《致癌基因》：研究发现新型通用癌生物标志物

来自第四军医大学肿瘤生物学国家重点实验室的研究人员发现了我国首个新型通用癌生物标志物：HAb18G／CD147。这一标志物作为癌症的全新药靶。对临床诊断和预后判断具有重要意义。这一研究成果公布在《致癌基因》（Oncogene）,《生物科学与生物工程期刊》（J Biosci Bioeng．）等杂志上。     

《致癌基因》：研究发现新型通用癌生物标志物

来自第四军医大学肿瘤生物学国家重点实验室的研究人员发现了我国首个新型通用癌生物标志物：HAb18G／CD147，这一标志物作为癌症的全新药靶，对临床诊断和预后判断具有重要意义。这一研究成果公布在《致癌基因》（Oncogene），《生物科学与生物工程期刊》（J Biosci Bioeng．）等杂志上。     

科研快讯

《EMBO分子医学》:或发现新乳腺癌致癌基因乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,其发病常与遗传有关。最近,英国和加拿大的研究人员合作研究发现,一种名为ZNF703的基因过度活跃,会导致乳腺癌。研究人员称,这是研究者5年来发现的首个乳腺癌致癌基因,对于乳腺癌的治疗极具意义。相关     

引起普通肾癌的基因

国立癌症研究所(NCI) (Bethesda,MD)已经发现了一种突变基因,据信该基因能够引起被称之为散发性明细胞癌这一最普通型的肾癌。象许多其它有疑问的致癌基因一样,该基因在功能正常时具有肿瘤抑制基因的作用。由该基因编码的蛋白似乎能抑制细胞复制。在一组患有肾脏明细胞癌的家族中,NCI发现有57％的患者体内该基因的二种拷贝均失活。     

肿瘤易感性标志物研究进展

肿瘤易感性标志物研究进展齐红伟,李中骞（首都医科大学宣武医院,北京１０００５３）（中国医学科学院肿瘤研究所,北京１０００２１）关键词　代谢酶,ＤＮＡ修复能力,遗传性基因缺陷,致癌基因生物标志物（ｂｉｏｍａｒｋｅｒｓ）是反映生物体或生物样品中某种事件的...     

非编码RNA在肿瘤液体活检中的研究进展

液体活检是一种基于分析体液样本中的生物标志物来诊断疾病、监测疾病进展和评估疗效的非侵入性的新型微创诊断技术。液体活检主要包括探查和检测循环肿瘤细胞、ctDNA、非编码RNAs和细胞外囊泡等。非编码RNA之前被认为是一类无功能的RNA,但近年来研究表明它们在肿瘤的发病机制中扮演着重要的角色。它们构成了基因调控的一个重要层面,其表达水平在多种癌种中呈现失调势态,这提示了它们作为肿瘤生物学标志物的临床应用潜力。飞速发展的高通量测序技术使得在泛癌领域建立非编码RNA表达谱的分子表征成为可能。该文系统阐述了非编码RNA作为非侵入性肿瘤标志物的研究进展,评估了其作为肿瘤生物标志物的适用性,同时总结了近期的检测技术突破对肿瘤分子标志物发展的影响。     

肝细胞癌相关差异基因的生物信息学及预后分析

肝细胞癌是全球癌症相关死亡的主要原因,目前对肝细胞癌的发病机制研究尚不完善,探索肝细胞癌发生、发展相关的分子标志物及其预后具有重要意义。从GEO数据库获得肝细胞癌组织和非癌组织的基因表达阵列数据GSE84402,利用GEO2R筛选差异表达基因;采用DAVID数据库对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析;通过STRING数据库和Cytoscape软件构建差异表达基因对应的蛋白质相互作用网络,并从网络中筛选出核心基因(hub genes);结合KM plotter数据库的临床信息对hub genes进行预后分析。结果显示:共得到1 307个差异表达基因,其中上调基因741个,下调基因566个,这些差异表达基因主要涉及细胞分裂、细胞周期、DNA复制及物质代谢等生物学过程及生物通路。通过GO、KEGG及蛋白质相互作用网络筛选出BUB1、BUB1B、CCNA2、CCNB1、CCNB2、CDC20、CDK1、MAD2L1、PLK1等9个hub genes,进一步分析发现hub genes均与细胞周期的调控相关,表明细胞周期的调控失常在肝细胞癌的发生、发展过程中具有重要作用。生存分析显示9个hub genes在肝细胞癌患者中均为表达上调的基因,且与患者预后不良相关,这为寻找肝细胞癌患者预后相关生物标志物的研究提供了线索。     

对癌基因的新认识

众所周知的原因,癌引起人们的普遍关切,特别是医学界的重视。由于这种人类共同利益的社会原因,推动了癌的科学理论的研究。关於它的病因,曾有过各种各样的理论,如化学物质致癌论,电离辐射致癌论,病毒致癌论、遗传致癌论等,致癌因素多得使人迷惑不解。半个多世纪以来,科学家们通过两条既独立又有联系的途径进行艰苦卓绝的研究,发现了癌基因。一条是通过反转录病毒的研究;另一条是通过分子克隆,基因转移的方法。获得了癌基因。我们还不能说一切问题迎刃而解了,但这一发现毕竟使人们从癌的迷宫中走出来,是一个光辉的里程碑!     

