miR-21 和miR-155在系统性红斑狼疮患者外周血B 细胞中的表达及意义

目的：探讨miR-21 和miR-155 在系统性红斑狼疮患者外周血B 细胞中的表达及意义。方法：将93 例系统性红斑狼疮(SLE) 患者根据SLEDAL评分分为轻度活动组(n=49)和中重度活动组(n=44),并选择40 例健康者作为对照组,采用实时荧光定量PCR 技术检测其外周血B细胞中miR-21、miR-155、骨形成蛋白-2(BMP-2)和骨形成蛋白受体Ⅱ(BMPRⅡ)的表达。结果：SLE 患者外 周血B 细胞中miR-21 和miR-155 相对表达量均高于对照组(P<0.05),中重度活动组患者外周血B 细胞中miR-21 和miR-155 相 对表达量均高于轻度活动组和对照组,且轻度活动组高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);SLE 患者外周血B 细胞中 BMP-2 mRNA 和BMPRⅡ mRNA 相对表达量均高于对照组(P<0.05),中重度活动组患者外周血B 细胞中BMP-2 mRNA和BMPR Ⅱ mRNA 相对表达量均高于轻度活动组和对照组,且轻度活动组高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析显 示SLE 患者外周血B 细胞中miR-21 和miR-155 相对表达量与BMP-2 mRNA和BMPRⅡ mRNA均呈正相关(r=0.292、0.365 和 0.481、0.279,P<0.05),SLE 患者外周血B细胞中miR-21 和miR-155 相对表达量均与补体C3 和补体C4 水平呈显著负相关(r=-0. 570、-0.289 和-0.751、-0.308,P<0.05)。结论：miR-21 和miR-155 在SLE 患者外周血B细胞中呈高表达,可能通过BMP信号通路 异常活化而发挥作用,且与补体C3 和C4 呈负相关,有望作为监控SLE 患者病情的参考指标。     

Caspase-9选择性剪切及其在非小细胞肺癌治疗中的应用

越来越多的证据指出前体mRNA选择性剪切的调节在癌症病理生理学上的重要性.在非小细胞肺癌(NSCLC)的发生及发展中caspase-9 mRNA的选择性剪切发挥着重要作用,caspase-9的2个剪切异构体caspase-9a和caspase-9b的比值与NSCLC肿瘤的发生和维持密切相关,并且调节该比值关系会影响到NSCLC细胞对于抗癌治疗的敏感性.因此,caspase-9的选择性剪切是目前NSCLC治疗和诊断最受关注的焦点.本文就caspase-9的选择性剪切及其在NSCLC治疗中的应用展开综述.     

大鼠睾丸黄体生成素受体剪切变异体cDNA在昆虫细胞中的高效表达

研究了大鼠睾丸黄体生成素受体剪切变异体ｃＤＮＡ在昆虫细胞中的表达,并对其产物性质作了初步鉴定。ＳＤＳＰＡＧＥ银染和免疫印迹结果显示,表达产物呈两条带,分子量为３８.５ｋＤａ的主带和分子量为４０ｋＤａ的次带。^１２５Ｉ.ｈＣＧ结合印迹分析表明,表达产物Ｒ３１６具有与配基专一性结合的生物活力。竞争性配基结合曲线和Ｓｃａｔｃｈａｒｄ分析结果显示,重组受体Ｒ３１６和配基ｈＣＧ有较高的亲和力,平衡解离常数Ｋｄ为８.１５×１０^－１０ｍｏｌ／Ｌ。表达产物为与膜结合的蛋白,在条件培养基中未检测到它的存在     

系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞Toll样受体9的表达及血清白介素-10水平的研究

目的:研究Toll样受体9(TLR-9)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血单个核细胞(PBMCs)上的表达水平及SLE患者血清白介素-10水平,探讨发病机制。方法:从23例活动期、19例缓解期SLE患者和20例正常对照组中分离PBMCs,利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测PBMCs中TLR9 mRNA的表达水平,利用酶联免疫吸附试验法检测其血清白介素-10水平。结果:活动期SLE患者PBMCs的TLR-9mRNA表达高于缓解组(P<0.01)及正常对照(P<0.01),缓解期和正常对照组相比,差异无统计学意义(P>0.05)。SLE活动期患者血清IL-10水平显著高于缓解期患者(P<0.01),并均高于正常对照组(P<0.01)。结论:活动期SLE患者PBMC的TLR9 mRNA的表达水平增高;并且活动期及缓解期SLE患者血清IL-10水平升高可能与TLR9 mRNA表达的上调相关。     

