S180克隆细胞株的选择及其细胞特性研究

目的 对北京市肿瘤研究所及本实验动物学部保存的S180进行了克隆培养,根据克隆细胞的腹水生长特性,从中选出8株克隆,对不同克隆S180细胞的特性进行研究。方法 免疫组化法测不同克隆细胞的蛋白质分布,流式细胞仪测定不同克隆细胞的DNA含量,扫描电镜观察克隆细胞表面结构,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测克隆细胞的电泳图谱。结果 其中3株克隆从可见腹水之日起,腹水即为血性;1株微显血性;4株在接种腹腔7日内腹水无血性。扫描电镜观察6株克隆细胞表面结构,各具特点,有所不同。流式细胞仪测定6株不同S180克隆细胞DNA含量,分别为8.5, 9.3,7.9,8.5,8.6,8.3pg。免疫组化染色显示不同克隆与11种抗体反应有所不同,一旦与某抗体反应阳性,则阳性细胞比率均在97%以上。SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定克隆细胞S1H10及S2D9的电泳图谱,S1H10克隆细胞有33条带,S2D9克隆细胞有30条带。 结论 8株克隆细胞各具特点。     

生物素标记的6种cDNA探针检测S180及其克隆细胞株mRNA的表达

目的检测S180及其克隆细胞株S1B11及S2D9mRNA的表达,对这些细胞株进行识别和质量控制.方法用生物素标记的6种cDNA探针,细胞玻片原位杂交的方法检测细胞中mRNA的表达.结果北京市肿瘤研究所(肿瘤所)保存的S180与生物素标记的P16、c-fos、c-myc及c-jun探针杂交阳性,克隆细胞株S1B11与c-fos及c-jun探针杂交阳性,克隆细胞株S2D9与c-fos、c-myc及c-jun探针杂交阳性.结论肿瘤所S180及其2株克隆细胞中mRNA的表达不同,c-myc基因的表达与否可以把S1B11及S2D9克隆细胞区别开;细胞株致瘤性与癌基因表达有关.     

不同单位保种的S180细胞核型及DNA含量的比较研究

对四个单位保种的S180 细胞经KM 小鼠腹腔传代,体外培养加秋水仙碱,涂片、染色后,显微镜下计数染色体数目:腹水传代的S180 细胞,用70 % 乙醇固定,流式细胞仪测DNA 含量。结果如下:本学部( 本部) ,中国医学科学院药物所( 药物所) ,武汉大学保种中心( 武汉大学) 和北京市肿瘤所( 肿瘤所) 保种的S180 细胞株,其染色体均数分别为62-8 ±22-8 ,69-1 ±21-2,39-9 ±8-26 ,58-7±9-75 条。四单位S180 细胞株染色体数做方差分析表明,除肿瘤所与本部外,其它两单位比较均有显著统计学差异(P< 0-01) 。直方图分析显示主流染色体范围分别为56 ～60 ,61 ～65,41 ～45,61 ～65 条。流式细胞术DNA 含量分析表明肿瘤所S180 DNA含量最多,武汉大学保种的S180 细胞的DNA含量最少。这些结果均证明四个单位的S180 细胞株在一些方面已出现显著差异。     

红松RAPD实验中各组成成份含量对实验结果的影响

本文采用Ｐｒｏｍｅｇａ的ＰＣＲ反应系统,以从红松幼叶中提取的总ＤＮＡ为模板,进行随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）实验。     

基于RAPD分析用百合DNA的提取

对百合DNA的提取过程进行改良和优化,筛选出较理想的DNA提取方法。结果表明,该方法提取的百合DNA在1％的琼脂糖胶电泳上为清晰的一条带,RNA去除干净,无降解现象,分子量大于23kb,OD200nm/OD280nm值为1．80-2．00。DNA的质量符合百合RAPD（随机扩增多态DNA）分析要求,在百合遗传多态性分析和品种分子鉴定中具有良好的应用前景．     