癌与遗传学研究

随着医学遗传学的发展,现已发现将近有 三千种疾病与遗传有关,癌就是其中一种。癌 与遗传的关系如何。这涉及癌的病因。我们知 道,癌细胞是由正常细胞癌变而成的,也就是 说,在致癌因子作用下,或是细胞原先就有的遗 传信息发生了改变,或是基因调控系统受到干 扰,改变了原先的遗传信息表达的时空程序,最 后使细胞代谢出现了异常而导致癌变。所有这 一切都是同基因的结构和功能的改变有关的, 这就表明了癌同遗传学研究的关系。     

Clin Cancer Res:新生物标志物可鉴别出高转移风险的葡萄膜黑色素瘤

正在一项新的研究中,美国迈阿密大学米勒医学院西尔维斯特综合癌症中心眼癌部位小组负责人J.William Harbour博士和同事们发现一种生物标志物能够鉴定出葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma)有更高风险发生转移的病人。在归类为1级的葡萄膜黑色素瘤中,含有高水平的被称作PRAME m RNA的生物标志物的病人要比含有低水平PRAME m RNA的那些病人更可能发生     

MicroRNA与肺癌发生、诊断及治疗

微小RNA(miRNAs)是一大类小的非编码RNA,它通过与靶mRNA 3′非翻译区部分互补配对来调节特定基因的表达。近来研究表明,miRNA可作为癌基因或抑癌基因在肺癌发生发展过程中起重要作用。比较癌组织和非癌组织中miRNA表达谱的差异可筛选出部分miRNA分子作为肺癌诊断和预后判断的潜在生物标记。调节具有致癌或抑癌功能的miRNA表达可能成为肺癌治疗新方法,而结合传统放化疗及其敏感性miRNA标志也为肺癌治疗研究提供了新的策略。该文对miRNA在肺癌发生与发展、基因诊断和治疗中的作用做一综述。     

《癌症研究》：两基因表达改变可诱发乳腺癌

Georgetown Lombard综合癌症中心的研究人员发现,在小鼠内,只要两个常见基因的表达有一点点调整,就能导致乳腺癌。这两个基因分别是雌激素受体d和p53,科学家们认为健康妇女体内的这两个基因能够成为生物标志物,帮助预测未来的乳腺癌疯险,     

前列腺癌中TMPRSS2-ETS基因融合及机制研究进展

超过50%的前列腺癌中存在跨膜丝氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)和E26(ETS)转录因子间的基因融合,其中TMPRSS2-ERG最为常见。TMPRSS2-ERG基因融合造成的ERG过表达参与了前列腺的癌变。雄激素受体结合和遗传毒性胁迫共同诱导了染色体的靠近和TMPRSS2-ETS的基因融合。TMPRSS2-ERG基因融合可作为前列腺癌诊断的一种生物标志物,并可通过病人尿液检测来实现。文章对TMPRSS2-ETS基因融合的特征、融合及致癌及临床应用进行了综述。     

肝细胞癌中FHIT基因启动子甲基化状态分析及其与临床病理特征之间的关系研究

目的:分析肝细胞癌组织中FHIT基因启动子甲基化状态及其与FHIT基因表达和肝细胞癌临床病理特征的关系。方法:运用甲基化特异性PCR(MSP)方法分析肝细胞癌组织和癌旁正常肝脏组织中FHIT基因启动子甲基化状况;应用RT-PCT和Western免疫印迹方法检测FHIT基因mRNA和蛋白的表达情况;统计学分析FHIT基因启动子甲基化与肝细胞癌临床病理特征的关系。结果:MSP分析结果表明肝细胞癌组织中FHIT基因甲基化率(60.8%)显著高于癌旁正常组织中FHIT基因甲基化(16.2%;x2=31.071,P=0.000)。同时我们还发现:发生完全或者部分甲基化的肝细胞癌组织或者癌旁正常肝组织中FHIT基因mRNA和蛋白表达水平显著降低。FHIT基因启动子甲基化和肝细胞癌患者的临床分期和肝外转移情况密切相关(P=0.006和0.049),而与其他临床病理特征无相关性(P>0.05)。结论:FHIT基因甲基化是导致FHIT基因在肝细胞癌中失活的一个重要因素,与肝细胞癌的发生密切相关,有望成为肝细胞癌早期诊断的分子检测标志物和分子治疗新靶点。     