CD11b在小鼠急性结肠炎模型中的表达及鼠李糖乳杆菌的调节作用

目的 研究CD11b在炎症性肠病模型小鼠结肠组织中的表达及定位,探讨鼠李糖乳杆菌(LGG)对CD11b的调节作用.方法 将28只SPF级小鼠随机分为3组:Ctrl组8只、DSS组10只、DSS+LGG组10只,给予3％ DSS自由饮用建立急性结肠炎模型,DSS+ LGG组小鼠提前1周管饲LGG共14 d;模型建立期间观...     

小鼠植入前胚胎及几种组织中IFRG15的差异表达研究

为进一步研究干扰素α应答基因IFRG15（Interferon responsive gene 15）在小鼠整个发育过程中的表达规律,从植入前胚胎及2、5、16周龄的雌、雄昆明小白鼠心、肝、脾、肺、肾、肌肉、卵巢或睾丸等组织中提取总RNA,以HPRT1（Hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1）为内参基因,利用RT-PCR的方法进行目的片段的扩增及差异性分析。结果表明,IFRG15在植入前胚胎8-细胞期,桑葚胚期开始显著高表达于受精卵、2-细胞期、4-细胞期（p〈0.05）,在囊胚期表达量达到最高,且显著高于其他各期（p〈0.05）;在雌雄小鼠几个组织体外发育过程中均检测到表达,但表达量有所不同,在雄性小鼠各组织中的表达无显著规律性差异;在5周龄雌性小鼠组织中达到最高（p〈0.05）,卵巢组织尤为明显,推测该基因对卵巢的成熟有重要的促进作用;本实验成功获得IFRG15在小鼠植入前各期胚胎及体外发育过程中的表达模式,为进一步探究该基因在小鼠克隆胚发育过程中的作用奠定基础。     

未经刺激的静止CD4+T细胞与克隆CD4+T细胞在抗原特异的及主要组织相容性抗原限制的无能诱导中的差异及其意义

在体外克隆T细胞中,T细胞无能可在多种条件下诱导产生,但T细胞在体内条件下的无能诱导仍有很多疑问和争议。由于正常动物体内对单一抗原特异应答的T细胞频率太低,从体内新提取未经刺激的T细胞进行无能诱导研究一直存在技术上的困难。本文利用HNT—TCR转基因小鼠高度单一的针对HA多肽抗原的CD4^ T细胞群体,以T细胞增殖反应作为检测方法,比较研究了克隆CD4^ T细胞和新提取未经刺激的CD4^ T细胞对无能诱导的反应。结果表明,经化学交联剂l—ethyl-3-3(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide(ECDI)处理的抗原提呈细胞(APC)与流感病毒血细胞凝集素(HA)多肽诱导在克隆CD4^ T细胞中产生了无能,这种无能是依赖于特异抗原和主要组织相容性抗原(MHC)的;而在同样条件下,新提取未经刺激的CD4^ T细胞则不能被诱导产生无能。结果提示,体内T细胞与克隆T细胞存在功能上的不同,体内T细胞的无能诱导可能需要不同的条件。这对体内T细胞免疫耐受产生的机制研究和临床应用都有重要意义。     