RAPD影响因素的研究及实验条件的优化进

针对叶种红松和阔叶树种蒙古栎为材料,研究了随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）的影响因素,优化了各种实验条件。ＲＡＰＤ对模板浓度的适应范围比较广,从１０－８０ｎｇ／反应均可得到一致的效果。     

丁不同群体间形态学差异与随机扩增多态DNA(RAPD)分析

采用聚类分析、主成分分析和判别分析3种数理统计方法,对我国新疆朱家湖丁群体7、3水库丁群体和从捷克引进我国的丁群体的可量性状和框架参数进行分析。聚类分析和主成分分析显示,朱家湖群体与73水库群体较为接近,而捷克群体与前两群体相距较远。判别分析亦可将捷克群体与前两群体分开,准确率达100%。从60个随机引物中筛选出的20个引物对丁朱家湖群体、73水库群体和捷克群体进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析。引物S440在捷克群体扩增出的450bp片段为该群体特有的标记片段。朱家湖群体、73水库群体、捷克群体多态位点比例分别为24%、22.67%和18.42%;群体内遗传相似度分别为0.8967、0.9035和0.9309;遗传多态度(π)分别为0.1539、0.1489和0.1142。表明朱家湖群体保持着较高的遗传变异。三群体间的遗传相似度为0.6868—0.9496,群体遗传分化系数(Fst)为0.048—0.238,分子方差分析发现群体内方差占总方差的83.96%,群体间的方差只占16.04%,由此推断三群体间遗传分化并不大。     

病毒治愈的荷瘤鼠对再次植入S180细胞的实验研究

给病毒治愈的Ｓ１８０荷瘤小鼠腹腔内植入不同剂量的Ｓ１８０细胞和Ｅｈｒｌｉｃｈ细胞,随着Ｓ１８０细胞的植入量的增加,其存活率从９－％下降至１５％,与植入的Ｓ１８０细胞量成反比。而用ＥｈｒＬｉｃｈ腹水瘤细胞入病毒治愈的Ｓ１８０小鼠,５０００／只和１００００／只两组各存活１０％,其它组１００％死亡。     

丁(鱼岁)不同群体间形态学差异与随机扩增多态DNA(RAPD)分析

采用聚类分析、主成分分析和判别分析3种数理统计方法,对我国新疆朱家湖丁(鱼岁)群体、73水库丁(鱼岁)群体和从捷克引进我国的丁(鱼岁)群体的可量性状和框架参数进行分析.聚类分析和主成分分析显示,朱家湖群体与73水库群体较为接近,而捷克群体与前两群体相距较远.判别分析亦可将捷克群体与前两群体分开,准确率达100%.从60个随机引物中筛选出的20个引物对丁(鱼岁)朱家湖群体、73水库群体和捷克群体进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析.引物S440在捷克群体扩增出的450bp片段为该群体特有的标记片段.朱家湖群体、73水库群体、捷克群体多态位点比例分别为24%、22.67%和18.42%;群体内遗传相似度分别为0.8967、0.9035和0.9309;遗传多态度(π)分别为0.1539、0.1489和0.1142.表明朱家湖群体保持着较高的遗传变异.三群体间的遗传相似度为0.6868-0.9496,群体遗传分化系数(Fst)为0.048-0.238,分子方差分析发现群体内方差占总方差的83.96%,群体间的方差只占16.04%,由此推断三群体间遗传分化并不大.     

RAPD应用于遗传多样性和系统学研究中的问题

在研究银杉（Ｃａｔｈａｙａ ａｒｇｙｒｏｐｈｙｌｌａ）的遗传多样性时,对ＲＡＰＤ 产物的影响因素进行了大量的实验探索,结果表明：逐级纯化的ＤＮＡ 模板的ＲＡＰＤ结果一致, 因而模板制备过程中的很多纯化步骤是不必要的; ＲＮＡ 对扩增产物无影响; 模板浓度在一个相当大的范围内不影响扩增结果; 从干叶和鲜叶中提取的ＤＮＡ 可获得一致的扩增产物; 从而证明ＲＡＰＤ 产物具有很好的重复性。进而讨论了ＲＡＰＤ产物分析及数据分析中的一些问题。通过对升麻属（Ｃｉｍ ｉｃｉｆｕｇａ） ５ 种、类叶升麻（Ａｃｔａｅａ ａｓｉａｔｉｃａ）及松潘乌头（Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｓｕｎｇｐａｎｅｎｓｅ）的ＲＡＰＤ 结果分析,认为ＲＡＰＤ 方法可用于种间乃至近缘属间的系统学研究, 但有一定的局限性     