高危型HPV DNA整合导致宫颈癌的作用机制和临床检测进展

高危型人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染是宫颈癌发生发展的必要因素之一。病毒DNA整合到宿主基因组中被认为是导致宫颈癌最重要的病因。高危型HPV DNA整合往往导致其E1和E2区大部分缺失或中断,E6和E7致癌基因过表达,宿主致癌基因激活和抑癌基因失活。目前研究表明高危型HPV整合可作为优质宫颈病变筛查的预测生物标志物,且其检测的有效方法大都基于荧光原位杂交、实时荧光定量PCR和杂交捕获技术结合Sanger测序法等。本文重点阐述了高危型HPV整合导致宫颈癌的主要机制,描述了宫颈病变筛查标志物以及预防性HPV疫苗研发和推广的研究进展,并综述了高危型HPV DNA整合状态的检测方法。     

JY—1型激光细胞显微照射系统

激光细胞显微照射系统是对细胞进行显微操作的新型仪器,广泛用于染色体显微外科(如染色体切割、焊结、失活),细胞融合,外源基因导入,致癌遗传基因的检测及细胞组成部份和特定功能的研究,是生物、医学和生物工程的新颖工具。     

RNA编辑在肿瘤中的研究进展

RNA编辑参与转录后RNA的调控,已证明与多种肿瘤发生发展相关,现逐渐成为肿瘤领域研究的热点。总结发现RNA编辑主要通过作用于致瘤相关基因(如抑癌基因、致癌基因)转录后RNA来发挥其相应作用。随着RNA编辑在肿瘤中的研究深入,可进一步从转录后水平阐明肿瘤发生发展的潜在机制,为肿瘤诊治提供新的思路。     

基于集成的共表达网络分析方法研究3种癌症的肿瘤相关模块

在肿瘤/癌旁基因表达数据中,差异表达 (DE,differential expression) 代表各种生物条件下基因表达水平的变化,而差异共表达 (DC,differential co-expression) 代表基因对之间相关系数的变化。单独的DC和DE研究方法已经被广泛应用于人类疾病研究中。但是,目前仍然缺乏有效整合DC和DE的分析方法。文中提出一个新颖的分析框架DC&DEmodule,该框架可以基于共表达模块整合DC和DE的特征,并同时整合多个肿瘤/癌旁表达谱的信息,用以识别与疾病相关的基因共表达模块,包括激活模块 (肿瘤样本中上调且共表达增强) 和失能模块 (肿瘤样本中下调且失去共表达)。将该框架用于分析肝癌、胃癌和结直肠癌各两组微阵列数据,分别得到肝癌、胃癌和结直肠癌的2、5和2个激活模块以及5、5和1个失能模块。富集分析表明与同类方法相比,文中的方法在检测已知的肿瘤相关通路和发现新通路方面均具有更高的灵敏度。然后,进一步从这3种癌症的激活模块中鉴定出17、69和11个模块关键基因,其中包含53个已报道的预后生物标志物以及3个分别与3种癌症存活率显著相关的新预后标志物。基于关键基因训练了3种癌症的随机森林模型,用于区分TCGA(The Cancer Genome Atlas) 和GEO (Gene Expression Omnibus)数据库中的肿瘤和癌旁样本,结果显示其分类的平均准确性达到了93%。三种癌症的比较为不同癌症的共有和组织特异性机制提供了新的见解。一系列评估表明,DC&DEmodule框架能够整合公共数据库中快速积累的表达谱,发现更多疾病中功能失调的生物过程。     

LATS1在食管鳞癌中的表达及启动子甲基化状态研究

在我们以前的研究中,在食管鳞癌细胞株中过表达大肿瘤抑制基因-1(large tumor suppressor kinase 1,LATS1)能够明显抑制细胞增殖、细胞迁移和侵袭,同时能够促进细胞凋亡。为了进一步研究LATS1基因在食管鳞状细胞癌发生发展中的作用以及可能的机制,我们在食管鳞癌组织与配对癌旁组织中,应用免疫组化检测LATS1基因蛋白质表达情况,应用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测配对组织LATS1基因mRNA表达差异。甲基化特异性PCR(MSP)和亚硫酸氢盐测序法(BGS)检测食管鳞癌组织及细胞中LATS1基因的CpG岛甲基化状态。我们发现LATS1基因在癌旁组织中广泛表达,而癌组织中LATS1基因表达明显下调。结果表明LATS1在食管鳞癌中起到抑癌基因的作用,并且与肿瘤的临床分期相关,而其下调与CpG岛的高甲基化无关。在食管鳞癌细胞中过表达LATS1抑制细胞增殖、细胞迁移和侵袭,同时能够促进细胞凋亡。因此,LATS1基因值得进一步探索作为食管鳞癌生物标志物的可能用途和未来分子诊断和治疗的目标。     

《癌细胞》：研究发现致癌基因调控机制

哈佛大学Beth Israel Deaconess医学中心（BIDMC）的科学家发现了调控着致癌基因MDM2的基因。MDM2又调控着肿瘤抑制蛋白质p53。但是这组科学家发现,这些基因并不是MDM2基因的”通断”开关,而更像一个调光器开关,这提示了一个更复杂的信号传导路径,它对于变化的环境敏感。研究报告发表在8月17日出版的《癌细胞》（Cancer Cell）杂志上。