过敏毒素受体(C3aR)在db/db糖尿病肾病小鼠肾脏中的表达及病理意义分析

利用半定量RT-PCR、免疫组化和Western blotting的方法,同时从mRNA水平和蛋白质水平对过敏毒素受体(C3aR)在不同病理阶段的2型糖尿病肾病模型小鼠——db/db小鼠肾脏中的表达情况进行了较为系统的分析．结果发现：a．在糖尿病前的db/db小鼠(4周龄的db/db小鼠),C3aR与作为正常对照的db/m小鼠相比没有明显差异．随着肥胖的加剧,高血糖、蛋白尿的发生和发展,C3aR在db/db小鼠肾脏中的表达显著升高．b．免疫组化分析显示,C3aR广泛地表达于db/m和db/db小鼠肾脏的皮质和髓质,分布于肾脏的上皮细胞中(包括肾小管上皮细胞、肾小球中的脏层上皮细胞(足细胞)和壁层上皮细胞)．从部位来看,皮髓交界处的肾小管中C3aR表达量明显要比其他部位的多．在肾小球,C3aR特异地存在于足细胞部位．在db/m小鼠,不同周龄小鼠肾脏中C3aR的表达量并没有明显变化,但在db/db小鼠,从8周龄开始,分布在db/db小鼠肾小管上皮细胞和小球足细胞中的C3aR均随小鼠周龄的增加而增加,至少在时间上,与小鼠糖尿病肾病的发生发展相关,其中尤以足细胞中和皮髓交界处肾小管上皮细胞中的变化最为明显． c．在糖尿病肾病小鼠中高表达C3aR的肾小管上皮细胞常有空泡变性的情况．上述工作印证了先前对2型糖尿病肾病患者肾小球基因表达谱的分析结果,更加明确了C3aR与糖尿病肾病的相关性,同时揭示了C3aR在正常小鼠和糖尿病肾病小鼠肾脏中的表达、分布和变化规律,有利于进一步揭示C3aR的功能及其在糖尿病肾病发生、发展过程中的可能作用,探讨糖尿病肾病的分子机制．     

大鼠卵巢促黄体激素/人绒毛膜促性腺激素受体cDNA的克隆和在昆虫细胞中的高效表达

促黄体激素/人绒毛膜促性腺激素受体(LH/hCG receptor)是一种与G-蛋白偶联的糖蛋白。本文报道了从大鼠卵巢cDNA库中筛选LH/hCG受体cDNA及其在昆虫细胞中的高效表达。LH/hCG受体cDNA全长2403bp,编码受体信号肽和成熟受体674个氨基酸。用多角体病毒表达载体pVL1393,LH/hCG受体cDNA在昆虫细胞中得到高效表达。在非还原和还原条件下的SDS-PAGE分析显示,用亲和层析分离纯化的受体表观分子量分别为120Kd和92Kd。经配基结合和Scatchard Plot分析表明,其与hCG反应的Kd为8.4×10~(-9)mol/L,与CHO细胞表达产物相似。     

过表达miR-31对结肠炎模型小鼠TLR4/NF-κB信号通路及凋亡蛋白的调控

目的: 探讨miR-31对DSS诱发结肠炎小鼠TLR4/NF-κB信号通路和凋亡相关蛋白的影响。方法: ①小鼠结肠炎实验:用1%葡聚糖硫酸钠(DSS)诱发小鼠溃疡性结肠炎(UC)。14只FVB非转基因小鼠随机分为control组(n=6),DSS组(n=8),16只FVB miR-31转基因小鼠随机分为miR-31过表达组(n=8),miR-31过表达+DSS 组(n=8),DSS溶于水后通过饮水给予小鼠。DSS组和miR-31+DSS组第一周饮用1%DSS水,第二周饮用正常无菌水,第三周饮用1%DSS水,如此5周后造模完成,之后留取小鼠的结肠组织,通过Western blot和IHC检测小鼠结肠组织NF-κB p65、TLR4、Bax、Bcl-2蛋白的表达;TUNEL检测小鼠结肠组织细胞凋亡。②细胞培养实验:在人结肠上皮细胞系HCT 116细胞中通过脂质体转染的方法转染miR-31 mimic和inhibitor,使miR-31过表达或敲低,每组均进行三次重复,48 h后收取细胞,通过Western blot检测NF-κB p65、TLR4蛋白的表达。结果: ①动物实验中,与control组相比,小鼠结肠组织中DSS组和miR-31过表达组NF-κB p65、TLR4蛋白表达水平和凋亡细胞指数均显著升高(P＜0.05或P＜0.01),Bcl-2/Bax比值显著降低(P＜0.05或P＜0.01);且与DSS组相比,miR-31+DSS组NF-κB p65、TLR4蛋白表达水平和凋亡细胞指数也显著升高(P＜0.01),Bcl-2/Bax比值显著降低(P＜0.01)。②细胞实验中,与control组相比, HCT 116细胞过表达miR-31组的NF-κB p65、TLR4蛋白表达水平均显著升高(P＜0.05或P＜0.01),敲低miR-31组的NF-κB p65、TLR4蛋白表达水平下降(P＜0.05)。结论: miR-31通过促进TLR4/NF-κB信号通路和介导肠上皮细胞凋亡促进结肠炎的发展。     

A Genome-Wide Analysis of the Gene Expression and Alternative Splicing Events in a Whole-Body Hypoxic Preconditioning Mouse Model

