡ。其中、关键的是ＰＣＲ扩增时两个引物的设计．３＇端引物Ｏｌｉｇｏ（ｄＴ）ＭＮ很容易与具有Ｎ＇Ｍ＇－ｐｏｌｙ（Ａ）－３＇末端的大多数ｍＲＮＡ结合,进行ｃＤＮＡ的逆转录合成。Ｍ、Ｎ提供锚定位点,防止３＇端引物在ｐｏｌｙ（Ａ）序列不同位置上的随机结合。５＇端为１０个碱基的随机引物。这个经验上的碱基数值较理论的６－７个碱基（表一）更能满足测序胶电泳要求的条件：分子大小在５００ｂｐ左右,每条泳道上条带数在１００条左右。该方法近年来又有如下改进：一、ＰＣＲ退火温度由４２℃改为４０℃,可在保证特异性的同时,增加泳道上的     

细菌mRNA的提取方法

mRNA提取技术不仅是分子生物学技术的重要组成部分 ,也是功能基因组学科研技术的重要基础。随着细菌的后基因组时代的到来 ,寻求一种有效的提取细菌mRNA的方法成为迫切需要解决的问题。介绍细菌mRNA的特点、提取方法、标记和稳定性问题。     

mRNA差异显示条件的优化

运用优化的mRNA差异显示技术分离受内生真菌诱导的差异基因。优化差异显示条件表现在增如指定引物和随机引物的长度、改变PCR参数和再扩增程序、运用银染显色等。应用这些条件共获得7个阳性差异片段。用未优化的PCR程序1筛选35条差异带,得到3个两端均为随机引物的差示片段。而用优化的PCR程序2,52条差异带中得到9条只能用锚定引物和随机引物才能扩增出的片段。地高辛标记的反向-Northern鉴定为阳性后进行克隆和测序。PCR方法1所得的3个差示片段均无开放的阅读框。PCR程序2得到7个差异表达的基因中,2个为已知基因,5个为未知基因。因此可运用优化的差显技术分离差异表达的基因。     

mRNA 5′端二级结构的预测法

研究mRNA 5′端二级结构有什么重要性呢?下面的例子可以说明这个问题:如果在接近剪接位点的编码序列内有二级结构, 就会影响基因的转录;在引物中有二级结构(如发夹)就会抑制PCR反应;如果在合成的基因序列的5′末端有二级结构会干扰它在表达系统的翻译, 降低基因表达产物的产量, 这不仅提高了生产成本, 还给生产工艺等带来极大麻烦.此外, RNA5′末端形成二级结构所需要的能量也影响基因产物的产量.所以, 要想在基因表达系统中得到大量的基因产物就必须考虑这些问题, 并对所克隆基因5′末端的结构和它形成二级结构所需要的自由能进行分析, 并在此基础上对氨基酸的简并密码子进行选择, 以获取最满意的结果.可见, 这是一个在理论上和实践上都有重要意义的问题.在基因工程产品的开发过程中, 对这些问题的认识与运用具有不可估量的经济价值.     

异二聚体介导的mRNA核输出机制

真核生物mRNA在细胞核内被转录,而到达细胞质内翻译成为蛋白质,因此跨越核孔的核输出过程是必须的。现在已确定异二聚体TAP/NXT(在酵母中为Mex67p/Mtr2p)在此过程中是最基本的元件,此外其他相关因子如Aly、UAP56等也参与了这个复杂的过程,包括结合、输出、解离和载体输入。本文简要介绍了mRNA输出的基本机制。     

mRNA结构及其稳定性的关系

mRNA结构与mRNA稳定性关系密切,mRNA稳定性与基因表达调控之间也有着紧密的联系。现从mRNA结构中所含的5'端帽结构、3'端poly(A)尾、5'非翻译区、3'非翻译区、编码区、富AU元件等方面综述了mRNA结构与mRNA稳定性之间的关系,为深入了解基因表达调控的分子机制提供理论基础。     

真核生物mRNA 3'非翻译区的功能

真核牛物mRNA的3'非翻译区的功能复杂多样,不仅能调控其mRNA的稳定性、控制mRNA的亚细胞定位,而且还在特定氨基酸的编码过程中起着指导作用.一些真核生物mRNA的3'非翻译区内的突变可引起疾病的发生.近几年的研究义发现,一些真核生物mRNA的3'非翻译区还具有抑制肿瘤生长的功能.     

mRNA 5'端发卡结构与翻译的起始调控

mRNA的5’端大多存在各种由RNA自身折叠形成的发卡结构,这些结构对于核糖体识别mRNA翻译起始位点并与之准确结合往往具有十分重要的意义。简要综述了此类结构的基本特征以及它们在生物体内所起到的调控蛋白质翻译的作用。     

真核生物mRNA非翻译区结构特征与mRNA翻译

真核生物中蛋白质合成通常在翻译水平受到调控,而mRNA非翻译区与mRNA翻译之间关系密切。真核生物mRNA非翻译区长度、mRNA二级结构、GC含量、顺式作用元件与反式作用因子、mRNA帽端结构和多聚腺苷酸尾等结构对翻译具有重要的调控作用。本文就真核生物mRNA非翻译区结构特征对其翻译的影响做一综述。     

Processing bodies are not required for mammalian nonsense-mediated mRNA decay

Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a eukaryotic quality-control mechanism that recognizes and degrades mRNAs with premature termination codons (PTCs). In yeast, PTC-containing mRNAs are targeted to processing bodies (P-bodies), and yeast strains expressing an ATPase defective Upf1p mutant accumulate P-bodies. Here we show that in human cells, an ATPase-deficient UPF1 mutant and a fraction of UPF2 and UPF3b accumulate in cytoplasmic foci that co-localize with P-bodies. Depletion of the P-body component Ge-1, which prevents formation of microscopically detectable P-bodies, also impairs the localization of mutant UPF1, UPF2, and UPF3b in cytoplasmic foci. However, the accumulation of the ATPase-deficient UPF1 mutant in P-bodies is independent of UPF2, UPF3b, or SMG1, and the ATPase-deficient UPF1 mutant can localize into the P-bodies independent of its phosphorylation status. Most importantly, disruption of P-bodies by depletion of Ge-1 affects neither the mRNA levels of PTC-containing reporter genes nor endogenous NMD substrates. Consistent with the recently reported decapping-independent SMG6-mediated endonucleolytic decay of human nonsense mRNAs, our results imply that microscopically detectable P-bodies are not required for mammalian NMD.