Frankia菌的遗传多样性的RAPD研究

选用20个随机引物,对分自2个分类接种群的8株Frandia纯培养的总DNA进行随机扩增,其中引物OPW15和OPW16能扩增得到较为稳定的RAPD图谱．扩增产物分子量大都分布在0．5～4Kb之间．从稳定的RAPD扩增图谱看,Frankia菌间存在有丰富的遗传多样性;在选定适当引物情况下,能依据共同带将Frankia菌化归为同一分类接种群．     

Use of random amplified polymorphic DNA (RAPD) for generating specific DNA probes for microorganisms

We report the rapid generation of DNA probes for several Azospirillum strains. This method does not require any knowledge of the genetics and/or the molecular biology of the organism (genome) to be investigated. The procedure is based on the generation of random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprints using primers with an embedded restriction site. The amplification product(s) peculiar to one strain or common to two or more strains can be purified, cloned, sequenced and used as molecular probes in hybridization experiments for the detection and identification of microorganisms. We have tested this methodology in the nitrogen-fixing bacterium Azospirillum by amplyfing the total DNA extracted from several Azospirillum strains. We have used amplification bands with different specificity as molecular probes in hybridization experiments performed on amplified DNA. Results obtained have demonstrated the usefulness of this methodology for Azospirillum. Its use in microbial ecology studies as a general strategy to generate specific DNA probes is also discussed.     

NJS小鼠与其亲本小鼠遗传多样性的RAPD分析

目的分析NJS及其亲本小鼠的遗传结构.方法筛选出5条随机引物对NJS及其亲本小鼠的遗传结构进行RAPD分析,并对NJS小鼠个体之间的基因组DNA进行相似性分析.结果两种小鼠均有相同的扩增片段且产生了各自的特异性条带;NJS小鼠不同个体间拥有的RAPD条带也具有差异,但拥有相同条带的个体小鼠比率较高.该群体小鼠的相似系数(F)为0.927(0.880～0.980).结论 RAPD分析获得的多态性可用于NJS与其亲本小鼠之间的遗传分析;而且NJS小鼠个体间具有较好的遗传一致性和遗传稳定性,其群体分化程度处在一个较低的水平.     

山医群体中国地鼠近交E家系RAPD分析

目的　分析山医群体中国地鼠E家系的遗传纯度。方法　应用经过筛选的 3 1条随机引物对中国地鼠E家系 12只个体基因组DNA进行RAPD扩增 ,计算近交个体间的相似系数。结果　所有样品的相似系数0 943 1到 0 9978之间变动 ,平均相似系数为 0 9749,聚类分析得到了这些个体的同源树资料。结论　山医群体E家系有较高的遗传纯度     

家蚕近交系遗传纯度的RAPD检测

目的分析家蚕近交系IS-c108A的遗传纯度,为家蚕实验动物化的培育工作提供指导。方法应用经过筛选的20条随机引物对家蚕近交系IS-c108A(F10)的3个蛾区各30个个体和该近交系的亲本系统c108、对照实用化品种871各30个个体的基因组DNA进行RAPD扩增,计算个体间和蛾区间的相似系数及遗传距离。结果家蚕近交系IS-c108A(F10)的3个蛾区内的多态性带频率分别为1.807%、1.841%、1.841%,平均为1.830%;起点亲本c108个体间多态性带频率为7.207%,对照品种871个体间的多态性带频率为7.08%;而近交系IS-c108A与c108之间的多态性带频率为49.20%,c108和871品种之间的多态性带频率为58.33%。家蚕近交系IS-c108A10的3个蛾区内个体之间遗传相似系数的平均值分别为0.99581、0.99555、0.99551,总平均为0.99562。结论家蚕近交系IS-c108A(F10)已具有较高的遗传纯合度,家蚕具有易于获得高纯的有利条件。     