Exposure to specific doses of hypoxia can trigger endogenous neuroprotective and neuroplastic mechanisms of the central nervous system. These molecular mechanisms, together referred to as hypoxic preconditioning (HPC), remain poorly understood. In the present study, we applied RNA sequencing and bioinformatics analyses to study HPC in a whole-body HPC mouse model. The preconditioned (H4) and control (H0) groups showed 605 differentially expressed genes (DEGs), of which 263 were upregulated and 342 were downregulated. Gene Ontology enrichment analysis indicated that these DEGs were enriched in several biological processes, including metabolic stress and angiogenesis. The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analysis showed that the FOXO and Notch signaling pathways were involved in hypoxic tolerance and protection during HPC. Furthermore, 117 differential alternative splicing events (DASEs) were identified, with exon skipping being the dominant one (48.51%). Repeated exposure to systemic hypoxia promoted skipping of exon 7 in Edrf1 and exon 9 or 13 in Lrrc45. This study expands the understanding of the endogenous protective mechanisms of HPC and the DASEs that occur during HPC.

     

内源CD133~+细胞示踪小鼠模型的制备和鉴定

目的:为了制备可追踪CD133阳性神经干细胞分化谱系的小鼠模型。方法:将两种C57B16背景的转基因小鼠CD133-Cre-ERT2和Rosa26-CAG-LSL-ZsGreen杂交,获得CD133-Cre ER;CAG-ZsGreen小鼠模型。结果:免疫组化和激光扫描共焦成像分析表明,经Tamoxifen作用后,该杂交小鼠在侧脑室SVZ区、第三脑室和第四脑室的室管膜区域均表达绿色荧光蛋白ZsGreen,且这些区域的绿色荧光与CD133~+红色荧光重合。结论:在室管膜区CD133~+是静息态神经干细胞的标志,因此,通过分析CD133-Cre ER;CAG-ZsGreen小鼠中的ZsGreen阳性细胞可追踪神经干细胞的细胞分化谱系。成功制备了内源CD133~+细胞示踪小鼠模型,为探讨大脑中CD133~+神经干细胞的激活、增殖、迁移和分化提供了帮助。     

人受精促进肽受体基因（TCP11b）的剪接、克隆和差别表达

运用同源比较和PCR法 ,从人睾丸组织中分离了人受精促进肽受体TCP11基因的一个新的剪切体TCP11b ,它编码 5 0 3个氨基酸的蛋白质 ,与TCP11a相比 ,在基因组的 5′端存在复杂的外显子剪接现象。运用荧光原位杂交 (FISH)方法 ,显示该基因定位到人染色体 6p2 1。Northern杂交及多组织RT PCR的结果显示该转录本在正常睾丸中表达 ,而其他组织、无精症患者及胎儿睾丸组织中未见该基因的表达。该结果结合mTcp 11功能的提示 ,TCP11b这种转录本对精子发生和人受精过程可能起重要作用。     

Alternative Splicing Results in Differential Expression, Activity, and Localization of the Two Forms of Arginyl-tRNA-Protein Transferase, a Component of the N-End Rule Pathway

The N-end rule relates the in vivo half-life of a protein to the identity of its N-terminal residue. The underlying ubiquitin-dependent proteolytic system, called the N-end rule pathway, is organized hierarchically: N-terminal aspartate and glutamate (and also cysteine in metazoans) are secondary destabilizing residues, in that they function through their conjugation, by arginyl-tRNA-protein transferase (R-transferase), to arginine, a primary destabilizing residue. We isolated cDNA encoding the 516-residue mouse R-transferase, ATE1p, and found two species, termed Ate1-1 and Ate1-2. The Ate1 mRNAs are produced through a most unusual alternative splicing that retains one or the other of the two homologous 129-bp exons, which are adjacent in the mouse Ate1 gene. Human ATE1 also contains the alternative 129-bp exons, whereas the plant (Arabidopsis thaliana) and fly (Drosophila melanogaster) Ate1 genes encode a single form of ATE1p. A fusion of ATE1-1p with green fluorescent protein (GFP) is present in both the nucleus and the cytosol, whereas ATE1-2p–GFP is exclusively cytosolic. Mouse ATE1-1p and ATE1-2p were examined by expressing them in ate1Δ Saccharomyces cerevisiae in the presence of test substrates that included Asp-βgal (β-galactosidase) and Cys-βgal. Both forms of the mouse R-transferase conferred instability on Asp-βgal (but not on Cys-βgal) through the arginylation of its N-terminal Asp, the ATE1-1p enzyme being more active than ATE1-2p. The ratio of Ate1-1 to Ate1-2 mRNA varies greatly among the mouse tissues; it is ~0.1 in the skeletal muscle, ~0.25 in the spleen, ~3.3 in the liver and brain, and ~10 in the testis, suggesting that the two R-transferases are functionally distinct.     

基于RNA-Seq数据识别果蝇剪接位点和可变剪接事件

完整基因结构的预测是当前生命科学研究的一个重要基础课题,其中一个关键环节是剪接位点和各种可变剪接事件的精确识别.基于转录组测序（RNA-seq）数据,识别剪接位点和可变剪接事件是近几年随着新一代测序技术发展起来的新技术策略和方法.本工作基于黑腹果蝇睾丸RNA-seq数据,使用TopHat软件成功识别出39718个果蝇剪接位点,其中有10584个新剪接位点.同时,基于剪接位点的不同组合,针对各类型可变剪接特征开发出计算识别算法,成功识别了8477个可变剪接事件（其中新识别的可变剪接事件3922个）,包括可变供体位点、可变受体位点、内含子保留和外显子缺失4种类型.RT-PCR实验验证了2个果蝇基因上新识别的可变剪接事件,发现了全新的剪接异构体.进一步表明,RNA-seq数据可有效应用于识别剪接位点和可变剪接事件,为深入揭示剪接机制及可变剪接生物学功能提供新思路和新手段.     

水牛CD14 cDNA的克隆、表达及鉴定

目的:克隆水牛白细胞分化抗原14(buffalo cluster of differentiation antigen14,bCD14)基因,表达bCD14蛋白,并进行Western Blot鉴定.方法:采用RT-PCR方法从水牛外周血白细胞中扩增bCD14基因,构建重组质粒pET28a-bCD14,转化入E coli BL21,IPTG诱导表达,对表达蛋白进行可溶性分析及Western blot鉴定.结果:bCD14基因含有一个1 122bp的开放阅读框,编码373个氨基酸;与印度水牛、挪威大鼠和人CD14的cDNA序列同源性分别为97.95%、68.78%、78.60%,氨基酸同源性分别为96.78%、61.27%、72.34%;主要以包涵体形式表达,表达蛋白经Western Blot鉴定,得到了一条约46 kD的特异性条带.结论:该文成功克隆了bCD14基因,表达了bCD14蛋白,为进一步揭示水牛抵抗革兰氏阴性菌感染的免疫机制奠定了基础.     

拟南芥不同组织基因表达及可变剪接差异分析

可变剪接是转录后重要的基因表达调控方式,也是转录组和蛋白质组多样性的重要来源. 近年来随着拟南芥、水稻、玉米等植物转录组测序的完成,研究人员发现植物pre-mRNA可变剪接的发生与组织分化、发育等生物学过程密切相关. 本工作基于GEO数据库的RNA-seq数据,使用高通量测序数据分析常用的Trimmomatic、Salmon、DESeq2、SUPPA2等工具,识别了拟南芥的种子、根、叶、花、花梗、节间、长角果共7种组织的表达基因和可变剪接事件,以及7种组织间的差异表达基因和差异可变剪接事件,并以叶和花为例展示了相应的生物学功能分析. 该工作系统地研究了拟南芥基因表达和可变剪接发生的组织特异性,有助于进一步阐明植物基因组的基因表达调控机制.     

KAI1/CD82 在早孕小鼠子宫内膜组织的表达研究

目的：观察KAI1／CD82 mRNA和蛋白在小鼠妊娠D1-D8子宫内膜组织的表达。方法：以胚胎与肿瘤同源性为理论基础,胚胎植入与肿瘤侵袭转移相似为切入点,采用免疫组化和RT-PCR技术。结果：KAI1／CD82 mRNA和蛋白在早孕子宫中,KAI1／CD82mRNA的表达渐增多,蛋白表达的量和范围也渐增强。结论：KAI1／CD82mRNA和蛋白在早孕子宫组织中的动态表达,提示它在胚胎精确侵袭子宫内膜的调节中发挥作用,是滋养层细胞精确侵袭调控的分子机制之一。