利用RAPD技术分析实验用比格犬的遗传背景

目的　运用RAPD技术对实验用比格犬 (Beagle)进行遗传背景分析。方法　筛选的 16个RAPD引物对 4 0个样品的分析 ,共得到 93个扩增条带。结果　所有样品的相似系数 80 4 %到 10 0 %间变动 ,平均相似系数为93 2 8% ,聚类分析得到了这些个体的同源树资料。结论　本遗传背景资料可以为以后的比格犬繁育生产和生物医药学的研究应用提供技术指导     

苦丁茶冬青的RAPD影响因素及实验条件的优化

以苦丁茶冬青为材料研究随机扩增多态DNA(RAPD)的影响因素及各种实验条件优化。研究结果表明：模板DNA的浓度适宜范围为20ng／反应-80ng／反应RAPD均可得到一致的结果;dNTVs的适宜浓度范围为200μmol／L-400μmol／L;Mg^2 适宜浓度范围为1．5mmol／L-2．0mmol／L;其合适的复性温度为35—37℃;2min的延伸时间,45次热循环。按照此优化的RAPD条件进行重复实验,实验结果重现性良好,因而确定了苦丁茶冬青RAPD反应体系之最佳的实验条件。     

Deterministic paternity exclusion using RAPD markers

The Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique can potentially provide hundreds of polymorphic markers for use by ecologists studying mating systems in natural populations. We consider here the implications of the dominance displayed by RAPD markers for deterministic paternity assignment. Our goal was to provide a means for assessing the costs associated with such a study for ecologists who might be considering the use of RAPD markers for paternity analysis. The theoretical expected proportion of offspring for which all males except the true father can be exlucded (P(ET)) is calculated for both dominant and codominant marker systems. The ability to assign paternity unambiguously generally increases with the number of loci and the frequency of the recessive allele (but only up to a point), and decreases with increasing sample size (number of individuals surveyed). The gain in P(ET) with decreasing sample size is unexpectedly slight. Not surprisingly, the performance of dominant markers at paternity exclusion is, in general, greatly exceeded by codominant markers, with the exception of the case in which the frequency of the recessive allele is high at all loci. In this case, codominant markers perform only slightly better than do dominant markers. Thus, a researcher should expect to score more than 50 RAPD loci for each offspring for most applications of paternity exclusion analysis.(ABSTRACT TRUNCATED AT 250 WORDS)     

A contribution to characterisation of genetic variation in some natural Polish populations of Elymus repens (L.) Gould and Elymus hispidus (Opiz) Melderis (Poaceae) as revealed by RAPD markers*

To determine the relative importance of clonal growth and sexual reproduction, the Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) method was used to study genetic diversity and clonal structure of six populations of Elymus repens and four populations of Elymus hispidus from Poland. These outbreeding species are virtually self‐sterile and form widely spreading and long‐lived rhizomes. Using 12 primers, a total of 150 unambiguous RAPD fragments were amplified and scored. Results of AMOVA showed no significant genetic distinction between morphologically distinguished varieties of E. repens and E. hispidus. E. repens had slightly higher intra‐specific genetic polymorphism than E. hispidus; the percentage of polymorphic bands per population ranged from 38 to 49 and from 19 to 38 respectively. Clonal diversity measured using the Simpson diversity index (D) indicated different contributions of clonal reproduction in particular populations of E. repens (D: 0.20–0.72). Populations of E. hispidus were dominated by one or a few clones, which were generally restricted to a single population (D: 0.00–0.22). RAPD revealed that most genetic diversity resided within populations of the two studied species, suggesting that, despite their clonal character, propagation by seeds contributes considerably to reproduction of E. repens and E. hispidus.